BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G52290.1
Length=4785
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg949785 jgi|Araly1|949785|scaffold_801672.1 6562 0.0
Ahg497372 jgi|Araly1|497372|fgenesh2_kg.271__2__AT5G52290.1 6551 0.0
> Ahg949785 jgi|Araly1|949785|scaffold_801672.1
Length=4786
Score = 6562 bits (3553), Expect = 0.0
Identities = 4107/4372 (94%), Gaps = 48/4372 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 456 GGTTAAATATGAGGGGTCAGATATTATCCTGCAGAACTCAAAGGACATTCA--AGAGCAG 513
||||||||||| | | ||||| |||| | ||||||||||| ||||| || | || |
Sbjct 401 GGTTAAATATGTTGAATTAGATACTATCTTACAGAACTCAAATGACATCCACCAAAG--G 458
Query 514 ATTTATTCTGTTGATTACATTCCTTCTGATTACTTTACAGAGAACAACACTTCTGTAGCA 573
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 459 ATTTATTCTGTTGATTACATTTCTTCTGATTACTTCACAGAGAACAATACTTCGGTAGCA 518
Query 574 GAAAATGAATGCTTC-CGCAAGATTCAACCATGGTTCAAAGATGCCAGATTTCCCCTTCT 632
|||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAAATGAATGC-TCTAGCAAGAATCAACCATGGTTCAAAGATGCCAGATTTCCCCTTCT 577
Query 633 AGAAGTGGATGAAGTAAACTTGAGCGAACTATCAAGCTTATCTGTGCTTGATAAAGTATT 692
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 578 AGAAGTGGATGAAGTAAACTTGAGAGAACTATCGAGCTTATCTACGCTTGATAAAGTATT 637
Query 693 TACTGTTCTTGAGACGATTGAACCCCAAGACACTAATGCAGGGAGTTCTCTCATTATCAA 752
|||||||||||| || |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 638 TACTGTTCTTGAAACAATTGAACCCCAAGATAAGAACGCAGCGAGTTCTCTCATTATCAA 697
Query 753 TTCTAAGGAGCTTATAGGCTCAAAGGATTATGATCTATTGGATGTACTCTCTACGGATTG 812
||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 698 TTCTAAGGAGCTTATAGGCTCTAAGGGTTATGATCTATTGGATATCCTCTCTACGGATTG 757
Query 813 CTATTTGAACAAGAGTGGCCAATCTGATGTGGTACCAGAGGATGAATTTTCTGAAATGGA 872
|||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 758 CTATTTGAACAAAAGTGGTCAATCTGATGTGGTGCCAGAGGATGAATTTTCTGAAGTGGA 817
Query 873 TATAGTGACTATCCTGGAAATATCAAATGCTGAGG--AA-------TTT------CAGGG 917
| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||
Sbjct 818 TTTAGTGAATATCCTGGAAATATCAAATGCTGAGGAAAACTTTCTGTTTGAACAACAAGG 877
Query 918 AAAGGTGGCTGTACCAGTAACTTATGAGGAATTCCAGATCCTGGATGTGGATATCTCTGA 977
|||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 878 AAAGCTGGCTCTCCCAGTAACTTTTGAGGAATTTCAGATCCTGGATGTGGAAATATCTGA 937
Query 978 TGTTTTTGATATCTTCCTTTGTCTTCAAAAAGCCATTGAACCAGAAATCTGTTACGGTAT 1037
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 938 TGTTTTTGATATCTTCCTTTGTCTTCTAAAAGCCATTGAACCAGAAATATGTTATGGGAT 997
Query 1038 GTTCAGTAAAGAGATGAACTTCAAGGATTTCGATGAATTAGTTGTCAGTTCCGAACTTGC 1097
||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 998 GTTTAGTAAAGAGATGAACTTCAAGAATTTCGATGAATTAGTAGTCAGTTCCGAACTTGC 1057
Query 1098 CTTCACAGATGATGCCTTCAAGTCTTTGCCTACTCCTATTTTACATGATTATGAGATGAC 1157
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 CTTCACAGATGATGCCTTCAAGTCTCTGCCTACTCCTATTTTACATGATTATGAGATGAC 1117
Query 1158 AAGATCTCTGGAGCTCATTTATGAGGATGTTTTGTCAAAGATCAAGCCTCAATCCTTGTC 1217
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118 AAGATCTCTGGATCTCATTTATGAGGATGTTTTGTCAAAGATCAAGCCTCAATCCTTGTC 1177
Query 1218 TGCCTCAAATGACATATACTTGCCGTGGAACCTTCTTGAGGAAAGAAACCACAACCATTG 1277
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 TGCTTCAAATGACATATACTTGCCCTGGAACCTTCTTGAGGAAAGAAACCACAACCATTG 1237
Query 1278 TGATTATCCGTTTGAAGAAATAGTTACATTCAACATTGATTATAACTGGGAAGCTTCAGA 1337
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||
Sbjct 1238 TGATTATCCGTTTGAAGAAATAGTTACACTCAACATTGATTTTAAGTGGGAATCTTCAGA 1297
Query 1338 AGGAGACAAATGGGTTTATGATTTCATTTTCTCTGAAGATGCTTTCTGCGAGCCACTTGT 1397
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1298 AGGAGACAAATGGGTTTATGATTTTATATTCTCTGAAGATGCTTTCAGCGAGCCACTTGT 1357
Query 1398 AGAGAAATGCACTGAACCTTTCTATGGTATATCTAACCTTGATGAGCATGCTCCTGTTAA 1457
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 AGAGAAATGCACTGAACCTTTCTATGGTATATCTACCCTTGATGAGCATGCTCCTGTTAA 1417
Query 1458 TACTTCGCATGGGTTATTGGAAAACCCTTTCCAAAAAACAGGAGCAAGGGATTGTGCAGT 1517
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 1418 TACTTCTCATGGGTTATTGGAAAACCTTTTCCAAAAAACAGGAGCCAGGGATTGTGGAGT 1477
Query 1518 GGATGATAATGCTAAGAAGGCTACGCTGTTGTTCAAATCAATGTCTGCTTTTGATGACTT 1577
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1478 GGATGATAATGCTAAGAAGGCTACGCTGTTGTTCAAATCAATGTCTGCGTTTGATGACTT 1537
Query 1578 AACCTTTTTCATGGATCCGAAGAAGGCTGTGATTGAAGATAATCTCGAGTCTAGAGTCGA 1637
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1538 AACCTTTTTCATGGATCCTCAGAAGGCTGTGACTGAAGATAATCTCGGGTCTAGAGTCGA 1597
Query 1638 AGCTGCTAAGACTACCAACCATAAATGTATGTCTATTGACTCGAAGGCTTCATGTAGATC 1697
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1598 AGCTGCTAAGACGGCCAACCATAAATTTATGTCTATTGACTCGAAGGCTTCATGTATATC 1657
Query 1698 TGGTGGTATGCACCCAAACCCGAAGACAGAGGAAATGATACTTCACAGTGTGCGCCCTTC 1757
|||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1658 TGGTGGCATGCACCCAAACCTGAAGACGGAGGAAATGATACTTCACAGTGTGCGCCCTTC 1717
Query 1758 AGAAAATATTCAGGCTCTTGTTGGGGAATTTGTGAAGAGCTATTTAACTCTTGTGAAGGA 1817
||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1718 AGAAAATATTCTGGTTCTTGTTGGGGACTTTGTGAAGAGCTATTTAACTCTTGTGAAGGA 1777
Query 1818 TGAATCAGAGAATTTATCAGAAGATAAACTTAAGTTACTCAGCATATCTAAAGGAAAGCT 1877
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1778 TGAATCAGAGAATTTATCAGAAGATAGACTTAAGTTACTCAGCATATCTAAAGGAAAGCT 1837
Query 1878 TATTGACTGCATAAGAAAGGCAAATGTCCACAAAACACAGTTGGCGGATGATAAGACTTT 1937
||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 TATTGACTGCATAAGAAAGGCAAATGTCCGCAACACGCAGTTGGCGGATGATAAGACTTT 1897
Query 1938 CACGTTTGCATTACTATTAGCAATTAAACAGATGACATGGTATATGTGTTTCTTCGGTAT 1997
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898 CACGTTTGCATTACTACTAGCAATTAAACAGATGACATGGTATATGTGTTTCTTCGGTAT 1957
Query 1998 CCATGTGGCATATATCTATCTTAACAAGGTATGTCGAAGCTCAAATCCCATGAAGATAGG 2057
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1958 CCATGTGGCATATCTCTATCTTAACAAGTTATGTCGAAGCTCAAATCCCATGAAGCTAGG 2017
Query 2058 ATTGCACACCCTCTACTCAGCAGTTGAAACAGAACACAAATCAGATGAGACAGACATCAC 2117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2018 ATTGCACACCCTCTACTCAGCAGTTGAAACAGAACACAAATCAGATGAGACAGACGTCAC 2077
Query 2118 AAGATCACATCCATCACTAGCTGTTATCCAGGGGATTTTACAGTCAGAATTTGCCCGGGG 2177
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2078 AAGATCACATCCATCACTAGCTGTTATCCAGGGGATTTTACATTCAGAATTTGCCCGGGG 2137
Query 2178 GAACTCCAAAGCATTACTTTTGGCTGAGAAAGTGTTTTGGTCCTCGCTGAAGAGGCTACT 2237
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138 GAACTCCAAAGCATTACTTTTGGCTGAGAAAGTTTTTTGGTCCTCGCTGAAGAGGCTACT 2197
Query 2238 GATGTCCATGGGGTTATCTTACAATGACCTCAACAGTCCCTCCCCAAGTGGAAATCGACC 2297
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2198 GATGTCCATGGGTTTATCTTACAATGAGCTCAACAGTCCCTCCCCAAGTGAAAATCGACC 2257
Query 2298 AAATGTTCATGAAGCCA-------T--------AGAACTTGGTTTCCTGCCGATTTCAGA 2342
||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2258 AAATGTTCATGAAGCCACGGGGTTTAAAACCGCAGAACGTGGTTTCCTGCCGATTTCAGA 2317
Query 2343 CTGTCTAATTATCTCTTACGAGCAAATTTCTCCATCTTTTCCTGTGGAGAATTTCAGCGT 2402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318 CTGTCTAATTATCTCTTACGAGCAAATTTCTCCATCTTTTCCTGTGGAGAATTTCAGCGT 2377
Query 2403 CATTGTAGAATATGGAGGTCCAAATGCCTCGCCCAGATATTCTTTTCCTTCAAAGTTGGA 2462
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||
Sbjct 2378 CATTGTAGAATATGGCGGTCCAAATGCCTCGCCCAAATTTTCTTTTCCTTCTAAGTTGGA 2437
Query 2463 TTCCTTTCCTTCCTTTCATTTCATAAAAGTGGAGCTGGATATGCCCAGTGCATGCGGGCA 2522
|||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2438 TTCCTTTCCTGACTTCCATTTCATAAAAGTTGAGATGGATATGTCCAGTGCATGCGGCCA 2497
Query 2523 ACTCTGTGCAGGTGTTACAGTACCTTATAGTCTCAAAATGATAAAGGGAGACGAAGTTGA 2582
||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 2498 ACTGTGTGCAGGTGTCAAAGTACCTTATAGTCTCAAAATGATAAAGGAAGATGAAGTTGA 2557
Query 2583 GACGAAAACTGGGTGGTTGGAAGAAGTGTTGAACTTTGTTCCACTTGAAAAAGTGTGTTA 2642
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2558 GACGAAAACTGGCTGGTTGGAAGAAGTGTTGAACTTTGTTCCACTTGAAAGTGTGTGTTA 2617
Query 2643 TGCAGGATCTTCCGAAACCACAAATGAATCTGAATTTATCTCCATGCCTCAAGAATCTGA 2702
|||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2618 TGCAGGATCTTCAGTAACCACAAATGAATCTGAATATATCTCCATGCCTCAAGAATCTGA 2677
Query 2703 AAGAAAACGTGGGATAATTGAAC-AGG-G-TCTCTCTGACCAAAGATCTGTGATTGTTGT 2759
||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2678 AAGAAAACGTGGGATAATTGAACAAGGAGTTCTCTCTGACCAAAGATCTGTGATTGTTGT 2737
Query 2760 GAACACAAAAACTGTCGATAAGGAGATGATCATATCCAGAAGAAGTACATACCAGAAGGT 2819
||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 GAATTCAAAAACTGTTGATAAGGAGATGATCATATCCAGAAGAAGTACATACCAGAAGGT 2797
Query 2820 GTTAGCAATGGAAAAAGAAGGAGTGCAAGTTGTGGAGCGCGATTCAGATCTACCTGTGGA 2879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 GTTAGCAATGGAAAAAGAAGGAGTGCAAGTTGTGGAGCGCGATTCAGATCTACCTGTGGA 2857
Query 2880 CCTGATGTTAAGTCCTGCAGTTTGCCTACTCTGGTATGATAGTGAAACTGTTAGTAAGAA 2939
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2858 CCTGATGCTAAGTCCTGCAGTTTGCCTACTCTGGTATGATTGTGAAACTGTTAGTAAGAA 2917
Query 2940 GTCGGCTGCAACTATTGGTACTTCCTCAAGTTCACTTTCATGGATTGGAGATATCGCAAC 2999
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2918 GTCGGCTGCAACTATTGGTACTTCCTCAAGCTCACTTTCATGGATTGGAGATATCGCAAC 2977
Query 3000 TAATGTTTTGACGTCATTGAGTTTCAGTTTCAGCACTTGCATTATGGTTTTTGAGGGGGA 3059
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2978 CAATGTTTTGACGTCATTGAGTTTCAGTTTCAGCACCTGCATTATGGTTTTTGAGGGGGA 3037
Query 3060 ACCCGCCTTCCTGGCTGCCGTAATGGACTCCTCTGATGAACTGTATGCAGCAGCTGGTAG 3119
||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3038 ACCCGCCTTTCTGGCTACAATAATGGACTCCTCTGATGAACTGTATGTAGCAGCTGGTAG 3097
Query 3120 CCTAGGAATCAGTTTACAGATGTTTTGCTCATCGTCAGCTAATCTCACGGATGAAATTAT 3179
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3098 CCTGGGAATCAGTTTACAGATGTTTTGCTCATCGTCAGCTGATTTCACGGATGAAATTAT 3157
Query 3180 ATTGAAGTGTATCAAATCTTCTGTTAAGTTGTCCAAACTCCATGTCAAAATGCCCGAGTC 3239
||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3158 ATTGAGGTGTATCAAGTCGTCTGTTAAGTTGTCCAAACTCCATGTCAAAATGCCCGAGTC 3217
Query 3240 AGAATCTCTAGCAGAATCATTTCTCACCAAGTTTCCTTCCGTGAATCCACTCACAGCTCA 3299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3218 AGAATCTCTAGCAGAATCATTTCTCACCAAGTTTCCTTCCGTGAATCCACTCACAGCTCA 3277
Query 3300 AGTAATTCTGTCATCTTCTGGGTCACTTCTCGAATTCATGAAGCTCCCACATAAAAGCAA 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3278 AGTAATTCTGTCATCTTCTGGGTCACTTCTCGAATTCATGAAGCTCCCACATAAAAGCAA 3337
Query 3360 GGTTGAAAGGACGCAAAAGTATCATGTACCTGAAGAGAGTGTTGATCTATTCAGTTCAGT 3419
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3338 GGTTGATAGGATGCAAAAGTATCATGTACCTGAAGAGAGTGTTGATCTATTCAGTTCACT 3397
Query 3420 ATGCAGATACGGAGCAAGGGAGGACTCCAGATCTGTAATGACAGACAGCTCTTCTTCGGT 3479
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3398 ATGCAGATACGGAGCGAGGGAGGACTCCAGATCTGTAATGACAGACAGCTCTTCTTCGGT 3457
Query 3480 ATCTTCTGGACCTGACTCAGACACACACCATGTCAGTGTCCATTCTGGCTCAAAAAAGAA 3539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 3458 ATCTTCTGGACCTGACTCAGACACACACCATGTCAGTGTCCATTCTGGTTCGAAAAAGAA 3517
Query 3540 ACAGTACATTGCTGAGAAAGATGAGATAGATATGGACGACTTGGTGCATTTTTCTCCCTC 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 3518 ACAGTACATTGCTGAGAAAGATGAGATAGATATGGACGACTTGGTCCATTTTGCTCCCTC 3577
Query 3600 GATAGAATTTGCTGATACACAGCTCAAGTCTTCTGGGGATTTCCAACTTGATGATTCTTG 3659
| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3578 CACAGAATTTGCTGATGCGCAGCTCAAGTCTTCTGGTGATTTTCAACTTGATGATTCTTG 3637
Query 3660 GTCATCGAAAGATCATGAGATCTTTCATTTTGACCCTGTCACTGAATTCTCAGATGCACC 3719
|||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3638 GTCATCGAGAGATAATGAGATATTTCATTTTGACCCTGTCACTGAATTCTCTGATGCACC 3697
Query 3720 TTTCAAACCTTCTGGGATCAGTCATCCCAATGACTCTTGGCCGTCTAAAGATCCTGAGAG 3779
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3698 TTTCAAGCCTTCTGGGATCAGTCATCCCAATGACTCTTGGCCATCTAAAGATCCTGAGAG 3757
Query 3780 ATTTGACAAGAAGTCAGGACCTGGTTCATCATCAAAGGACACATTTTGGGAGAAAGATCA 3839
||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3758 ATTCGACAAGAAGCCAAGACCTGGTTCATCATCAAAGGACACATTTTGGGAGAAAGATCA 3817
Query 3840 GCCTGATTTTTCAGTGGAGGACAGTCTTCCTGGAATTCCTGAATTAGAAGATTGGAGTTT 3899
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3818 GCCTGGTTTTTCAGTGGAGGACAGTCTTCCTGGAATTCCTGAATTAGAAGATTGGAGTTT 3877
Query 3900 CCCAGTTAAAGACAAATTCATGAGCCAGAACAGAGGATGTAAATTTCCGGTGATGAGAGA 3959
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||
Sbjct 3878 CCCAGTTAAAGACAAGTTCAAGAGCCAGAACAGAGGATGTAAATTCCCAGTGATGGGAGA 3937
Query 3960 TTTTAACTTGCATGACAATAGGAACTCGGAGAATTTCATCGCAGACTACAAAGGTGAAGT 4019
||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3938 TTTCAACTTGCATGACAATAGGAACTCAGAGAGTTTCATCGTAGACTACAAAGGTGAAGT 3997
Query 4020 AATTGACAGAGCTGATAAGTATCTCGAGGAAGACTTCCCGCCTTCTCCTGGTTATAATAG 4079
||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3998 AATCAACAGAGCTGATAAATTTCTGGAGGAAGACTTCCCGCCTTCTCCTGGTTACAATAG 4057
Query 4080 GTTTGCTCGAATAGTTTCTGATGTTAATGAAGAGGAACTTCCAAGAAAATCAAAATCTTC 4139
|||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4058 GTTTTCTCCAATAGTTTCTGATGTTGATGAAGAGGAACTTCCAAGAAAATCAAAATCTGC 4117
Query 4140 AAGGAAGTTATCTTTCTTTGGATCTCTCCAGCCTAACTTCCCAAAGGCGGCTGACATCGA 4199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct 4118 AAGGAAGTTATCTTTCTTTGGATCTCTCCAGCCTAACTTCCCAAAAGCAGCTGAGATCGA 4177
Query 4200 CTCGAGTTCTGAAAGATACGCCACTGAGAAAGATTCAAAATATGATAACAACACTTCTTT 4259
|| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4178 CTTGAGTTCTGAAAGATTCACCACCGAGAAAGATTCAAAATATGATAACAATGCTTCTTT 4237
Query 4260 GCGTGGCTATGCTGATAACTATCCAGCAAAACGCCAAAGGACCCTTTTGGAGGAGGTCTT 4319
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4238 GCGTGGTTATGCTGATAACTATCCAGCAAAACGCCAAAGAACCCTTTTGGAGGAGGTCTT 4297
Query 4320 AACACGAAGATCTGCAGTTCCAACAACAGAGCTTCCATTTAGAGAAGAAATATCACATTT 4379
||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4298 AACTCGGAGATCCGCAGTTCCAACAACAGAGCTTCCATTTAGAGAAGAGATATCACATTT 4357
Query 4380 TGGTGGATCTCCACTATCAAACGCAATCCGTTCTTCAAATCAAGTACAAAGTTCTCCTTG 4439
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4358 TGGTGGATCTCCACTATCAAACGCAATCCGTTCTTCAAATCAAGTACAGAGTTCTCCTTG 4417
Query 4440 GACGGTTGATTTCCTTAACAGAGTTCGAGAAAGAAGCAGAGCAAGGAAACAACAACAATC 4499
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 4418 GACGGTTGATTTCCTTAACAGAGTTAGAGAAAGAAGCAGGGCAAGGAAACAACATCAATC 4477
Query 4500 TCTTCCTTCTTATG-CTTCTCCAC-CTAGTTTGGAGACTCCAGGGAACATAAAGAAAGCT 4557
|||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4478 TCTTCCTTCTTATGTCA-CTCC-CTCTAGTTTGGAGACTCCAGGGAACATAAAGAAAGCT 4535
Query 4558 AATACCAAGAGAAAGAGTCCATCCATACTCGAGTTTTTCAAGTATAAAGGAGGCAACAAA 4617
| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4536 AGTACCAAGAGAAAGAGTCCTTCCATACTAGAGTTTTTCAAGTATAAAGGAGGCAAAAAA 4595
Query 4618 CTTCAAGAAGAGAAGAGGCAGAAGCGGTCAAAGAA-TTCTTCAGCCTCACCAAAAAACGA 4676
||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4596 ATTCCAGAAGAGAAAAAGCAGAAGCGGTCAAA-AACTTCTTCAGCCTCGCCAAAAAACGA 4654
Query 4677 GAGATTTTACTCGCCTCTTAAGTCATGCACACCAATTGATAAGCGAGCAAAACAGTCTCT 4736
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4655 GAGATTTTACTCTCCTCTTAAGTCATGGACACCAATTGATAAGCGAGCAAAACAGTCTCT 4714
Query 4737 ATCTTACACAGCGAATGGAACTGG---CCAAACAAAACTTGTATGGAAGTAA 4785
||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4715 ATCTTACGCAGGGAATGGAACTGGAGGCCAAACAAAACTGGTATGGAAGTAA 4766
Score = 496 bits (268), Expect = 9e-139
Identities = 346/384 (90%), Gaps = 4/384 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCGAACTCGATTTCTCAACATCGATTACTTCTCTACTCCACCTTCTCACGTATTTGAA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 21 ATGCGAACTCGATTTCTCAACATCGATTACTTCTCTACTCCATCTTCTCAGGTATTTGAA 80
Query 61 ACCCTAGGCTTCCTCAATCTTCCGGCTCCTGATAATTTCCCGGCACCCATCGTCTACAAC 120
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||
Sbjct 81 ACCCTAGGCTTCCTTAATCTTCCGGCTCCTGATAATTTTCCGGGACCTATAGTCTACGAC 140
Query 121 GGAGAAGAAGACCGTCTCCGATTTGGCTC-GATCGAAAATGT-TAGTATCCCTATCGGAA 178
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||| ||||| |
Sbjct 141 GGAGAAGAAGACCGTCTCCGATTTGGCTCTG-TCGAAAATGTCT-GTCTCCCAATCGGGA 198
Query 179 ATTTGCCTATTGAAGCTGCTTTGTCGAAGTTCCTTTCCGACGTGGTTCCCGACCGCGTCA 238
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 199 ATTTTACTATTGAAGCTGCTTTGTCGAAGTTCCTTTCCGACGTGGTTCCCGATTGCGTTA 258
Query 239 GTGTGGACTATCGAGTTTTTGAAATCGACGACTCTTCGCTCGGAGTTTATTACTCAGACG 298
||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 259 GTGTGGACTATGGAGTTTTTGAAATTGATGATTCTTCCCTCGGAGATTATTTCTCAGACG 318
Query 299 AGAAGGATGACGGAGATGCCATTGCGGATAAAGCTACACCTAAAATTATTGAGTTGGAGA 358
||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||
Sbjct 319 AGAAGAATGACGGAGATGCCATTGAGGACAAAGCTGTATTTAACATTATGGAGTTGGAGA 378
Query 359 CTCCAGAGTTGGATTTTGAGATGG 382
|||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 379 CTCCGGAGTTGGATTTTGAAATGG 402
> Ahg497372 jgi|Araly1|497372|fgenesh2_kg.271__2__AT5G52290.1
Length=4746
Score = 6551 bits (3547), Expect = 0.0
Identities = 4107/4374 (94%), Gaps = 52/4374 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 456 GGTTAAATATGAGGGGTCAGATATTATCCTGCAGAACTCAAAGGACATTCAAGAGCA-GA 514
||||||||||| | | ||||| |||| | ||||||||||| |||| || | | | ||
Sbjct 381 GGTTAAATATGTCGAATTAGATACTATCTTACAGAACTCAAATGACA-TCCATCGAAGGA 439
Query 515 TTTATTCTGTTGATTACATTCCTTCTGATTACTTTACAGAGAACAACACTTCTGTAGCAG 574
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||| | | |||
Sbjct 440 TTTATTCTGTTGATTACATTTCTTCTGATTACTTCATAGAGAATAATACTTCGGCAACAG 499
Query 575 AAAATGAATGCTTCC-GCAAGATTCAACCATGGTTCAAAGATGCCAGATTTCCCCTTCTA 633
||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 500 AAAATGAATGC-TCCAGCAAGAATCAACCATGGTTCAAAGATGCCAGATTTCCCCTTCTA 558
Query 634 GAAGTGGATGAAGTAAACTTGAGCGAACTATCAAGCTTATCTGTGCTTGATAAAGTATTT 693
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 559 GAAGTGGATGAAGTAAACTTGAGAGAACTATCGAGCTTATCTATGCTTGATAAAGTATTT 618
Query 694 ACTGTTCTTGAGACGATTGAACCCCAAGACACTAATGCAGGGAGTTCTCTCATTATCAAT 753
||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 619 ACTGTTCTTGAAACAATTGAACCCCAAGACAAGAACGCAGCGAGTGCTCTCATTATCAAT 678
Query 754 TCTAAGGAGCTTATAGGCTCAAAGGATTATGATCTATTGGATGTACTCTCTACGGATTGC 813
||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 679 TCTAATGACCTTATAGGCTCTAAGGGTTATGATCTATTGGATATCCTCTCTACGGATTGC 738
Query 814 TATTTGAACAAGAGTGGCCAATCTGATGTGGTACCAGAGGATGAATTTTCTGAAA-TGGA 872
||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct 739 TATTTGAACAAAAGTGGTCAATCTGATGTGGGGCCAGAGGATGGATTTTCT-AAAGTGGA 797
Query 873 TATAGTGACTATCCTGGAAATATCAAATGCTGAGG--AA-------TTT------CAGGG 917
|||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||
Sbjct 798 TATAGTTAATATCCTGGAAATATCAAATGCTGAGGAAAATTTTCTGTTTGAACAACAGGG 857
Query 918 AAAGGTGGCTGTACCAGTAACTTATGAGGAATTCCAGATCCTGGATGTGGATATCTCTGA 977
|||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 858 AAAGGTGGCTCTCCCAGTAACTTTTGAGGAATTTCAGATCCTGGATGTGGAGATATCTGA 917
Query 978 TGTTTTTGATATCTTCCTTTGTCTTCAAAAAGCCATTGAACCAGAAATCTGTTACGGTAT 1037
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 918 TGTTTTTGACATCTTCCTTTGTCTTCAAAAAGCCATTGAACCAGAAATATGTTATGGGAT 977
Query 1038 GTTCAGTAAAGAGATGAACTTCAAGGATTTCGATGAATTAGTTGTCAGTTCCGAACTTGC 1097
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 978 GTTTAGTAAAGAGATGAACTTCAAAAATTTCGATGAATTAGTTGTCAGTTCTGAACTTGC 1037
Query 1098 CTTCACAGATGATGCCTTCAAGTCTTTGCCTACTCCTATTTTACATGATTATGAGATGAC 1157
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1038 CTTCACAGATGATGCCTTCAAGTCTCTGCCTACTCCTATTTTACATGATTATGAGGTGAC 1097
Query 1158 AAGATCTCTGGAGCTCATTTATGAGGATGTTTTGTCAAAGATCAAGCCTCAATCCTTGTC 1217
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098 AAGATCTCTGGATCTCATTTATGAGGATGTTTTGTCAAAGATCAAGCCTCAATCCTTGTC 1157
Query 1218 TGCCTCAAATGACATATACTTGCCGTGGAACCTTCTTGAGGAAAGAAACCACAACCATTG 1277
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 TGCTTCAAATGACATATACTTGCCCTGGAACCTTCTTGAGGAAAGAAACCACAACCATTG 1217
Query 1278 TGATTATCCGTTTGAAGAAATAGTTACATTCAACATTGATTATAACTGGGAAGCTTCAGA 1337
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||
Sbjct 1218 TGATTATCCGTTTGAAGAAATAGTTACACTCAACATTGATTTTAAGTGGGAATCTTCAGA 1277
Query 1338 AGGAGACAAATGGGTTTATGATTTCATTTTCTCTGAAGATGCTTTCTGCGAGCCACTTGT 1397
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1278 AGGAGACAAATGGGTTTATGATTTCATTTTCTCTGAAGATGCTTTCAGCGAGCCACTTGT 1337
Query 1398 AGAGAAATGCACTGAACCTTTCTATGGTATATCTAACCTTGATGAGCATGCTCCTGTTAA 1457
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 AGAGAAATGCACTGAACCTTTCTATGGTATATCTACCCTTGATGAGCATGCTCCTGTTAA 1397
Query 1458 TACTTCGCATGGGTTATTGGAAAACCCTTTCCAAAAAACAGGAGCAAGGGATTGTGCAGT 1517
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 1398 TACTTCTCATGGGTTATTGGAAAACCCTTTCCAAAAAACAGGAGCCAGGGATTGTGGAGT 1457
Query 1518 GGATGATAATGCTAAGAAGGCTACGCTGTTGTTCAAATCAATGTCTGCTTTTGATGACTT 1577
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1458 GGATGATAATGCTAAGAAGGCTACGTTGTTGTTCAAATCAATGTCTGCGTTTGATGACTT 1517
Query 1578 AACCTTTTTCATGGATCCGAAGAAGGCTGTGATTGAAGATAATCTCGAGTCTAGAGTCGA 1637
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||
Sbjct 1518 AACCTTTTTCATGGATCCTCAGAAGGCTGTGATTGAAGATTATCTCGGGTCTAGAGTAGA 1577
Query 1638 AGCTGCTAAGACTACCAACCATAAATGTATGTCTATTGACTCGAAGGCTTCATGTAGATC 1697
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1578 AGCTGCTAAGACTGCCAACCATAAATTTATGTCTATTGACTCGAAGGCTTCATGTATATC 1637
Query 1698 TGGTGGTATGCACCCAAACCCGAAGACAGAGGAAATGATACTTCACAGTGTGCGCCCTTC 1757
|||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 TGGTGGCATGCACCCAAACCTGAAGACGGAGGAAATGATACTTCACAGTGTGCGCCCTTC 1697
Query 1758 AGAAAATATTCAGGCTCTTGTTGGGGAATTTGTGAAGAGCTATTTAACTCTTGTGAAGGA 1817
||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698 AGAAAATATACTGGTTCTTGTTGGGGACTTTGTGAAGAGCTATTTAACTCTTGTGAAGGA 1757
Query 1818 TGAATCAGAGAATTTATCAGAAGATAAACTTAAGTTACTCAGCATATCTAAAGGAAAGCT 1877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 TGAATCAGAGAATTTATCAGAAGATAAACTTAAGTTACTCAGCATATCTAAAGGAAAGCT 1817
Query 1878 TATTGACTGCATAAGAAAGGCAAATGTCCACAAAACACAGTTGGCGGATGATAAGACTTT 1937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818 TATTGACTGCATAAGAAAGGCAAATGTCCACAAAACACAGTTGGCGGATGATAAGACTTT 1877
Query 1938 CACGTTTGCATTACTATTAGCAATTAAACAGATGACATGGTATATGTGTTTCTTCGGTAT 1997
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878 CACGTTTGCATTACTACTAGCAATTAAACAGATGACATGGTATATGTGTTTCTTCGGTAT 1937
Query 1998 CCATGTGGCATATATCTATCTTAACAAGGTATGTCGAAGCTCAAATCCCATGAAGATAGG 2057
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1938 CCATGTGGCATATCTCTATCTTAACAAGTTATGTCGAAGCTCAAATCCCATGAAGCTAGG 1997
Query 2058 ATTGCACACCCTCTACTCAGCAGTTGAAACAGAACACAAATCAGATGAGACAGACATCAC 2117
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1998 ATTGCATACCCTCTACTCAGCAGTTGAAACAGAACACAAATCAGATGAGACAGACGTCAC 2057
Query 2118 AAGATCACATCCATCACTAGCTGTTATCCAGGGGATTTTACAGTCAGAATTTGCCCGGGG 2177
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2058 AAGATCACATCCATCACTAGCTGTTATCCAGGGGATTTTACAGTCAGAATTTGCCCAGGG 2117
Query 2178 GAACTCCAAAGCATTACTTTTGGCTGAGAAAGTGTTTTGGTCCTCGCTGAAGAGGCTACT 2237
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2118 GAACTCTAAAGCATTACTTTTGGCTGAGAAAGTTTTTTGGTCCTCGCTGAAGAGGCTACT 2177
Query 2238 GATGTCCATGGGGTTATCTTACAATGACCTCAACAGTCCCTCCCCAAGTGGAAATCGACC 2297
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2178 GATGTCCATGGGGTTATCTTACAATGAGCTCAACAGTCCCTCCCCAAGTGGAAATCGACC 2237
Query 2298 AAATGTTCATG-A---A-------G----CCATAGAACTTGGTTTCCTGCCGATTTCAGA 2342
||||||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2238 AAATGTTCATGAAGCCATGGGGTTGAATACCATAGAACATGGTTTCCTGCCGATTTCAGA 2297
Query 2343 CTGTCTAATTATCTCTTACGAGCAAATTTCTCCATCTTTTCCTGTGGAGAATTTCAGCGT 2402
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2298 CTGCCTAATTATCTCTTACGAGCAAATTTCTCCATCTTTTCCTGTGGAGAATTTCAGCGT 2357
Query 2403 CATTGTAGAATATGGAGGTCCAAATGCCTCGCCCAGATATTCTTTTCCTTCAAAGTTGGA 2462
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 2358 CATTGTAGAATATGGAGGTCCAAATGTCTCGCCCAGATTTTCTTTTCCTTCGAAGTTGGA 2417
Query 2463 TTCCTTTCCTTCCTTTCATTTCATAAAAGTGGAGCTGGATATGCCCAGTGCATGCGGGCA 2522
|||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2418 TTCCTTTCCTGACTTCCATTTCATAAAAGTTGAGATGGATATGTCCAGTGCATGCGGGCA 2477
Query 2523 ACTCTGTGCAGGTGTTACAGTACCTTATAGTCTCAAAATGATAAAGGGAGACGAAGTTGA 2582
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2478 ACTGTGTGCAGGTGTTACAGTACCTTATAGTCTCAAAATGATAAAGGGAGATGAAGTTGA 2537
Query 2583 GACGAAAACTGGGTGGTTGGAAGAAGTGTTGAACTTTGTTCCACTTGAAAAAGTGTGTTA 2642
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2538 GACGAAAACTGGCTGGTTGGAAGAAGTGTTGAACTTTGTTCCACTTGAAAGTGTGTGTTA 2597
Query 2643 TGCAGGATCTTCCGAAACCACAAATGAATCTGAATTTATCTCCATGCCTCAAGAATCTGA 2702
||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2598 TGCAGTATCTTCAGAAACCACAAATGAATCTGAATACATTTCCATGCCTCAAGAATCTGA 2657
Query 2703 AAGAAAACGTGGGATAATTGAAC-AGG-G-TCTCTCTGACCAAAGATCTGTGATTGTTGT 2759
||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658 AAGAAAACGTGGGATAATTGAACAAGGAGTTCTCTCTGACCAAAGATCTGTGATTGTTGT 2717
Query 2760 GAACACAAAAACTGTCGATAAGGAGATGATCATATCCAGAAGAAGTACATACCAGAAGGT 2819
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2718 GAACACAAAAACTGTTGATAAGGAGATGATCATATCCAGAAGAAGTACATACCTGAAGGT 2777
Query 2820 GTTAGCAATGGAAAAAGAAGGAGTGCAAGTTGTGGAGCGCGATTCAGATCTACCTGTGGA 2879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2778 GTTAGCAATGGAAAAAGAAGGAGTGCAAGTTGTGGAGCGCGATTCAGATCTACCTGTGGA 2837
Query 2880 CCTGATGTTAAGTCCTGCAGTTTGCCTACTCTGGTATGATAGTGAAACTGTTAGTAAGAA 2939
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2838 CCTGATGCTAAGTCCTGCAGTTTGCCTACTCTGGTATGATTGTGAAACTGTTAGTAAGAA 2897
Query 2940 GTCGGCTGCAACTATTGGTACTTCCTCAAGTTCACTTTCATGGATTGGAGATATCGCAAC 2999
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2898 GTCGGCTGCAACTATTGGTACTTCCTCAAGCTCACTTTCATGGATTGGAGATATCGCAAC 2957
Query 3000 TAATGTTTTGACGTCATTGAGTTTCAGTTTCAGCACTTGCATTATGGTTTTTGAGGGGGA 3059
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2958 CAATGTTTTGACGTCATTGAGTTTTAGTTTCAGCACCTGCATTATGGTTTTTGAGGGGGA 3017
Query 3060 ACCCGCCTTCCTGGCTGCCGTAATGGACTCCTCTGATGAACTGTATGCAGCAGCTGGTAG 3119
|||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3018 ACCCACCTTCCTGGCTACAATAATGGACTCCTCTGATGAACTGTATGCAGCAGCTGGTAG 3077
Query 3120 CCTAGGAATCAGTTTACAGATGTTTTGCTCATCGTCAGCTAATCTCACGGATGAAATTAT 3179
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3078 CCTGGGAATCAGTTTACAGATGTTTTGCTCATCGTCAGCTGATTTCACGGATGAAATTAT 3137
Query 3180 ATTGAAGTGTATCAAATCTTCTGTTAAGTTGTCCAAACTCCATGTCAAAATGCCCGAGTC 3239
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3138 ATTGAGGTGTATCAAATCTTCTGTTAAGTTGTCCAAACTCCATGTCAAAATGCCAGAGTC 3197
Query 3240 AGAATCTCTAGCAGAATCATTTCTCACCAAGTTTCCTTCCGTGAATCCACTCACAGCTCA 3299
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3198 AGAATCTCTAGCAGAATCATTTTTCACCAAGTTTCCTTCCGTGAATCCACTCACAGCCCA 3257
Query 3300 AGTAATTCTGTCATCTTCTGGGTCACTTCTCGAATTCATGAAGCTCCCACATAAAAGCAA 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3258 AGTAATTCTGTCATCTTCTGGGTCACTTCTCGAATTCATGAAGCTCCCACATAGTAGCAA 3317
Query 3360 GGTTGAAAGGACGCAAAAGTATCATGTACCTGAAGAGAGTGTTGATCTATTCAGTTCAGT 3419
||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |
Sbjct 3318 GGTTGAAAGGATGCAAAAGTATCAGGTACATGAAGAGAGTGTTGAACTATTTAGTTCACT 3377
Query 3420 ATGCAGATACGGAGCAAGGGAGGACTCCAGATCTGTAATGACAGACAGCTCTTCTTCGGT 3479
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3378 ATGCAGATACGGAGCGAGGGAGGACTCCAGATCTGTAATGACAGACAGCTCGTCTTCGGT 3437
Query 3480 ATCTTCTGGACCTGACTCAGACACACACCATGTCAGTGTCCATTCTGGCTCAAAAAAGAA 3539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||
Sbjct 3438 ATCTTCTGGACCTGACTCAGACACACACCATGTCAGTGTCCATTCTGGTTGGAGAAAGAA 3497
Query 3540 ACAGTACATTGCTGAGAAAGATGAGATAGATATGGACGACTTGGTGCATTTTTCTCCCTC 3599
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 3498 ACAGTATATTGCTGAGAAAGATGAGATAGATATGGACGACTTGGTCCATTTTGCTCCCTC 3557
Query 3600 GATAGAATTTGCTGATACACAGCTCAAGTCTTCTGGGGATTTCCAACTTGATGATTCTTG 3659
| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3558 TACAGAATTTGCTGATGCGCAGCTCAAGTCTTCTGGGGATTTCCAACTTGATGATTCTTG 3617
Query 3660 GTCATCGAAAGATCATGAGATCTTTCATTTTGACCCTGTCACTGAATTCTCAGATGCACC 3719
|||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3618 GTCATCGAGAGATCATGAGATATTTCGTTTTAACCCTGTCACTGAATTCTCCGATGCACC 3677
Query 3720 TTTCAAACCTTCTGGGATCAGTCATCCCAATGACTCTTGGCCGTCTAAAGATCCTGAGAG 3779
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 3678 TTTCAAGCCTTCTGGGATCAGTCATCCCAATGACTCTTGGCCATCTAAAAATCCTGAGAG 3737
Query 3780 ATTTGACAAGAAGTCAGGACCTGGTTCATCATCAAAGGACACATTTTGGGAGAAAGATCA 3839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3738 ATTTGACAAGAAGTCAGGACCTGGTTCATCATCAAAGGACACATTTTGGGAGAAAGATCA 3797
Query 3840 GCCTGATTTTTCAGTGGAGGACAGTCTTCCTGGAATTCCTGAATTAGAAGATTGGAGTTT 3899
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3798 GCCTGATTTTTCAGTGGAGGACAGTCTCCCTGGAATTCCTGAATTAGAAGATTGGAGTTT 3857
Query 3900 CCCAGTTAAAGACAAATTCATGAGCCAGAACAGAGGATGTAAATTTCCGGTGATGAGAGA 3959
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3858 CCCAGTTAAAGACAAATTCAAGAGCCAGAACAGAGGATGTAAATTTCCGGTGATGGGAGA 3917
Query 3960 TTTTAACTTGCATGACAATAGGAACTCGGAGAATTTCATCGCAGACTACAAAGGTGAAGT 4019
||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3918 TTTCGACTTGCATGACAATAGGAACTCAGAGAATTTCATCGCAGACTACAAAGGTGAAGT 3977
Query 4020 AATTGACAGAGCTGATAAGTATCTCGAGGAAGACTTCCCGCCTTCTCCTGGTTATAATAG 4079
||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3978 AATCGACAGAGCTGATAAGTTTCTGGAGGAAGACTTCCCGCCTTCTCCTGTTTATAATAG 4037
Query 4080 GTTTGCTCGAATAGTTTCTGATGTTAATGAAGAGGAACTTCCAAGAAAATCAAAATCTTC 4139
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4038 GTTTGCTCCAATAGTTTCTGATGTTGATGAAGAGGAACTTCCAAGAAAATCAAAATCTGC 4097
Query 4140 AAGGAAGTTATCTTTCTTTGGATCTCTCCAGCCTAACTTCCCAAAGGCGGCTGACATCGA 4199
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4098 AAGGAAATTATCTTTCTTTGGGTCTCTCCAGCCTAACTTCCCAAAAACGGCTGACATCGA 4157
Query 4200 CTCGAGTTCTGAAAGATACGCCACTGAGAAAGATTCAAAATA-TGATAACAACACTTCTT 4258
|| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||
Sbjct 4158 CTTGAGTTCTGAAAGATTCGCCTCAGAGAAAGATTCAAA-TAATGATAACAATGCTTCTT 4216
Query 4259 TGCGTGGCTATGCT-GATAACTATCCAGCAAAACGCCAAAGGACCCTTTTGGAGGAGGTC 4317
||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4217 TGCGTGGTTATG-TAGATAACTATCCAGCAAAACGCCAAAGGACCCTTTTGGAGGAGGTC 4275
Query 4318 TTAACACGAAGATCTGCAGTTCCAACAACAGAGCTTCCATTTAGAGAAGAAATATCACAT 4377
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4276 TTAACACGAAGATCTGCAGTTCCAACAACAGAGCTTCCATTTAGAGAAGAGATATCACAT 4335
Query 4378 TTTGGTGGATCTCCACTATCAAACGCAATCCGTTCTTCAAATCAAGTACAAAGTTCTCCT 4437
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4336 TTTGGTGGATCTCCACTATCGAACGCAATCCGTTCTTCAAATCAAGTACAAAGTTCTCCT 4395
Query 4438 TGGACGGTTGATTTCCTTAACAGAGTTCGAGAAAGAAGCAGAGCAAGGAAACAACAACAA 4497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 4396 TGGACGGTTGATTTCCTTAACAGAGTTCGAGAAAGAAGCAGGGCAAGGAAACAACATCAA 4455
Query 4498 TCTCTTCCTTCTTATG-CT-TCTCCACCTAGTTTGGAGACTCCAGGGAACATAAAGAAAG 4555
|||||||||||||||| | || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4456 TCTCTTCCTTCTTATGTCAATC-CCTC-TAGCTTGGAGACTCCAGGGAACATAAAGAAAG 4513
Query 4556 CTAATACCAAGAGAAAGAGTCCATCCATACTCGAGTTTTTCAAGTATAAAGGAGGCAACA 4615
||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4514 CTAGTACCAAGAGAAAGAGTCCTTCCATACTAGAGTTTTTCAAGTATAAAGGAGGCAAAA 4573
Query 4616 AACTTCAAGAAGAGAAGAGGCAGAAGCGGTCAAAGAA-TTCTTCAGCCTCACCAAAAAAC 4674
|| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||
Sbjct 4574 AATTTCCAGAAGAGAAAAAGCAGAAGCGTTCAAA-AACTTCTTCAGCCTCGCCAAAAAAC 4632
Query 4675 GAGAGATTTTACTCGCCTCTTAAGTCATGCACACCAATTGATAAGCGAGCAAAACAGTCT 4734
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4633 GAGAGATTTTACTCGCCTCTTAAGTCATGGACACCAATTGATAAACGAGCAAAACAGTCT 4692
Query 4735 CTATCTTACACAGCGAATGGAACTGG---CCAAACAAAACTTGTATGGAAGTAA 4785
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4693 CTATCTTACACAGTAAATGGAACTGGAGGCCAAACAAAACTTGTCTGGAAGTAA 4746
Score = 545 bits (295), Expect = 9e-154
Identities = 355/384 (92%), Gaps = 4/384 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCGAACTCGATTTCTCAACATCGATTACTTCTCTACTCCACCTTCTCACGTATTTGAA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 1 ATGCGAACTCGATTTCTCAACATCGATTACTTCTCTACTCCATCTTCTCAGGTATTTGAA 60
Query 61 ACCCTAGGCTTCCTCAATCTTCCGGCTCCTGATAATTTCCCGGCACCCATCGTCTACAAC 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||
Sbjct 61 ACCCTAGGCTTCCTCAATCTTCCGGCTCCTGATAATTTTCCGGCACCTATCGTCTACGAC 120
Query 121 GGAGAAGAAGACCGTCTCCGATTTGGCTC-GATCGAAAATGT-TAGTATCCCTATCGGAA 178
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || |||| |||||||
Sbjct 121 GGAGAAGAAGACCGTCTCCGATTTGGCTCTG-TCGAAAATGTCT-GTCTCCCGATCGGAA 178
Query 179 ATTTGCCTATTGAAGCTGCTTTGTCGAAGTTCCTTTCCGACGTGGTTCCCGACCGCGTCA 238
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 179 ATTTTCCTATTGAAGCTGCTTTGTCGAAGTTCCTTTCCGACGTGGTTCCCGAACGCGTCA 238
Query 239 GTGTGGACTATCGAGTTTTTGAAATCGACGACTCTTCGCTCGGAGTTTATTACTCAGACG 298
||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 239 GTGTGGACTATGGAGCTTTTGAAATCGATGATTCTTCCCTCGGAGGTTATTTCTCAGACG 298
Query 299 AGAAGGATGACGGAGATGCCATTGCGGATAAAGCTACACCTAAAATTATTGAGTTGGAGA 358
||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||
Sbjct 299 AGAAGAATGACGGAGATGCCATTGAGGACAAAGCTACATTTAACATTATAGAGTTGGAGA 358
Query 359 CTCCAGAGTTGGATTTTGAGATGG 382
|||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 359 CTCCGGAGTTGGATTTTGAAATGG 382
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 181077932334
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5