BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G51200.1
Length=5701
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg495190 jgi|Araly1|495190|fgenesh2_kg.8__1006__AT5G51200.1 7535 0.0
> Ahg495190 jgi|Araly1|495190|fgenesh2_kg.8__1006__AT5G51200.1
Length=5602
Score = 7535 bits (4080), Expect = 0.0
Identities = 4350/4483 (97%), Gaps = 8/4483 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1214 AGGTGAAGGAATCAAAGGACATGGCTATGAGTGTTCTAAATTCTTACCGAACTTCTGATC 1273
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1124 AGGTGAAGGAATCAAAGGACATGGCTATGAGTGTTCTAAATTCTTACCGAACTTGTGATT 1183
Query 1274 CGCTTGATGGAAGTATGCAGACTGAAGAGTCTGACAGGCCACTGCCCTTCATTTCTCTTA 1333
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 CGCTTGATGGAAGTATGCAGACTGAAGAGGCTGACAGGCCACTGCCCTTCATTTCTCTTA 1243
Query 1334 TGGAGTTTAAGGAACCTGAGCTACTCTCCGGGAATGATGTCTTGTGGACTTTTGTGAATT 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1244 TGGAGTTTAAGGAACCTGAGCTACTCTCCGGGAATGATGTCTTGTGGACATTTGTGAATT 1303
Query 1394 TTGCTGGAGAGGACCACACAAATTTTAAAACTCTTGTGGCTTTCTTGGAAATGCTGTGTA 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 TTGCTGGAGAGGACCACACAAATTTTAAAACTCTTGTGGCTTTCTTGGAAATGCTGTGTA 1363
Query 1454 CCTTGGCTTCCACTCAGGAAGGTGCTTCTAAAGTTTATGAGTTGCTCCGGGGTACATCAT 1513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364 CCTTGGCTTCCACTCAGGAAGGTGCTTCTAAAGTTTATGAGTTGCTCCGGGGTACATCAT 1423
Query 1514 TTCGCAGTATAGGATGGCCCACTTTGTTTGATTGTATAAGAATTTACGATGAGAAGTTCA 1573
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424 TCCGCAGTATAGGATGGGCCACTTTGTTTGATTGTATAAGAATTTACGATGAGAAGTTCA 1483
Query 1574 AGCAGTCTCTTCAAACTGCTGGAGCCATGATGCCAGAGTTCCTGGAGGGCGATGCAAAAG 1633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484 AGCAGTCTCTTCAAACTGCTGGAGCCATGATGCCAGAGTTCCTGGAGGGCGATGCAAAAG 1543
Query 1634 CACTTGTCGCTTATCTGAATGTACTTCAGAAGGTTGTTGAAAATGGTAATCCCACTGAGA 1693
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1544 CACTTGTCGCATATCTGAATGTACTTCAGAAGGTTGTTGAGAATGGTAATCCCACTGAGA 1603
Query 1694 GGAAAAACTGGTTTCCTGATATCGAACCATTTTTTAAGCTTCTGGGTTACGAAAACATCC 1753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1604 GGAAAAACTGGTTTCCTGATATCGAACCATTTTTTAAGCTTCTTGGTTATGAAAACATCC 1663
Query 1754 CTCCATATCTGAAGGGTGCTCTTAGAAAGACCATTGCTGCCTTTGTTAATGTCTTTCCAG 1813
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1664 CTCCATACCTGAAGGGTGCTCTTAGAAAGACCATTGCTGCCTTTGTTTATGTCTTTCCAG 1723
Query 1814 AAATGAGGGACTCTATCTGGGCTTTTCTTGAGCAGTATGATCTGCCTGTTGTTGTGGGAT 1873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1724 AAATGAGGGACTCTATCTGGGCTTTTCTTGAGCAGTATGATCTGCCTGTTGTTGTGGGAT 1783
Query 1874 CACAAGTTGGAAAGAGTGACCAATCTTCTCAGGTCTATGATATGCAATTTGAGTTAAATG 1933
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1784 CACCAGTTGGAAAGAGTGACCAATCTTCTCAGGTCTATGATATGCAATTTGAGTTAAATG 1843
Query 1934 AAGTGGAAGCAAGGAGAGAACAGTATCCTTCAACAATATCGTTCCTTAATCTTATAAATG 1993
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1844 AAGTGGAAGCAAGGAGAGAACAATATCCTTCAACAATATCGTTCCTTAATCTTATAAACG 1903
Query 1994 CTCTGATTGCTGGAGAGAAAGATGTGAATGATCGTGGGCGTAGGGCATATTCAGATCCCT 2053
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1904 CTCTGATTGCTGGGGAGAAAGATGTGAATGATCGTGGGCGTAGGGCATATTCTGATCCTT 1963
Query 2054 GTGAGAAGTGGCAATTGGTTGTGGCATGCCTTCAACATTTTCACATGATCTTAAGCATGT 2113
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 1964 GTGAGAAGTGGCAATTGGTTGTGGCATGCCTTCAGCATTTTCATATGGTCTTAAGCATGT 2023
Query 2114 ATGATATTCAGGAGGAGGATCTTGATGGATTTACTGAGCATCCACATTTTCTGGTGTCAC 2173
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2024 ATGATATTCAGGAGGAGGATCTAGATGGATTTACTGAGCATCCACATTTTCTGGTGTCAG 2083
Query 2174 TTGAAACATCTTCACTGCAAACGCAGCTGCCAATTATAGAATTACTAAAAGATTTCATGA 2233
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2084 TTGAAACATCTTCACTGCAAACGCAGCTACCAATTATAGAATTACTAAAAGATTTCATGA 2143
Query 2234 GTGGGAAAGCTCTCTATAGGAACCTCATGGGTATCCTTCAGGTTGGGGTCAATTCCATCA 2293
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 GTGGGAAAGCTCTTTATAGGAACCTCATGGGTATCCTTCAGGTTGGGGTCAATTCCATCA 2203
Query 2294 TCAGCGAGCGATTGAGTAAAACTTATGGGAAGATCTTAGAAAAGGCTGTACAACTTTCTT 2353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2204 TCAGCGAGCGATTGAGTAAAACTTATGGGAAGATCTTGGAAAAGGCTGTACAACTTTCTT 2263
Query 2354 TGGAAATCTTACTACTCGTCTTTGAGAAGGATTTGCTTGTTTCCGATGTTTGGCGTCCGC 2413
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2264 TGGAAATCTTACTGCTCATCTTTGAGAAGGATTTGCTTGTTTCCGATGTTTGGCGTCCAC 2323
Query 2414 TGTACCAGCCTTTGGATATAATTCTCTCACAAGATCATAATCAAATTATAGCCTTGTTGG 2473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2324 TGTACCAGCCTTTGGATATAATTCTCTCACAAGATCATAATCAAATTATTGCCTTGTTGG 2383
Query 2474 AGTATGTCAGATATGATTCTCTTCCTCAGATTCAGCGATCTTCAATCAAAATCATGAACA 2533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384 AGTATGTCAGATATGATTCTCTTCCTCAGATTCAGCGATCTTCAATCAAAATCATGAACA 2443
Query 2534 TTTTAAGGTGTTCTCGCTTGGTTGGACTTGTTCCAATGCTGATCAAAATTGATGCTGCGA 2593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 TTTTAAGGTGTTCTCGCTTGGTTGGACTTGTTCCAATGCTGATCAAAATTGATGCTGCGA 2503
Query 2594 ATTCCTTGATTGAGGATTATGCCGCCTGCCTTGAGGGACGACTTGAAGAGGGTGAAGTTG 2653
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504 ATTCCTTGATCGAGGATTATGCGGCCTGCCTTGAGGTACGACTTGAAGAGGGTGAAGTTG 2563
Query 2654 TAGAGAACAGTTGTGATGATCTAGGGGTCCTTATTATGCAGCTTCTGGTTGATAATATCA 2713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 TAGAGAACAGTTGTGATGATCTAGGGGTCCTTATTATGCAGCTTCTGGTTGATAATATCA 2623
Query 2714 ACCGGCCTGCCCCAAGTATCACACATTTGCTTCTGAAGTTTGATCTTGATGCCCCTGTGG 2773
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2624 ACCGGCCTGCACCAAGCATCACACATTTGCTTCTGAAGTTTGACCTTGATGCCCCCGTGG 2683
Query 2774 AAGGGACAGTTTTGCAGCCGAAGTTTCACTACAGTTGTCTGAAGGTCATTCTTGAAATGC 2833
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684 AAGGGACAGTTTTGCAGCCTAAGTTCCACTACAGTTGTCTGAAGGTCATTCTTGAAATGC 2743
Query 2834 TGGAGAAGCTTCCAAACCCTGATATAAACTTCTTACTCTTTGAGTTTGGCTTCCAGCTTT 2893
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2744 TGGAGAAGCTTCCAAACCCCGATATAAACTTCTTACTCTTTGAGTTTGGTTTTCAGCTTT 2803
Query 2894 TGTGTGAGTTGAATTTGGATCCACTAACTAGTGGTCCAACCATGGATCTATTGAGCAGCA 2953
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2804 TGTGTGAGTTGAATTTGGATCCATTAACTAGTGGTCCAACCATGGATCTCTTGAGCAGCA 2863
Query 2954 AAAAATATCAGTTTTTTCTCCAGCACCTCGATACCATCGGTGTTGCCACTCTTCCAAAAA 3013
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2864 AGAAATATCAGTTTTTTCTCCAGCACCTCGATACCATTGGTGTTGCCACTCTTCCAAAAA 2923
Query 3014 GAAGTGGCAGCCAAGCACTCCGTATTAGTTCCCTTCATCAGAGGGCGTGGCTATTAAAGC 3073
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2924 GAAGTGGCAGCCAGGCACTCCGTATTAGTTCCCTTCATCAGAGGGCGTGGCTATTAAAGC 2983
Query 3074 TCCTAGCTATTGCACTGCATACTGGTTCTGGAAGCAGTTCAGCTCACCTAGAGGCATGTC 3133
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2984 TCTTAGCTATTGCATTGCATACTGGTTCTGGAAGCAGTTCAGCTCACCTAGAGGCATGTC 3043
Query 3134 AGAGCATACTTTCTCATCTTTTTGGGCGGGAGGTAACTGAAGCAGCGAATGAACCTTTTT 3193
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3044 AGAGCATACTTTCTCATCTTTTTGGGCGGGAGGTAACTGAAGCAGCGAATGAACTTTTTT 3103
Query 3194 CTTCCAGTACATATCCTCAGGATGGTCTTGATTATGCTGGAACTAGTTCAATCAGTAAAA 3253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3104 CTTCCAGTACATATCCTCAGGATGGTCTTGATTATGCTGGTACTAGTTCAATCAGTAAAA 3163
Query 3254 GTAAGGCATTGGCTTTGCTTGAAATTCTTCAGTTTAGATCTCCTGATGCTTCGATGCAGC 3313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3164 GTAAGGCATTGGCTTTGCTTGAAATTCTTCAGTTTAGATCTCCTGATGCTTCGATGCAGC 3223
Query 3314 TTCCTCAAATTGTGTCAAGCCTAAAGTATGACTCATTGGTGGAGGACATACTTGGGAACC 3373
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224 TTCCTCAAATTGTGTCAAGCCGAAAGTATGACTCACTGGTGGAGGACATACTTGGGAACC 3283
Query 3374 GTGATACCTCTGTTAGCGGCAGTATTTACTATTATTCTGAGCGTGGTGATCGGCTAATTG 3433
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3284 GTGATACCTCTGTTAGCGGCAGTATCTACTATTATTCTGAGCGTGGGGATCGGCTAATTG 3343
Query 3434 ATCTATCTTCCTTCAGCAACAAACTCTGGCAGAAACTACATTCTGGATTTCCCCTAGTAG 3493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 3344 ATCTATCTTCCTTCAGCAACAAACTCTGGCAGAAACTTCATTCTGGATTTCCCCTAGTGG 3403
Query 3494 ATAGTTTTCCAAATGTTGCTGAGCTGAGTGAAGTTAGAGAGACAATTCAACAGCTGTTGA 3553
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3404 ATAGTTTTCCAAATGTTGCTGAGCTTAGTGAAGCTAGAGAGACAATCCAACAGCTGTTGA 3463
Query 3554 AATGGGGCTGGAAGTATAACCGAAACCTTGAGGAGCAAGCTGCCCAACTTCATATGTTAG 3613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 AATGGGGCTGGAAGTATAACCGAAACCTTGAGGAGCAAGCTGCCCAACTTCATATGTTAG 3523
Query 3614 CTGGCTGGTCTCAGATTGTTGAGGTGTCTGCTTGCAGAAGAATATCTTCTCTTGATAACC 3673
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3524 CTGGCTGGTCTCAGATTGTTGAGGTGTCTGCTTGCAGAAGAATATCTTCTCTTGATAATC 3583
Query 3674 GGTCTGAAATTTTGTACCGGATACTTGATGCCTCTCTTAGCGCCTCCGCGTCTCCAGATT 3733
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3584 GGTCTGAAATTTTGTACCGGTTACTTGATGCCTCTCTTAGTGCCTCCGCGTCTCCAGATT 3643
Query 3734 GTTCATTAAAAATGGCGTTTGTACTCACTCAGGTTGCCCTTACCTGCATTGCCAAACTTC 3793
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3644 GTTCATTAAAAATGGCGTTTGTACTTACTCAGGTTGCCCTTACCTGCATTGCCAAGCTTC 3703
Query 3794 GTGATGATAGATTTTCATTTCAAGGGGCCTTGAGTTCTGATACCGTGACATGTCTAGATG 3853
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3704 GTGATGATAGATTTTCATTTCAAGGGGCCTTGAGTTCTGACACCGTGACATGTCTAGATG 3763
Query 3854 TTATGATGGTCAAACATTTATCCACTGGTGCTTGCCACTCAGTTCTATTTAAACTTGTTA 3913
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3764 TTATGATGGTCAAACATTTATCCACTGGTGCTTGCAACTCGGTTCTATTTAAACTTGTTA 3823
Query 3914 TGGCAATTCTAAGGCATGAGTCATCAGAATCCTTGAGAAGGCGCCAATATGCATTGCTCT 3973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3824 TGGCAATTCTAAGGCATGAGTCATCAGAATCCTTGAGAAGGCGCCAATATGCATTGCTCT 3883
Query 3974 TGAGCTATTTCCAGTACTGCCAGCATATGATTGCTCTTGATGTGCCAACATCAGTTGTGC 4033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3884 TGAGCTATTTCCAGTACTGCCAGCATATGATTGCTCTGGATGTGCCAACATCAGTTGTGC 3943
Query 4034 AGTTCTTGTTACTTAATGAGCAAGATGGTGAAGATTTGGATATCCAGAAGATTGACAAGG 4093
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3944 AGTTCTTGTTACTTAATGAGCAAGACGGTGAAGATTTGGATATCCAGAAGATTGACAAGG 4003
Query 4094 AGCAGGCTGACCTTGCTCGTGCCAACTTTTTTATTATAAAGAAAGAAGCTCAGGGCATCT 4153
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4004 AGCAGGCTGACCTTGCTCGTGCCAACTTTTTTGTAATAAAGAAAGAAGCTCAGGGCATCT 4063
Query 4154 TGGATCTGGTAATCAAGGATGCAAGTCAAGGCAGTGAGTTTGGGAAAACAATATCACTTT 4213
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4064 TGGATCTGGTAATCAAAGATGCAAGTCAAGGCAGTGAGTTTGGAAAAACAATATCACTTT 4123
Query 4214 ATGTGCTGGAAGCTCTTGTTTGTATTGATCACGAGAGATATTTTCTTAGTCAGCTCCAGA 4273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4124 ATGTGCTGGAAGCTCTTGTTTGTATTGATCACGAGAGATATATTCTTAGTCAGCTCCAGA 4183
Query 4274 GCAGAGGTTTCATACGATCTTGTCTTGGAAGCATTAGTAATATCTCCTACCAGGATGGAA 4333
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4184 GCAGAGGTTTCATACGGTCTTGCCTTGGAAGCATTAGTAATATCTCCTACCAGGATGGAA 4243
Query 4334 CACATTTGCTGGAGTCACAACAGCGAGCTTGTACGTTAGAAGCAGAACTTGCATTGCTAC 4393
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4244 CACATTTGCTGGAGTCACAACAGCGAGCATGTACCTTAGAAGCAGAACTTGCATTGCTAC 4303
Query 4394 TTAGAATTAGTCACAAGTACGGAAAGTCTGGAGGCCAGGTTCTGTTCTCCATGGGTGCGC 4453
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4304 TTAGAATTAGTCACAAGTACGGAAAGTCTGGAGGCCAGGTTCTGTTCTCCATGGGTGCAC 4363
Query 4454 TGGAACATATTGCTTCATGTAGAGCTATCAGCTTTAAGGGAAATATGAGGCGTGTGGATA 4513
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 4364 TGGAACATATCGCTTCATGTAGAGCTATCAGCTTTAAGGGAAATATGAGACGGGTGGATA 4423
Query 4514 TGAAACTTCAGAGTGATGTAGGATATAATGTGCAAAAGCAACGAACGATAATCACTGCTG 4573
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4424 TGAAACTTCAGAGTGATGTAGGATATAGTGTGCAAAAGCAACGAACGATAATCACTGCTG 4483
Query 4574 TCCTAAGACTGGTGTTTGCTCTAACCTCATTGGTTGAGACCTCTGAATTTTTTGAGGGGA 4633
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4484 TCCTAAGACTGGTGTTTGCTCTAACCTCATTGGTTGAGACCTCTGAATTTTTTGAGGGAA 4543
Query 4634 GGAATAAAATTGTTCGTGACGTCGTTGAGTTTATCAAAGGACATCAATCTCTGTTTGACC 4693
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 4544 GGAATAAAATTGTTCGTGAAGTCATTGAGTTTATCAAAGGACATCAATTTCTTTTTGACC 4603
Query 4694 AACTTCTTCGTGAAGACTTTACTCAAGCAGATGATTTATTGATGGAGCAAATTATTCTTG 4753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4604 AACTTCTTCGTGAAGACTTTACTCAAGCAGATGATTTATTGATGGAGCAAATTATTCTTG 4663
Query 4754 CAGTGGGAATATTGAGCAAGGTCTGGCCTTTTGAAGAGAACGATGGATATGGATTTGTTC 4813
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4664 CAGTGGGAATATTGAGCAAGGTCTGGCCTTTTGAAGAGAATGACGGATATGGATTTGTTC 4723
Query 4814 AAGGGCTATTTGATATGATGAGCAAGCTTTTCATCGCCTCCCCGATTAAATCGATATTAT 4873
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||
Sbjct 4724 AAGGGCTTTTTGATATGATGAGCAACCTTTTCATCGTCTCCCCCATTAAATTGATATCAT 4783
Query 4874 CGCAGGGATCAGAGCTCAAATTGTCTCAGTTGCGATTCAGCTTGACTTCTTACTTATATT 4933
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4784 CGCAGGTATCAGAGCTCAAATTGTCTCAGTTGCGATTCAGCTTGACTTCTTACTTATATT 4843
Query 4934 TTCTGGTGACCAAAAATTCTCTGAGGTTACAGGTTTCAGATGATTCTCTTGATAGTTCCA 4993
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4844 TTCTGGTGACCAAAAATTCTCTGAGGTTGCAGGTTTCAGATGATTCTCTTGATAGTTCCA 4903
Query 4994 CTAAACTACGCCAACCAACATTGCTGTTGCTTGCATCTCTTCTTTCGCATGTGACTGATT 5053
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4904 CTAAACTACGCCAACCAACGTTACTGTTGCTTGCATCTCTTCTTTCGCATGTGACTGATT 4963
Query 5054 CCCTCGAGAGAGCAGCAGAGAAGAAGTCCTTACTTCTTCATAAGATTAGAGACATAAACG 5113
|||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4964 CCCTCGAGAGAGCAGCTGAGAAAAAGTCATTACTTCTTCATAAGATTAGAGACATAAACG 5023
Query 5114 AGCTCTCAAGACAAGATGTAGATGCGATCATCAAGATCTGTGATTCCCAAGAATATGTCA 5173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5024 AGCTCTCAAGACAAGATGTAGATGCGATCATCAAGATATGTGATTGCCAAGAATATGTCA 5083
Query 5174 CACCGTCCGACAACATACATAAAAGGAGATACATAGCTATGGTTGAAATGTGCCAAATCG 5233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5084 CACCGTCCGACAACATACATAAAAGGAGATACATAGCTATGGTTGAAATGTGCCAAATCG 5143
Query 5234 TGGGTAACAGGGACCAGTTAATCACCTTGTTACTGCAACTTGCCGAGCATGTACTAAATA 5293
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5144 TGGGTAACAGGGACCAGTTAATCACCTTGTTACTACAACTTGCCGAGCATGTACTAAATA 5203
Query 5294 TTATCCTGATCCATCTCCAAGATAGATCCGTTAGTTCAAATGAAAGGGGATCATATGGTT 5353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5204 TTATCCTGATCCATCTCCAAGATAGATCCGTTAGTTCAAATGAAAGGGGATCATATGGTT 5263
Query 5354 CAAAATCCCATATACAACAGGAAGTTACAGATCTCTGTGGCAAATTGTCACCTACCATAG 5413
||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5264 CAAAATCCCATCTACAACAGGATGTTACAGATCTATGTGGCAAATTGTCACCTACCATAG 5323
Query 5414 ATAGGCTTGCATTACTGAATGAGGGAAAAGTAGGACATAACCTGAAGGTGTTCCAGAGAC 5473
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5324 AGAGGCTTGCATTACTGAATGAGGGAAAAGTAGGACATAACCTGAAGGTGTTCCAGAGAC 5383
Query 5474 TGGCAACGACTGTAAAAGAAATGGCCATCCAAAAGTGTGTATGA-AATAAGCTTCTCAAG 5532
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 5384 TGGCAACGACTGTAAAAGAAATGGCCATCCAAAAGTGTTTATGATAATAAGCTTCTCAAG 5443
Query 5533 AAATGTATTTTTGTGTGTCAAATGTCCAAATCT-AAATTTGTAGTATGAGTCTGTATAAC 5591
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||
Sbjct 5444 AAATGTATTTTTGTGTGTGAAATGTCCAAATCTGAAATT-GTAGTGCGGGTCTGTATAAC 5502
Query 5592 AAAATAGTAAATCCACATGATTTCAAATGATACTTTCTCTGAGACTC-TTGAGAAAAAAC 5650
||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |
Sbjct 5503 AAAATAGTAAATCCATATGAATTCAGATAATACTTTCTCTGAGG-TGATTGGGAAAAA-C 5560
Query 5651 TTTAAAAGCTCCAGCTTAATTTTAAAGT-TATGAAAGCCAAAA 5692
||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 5561 TTTAAAAGCTCCAACTTTATTTTAAAGTCT-TGAAAGCCAAAA 5602
Score = 1912 bits (1035), Expect = 0.0
Identities = 1095/1125 (97%), Gaps = 0/1125 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTGTCGCCGAAAGATTTAGTGGCGATAGTACACTCTTCGCTGCTCGGAACATCCCGG 60
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1 ATGGTGTCGCCGAAAGAGTTAGTGGCCATAGTACACTCTTCGCTGCTCGGAACGTCACGG 60
Query 61 CCAACTCCAACGCAGCGTATCGAACTCACTCATGCCATTCGCAACTCATTTCCCTCTCTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 61 CCAACTCCAACGCAGCGTATCGAACTCACTCATGCCATTCGCAACTCATTTTCCTCTATT 120
Query 121 CAGAACCTCCTCTCTTTCCCGCCTCCGAAGCCGTCGGACAGAGCGCAAGTTCAGTCCAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CAGAACCTCCTCTCTTTCCCGCCTCCGAAGCCGTCGGACAGAGCGCAAGTTCAGTCCAAA 180
Query 181 GAAATTCGACTCCCGGATTCGCTGCCAATATCTTTGGATGACCAAGATATCGCTATTAGC 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 181 GAAATTCGACTCCCGGATTCGCTGCCAATATCTTTGGATGACCAAGATGTCGCTATTAGC 240
Query 241 TTGAAACTGAGTGATGAGCTTCACCTAAATGAGATAGATTCTGTTCGTCTGCTTGTATCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 241 TTGAAACTGAGTGATGAGCTTCACCTAAATGAGATAGATTCTGTTCGCCTGCTTGTATCT 300
Query 301 TCGAATCAGGAGTGGGGCTTAATGGGACGAGACCCTCTTGAGATTCAACGGCTTGCAACT 360
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCAAATCAGGAGTGGGGCTTAATGGGACGGGACCCTCTTGAGATTCAACGGCTTGCAACT 360
Query 361 GGACTATGGTATACAGGGAGAAGAGATCTTACATCAACGCTATACACACTCCTGAGGGCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGACTATGGTATACAGGGAGAAGAGATCTTACATCAACGCTATACACACTCCTGAGGGCA 420
Query 421 GTTGTTCTGGACGAGGGGCTTGAACCTGATCTTATAGCTGACATTCAGGGACTCTTAGAA 480
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTTGTTCTGGACCAGGGGCTTGAACCTGATCTTATAGCTGACATTCAGGGACTCTTAGAA 480
Query 481 GAACTGATTGAAGCTGGGCTCAGACAACGGTTGATTACTCTTATAAAGGAACTCAATCGG 540
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAACTTATTAAAGCTGGGCTCAGACAACGGTTGATTACTCTTATAAAGGAACTCAATCGG 540
Query 541 GAGGATCCTACTGGACTGGGTGGGCCCTTATGCGAGCGATACCTTATTGACTCAAGAGGT 600
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CAGGATCCTACTGGATTGGGTGGGCCCTTATGCGAGCGATACCTTATTGACTCAAGAGGT 600
Query 601 GCTCTTGTTGAACGAAGAGCTGTTGTTCAGAGGGAAAGATTGATACTGGGACATTGCCTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCTCTTGTTGAACGAAGAGCTGTTGTTCAGAGGGAAAGACTGATACTGGGACATTGCCTT 660
Query 661 GTTCTTTCAATTTTGGTTGATAGACCTGGTTCGAAAGATGTGAAGGATATATACTATATT 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 661 GTTCTTTCAATTTTGGTTGATAGACCTGGTTCGAAAGATGTGAAGGATATATACTACGTT 720
Query 721 TTAAAAGATAATGCAGCTCAATTAACTGAAGGAAATGACACCATAAGTTCTCAGATTACT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTAAAAGATAATGCAGCTCAATTAACTGAAGGAAATGACACCATAAGTTCTCAGATTACT 780
Query 781 TTTAGTCTTCTGTTTTCTCTCATCATCACCTTCGTATCAGATGCAATCAGCAGACTATCT 840
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 781 TTTAGTCTTTTGTTTTCTCTCATCATCACCTTCGTATCAGATGCAATCAGTGGACTATCT 840
Query 841 GATAAGTCATCTATGATATCTCAAGATGCTTCATTTAGGACAGACTTTCAGGATATTGTC 900
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GATAAGTCATCTATGATATCTCAAGATGCTTCGTTTAGGACAGACTTTCAGGATATTGTT 900
Query 901 ATGGCTTCTGGCAGTGACCCCACTGCTGATGGCTTCATTGGTGGCATAAGGCTTGCCTGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATGGCTTCTGGCAGTGACCCCACTGCTGATGGCTTCATTGGTGGCATAAGGCTTGCCTGG 960
Query 961 GCTGTACATTTAATGCTGATACATGATGGAATATCGGGAATGGATACAATTTCCACTGCT 1020
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 961 GCTGTACATTTAATGCTCATACATGATGGAATATCTGGAATGGATACGATTTCCACTGCT 1020
Query 1021 TCAACAACAGATATGGGGCATATATGCTCCTGCCTGGAGTCCATCTTCTCAAAAAACGTG 1080
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 TCAACAAAAGATATGGGGCACATATGCTCCTGCCTGGAGTCCATCTTCTCAAAAAATGTG 1080
Query 1081 TTTCAATTTTTGCTGGATAATGTTCTTCGAACTGCAGCCTACCAG 1125
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TTTCAATTTTTGCTGGATAATGTTCTTCGAACTGCAGCCTACCAG 1125
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 215938669202
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5