BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G50330.1 Length=1744 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg497506 jgi|Araly1|497506|fgenesh2_kg.664__1__AT5G50330.1 2588 0.0 Ahg495093 jgi|Araly1|495093|fgenesh2_kg.8__909__AT5G50330.1 2560 0.0 Ahg492357 jgi|Araly1|492357|fgenesh2_kg.7__1790__AT4G24810.2 1277 0.0 > Ahg497506 jgi|Araly1|497506|fgenesh2_kg.664__1__AT5G50330.1 Length=1652 Score = 2588 bits (1401), Expect = 0.0 Identities = 1542/1609 (96%), Gaps = 13/1609 (1%) Strand=Plus/Plus Query 18 CGATCTCGATCAACTTCATCGCTTCTTCCG--AAAGCTTTCACATTTGATA---TCAAAA 72 ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || || ||| Sbjct 1 CGATCTCTATCAACTTCATCGTTTCTTCCGTTAAAGCTTTCACATTTGTTACGTTCGAAA 60 Query 73 TCGAGAAACAAAAATTGAAAACAATCTGTTTCACC--aa-aaaaaGAACAAAATGCATGG 129 |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||| Sbjct 61 TCGAGATACACAAATTGATAACAATCTG-TTCTCCAAAAGAAAAAGAAAAAAATGCATGG 119 Query 130 GTTCGATTTCAAAGAGATCCAGGAGAAGATCTCCGATAGCTTTCGTCCATGGCAACGCTC 189 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 GTTCGATTTCAAAGAGATTCAGGAGAAGATCTCCGAGAGCTTTCGTCCATGGCAACGCTC 179 Query 190 TTTTCAATTCTGGGTTCGAGCTACTAATATCTACACAGGCTACAAGGTGTTTCAACTTCG 249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 TTTTCAATTCTGGGTTCGAGCTACTAATATCTACACAGGCTACAAGGTGTTTCAACTTCG 239 Query 250 AGTAAGTTTAGTAAAAGATGCAAAGAAGCAAGAGGAAATGTGGGAAAGACAACATGAACA 309 ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 240 AGTGAGTTTAGTGAAAGATGCAAAGAAGCAAGAGGAAATGTGGGAAAGACAACATGAGCA 299 Query 310 AGCTGCTGATAAGATTTACTTCATGTGCTCTGATCTTGGTGGTTTCTTCCTTAAGATTGC 369 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 300 AGCTGCTGATAACATTTACTTCATGTGCTCTGATCTTGGGGGTTTCTTCCTTAAGATTGC 359 Query 370 TCAACTTTTAGCAAAACCTGACATGGCACCAGCTGCG-TGGGTGAAAAAGCTTGTCACTT 428 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| Sbjct 360 TCAACTTTTAGCAAAACCTGACATGGCACCAGCTG-GTTGGGTGAAAAAGCTTGTAACTT 418 Query 429 TGTGTGATCAAGCTCCTGCGACGCCGTTTGATGCGATTCAACTTGTTCTAGAGAAGGAGT 488 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 419 TGTGTGATCAAGCTCCTGCGACGCCGTTTGATGCAATTCAACTTGTTCTAGAGAAGGAGT 478 Query 489 TAGGTAAAAGCATTGGTGAAATCTTTGAAACGTTTGATGAAAAGCCTCTTGGTTCTGCTT 548 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 TAGGTAAAAGCATTGGTGAAATCTTTGAAACATTTGATGAAAAGCCTCTTGGTTCTGCTT 538 Query 549 CTATTGCTCAGGTTCATAGAGCAATAGTAAAGGGTAACAAGATGAATGTTGTTGTAAAGG 608 |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 CTATTGCTCAGGTTCACAGAGCAAGAGTAAAGGGTAACAAGATGAATGTTGTTGTAAAGG 598 Query 609 TTCAACATCCTGGCATTGAAAGATTGATGATGACAGACATAAGAAACTTGCAACTATTCG 668 ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 599 TTCAACACCCTGGCATCGAAAGGTTGATGATGACAGACATTAGAAACTTGCAACTATTCG 658 Query 669 CCTTATACATGCAGAGAACAGATATCAAATTTGACCTGCATTCCATAACAAAGGAAATGG 728 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 659 CCTTATACATGCAGAGAACAGATATCAAATTTGACCTGCATTCCATAACCAAGGAAATGG 718 Query 729 AGAAACAGATTGGTTATGAATTTGACTTCAAAAGGGAGGCCAATGCAATGGAAAGAATTC 788 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 719 AGAAACAGATTGGTTATGAATTTGACTTCAAAAGGGAGGCCAGTGCAATGGAAAGAATTC 778 Query 789 GATGTTTTCTTTATGAGAACAACAAAAAGTCTCCTGTTTTGGTACCAAGAGTTCTGCGAG 848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 779 GATGTTTTCTTTATGAGAACAACAAAAAGTCTCCTGTTTTGGTACCAAGAGTTCTGCGAG 838 Query 849 ATATGGTGACTAAGAGGGTTTTGGTGATGGAATACATTAATGGAATTCCAATCCTGAGCA 908 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 839 ATATGGTGACTAAGAGGGTTTTGGTGATGGAATACATTAATGGAATTCCAATTCTGAGCA 898 Query 909 TTGGTGATGAGATGGCTAAAAGAGGGATAAATCCTCATGGTAAGATTGCAGAGGCAGCAA 968 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 899 TTGGTGATGAGATGGCTAAAAGAGGGATAAATCCTCATGGTAAGATTGCAGAGGCAGCAA 958 Query 969 AGCACAATATACTTAACAGTTTATCCCGTGCGTATGGCCAAATGATACTGAAAAGTGGTT 1028 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 AGCACAATATACTTAGCAGTTTATCCCGTGCGTATGGCCAAATGATACTGAAAAGTGGTT 1018 Query 1029 TCTTTCATGCGGATCCACATCCTGGAAATATCTTGATTTGCAAAGGTCAAGAGGTTGCAT 1088 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 TCTTTCATGCGGATCCACATCCTGGAAATATCTTGATTTGCAAAGGTCAAGAGGTTGCAC 1078 Query 1089 TGCTGGACTATGGTCAAGTGAAGGAACTACCCAACAAGTTGAGACTTGGTTATGCAAATT 1148 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1079 TGCTGGACTATGGTCAAGTGAAGGAACTACCCGACAAGTTGAGACTTGGTTATGCGAATT 1138 Query 1149 TGGTCATTGCCATGGCTGATAACAATGCTTCACGAGTATCACAGAGCTTTTGGGAAATGG 1208 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1139 TGGTCATTGCCATGGCTGATGACAATGCTTCAGGAGTATCACAGAGCTTTTGGGAAATGG 1198 Query 1209 GTTTACATACAGTGGCCAAGTGTGAGAATGAGCAGCAAGAACTTCTGCGGTTAGCACAAA 1268 |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 GTTTGCATACAGTGGCCAAGTGTGTGAACGAGCAGCAAGAACTTCTGCGGTTAGCACAAA 1258 Query 1269 CACTTTTTGATACAAAGATGCCTA-CTGGTCAGACAGTTTTACAACCTTTCTCAGATGAC 1327 ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1259 CACTTTTCGATACAAAGATGCC-AGCTGGTCAGACAGTTTTGCAACCATTCTCAGATGAC 1317 Query 1328 TCTTCGATTAAAAAGATAGCCGTTGAGACATTTCCAGAGGAACTGTTCTCTGTACTTCGC 1387 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1318 TCTTCGATTAAAAAGATAGCCGTTGAGACATTTCCAGAGGAACTGTTCTCTGTACTTCGT 1377 Query 1388 ACTGTGGTTCTGTTAAGAGGACTCAGTGTTGGGATGGGAGTTAATTATTCGTGTGCAGAA 1447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || Sbjct 1378 ACTGTGGTTCTGTTAAGAGGACTCAGTGTTGGGATGGGAGTTAATTACTCATGTGCACAA 1437 Query 1448 CAATGGAGAGCAATGGCCGAAGAGGCTTTACTTGCATCTGGAAGAGTGACAAGAGATGGC 1507 || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 1438 CAGTGGAGATCAATGGCCGAAGAGGCTTTACTTGCATCTGGAAGAGTAACACGAGATGGC 1497 Query 1508 AAAGAAAGATCTCGTAGACGGGCTTCTCTACGAAGGCTACGCACAGGAAGTTAGGAAAAA 1567 |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1498 AAAGGAAGATCTCGTAGACAGGCTTCTCTCCGAAGGCTACGCCCAGGAAGTTAGGAAAAG 1557 Query 1568 GATAGGAGTATTTCTCATCACTTAGACTCTCCCATGAGCAGGATCTGAG 1616 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 GATAGGAGTATTTATCATCACTTAGACTCTCCCATGAGCAGGATCTGAG 1606 Score = 76.8 bits (41), Expect = 5e-13 Identities = 45/47 (96%), Gaps = 0/47 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1644 GTGAGAATTTGAATGATAGGAGAAGTTGGATAACACTTGAATGTAAT 1690 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1606 GTGAGAATTTGAATGATAGGAGAAGTTGGATAGGACTTGAATGTAAT 1652 > Ahg495093 jgi|Araly1|495093|fgenesh2_kg.8__909__AT5G50330.1 Length=1652 Score = 2560 bits (1386), Expect = 0.0 Identities = 1537/1609 (96%), Gaps = 13/1609 (1%) Strand=Plus/Plus Query 18 CGATCTCGATCAACTTCATCGCTTCTTCCG--AAAGCTTTCACATTTGATA---TCAAAA 72 ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| || ||| Sbjct 1 CGATCTCTATCAACTTCATCGTTTCTTCCGTTAAAGCTTTCAAATTTGATACGTTCGAAA 60 Query 73 TCGAGAAACAAAAATTGAAAACAATCTGTTTCACC--aa-aaaaaGAACAAAATGCATGG 129 |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||| Sbjct 61 TCGAGATACACAAATTGAAAACAATCTG-TTCTCCAAAAGAAAAAGAAAAAAATGCATGG 119 Query 130 GTTCGATTTCAAAGAGATCCAGGAGAAGATCTCCGATAGCTTTCGTCCATGGCAACGCTC 189 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 GTTCGATTTCAAAGAGATTCAGGAGAAGATCTCCGAGAGCTTTCGTCCATGGCAACGCTC 179 Query 190 TTTTCAATTCTGGGTTCGAGCTACTAATATCTACACAGGCTACAAGGTGTTTCAACTTCG 249 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 TTTTCATTTCTGGGTTCGAGCTACTAATATCTACACAGGCTACAAGGTGTTTCAACTTCG 239 Query 250 AGTAAGTTTAGTAAAAGATGCAAAGAAGCAAGAGGAAATGTGGGAAAGACAACATGAACA 309 ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 240 AGTGAGTTTAGTGAAAGATGCAAAGAAGCAAGAGGAAATGTGGGAAAGACAACATGAGCA 299 Query 310 AGCTGCTGATAAGATTTACTTCATGTGCTCTGATCTTGGTGGTTTCTTCCTTAAGATTGC 369 |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 300 AGCTGCTGATAAAATCTACTTCATGTGCTCTGACCTTGGGGGTTTCTTCCTTAAGATTGC 359 Query 370 TCAACTTTTAGCAAAACCTGACATGGCACCAGCTGCGTGGGTGAAAAAGCTTGTCACTTT 429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 360 TCAACTTTTAGCAAAACCTGACATGGCACCAGCTGCTTGGGTGAAAAAGCTTGTAACTTT 419 Query 430 GTGTGATCAAGCTCCTGCGACGCCGTTTGATGCGATTCAACTTGTTCTAGAGAAGGAGTT 489 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 GTGTGATCAAGCTCCTGCGACGCCGTTTGATGCAATTCAACTTGTTCTAGAGAAGGAGTT 479 Query 490 AGGTAAAAGCATTGGTGAAATCTTTGAAACGTTTGATGAAAAGCCTCTTGGTTCTGCTTC 549 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 480 AGGTAAAAGCATTGGTGAAATCTTTGAAACATTTGATGAAAAGCCGCTTGGTTCTGCTTC 539 Query 550 TATTGCTCAGGTTCATAGAGCAATAGTAAAGGGTAACAAGATGAATGTTGTTGTAAAGGT 609 ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 TATTGCTCAGGTTCACAGAGCAAGAGTAAAGGGTAACAAGATGAATGTTGTTGTAAAGGT 599 Query 610 TCAACATCCTGGCATTGAAAGATTGATGATGACAGACATAAGAAACTTGCAACTATTCGC 669 |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 600 TCAACACCCTGGCATCGAAAGGTTGATGATGACAGACATTAGAAACTTGCAACTATTCGC 659 Query 670 CTTATACATGCAGAGAACAGATATCAAATTTGACCTGCATTCCATAACAAAGGAAATGGA 729 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 660 CTTATACATGCAGAGAACAGATATCAAATTTGACCTGCATTCCATAACCAAGGAAATGGA 719 Query 730 GAAACAGATTGGTTATGAATTTGACTTCAAAAGGGAGGCCAATGCAATGGAAAGAATTCG 789 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 720 GAAACAGATTGGTTATGAATTTGACTTCAAAAGGGAGGCCAGTGCAATGGAAAGAATTCG 779 Query 790 ATGTTTTCTTTATGAGAACAACAAAAAGTCTCCTGTTTTGGTACCAAGAGTTCTGCGAGA 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 ATGTTTTCTTTATGAGAACAACAAAAAGTCTCCTGTTTTGGTACCAAGAGTTCTGCGAGA 839 Query 850 TATGGTGACTAAGAGGGTTTTGGTGATGGAATACATTAATGGAATTCCAATCCTGAGCAT 909 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 840 TATGGTGACTAAGAGGGTTTTGGTGATGGAATACATTAATGGAATTCCAATTCTGAGCAT 899 Query 910 TGGTGATGAGATGGCTAAAAGAGGGATAAATCCTCATGGTAAGATTGCAGAGGCAGCAAA 969 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 TGGTGATGAGATGGCTAAAAGAGGGATAAATCCTCATGGTAAGATTGCAGAGGCAGCAAA 959 Query 970 GCACAATATACTTAACAGTTTATCCCGTGCGTATGGCCAAATGATACTGAAAAGTGGTTT 1029 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 GCACAATATACTTAGCAGTTTATCCCGTGCGTATGGCCAAATGATACTGAAAAGTGGTTT 1019 Query 1030 CTTTCATGCGGATCCACATCCTGGAAATATCTTGATTTGCAAAGGTCAAGAGGTTGCATT 1089 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1020 CTTTCATGCGGATCCACATCCTGGAAATATCTTGATTTGCAAAGGTCAAGAGGTTGCACT 1079 Query 1090 GCTGGACTATGGTCAAGTGAAGGAACTACCCAACAAGTTGAGACTTGGTTATGCAAATTT 1149 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1080 GCTGGACTATGGTCAAGTGAAGGAACTACCCGACAAGTTGAGACTTGGTTATGCGAATTT 1139 Query 1150 GGTCATTGCCATGGCTGATAACAATGCTTCACGAGTATCACAGAGCTTTTGGGAAATGGG 1209 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 GGTCATTGCCATGGCTGATGACAATGCTTCAGGAGTATCACAGAGCTTTTGGGAAATGGG 1199 Query 1210 TTTACATACAGTGGCCAAGTGTGAGAATGAGCAGCAAGAACTTCTGCGGTTAGCACAAAC 1269 ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 TTTGCGTACAGTGGCCAAGTGTGTGAACGAGCAGCAAGAACTTCTGCGGTTAGCACAAAC 1259 Query 1270 ACTTTTTGATACAAAGATGCCTA-CTGGTCAGACAGTTTTACAACCTTTCTCAGATGACT 1328 |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 1260 ACTTTTCGATACAAAGATGCC-AGCTGGTCAGACAGTTTTGCAACCATTCTCAGATGACT 1318 Query 1329 CTTCGATTAAAAAGATAGCCGTTGAGACATTTCCAGAGGAACTGTTCTCTGTACTTCGCA 1388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1319 CTTCGATTAAAAAGATAGCCGTTGAGACATTTCCAGAGGAACTGTTCTCTGTACTTCGTA 1378 Query 1389 CTGTGGTTCTGTTAAGAGGACTCAGTGTTGGGATGGGAGTTAATTATTCGTGTGCAGAAC 1448 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| Sbjct 1379 CTGTGGTTCTGTTAAGAGGACTCAGTGTTGGGATGAGAGTTAATTACTCATGTGCACAAC 1438 Query 1449 AATGGAGAGCAATGGCCGAAGAGGCTTTACTTGCATCTGGAAGAGTGACAAGAGATGGCA 1508 | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 1439 AGTGGAGATCAATGGCCGAAGAGGCTTTACTTGCATCTGGAAGAATAACAAGAGATGGCA 1498 Query 1509 AAGAAAGATCTCGTAGACGGGCTTCTCTACG-AAGGCTACGCACAGGAAGTTAGGAAAAA 1567 ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1499 AAGGAAGATCTCGTAGACAGGCTTCTCT-CGGAAGGCTACGCCCAGGAAGTTAGGAAAAG 1557 Query 1568 GATAGGAGTATTTCTCATCACTTAGACTCTCCCATGAGCAGGATCTGAG 1616 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 GATAGGAGTATTTATCATCACTTAGACTCTCCCATGAGCAGGATCTGAG 1606 Score = 82.4 bits (44), Expect = 1e-14 Identities = 46/47 (98%), Gaps = 0/47 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1644 GTGAGAATTTGAATGATAGGAGAAGTTGGATAACACTTGAATGTAAT 1690 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1606 GTGAGAATTTGAATGATAGGAGAAGTTGGATAAGACTTGAATGTAAT 1652 > Ahg492357 jgi|Araly1|492357|fgenesh2_kg.7__1790__AT4G24810.2 Length=1630 Score = 1277 bits (691), Expect = 0.0 Identities = 1163/1390 (84%), Gaps = 36/1390 (3%) Strand=Plus/Plus Query 121 AATGCATGGGTTCGATTTCAAAGAGATCCAGGAGAAGATCTCCGATAGCTTTCGTCCATG 180 |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | || || || || Sbjct 29 AATGCATGCGATCGATTTCAAAGAGATTCAGGAGAAGCTCTCTGATGGATTCCGGCCTTG 88 Query 181 GCAACGCTCTTTTCAATTCTGGGTTCGAGCTACTAATATCTACACAGGCTACAAGGTGTT 240 |||||| || ||||| ||||||| ||| || ||| | |||||||| || |||||||| || Sbjct 89 GCAACGATCGTTTCAGTTCTGGGCTCGTGCCACTGACATCTACACTGGATACAAGGTATT 148 Query 241 TCAACTTCG-AGT-AAGTTTAGTAAAAGATG-CAAAGAAGCAAGAGGAAATGTGGGAAAG 297 ||||||||| | | || || || || |||| | || ||||| |||||||||||||| || Sbjct 149 TCAACTTCGTA-TGAA-CTTCGTTAAGGATGTC-AATAAGCACGAGGAAATGTGGGAGAG 205 Query 298 ACAACATGAACAAGCTGCTGAT-AAGATTTACTTC-ATGTGCTCTGATCTTGGTGGTTTC 355 ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 206 ACAACATGAACTTGCTGCT-CTCAAAATTTA-TTCTATGTGCTCTGACCTTGGTGGTTTC 263 Query 356 TTCCTTAAGATTGCTCAACTTTTAGCAAAACCTGACATGGCACCAGCTGCGTGGGTGA-A 414 |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | | Sbjct 264 TTCCTTAAGATTGCACAAATTCTAGGTAAACCTGACTTGGCTCCAGCTGCGTGGGTTAGA 323 Query 415 AAAGCTTGTCACTTTGTGTGATCAAGCTCCTGCGACGCCGTTTGATGCGATTCAACTTGT 474 ||| || ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| |||| | |||| Sbjct 324 AAA-CTCGTCACTTTGTGTGATCATGCTCCTGCCACATCATTTGATGCCATTCGAGTTGT 382 Query 475 TCTAGAGAAGGAGTTAGGTAAAAGCATTGGTGAAATCTTTGAAACGTTTGATGAAAAGCC 534 || ||||| ||||||||||||||| | | || | |||||||| |||||||| ||||| Sbjct 383 CCTTGAGAAAGAGTTAGGTAAAAGCCTCGAAGATGTGTTTGAAACATTTGATGAGAAGCC 442 Query 535 TCTTGGTTCTGCTTCTATTGCTCAGGTTCATAGAGCAATAGTAAAGGGTAACAAGATGAA 594 |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||| | | Sbjct 443 TCTTGGCTCTGCTTCTATTGCTCAGGTACACCGAGCAAGAGTAAAAGGTGACAAGAGGGA 502 Query 595 TGTTGTTGTAAAGGTTCAACATCCTGGCATTGA-AAGATTGATGATGACAGACATAAGAA 653 ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| ||| || |||| Sbjct 503 TGTTGTTGTAAAGGTCCAACATCCTGGCGTTGAGAA-ATTGATGATGGTAGATATCAGAA 561 Query 654 ACTTGCAACTATTCGCCTTATACATGCAGAGAACAGATATCAAATTTGACCTGCAT-TCC 712 |||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || | ||| Sbjct 562 ACTTGCAAGTATTTGCATTATACATGCAGAAAACTGATATTAAATTTGACTTG-TTCTCC 620 Query 713 ATAACAAAGGAAATGGAGAAACAGATTGGTTATGAATTTGACTTCAAAAGGGAGGCCAAT 772 || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 621 ATGACAAAAGAAATCGAGAAGCAGATTGGGTATGAATTCGACTTTAAAAGGGAGGCCAAT 680 Query 773 GCAATGG-AAAGAATTCGATGTTTTCTTTATGAGAACAACAAAAAGTCTCCTGTTTTGGT 831 || |||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||| Sbjct 681 GCTATGGAAAAG-ATCCGACGTTTTCTTTATGATAACAATAGAAAGAGTCCTGTCCTGGT 739 Query 832 ACCAAGAGTTCTGCGAGATATGGTGACTAAG-AGGGTTTTGGTGATGGAATACATTAATG 890 || || || || | | || |||||||| || | ||| |||||||||| ||||| || | Sbjct 740 TCCCAGGGTGCTTCCAAATTTGGTGACT-AGAAAGGTACTGGTGATGGATTACATGAACG 798 Query 891 GAATTCCAATCCTGAGCATTGGTGATGAGATGGCTAAAAGAGGGATAAATCCTCATGGTA 950 |||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 799 GAATCCCAATCTTGAGCCTCGGTGATGAGATGGCCAAAAGAGGGATAAATCCTCATGGTA 858 Query 951 AGATTGCAGAGGCAGCAAAGCACAATATACTTAACAGTTTATCCCGTGCGTATGGCCAAA 1010 | || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||| Sbjct 859 AAATGGCAGAGGCGGCAAAATTCAATATACTAAACAGTTTGTCCCAAGCATATGGCCAAA 918 Query 1011 TGATACTGAAAAGTGGTTTCTTTCATGCGGATCCACATCCTGGAAATATCTTGATTTGC- 1069 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | Sbjct 919 TGATACTGAAGAGTGGTTTCTTTCATGCGGATCCACATCCTGGGAATATCTTGATTT-CT 977 Query 1070 AAAGGT-CAAGAGGTTGCATTGCTGGACTATGGTCAAGTGAAGGAACTACCCA-ACAAGT 1127 |||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| || | Sbjct 978 AAAGGTTCA-GAGGTTGCACTGTTGGACTATGGACAAGTGAAGGAACT-CCCTGACCACC 1035 Query 1128 TGAGACTTGGTTATGCAAATTTGGTCATTGCCATGGCTGATAACAATGCTTCAC-GAGTA 1186 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | | | Sbjct 1036 TGAGACTTGGTTATGCAAATTTGGTAATTGCCATCGCTGATAACAATGCCTCATTG-GCA 1094 Query 1187 TCACAGAGCTTTTGGGAAATGGGTTTA-CATACAGTGGCCAAGTGTGAGAATGAGCAGCA 1245 | |||||||||| ||||| | || || | |||||| ||||||||| |||||||||| || Sbjct 1095 TTACAGAGCTTTAGGGAACTTGGCATAGC-TACAGTCGCCAAGTGTAAGAATGAGCAACA 1153 Query 1246 AGAACTTCTGCGGTTAGCACAAACACTTTTTGATACAAAGATGCCTACTGGT-CAGACAG 1304 ||| ||||| | ||||||| ||||| | || || ||| |||||||| ||||| | |||| Sbjct 1154 AGAGCTTCTCCAGTTAGCAAAAACAATGTTCGACACAGAGATGCCTCCTGGTAC-GACAA 1212 Query 1305 TTTTACAACCTTTCTCAGATGACTCTTCGATTAAAAAGATAGCCGTTGAGACATTTCCAG 1364 | | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| Sbjct 1213 CTCTGCAACCTTTCTCAGTTGACTCTTCGATCAAAAAGATTTCGGTTGAGGCATTTCCAG 1272 Query 1365 AGGAACTGTTCTCTGTACTTCGCACTGTGGTTCTGTTAAGAGGACTCAGTGTTGGGAT-G 1423 |||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| | Sbjct 1273 AGGAGCTTTTCTCTGTTCTTCGCACGGTAGTTCTGTTAAGAGGACTCAGCGTAGGGATAG 1332 Query 1424 GGAGTTAATTATTCGTGTGCAGAACAATGGAGAG-CAATGGCCGAAGAGGCTTTACTTGC 1482 ||| ||||||| || || || |||| ||||| | | ||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 1333 GGA-TTAATTACTCCTGCGCTCAACACTGGAG-GTCTATGGCAGAAGAGGCTTTGCTTGC 1390 Query 1483 ATCTGGAAGA 1492 |||||||||| Sbjct 1391 ATCTGGAAGA 1400 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 65439040910 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5