BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G51300.1 Length=2857 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg495202 jgi|Araly1|495202|fgenesh2_kg.8__1018__AT5G51300.2 3840 0.0 Ahg475645 jgi|Araly1|475645|fgenesh2_kg.2__775__AT5G51300.3 3520 0.0 > Ahg495202 jgi|Araly1|495202|fgenesh2_kg.8__1018__AT5G51300.2 Length=2528 Score = 3840 bits (2079), Expect = 0.0 Identities = 2348/2473 (95%), Gaps = 38/2473 (2%) Strand=Plus/Plus Query 37 GCTATGGAGTCCGTCGAA---ATGAA---CAATCCCAATTCGCAAACCCTAGATCAACCT 90 |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||||| Sbjct 1 GCTATGGAGTCCGTCGAATTGATCAATCCCAATCCCGATTCACAAACCCTAGATCAACCT 60 Query 91 CCTCCTTCCTCCAACGGAGACACTGCTCCACTCGCATTGGATCATATGAATCCTCAGAAT 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CCTCCTTCCTCCAACGGAGACACTGCTCCACTCGCATCGGATCATATGAATCCTCAGAAT 120 Query 151 TCGGAGTCTGTGGCTTTAAACGGTTCTTCTACTCCTATCCCCGATACTAATGGTTCATCA 210 ||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||||| Sbjct 121 TCGGAATCTGTGACTTTAAAC-G-------------------G-TACTAATGGTTCATCA 159 Query 211 GCAAAGCCTGAGCTCTTACGTCCTTTGCTATCGGAGAACGGTGTTAGCAAGACGCTGAGT 270 |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 160 GCAAAGCCTGAGTTCTTGCGTCCTTTGCTATCGGAGAGCGGTGTTAGCAAGACGCTGAGT 219 Query 271 GGTAACGATAAGGATCAGTCTGGTGGAGAGGAAGAGACTACAAGCCGGAGGAAGCGTCGG 330 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 220 GGTAACGATAAGGATCAGTCTGGTGGAGAGGAAGAGACTACAAGCCGGAGGAAGCGTCGG 279 Query 331 AGTCGGTGGGATCCTCCGCCTTCTGAGTCCATTAATAACCCTAGCGCCGAAGGGGGTACT 390 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 280 AGCCGGTGGGATCCTCCGCCTTCTGAGTCGGGTAATAACCCTAGCGCTGAAGGGGGTACT 339 Query 391 GATTCCGGTACTGGGACTAGGAAGCGTAAGTCGAGATGGGCAGATGATGAGCCGAGGACG 450 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || Sbjct 340 GATTCCGGTACTGGAACTAGGAAGCGTAAGTCGAGATGGGCAGATGATGAGCCCAAGCCG 399 Query 451 CAAATTCAGTTACCTGACTTCATGAAGGATTTCACTGGAGGTATTGAGTTTGATCCTGAG 510 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 400 CACATTCAGTTACCTGATTTCATGAAGGATTTCACTGGAGGTATTGAGTTTGATCCTGAG 459 Query 511 ATTCAAGCTTTGAATAGTAGGTTACTTGAGATTAGTAGGATGTTGCAGTCTGGTATGCCT 570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 460 ATTCAAGCTTTGAATAGTAGGTTACTTGAGATTAGTAGGATGTTGCAGTCTGGTATGCCT 519 Query 571 TTGGATGATAGACCAGAAGGACAGAGGTCTCCTTCACCAGAGCCTGTGTATGATAACATG 630 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 520 TTGGATGATAGACCGGAAGGACAGAGGTCTCCTTCACCAGAGCCTGTGTATGATAACATG 579 Query 631 GGAATTAGGATCAACACTAGGGAGTATCGAGCGAGGGAGAGGTTGAATAGAGAAAGACAA 690 || |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 580 GGGATTAGGATTAACACTAGAGAGTATAGAGCAAGGGAGAGGTTGAATAGAGAAAGACAA 639 Query 691 GAAATTATTGCTCAGATTATCAAGAAGAATCCTGCTTTTAAACCTCCGGCAGATTATAGA 750 ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 640 GAAATTATTGCTCAGATTATCAAAAAGAATCCGGCTTTTAAACCTCCAGCAGATTATAGG 699 Query 751 CCTCCTAAGCTCCATAAGAAGCTTTTCATTCCAATGAAGGAGTTTCCTGGTTACAATTTT 810 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 700 CCTCCTAAGCTCCATAAGAAGCTTTTCATTCCAATGAAGGAGTTTCCTGGTTACAATTTT 759 Query 811 ATTGGTCTGATTATTGGTCCC-AGGGGTAATACTCAGAAGAGAATGGAGAGGGAGACTGG 869 ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 760 ATTGGTCTGATTATTGG-CCCTAGGGGTAATACTCAGAAGAGAATGGAGAGGGAGACAGG 818 Query 870 TGCAAAAATTGTAATTCGGGGTAAAGGGTCTGTAAAAGAAGGTAGGCATCAGCAGAAAAA 929 ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 819 TGCTAAAATTGTAATTCGGGGTAAAGGATCGGTTAAAGAAGGTAGGCATCAGCAGAAAAA 878 Query 930 GGATTTGAAATATGACCCTTCTGAGAATGAAGACTTGCATGTTTTAGTCGAGGCTGAGAC 989 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 879 GGATTTGAAATATGACCCTTCAGAGAATGAAGACTTGCATGTTTTAGTCGAGGCTGAGAC 938 Query 990 TCAGGAAGCTCTTGAAGCTGCTGCTGGTATGGTTGAAAAGCTAT-TGCAACCTGTTGATG 1048 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| Sbjct 939 TCAGGATGCTCTTGAAGCTGCTGCTGGTATGGTTGAGAAGCT-TCTGCAACCTGTTGATG 997 Query 1049 AAGTGCTCAACGAGCACAAGAGGCAACAGCTCAGGGAACTTGCAACCTTGAATGGGACAA 1108 ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 998 AAGTGTTGAACGAGCACAAGAGGCAACAGCTCAGGGAACTTGCTACCTTGAATGGGACAA 1057 Query 1109 TAAGGGATGAAGAATTCTGTAGACTGTGTGGTGAGCCAGGACATAGACAGTATGCATGTC 1168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1058 TAAGGGATGAAGAATTCTGTAGACTGTGTGGTGAGCCAGGACATAGACAGTATGCATGTC 1117 Query 1169 CTTCTCGTACGAATACCTTTAAGAGTGATGTTCTTTGCAAGATCTGTGGTGATGGTGGAC 1228 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1118 CGTCTCGTACCAATACCTTTAAGAGTGATGTTCTTTGCAAGATTTGTGGTGATGGTGGAC 1177 Query 1229 ACCCTACTATTGATTGCCCGGTGAAGGGTACTACTGGGAAGAAAATGGATGATGAATATC 1288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1178 ACCCTACTATTGATTGCCCGGTGAAGGGTACTACTGGGAAGAAAATGGATGATGAATATC 1237 Query 1289 AGAACTTCTTGGCAGAGTTAGGAGGAACTGTACCTGAATCTTCTCTCAAACAGAGTGCTA 1348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1238 AGAACTTCTTGGCAGAGTTAGGAGGAACTGTACCTGAATCTTCTCTCAAACAGAGTGCTA 1297 Query 1349 C-CTTAGCTCTTGGTCCGGGAAGTTCGGGAAGTAATCCTCCATGGGCTAATAATGCAGGG 1407 | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1298 CGCTG-GCTCTTGGTCCGGGAAGTTCGGGAAGTAATCCTCCATGGGCTAATAATGCAGGG 1356 Query 1408 AATGGTGCAAGTGCGCATCCTGGCTTAGGGTCAACTCCGACTAAACCCCCCTCCAAAGAA 1467 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1357 AATGGTGCAAGTGCGCATCCTGGCTTAGGGTCAACTCCGACCAAACCCCCCTCCAAAGAA 1416 Query 1468 TATGACGAAACAAATTTGTACATTGGGTTCTTACCTCCGATGCTGGAGGACGATGGTTTG 1527 ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1417 TATGATGAAACAAATCTGTACATTGGGTTCTTACCTCCGATGCTTGAGGACGATGGTTTG 1476 Query 1528 ATTAATCTCTTTTCATCCTTTGGTGAAATTGTGATGGCAAAGGTAATCAAGGACCGTGTG 1587 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1477 ATTAATCTGTTTTCATCCTTTGGTGAAATTGTGATGGCAAAGGTAATCAAGGACCGTGTG 1536 Query 1588 ACTGGGCTGAGCAAAGGCTATGGTTTTGTGAAGTACGCTGATGTACAGATGGCTAATACT 1647 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1537 ACTGGGCTGAGCAAAGGCTATGGTTTTGTGAAGTACGCTGATGTACAGATGGCCAATACT 1596 Query 1648 GCTGTTCAGGCAATGAATGGCTATCGTTTCGAAGGCCGAACACTCGCTGTCAGGATTGCA 1707 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1597 GCTGTTCAGGCAATGAATGGCTATCGATTCGAAGGCCGAACACTCGCTGTCAGGATTGCA 1656 Query 1708 GGCAAA-TCGCCACCGCCTATTGCACCTCCAGGACCTCCAGCTCCTCAACCACCAACTCA 1766 |||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1657 GGCAAAGT-GCCACCGCCTACTGCACCTCCAGGGCCTCCAGCTCCTCAACCACCAACTCA 1715 Query 1767 AGGTTATCCTCCCTCAAACCAGCCGCCTGGTGCCTATCCATCTCAACAGTATGCCACTGG 1826 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1716 AGGTTATCCTCCCTCAAACCAGCCACCAGGTGCCTATCCTTCTCAACAGTATGCCACTGG 1775 Query 1827 TGGTTATTCAACAGctccagttccttggggtcctcctgttccttcctattctccatatgc 1886 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1776 TGGTTATTCAACAGCTCCAGTTCCTTGGGGTCCTCCCGTTCCTTCCTATTCTCCATATGC 1835 Query 1887 tcttccccctcctcctcctGGTTCTTACCATCCTGTCCATGGTCAACATATGCCTCCTTA 1946 || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 1836 TCCTCCGCCTCCTCCTCCTGGTTCTTACCATCCTATCCATGGTCAACATATGTCACCTTA 1895 Query 1947 TGGAATGCAATACCCACCACCACCACCTCATGTGACACAAGCACCTCCACCTGGCACTAC 2006 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1896 TGGAATGCAATACCCACCACCACCACCTCATGTGACACAAGCACCTCCACCTGGCACTAC 1955 Query 2007 TCAAAACCCATCTTCTAGTGAACCCCAGCAAAGCTTCCCACCAGGAGTACAAGCTGATAG 2066 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1956 TCAAAACCCAGCTTCTAGTGAACCCCAGCAAAGCTTCCCACCAGGAGTACAAGCTGACAG 2015 Query 2067 TGGTGCTGCTACGTCGTCTATACCACCAAATGTCTATGGTAGCTCAGTCACGGCTATGCC 2126 |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2016 TGGTTCTGCTACGTC-TGTA--CCACCAAATGTCTATGGTAGCTCAGTCACGGCTATACC 2072 Query 2127 TGGACAGCCTCCATATATGAGTTATCCGTCTTACTACAATGCTGTTCCCCCTCCAACACC 2186 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2073 TGGACAGCCTCCATATATGAGTTATCAGTCTTACTACAATGCTGTTCCCCCTCCACCACC 2132 Query 2187 TCCTGCACCGGCCTCGTCTACTGATCATTCCCAAAACATGGGTAACATGCCATGGGCCAA 2246 ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2133 TCCAGCACCAGCCTCGTCTACTGATCATTCCCAAAACATGGGTAACATGCCATGGGCCAA 2192 Query 2247 CAATCCTTCTGTCTCAACACCTGATCACTCACAAGGTCTTGTTAATGCACCTTGGGCACC 2306 ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 2193 CAATCCTCCTGTCTCAACACCTGATCACTCGCAAGGTCCTGGTAATGCACCTTGGGCACC 2252 Query 2307 TAATCCTCCTATGCCACCCACTGTTGGCTATTCACAGAGCATGGGGAACGTACCCTGGGC 2366 || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2253 TACTCCTCCTATGCCGCCCACTGTTGGGTATTCACAGAGCATGGGGAACGTACCCTGGGC 2312 Query 2367 TCCCAAACCTCCAGTACAGCCTCCTGCAGAGAATCCATCCTCTGTTGGAGAGTCTGAGTA 2426 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 2313 TCCCAAACCTCCTGTACAGCCACCTGCAGAGAATCCATCCGCTGTTGGAGATTCTGAGTA 2372 Query 2427 TGAGAAGTTCATGGCTGAGATGAAGTAGCATGCGTGTTCTGATGAGAAACTCCTTAGTGG 2486 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2373 TGAGAAGTTCATGGCTGAGATGAAGTAGCATGTGTGTTCTGAGGAGAAACTCCTTAGTGG 2432 Query 2487 AGAGGTGTGATGT 2499 |||||| ||||| Sbjct 2433 AGAGGTAAGATGT 2445 > Ahg475645 jgi|Araly1|475645|fgenesh2_kg.2__775__AT5G51300.3 Length=2487 Score = 3520 bits (1906), Expect = 0.0 Identities = 2293/2466 (93%), Gaps = 82/2466 (3%) Strand=Plus/Plus Query 33 TTTTGCTATGGAGTCCGTCGAAATGAACAATCCCAAT------TCGCAAACCCTAGATCA 86 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1 TTTGGCTATGGAGTCCGTCGAATTGAACAATCCCAATCCCAAATCGCAAACCCTAGATCA 60 Query 87 ACCTCCTCCTTCCTCCAACGGAGACACTGCTCCACTCGCATTGGATCATATGAATCCTCA 146 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 61 ACCTCCTCCTTCCTCCAACGGAGACACTGCTCCACTCGCATCGGATCATATGAATCCTCA 120 Query 147 GAATTCGGAGTCTGTGGCTTTAAACGGTTCTTCTACTCCTATC-CCCGATACTAATGGTT 205 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 121 GAATTCGGATTCTGTGGCTTTAAACGGTTCTTCTACTCCTA-CACCCGATACTAATGGTT 179 Query 206 CATCAGCAAAGCCTGAGCTCTTACGTCCTTTGCTATCGGAGAACGGTGTTAGCAAGACGC 265 ||||||||||||||||| | | | |||| || | | || || | || Sbjct 180 CATCAGCAAAGCCTGAG----T---T-C-TTGC-GTC------C--T-TT-GCTA-TCG- 217 Query 266 TGAGTGGTAACGATAAGGATCAGTCTGGTGGAGAGGAAGAGACTACAAGCCGGAGGAAGC 325 || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| Sbjct 218 -GA---G-AACGATAAGGATCAGTCTGGTGGAGAGGAAGAAACTACGAGCAGGAGGAAGC 272 Query 326 GTCGGAGTCGGTGGGATCCTCCGCCTTCTGAGTCCATTAATAACCCTAGCGCCGAAGGGG 385 ||||||| |||||||||||| | | | || | | || ||||||| Sbjct 273 GTCGGAGCCGGTGGGATCCT----C--C---G-CC--T--T----CT------GAAGGGG 308 Query 386 GTACTGATTCCGGTA-CTGGGACTAGGAAGCGTAAGTCGAGATGGGCAGATGATGAGCCG 444 ||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 309 GTACTGATTCC-GAACCTGGAATTAGGAAGCGTAAGTCGCGATGGGCAGATGATGAGCCC 367 Query 445 AGGACGCAAATTCAGTTACCTGACTTCATGAAGGATTTCACTGGAGGTATTGAGTTTGAT 504 | | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 368 AAGCCGCAGATTCAGTTACCTGATTTCATCAAGGATTTCACTGGAGGTATTGAGTTCGAT 427 Query 505 CCTGAGATTCAAGCTTTGAATAGTAGGTTACTTGAGATTAGTAGGATGTTGCAGTCTGGT 564 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 428 CCTGAGATTCAGGCTTTGAATAGTAGGTTACTTGAGATTAGTAGGATGTTGCAGTCTGGT 487 Query 565 ATGCCTTTGGATGATAGACCAGAAGGACAGAGGTCTCCTTCACCAGAGCCTGTGTATGAT 624 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 488 ATGCCTTTGGATGATAGACCGGAAGGACAGAGGTCTCCTTCACCAGAGCCTGTGTATGAT 547 Query 625 AACATGGGAATTAGGATCAACACTAGGGAGTATCGAGCGAGGGAGAGGTTGAATAGAGAA 684 || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 548 AATATGGGAATTAGGATTAACACTAGAGAGTATAGAGCAAGGGAGAGGTTGAATAGAGAA 607 Query 685 AGACAAGAAATTATTGCTCAGATTATCAAGAAGAATCCTGCTTTTAAACCTCCGGCAGAT 744 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 608 AGACAAGAAATCATTGCTCAGATTATCAAAAAGAATCCGGCTTTTAAACCTCCAGCAGAT 667 Query 745 TATAGACCTCCTAAGCTCCATAAGAAGCTTTTCATTCCAATGAAGGAGTTTCCTGGTTAC 804 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 668 TATAGGCCTCCTAAGCTCCACAAGAAGCTTTTCATTCCAATGAAGGACTTTCCTGGTTAC 727 Query 805 AATTTTATTGGTCTGATTATTGGTCCCAGGGGTAATACTCAGAAGAGAATGGAGAGGGAG 864 |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 728 AATTTTATTGGTCTCATTATTGGCCCCAGAGGTAATACTCAGAAGAGAATGGAGAGGGAG 787 Query 865 ACTGGTGCAAAAATTGTAATTCGGGGTAAAGGGTCTGTAAAAGAAGGTAGGCATCAGCAG 924 || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 788 ACGGGTGCTAAAATTGTTATTCGGGGTAAAGGATCTGTAAAAGAAGGTAGGCATCAGCAG 847 Query 925 AAAAAGGATTTGAAATATGACCCTTCTGAGAATGAAGACTTGCATGTTTTAGTCGAGGCT 984 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 848 AAAAAGGATTTGAAATATGACCCTGCTGAGAATGAAGACTTGCATGTTTTAGTTGAGGCT 907 Query 985 GAGACTCAGGAAGCTCTTGAAGCTGCTGCTGGTATGGTTGAAAAGCTATTGCAACCTGTT 1044 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 908 GAGACTCAGGATGCTCTTGAAGCTGCTGCTGGTATGGTTGAGAAGCTTTTGCAACCTGTT 967 Query 1045 GATGAAGTGCTCAACGAGCACAAGAGGCAACAGCTCAGGGAACTTGCAACCTTGAATGGG 1104 ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 968 GATGAAGTGTTGAACGAGCACAAGAGGCAACAGCTCAGGGAACTTGCTACCTTGAATGGA 1027 Query 1105 ACAATAAGGGATGAAGAATTCTGTAGACTGTGTGGTGAGCCAGGACATAGACAGTATGCA 1164 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1028 ACAATAAGGGATGAAGAATTCTGTAGACTGTGTGGTGAGCCAGGACATAGACAGTATGCA 1087 Query 1165 TGTCCTTCTCGTACGAATACCTTTAAGAGTGATGTTCTTTGCAAGATCTGTGGTGATGGT 1224 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1088 TGTCCTTCTCGTACCAATACCTTTAAGAGTGATGTTCTTTGCAAGATTTGTGGTGATGGT 1147 Query 1225 GGACACCCTACTATTGATTGCCCGGTGAAGGGTACTACTGGGAAGAAAATGGATGATGAA 1284 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1148 GGACACCCTACTATTGATTGCCCGGTGAAGGGTACTACTGGGAAGAAAATGGATGATGAA 1207 Query 1285 TATCAGAACTTCTTGGCAGAGTTAGGAGGAACTGTACCTGAATCTTCTCTCAAACAGAGT 1344 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1208 TATCAGAACTTCTTAGCAGAGTTGGGAGGAACTGTACCTGAATCTTCTCTCAAACAGAGT 1267 Query 1345 GCTACCTTAGCTCTTGGTCCGGGAAGTTCGGGAAGTAATCCTCCATGGGCTAATAATGCA 1404 |||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1268 GCTACCCTGGCTCTTGGTCCGGGAAGT-----AA-T---CCTCCATGGGCTAATAATGCA 1318 Query 1405 GGGAATGGTGCAAGTGCGCATCCTGGCTTAGGGTCAACTCCGACTAAACCCCCCTCCAAA 1464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1319 GGGAATGGTGCAAGTGCGCATCCTGGCTTAGGGTCAACTCCGACCAAACCCCCCTCCAAA 1378 Query 1465 GAATATGACGAAACAAATTTGTACATTGGGTTCTTACCTCCGATGCTGGAGGACGATGGT 1524 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1379 GAATATGACGAAACAAATCTGTACATTGGGTTCTTACCTCCGATGCTTGAGGACGATGGT 1438 Query 1525 TTGATTAATCTCTTTTCATCCTTTGGTGAAATTGTGATGGCAAAGGTAATCAAGGACCGT 1584 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 TTGATTAATCTTTTTTCATCCTTCGGTGAAATTGTGATGGCAAAGGTAATCAAGGACCGT 1498 Query 1585 GTGACTGGGCTGAGCAAAGGCTATGGTTTTGTGAAGTACGCTGATGTACAGATGGCTAAT 1644 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1499 GTGACTGGGCTGAGCAAAGGCTATGGTTTCGTGAAGTACGCTGATGTGCAGATGGCTAAT 1558 Query 1645 ACTGCTGTTCAGGCAATGAATGGCTATCGTTTCGAAGGCCGAACACTCGCTGTCAGGATT 1704 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 ACTGCTGTTCAGGCAATGAATGGCTATCGGTTCGAAGGCCGAACACTCGCTGTCAGGATT 1618 Query 1705 GCAGGCAAATCGCCACCGCCTATTGCACCTCCAGGACCTCCAGCTCCTCAACCACCAACT 1764 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | || Sbjct 1619 GCAGGCAAATTGCCACCGCCTACTGCACCTCCAGGACCTCCAGC-----A-CCA--A-CT 1669 Query 1765 CAAGGTTATCCTCCCTCAAACCAGCCGCCTGGTGCCTATCCATCTCAACAGTATGCCACT 1824 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 1670 CAAGGTTATCCTCCCTCAAACCAGCCTCCTGGTGCCTATCCTTCTCAACAGTATGCAACT 1729 Query 1825 GGTGGTTATTCAACAGctccagttccttggggtcctcctgttccttcctattctccatat 1884 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1730 GGTGGTTATTCAACAGCTCCAGTTCCTTGGGGTCCTCCTGTTCCCTCCTATTCTCCATAT 1789 Query 1885 gctcttccccctcctcctcctGGTTCTTACCATCCTGTCCATGGTCAACATATGCCTCCT 1944 |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1790 GCTCCTCCCCCTCCACCTCCTGGTTCTTACCATCCTGTCCATGGTCAACATATGTCTCCT 1849 Query 1945 TATGGAATGCAATACCCACCACCACCACCTCATGTGACACAAGCACCTCCACCTGGCACT 2004 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1850 TATGGAATGCAATACCCACCACCACCACCTCATGTGACACAAGCACCTCCACCTGGCACT 1909 Query 2005 ACTCAAAACCCATCTTCTAGTGAACCCCAGCAAAGCTTCCCACCAGGAGTACAAGCTGAT 2064 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1910 ACTCAAAACCCATCTTCTAGTGAACCCCAGCAAAGCTTCCCACCAGGAGTACAAGCTGAC 1969 Query 2065 AGTGGTGCTGCTACGTCGTCTATACCACCAAATGTCTATGGTAGCTCAGTCACGGCTATG 2124 ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1970 AGTGGTGCTGCTACGTC-TGTA--CCACCAAATGTCTATGGTAGCTCAGTCACGGCTATG 2026 Query 2125 CCTGGACAGCCTCCATATATGAGTTATCCGTCTTACTACAATGCTGTTCCCCCTCCAACA 2184 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2027 CCTGGACAGCCTCCATATATGAGTTATACGTCTTACTACAATGCTGTTCCCCCTCCACCA 2086 Query 2185 CCTCCTGCACCGGCCTCGTCTACTGATCATTCCCAAAACATGGGTAACATGCCATGGGCC 2244 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2087 CCTCCAGCACCGGCCTCGTCTACTGATCATTCCCAAAACATGGGTAACATGCCATGGGCC 2146 Query 2245 AACAATCCTTCTGTCTCAACACCTGATCACTCACAAGGTCTTGTTAATGCACCTTGGGCA 2304 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct 2147 AACAATCCTCCTGTCTCAACACCTGATCACTCACAAGGTCTTGGTAATGCATCTTGGGCA 2206 Query 2305 CCTAATCCTCCTATGCCACCCACTGTTGGCTATTCACAGAGCATGGGGAACGTACCCTGG 2364 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2207 CCTAATCCTCCTATGCCGCCCACTGTTGGTTATTCACAGAGCATGGGGAACGTACCCTGG 2266 Query 2365 GCTCCCAAACCTCCAGTACAGCCTCCTGCAGAGAATCCATCCTCTGTTGGAGAGTCTGAG 2424 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct 2267 GCTCCCAAACCTCCAGTACAGCCCCCTGCAGAGAATCCATCCACTGTTGGAGATTCTGAG 2326 Query 2425 TATGAGAAGTTCATGGCTGAGATGAAGTAGCATGCGTGTTCTGATGAGAAACTCCTTAGT 2484 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2327 TATGAGAAGTTCATGGCTGAGATGAAGTAGCATGTGTGTTCTGATGAGAAACTCCGTAGT 2386 Query 2485 GGAGAG 2490 | |||| Sbjct 2387 GAAGAG 2392 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 107833483595 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5