BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G51300.1
Length=2857
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg495202 jgi|Araly1|495202|fgenesh2_kg.8__1018__AT5G51300.2 3840 0.0
Ahg475645 jgi|Araly1|475645|fgenesh2_kg.2__775__AT5G51300.3 3520 0.0
> Ahg495202 jgi|Araly1|495202|fgenesh2_kg.8__1018__AT5G51300.2
Length=2528
Score = 3840 bits (2079), Expect = 0.0
Identities = 2348/2473 (95%), Gaps = 38/2473 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 37 GCTATGGAGTCCGTCGAA---ATGAA---CAATCCCAATTCGCAAACCCTAGATCAACCT 90
|||||||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1 GCTATGGAGTCCGTCGAATTGATCAATCCCAATCCCGATTCACAAACCCTAGATCAACCT 60
Query 91 CCTCCTTCCTCCAACGGAGACACTGCTCCACTCGCATTGGATCATATGAATCCTCAGAAT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCTCCTTCCTCCAACGGAGACACTGCTCCACTCGCATCGGATCATATGAATCCTCAGAAT 120
Query 151 TCGGAGTCTGTGGCTTTAAACGGTTCTTCTACTCCTATCCCCGATACTAATGGTTCATCA 210
||||| |||||| |||||||| | | ||||||||||||||||
Sbjct 121 TCGGAATCTGTGACTTTAAAC-G-------------------G-TACTAATGGTTCATCA 159
Query 211 GCAAAGCCTGAGCTCTTACGTCCTTTGCTATCGGAGAACGGTGTTAGCAAGACGCTGAGT 270
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 160 GCAAAGCCTGAGTTCTTGCGTCCTTTGCTATCGGAGAGCGGTGTTAGCAAGACGCTGAGT 219
Query 271 GGTAACGATAAGGATCAGTCTGGTGGAGAGGAAGAGACTACAAGCCGGAGGAAGCGTCGG 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 GGTAACGATAAGGATCAGTCTGGTGGAGAGGAAGAGACTACAAGCCGGAGGAAGCGTCGG 279
Query 331 AGTCGGTGGGATCCTCCGCCTTCTGAGTCCATTAATAACCCTAGCGCCGAAGGGGGTACT 390
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 280 AGCCGGTGGGATCCTCCGCCTTCTGAGTCGGGTAATAACCCTAGCGCTGAAGGGGGTACT 339
Query 391 GATTCCGGTACTGGGACTAGGAAGCGTAAGTCGAGATGGGCAGATGATGAGCCGAGGACG 450
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||
Sbjct 340 GATTCCGGTACTGGAACTAGGAAGCGTAAGTCGAGATGGGCAGATGATGAGCCCAAGCCG 399
Query 451 CAAATTCAGTTACCTGACTTCATGAAGGATTTCACTGGAGGTATTGAGTTTGATCCTGAG 510
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 CACATTCAGTTACCTGATTTCATGAAGGATTTCACTGGAGGTATTGAGTTTGATCCTGAG 459
Query 511 ATTCAAGCTTTGAATAGTAGGTTACTTGAGATTAGTAGGATGTTGCAGTCTGGTATGCCT 570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 ATTCAAGCTTTGAATAGTAGGTTACTTGAGATTAGTAGGATGTTGCAGTCTGGTATGCCT 519
Query 571 TTGGATGATAGACCAGAAGGACAGAGGTCTCCTTCACCAGAGCCTGTGTATGATAACATG 630
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 TTGGATGATAGACCGGAAGGACAGAGGTCTCCTTCACCAGAGCCTGTGTATGATAACATG 579
Query 631 GGAATTAGGATCAACACTAGGGAGTATCGAGCGAGGGAGAGGTTGAATAGAGAAAGACAA 690
|| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 GGGATTAGGATTAACACTAGAGAGTATAGAGCAAGGGAGAGGTTGAATAGAGAAAGACAA 639
Query 691 GAAATTATTGCTCAGATTATCAAGAAGAATCCTGCTTTTAAACCTCCGGCAGATTATAGA 750
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 640 GAAATTATTGCTCAGATTATCAAAAAGAATCCGGCTTTTAAACCTCCAGCAGATTATAGG 699
Query 751 CCTCCTAAGCTCCATAAGAAGCTTTTCATTCCAATGAAGGAGTTTCCTGGTTACAATTTT 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 700 CCTCCTAAGCTCCATAAGAAGCTTTTCATTCCAATGAAGGAGTTTCCTGGTTACAATTTT 759
Query 811 ATTGGTCTGATTATTGGTCCC-AGGGGTAATACTCAGAAGAGAATGGAGAGGGAGACTGG 869
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 760 ATTGGTCTGATTATTGG-CCCTAGGGGTAATACTCAGAAGAGAATGGAGAGGGAGACAGG 818
Query 870 TGCAAAAATTGTAATTCGGGGTAAAGGGTCTGTAAAAGAAGGTAGGCATCAGCAGAAAAA 929
||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 TGCTAAAATTGTAATTCGGGGTAAAGGATCGGTTAAAGAAGGTAGGCATCAGCAGAAAAA 878
Query 930 GGATTTGAAATATGACCCTTCTGAGAATGAAGACTTGCATGTTTTAGTCGAGGCTGAGAC 989
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 GGATTTGAAATATGACCCTTCAGAGAATGAAGACTTGCATGTTTTAGTCGAGGCTGAGAC 938
Query 990 TCAGGAAGCTCTTGAAGCTGCTGCTGGTATGGTTGAAAAGCTAT-TGCAACCTGTTGATG 1048
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||
Sbjct 939 TCAGGATGCTCTTGAAGCTGCTGCTGGTATGGTTGAGAAGCT-TCTGCAACCTGTTGATG 997
Query 1049 AAGTGCTCAACGAGCACAAGAGGCAACAGCTCAGGGAACTTGCAACCTTGAATGGGACAA 1108
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 998 AAGTGTTGAACGAGCACAAGAGGCAACAGCTCAGGGAACTTGCTACCTTGAATGGGACAA 1057
Query 1109 TAAGGGATGAAGAATTCTGTAGACTGTGTGGTGAGCCAGGACATAGACAGTATGCATGTC 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 TAAGGGATGAAGAATTCTGTAGACTGTGTGGTGAGCCAGGACATAGACAGTATGCATGTC 1117
Query 1169 CTTCTCGTACGAATACCTTTAAGAGTGATGTTCTTTGCAAGATCTGTGGTGATGGTGGAC 1228
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1118 CGTCTCGTACCAATACCTTTAAGAGTGATGTTCTTTGCAAGATTTGTGGTGATGGTGGAC 1177
Query 1229 ACCCTACTATTGATTGCCCGGTGAAGGGTACTACTGGGAAGAAAATGGATGATGAATATC 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 ACCCTACTATTGATTGCCCGGTGAAGGGTACTACTGGGAAGAAAATGGATGATGAATATC 1237
Query 1289 AGAACTTCTTGGCAGAGTTAGGAGGAACTGTACCTGAATCTTCTCTCAAACAGAGTGCTA 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 AGAACTTCTTGGCAGAGTTAGGAGGAACTGTACCTGAATCTTCTCTCAAACAGAGTGCTA 1297
Query 1349 C-CTTAGCTCTTGGTCCGGGAAGTTCGGGAAGTAATCCTCCATGGGCTAATAATGCAGGG 1407
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 CGCTG-GCTCTTGGTCCGGGAAGTTCGGGAAGTAATCCTCCATGGGCTAATAATGCAGGG 1356
Query 1408 AATGGTGCAAGTGCGCATCCTGGCTTAGGGTCAACTCCGACTAAACCCCCCTCCAAAGAA 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1357 AATGGTGCAAGTGCGCATCCTGGCTTAGGGTCAACTCCGACCAAACCCCCCTCCAAAGAA 1416
Query 1468 TATGACGAAACAAATTTGTACATTGGGTTCTTACCTCCGATGCTGGAGGACGATGGTTTG 1527
||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1417 TATGATGAAACAAATCTGTACATTGGGTTCTTACCTCCGATGCTTGAGGACGATGGTTTG 1476
Query 1528 ATTAATCTCTTTTCATCCTTTGGTGAAATTGTGATGGCAAAGGTAATCAAGGACCGTGTG 1587
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 ATTAATCTGTTTTCATCCTTTGGTGAAATTGTGATGGCAAAGGTAATCAAGGACCGTGTG 1536
Query 1588 ACTGGGCTGAGCAAAGGCTATGGTTTTGTGAAGTACGCTGATGTACAGATGGCTAATACT 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1537 ACTGGGCTGAGCAAAGGCTATGGTTTTGTGAAGTACGCTGATGTACAGATGGCCAATACT 1596
Query 1648 GCTGTTCAGGCAATGAATGGCTATCGTTTCGAAGGCCGAACACTCGCTGTCAGGATTGCA 1707
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597 GCTGTTCAGGCAATGAATGGCTATCGATTCGAAGGCCGAACACTCGCTGTCAGGATTGCA 1656
Query 1708 GGCAAA-TCGCCACCGCCTATTGCACCTCCAGGACCTCCAGCTCCTCAACCACCAACTCA 1766
|||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657 GGCAAAGT-GCCACCGCCTACTGCACCTCCAGGGCCTCCAGCTCCTCAACCACCAACTCA 1715
Query 1767 AGGTTATCCTCCCTCAAACCAGCCGCCTGGTGCCTATCCATCTCAACAGTATGCCACTGG 1826
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 AGGTTATCCTCCCTCAAACCAGCCACCAGGTGCCTATCCTTCTCAACAGTATGCCACTGG 1775
Query 1827 TGGTTATTCAACAGctccagttccttggggtcctcctgttccttcctattctccatatgc 1886
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 TGGTTATTCAACAGCTCCAGTTCCTTGGGGTCCTCCCGTTCCTTCCTATTCTCCATATGC 1835
Query 1887 tcttccccctcctcctcctGGTTCTTACCATCCTGTCCATGGTCAACATATGCCTCCTTA 1946
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1836 TCCTCCGCCTCCTCCTCCTGGTTCTTACCATCCTATCCATGGTCAACATATGTCACCTTA 1895
Query 1947 TGGAATGCAATACCCACCACCACCACCTCATGTGACACAAGCACCTCCACCTGGCACTAC 2006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 TGGAATGCAATACCCACCACCACCACCTCATGTGACACAAGCACCTCCACCTGGCACTAC 1955
Query 2007 TCAAAACCCATCTTCTAGTGAACCCCAGCAAAGCTTCCCACCAGGAGTACAAGCTGATAG 2066
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1956 TCAAAACCCAGCTTCTAGTGAACCCCAGCAAAGCTTCCCACCAGGAGTACAAGCTGACAG 2015
Query 2067 TGGTGCTGCTACGTCGTCTATACCACCAAATGTCTATGGTAGCTCAGTCACGGCTATGCC 2126
|||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2016 TGGTTCTGCTACGTC-TGTA--CCACCAAATGTCTATGGTAGCTCAGTCACGGCTATACC 2072
Query 2127 TGGACAGCCTCCATATATGAGTTATCCGTCTTACTACAATGCTGTTCCCCCTCCAACACC 2186
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2073 TGGACAGCCTCCATATATGAGTTATCAGTCTTACTACAATGCTGTTCCCCCTCCACCACC 2132
Query 2187 TCCTGCACCGGCCTCGTCTACTGATCATTCCCAAAACATGGGTAACATGCCATGGGCCAA 2246
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2133 TCCAGCACCAGCCTCGTCTACTGATCATTCCCAAAACATGGGTAACATGCCATGGGCCAA 2192
Query 2247 CAATCCTTCTGTCTCAACACCTGATCACTCACAAGGTCTTGTTAATGCACCTTGGGCACC 2306
||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2193 CAATCCTCCTGTCTCAACACCTGATCACTCGCAAGGTCCTGGTAATGCACCTTGGGCACC 2252
Query 2307 TAATCCTCCTATGCCACCCACTGTTGGCTATTCACAGAGCATGGGGAACGTACCCTGGGC 2366
|| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TACTCCTCCTATGCCGCCCACTGTTGGGTATTCACAGAGCATGGGGAACGTACCCTGGGC 2312
Query 2367 TCCCAAACCTCCAGTACAGCCTCCTGCAGAGAATCCATCCTCTGTTGGAGAGTCTGAGTA 2426
|||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 2313 TCCCAAACCTCCTGTACAGCCACCTGCAGAGAATCCATCCGCTGTTGGAGATTCTGAGTA 2372
Query 2427 TGAGAAGTTCATGGCTGAGATGAAGTAGCATGCGTGTTCTGATGAGAAACTCCTTAGTGG 2486
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2373 TGAGAAGTTCATGGCTGAGATGAAGTAGCATGTGTGTTCTGAGGAGAAACTCCTTAGTGG 2432
Query 2487 AGAGGTGTGATGT 2499
|||||| |||||
Sbjct 2433 AGAGGTAAGATGT 2445
> Ahg475645 jgi|Araly1|475645|fgenesh2_kg.2__775__AT5G51300.3
Length=2487
Score = 3520 bits (1906), Expect = 0.0
Identities = 2293/2466 (93%), Gaps = 82/2466 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 33 TTTTGCTATGGAGTCCGTCGAAATGAACAATCCCAAT------TCGCAAACCCTAGATCA 86
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTGGCTATGGAGTCCGTCGAATTGAACAATCCCAATCCCAAATCGCAAACCCTAGATCA 60
Query 87 ACCTCCTCCTTCCTCCAACGGAGACACTGCTCCACTCGCATTGGATCATATGAATCCTCA 146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACCTCCTCCTTCCTCCAACGGAGACACTGCTCCACTCGCATCGGATCATATGAATCCTCA 120
Query 147 GAATTCGGAGTCTGTGGCTTTAAACGGTTCTTCTACTCCTATC-CCCGATACTAATGGTT 205
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 121 GAATTCGGATTCTGTGGCTTTAAACGGTTCTTCTACTCCTA-CACCCGATACTAATGGTT 179
Query 206 CATCAGCAAAGCCTGAGCTCTTACGTCCTTTGCTATCGGAGAACGGTGTTAGCAAGACGC 265
||||||||||||||||| | | | |||| || | | || || | ||
Sbjct 180 CATCAGCAAAGCCTGAG----T---T-C-TTGC-GTC------C--T-TT-GCTA-TCG- 217
Query 266 TGAGTGGTAACGATAAGGATCAGTCTGGTGGAGAGGAAGAGACTACAAGCCGGAGGAAGC 325
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||
Sbjct 218 -GA---G-AACGATAAGGATCAGTCTGGTGGAGAGGAAGAAACTACGAGCAGGAGGAAGC 272
Query 326 GTCGGAGTCGGTGGGATCCTCCGCCTTCTGAGTCCATTAATAACCCTAGCGCCGAAGGGG 385
||||||| |||||||||||| | | | || | | || |||||||
Sbjct 273 GTCGGAGCCGGTGGGATCCT----C--C---G-CC--T--T----CT------GAAGGGG 308
Query 386 GTACTGATTCCGGTA-CTGGGACTAGGAAGCGTAAGTCGAGATGGGCAGATGATGAGCCG 444
||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 309 GTACTGATTCC-GAACCTGGAATTAGGAAGCGTAAGTCGCGATGGGCAGATGATGAGCCC 367
Query 445 AGGACGCAAATTCAGTTACCTGACTTCATGAAGGATTTCACTGGAGGTATTGAGTTTGAT 504
| | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 368 AAGCCGCAGATTCAGTTACCTGATTTCATCAAGGATTTCACTGGAGGTATTGAGTTCGAT 427
Query 505 CCTGAGATTCAAGCTTTGAATAGTAGGTTACTTGAGATTAGTAGGATGTTGCAGTCTGGT 564
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 CCTGAGATTCAGGCTTTGAATAGTAGGTTACTTGAGATTAGTAGGATGTTGCAGTCTGGT 487
Query 565 ATGCCTTTGGATGATAGACCAGAAGGACAGAGGTCTCCTTCACCAGAGCCTGTGTATGAT 624
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 ATGCCTTTGGATGATAGACCGGAAGGACAGAGGTCTCCTTCACCAGAGCCTGTGTATGAT 547
Query 625 AACATGGGAATTAGGATCAACACTAGGGAGTATCGAGCGAGGGAGAGGTTGAATAGAGAA 684
|| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 548 AATATGGGAATTAGGATTAACACTAGAGAGTATAGAGCAAGGGAGAGGTTGAATAGAGAA 607
Query 685 AGACAAGAAATTATTGCTCAGATTATCAAGAAGAATCCTGCTTTTAAACCTCCGGCAGAT 744
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 608 AGACAAGAAATCATTGCTCAGATTATCAAAAAGAATCCGGCTTTTAAACCTCCAGCAGAT 667
Query 745 TATAGACCTCCTAAGCTCCATAAGAAGCTTTTCATTCCAATGAAGGAGTTTCCTGGTTAC 804
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 668 TATAGGCCTCCTAAGCTCCACAAGAAGCTTTTCATTCCAATGAAGGACTTTCCTGGTTAC 727
Query 805 AATTTTATTGGTCTGATTATTGGTCCCAGGGGTAATACTCAGAAGAGAATGGAGAGGGAG 864
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 AATTTTATTGGTCTCATTATTGGCCCCAGAGGTAATACTCAGAAGAGAATGGAGAGGGAG 787
Query 865 ACTGGTGCAAAAATTGTAATTCGGGGTAAAGGGTCTGTAAAAGAAGGTAGGCATCAGCAG 924
|| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 ACGGGTGCTAAAATTGTTATTCGGGGTAAAGGATCTGTAAAAGAAGGTAGGCATCAGCAG 847
Query 925 AAAAAGGATTTGAAATATGACCCTTCTGAGAATGAAGACTTGCATGTTTTAGTCGAGGCT 984
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 848 AAAAAGGATTTGAAATATGACCCTGCTGAGAATGAAGACTTGCATGTTTTAGTTGAGGCT 907
Query 985 GAGACTCAGGAAGCTCTTGAAGCTGCTGCTGGTATGGTTGAAAAGCTATTGCAACCTGTT 1044
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 908 GAGACTCAGGATGCTCTTGAAGCTGCTGCTGGTATGGTTGAGAAGCTTTTGCAACCTGTT 967
Query 1045 GATGAAGTGCTCAACGAGCACAAGAGGCAACAGCTCAGGGAACTTGCAACCTTGAATGGG 1104
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 968 GATGAAGTGTTGAACGAGCACAAGAGGCAACAGCTCAGGGAACTTGCTACCTTGAATGGA 1027
Query 1105 ACAATAAGGGATGAAGAATTCTGTAGACTGTGTGGTGAGCCAGGACATAGACAGTATGCA 1164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 ACAATAAGGGATGAAGAATTCTGTAGACTGTGTGGTGAGCCAGGACATAGACAGTATGCA 1087
Query 1165 TGTCCTTCTCGTACGAATACCTTTAAGAGTGATGTTCTTTGCAAGATCTGTGGTGATGGT 1224
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1088 TGTCCTTCTCGTACCAATACCTTTAAGAGTGATGTTCTTTGCAAGATTTGTGGTGATGGT 1147
Query 1225 GGACACCCTACTATTGATTGCCCGGTGAAGGGTACTACTGGGAAGAAAATGGATGATGAA 1284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148 GGACACCCTACTATTGATTGCCCGGTGAAGGGTACTACTGGGAAGAAAATGGATGATGAA 1207
Query 1285 TATCAGAACTTCTTGGCAGAGTTAGGAGGAACTGTACCTGAATCTTCTCTCAAACAGAGT 1344
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208 TATCAGAACTTCTTAGCAGAGTTGGGAGGAACTGTACCTGAATCTTCTCTCAAACAGAGT 1267
Query 1345 GCTACCTTAGCTCTTGGTCCGGGAAGTTCGGGAAGTAATCCTCCATGGGCTAATAATGCA 1404
|||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1268 GCTACCCTGGCTCTTGGTCCGGGAAGT-----AA-T---CCTCCATGGGCTAATAATGCA 1318
Query 1405 GGGAATGGTGCAAGTGCGCATCCTGGCTTAGGGTCAACTCCGACTAAACCCCCCTCCAAA 1464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1319 GGGAATGGTGCAAGTGCGCATCCTGGCTTAGGGTCAACTCCGACCAAACCCCCCTCCAAA 1378
Query 1465 GAATATGACGAAACAAATTTGTACATTGGGTTCTTACCTCCGATGCTGGAGGACGATGGT 1524
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1379 GAATATGACGAAACAAATCTGTACATTGGGTTCTTACCTCCGATGCTTGAGGACGATGGT 1438
Query 1525 TTGATTAATCTCTTTTCATCCTTTGGTGAAATTGTGATGGCAAAGGTAATCAAGGACCGT 1584
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 TTGATTAATCTTTTTTCATCCTTCGGTGAAATTGTGATGGCAAAGGTAATCAAGGACCGT 1498
Query 1585 GTGACTGGGCTGAGCAAAGGCTATGGTTTTGTGAAGTACGCTGATGTACAGATGGCTAAT 1644
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1499 GTGACTGGGCTGAGCAAAGGCTATGGTTTCGTGAAGTACGCTGATGTGCAGATGGCTAAT 1558
Query 1645 ACTGCTGTTCAGGCAATGAATGGCTATCGTTTCGAAGGCCGAACACTCGCTGTCAGGATT 1704
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 ACTGCTGTTCAGGCAATGAATGGCTATCGGTTCGAAGGCCGAACACTCGCTGTCAGGATT 1618
Query 1705 GCAGGCAAATCGCCACCGCCTATTGCACCTCCAGGACCTCCAGCTCCTCAACCACCAACT 1764
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | ||
Sbjct 1619 GCAGGCAAATTGCCACCGCCTACTGCACCTCCAGGACCTCCAGC-----A-CCA--A-CT 1669
Query 1765 CAAGGTTATCCTCCCTCAAACCAGCCGCCTGGTGCCTATCCATCTCAACAGTATGCCACT 1824
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1670 CAAGGTTATCCTCCCTCAAACCAGCCTCCTGGTGCCTATCCTTCTCAACAGTATGCAACT 1729
Query 1825 GGTGGTTATTCAACAGctccagttccttggggtcctcctgttccttcctattctccatat 1884
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1730 GGTGGTTATTCAACAGCTCCAGTTCCTTGGGGTCCTCCTGTTCCCTCCTATTCTCCATAT 1789
Query 1885 gctcttccccctcctcctcctGGTTCTTACCATCCTGTCCATGGTCAACATATGCCTCCT 1944
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1790 GCTCCTCCCCCTCCACCTCCTGGTTCTTACCATCCTGTCCATGGTCAACATATGTCTCCT 1849
Query 1945 TATGGAATGCAATACCCACCACCACCACCTCATGTGACACAAGCACCTCCACCTGGCACT 2004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 TATGGAATGCAATACCCACCACCACCACCTCATGTGACACAAGCACCTCCACCTGGCACT 1909
Query 2005 ACTCAAAACCCATCTTCTAGTGAACCCCAGCAAAGCTTCCCACCAGGAGTACAAGCTGAT 2064
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 ACTCAAAACCCATCTTCTAGTGAACCCCAGCAAAGCTTCCCACCAGGAGTACAAGCTGAC 1969
Query 2065 AGTGGTGCTGCTACGTCGTCTATACCACCAAATGTCTATGGTAGCTCAGTCACGGCTATG 2124
||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 AGTGGTGCTGCTACGTC-TGTA--CCACCAAATGTCTATGGTAGCTCAGTCACGGCTATG 2026
Query 2125 CCTGGACAGCCTCCATATATGAGTTATCCGTCTTACTACAATGCTGTTCCCCCTCCAACA 2184
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2027 CCTGGACAGCCTCCATATATGAGTTATACGTCTTACTACAATGCTGTTCCCCCTCCACCA 2086
Query 2185 CCTCCTGCACCGGCCTCGTCTACTGATCATTCCCAAAACATGGGTAACATGCCATGGGCC 2244
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 CCTCCAGCACCGGCCTCGTCTACTGATCATTCCCAAAACATGGGTAACATGCCATGGGCC 2146
Query 2245 AACAATCCTTCTGTCTCAACACCTGATCACTCACAAGGTCTTGTTAATGCACCTTGGGCA 2304
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2147 AACAATCCTCCTGTCTCAACACCTGATCACTCACAAGGTCTTGGTAATGCATCTTGGGCA 2206
Query 2305 CCTAATCCTCCTATGCCACCCACTGTTGGCTATTCACAGAGCATGGGGAACGTACCCTGG 2364
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2207 CCTAATCCTCCTATGCCGCCCACTGTTGGTTATTCACAGAGCATGGGGAACGTACCCTGG 2266
Query 2365 GCTCCCAAACCTCCAGTACAGCCTCCTGCAGAGAATCCATCCTCTGTTGGAGAGTCTGAG 2424
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2267 GCTCCCAAACCTCCAGTACAGCCCCCTGCAGAGAATCCATCCACTGTTGGAGATTCTGAG 2326
Query 2425 TATGAGAAGTTCATGGCTGAGATGAAGTAGCATGCGTGTTCTGATGAGAAACTCCTTAGT 2484
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2327 TATGAGAAGTTCATGGCTGAGATGAAGTAGCATGTGTGTTCTGATGAGAAACTCCGTAGT 2386
Query 2485 GGAGAG 2490
| ||||
Sbjct 2387 GAAGAG 2392
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 107833483595
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5