BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G53460.1
Length=7064
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg949937 jgi|Araly1|949937|scaffold_801824.1 1.102e+04 0.0
> Ahg949937 jgi|Araly1|949937|scaffold_801824.1
Length=6667
Score = 1.102e+04 bits (5967), Expect = 0.0
Identities = 6425/6652 (97%), Gaps = 8/6652 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCGGCAGCTTCTTCTAGCTCCGTTCTTCACCTCCGAACCAACCAACAACTGTTATCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 22 ATGTCGGCAGCTTCTTCTAGCTCCGTTCTTCACCTCCGAACCAACCAACAATTGTTGTCA 81
Query 61 CTCCGATCTCTCAAAAATTCCACCTCCGTTGCTTCTCAATTGGCCGTTACGTCTGGTGTT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 82 CTCCGATCTCTCAAAAATTCCACCTCCGTTGCATCTCAATTGGCCGTTACGTCTGGTGTT 141
Query 121 AGCCGTAGAAGATCGTGTACGGCGCGATGCTCTGTGAAGAAACCGGTGATTCCTGAGAGT 180
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 142 AGCCGTAGAAGGTCGTGTACGGCGCGATGTTCTGTGAAGAAACCGGTGGCTCCAGAGAGT 201
Query 181 CCTTTCCTAGGGACTCGTGTGCGGAGATCCGGATCCGAGACGCTTCAGTTCTGGAGATCA 240
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 CCTTTCTTAGGGACTCGTGTGCGGAGATCCGGATCCGAGACGCTTCAGTTCTGGAGATCG 261
Query 241 GATGGTCCTGGACGGTCTGCGAAGCTTCGAACGGTGGTTAAATCGTCATTTTCCGCTGTT 300
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 262 GATGGTCCTGGACGGTCTGCGAAGCTCCGAACGGTGGTTAAGTCGTCATTTTCCGGTGTT 321
Query 301 CCGGAGAAGCCTCTTGGTCTTTATGATCCTTCCTATGATAAAGACTCTTGTGGTGTTGGT 360
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 322 CCGGAGAAGCCTCTCGGTCTTTATGATCCTTCCTATGATAAAGACTCTTGTGGTGTCGGT 381
Query 361 TTTGTAGCAGAGTTGTCCGGCGAGACCACCCGCAAAACGGTGACTGATTCGTTGGAGATG 420
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 TTTGTAGCAGAGTTATCCGGCGAGACCAGTCGCAAAACGGTGACTGATTCGTTGGAGATG 441
Query 421 TTGATACGGATGACTCATAGAGGTGCTTGTGGTTGTGAGAGCAACACTGGTGACGGCGCT 480
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 442 TTGATAAGGATGACTCATAGAGGTGCTTGTGGTTGTGAAAGCAACACTGGTGACGGCGCT 501
Query 481 GGGATTCTTGTTGGTCTGCCTCATGATTTCTATGCAGAGGCTGCGACAGAGCTTGGCTTT 540
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 GGGATTCTTGTTGGTCTGCCTCACGATTTCTATGCAGAGGCTGCGACAGAGCTTGGCTTT 561
Query 541 GTACTTCCTTCTGCTGGAAATTATGCTGTTGGTATGTTCTTCTTGCCAACTGTTGAAAGC 600
|| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 GTGCTTCCTCCTGCGGGAAAATATGCTGTTGGTATGTTCTTCTTGCCAACTGTTGAAAGC 621
Query 601 AGGAGAGAAGAAAGCAAGAATGTTTTCACTAAGGTTGCTGAATCACTTGGCCACTCGGTT 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 622 CGGAGAGAAGAAAGCAAGAATGTTTTCACTAAGGTTGCTGAATCACTTGGCCATTCGGTT 681
Query 661 CTTGGATGGAGATTAGTGCCTACCGATAATTCTGGACTGGGAAACTCCGCTTTGCAGACT 720
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 682 CTTGGATGGAGATTAGTGCCTACCGATAATTCCGGGCTGGGAAATTCCGCTTTGCAGACG 741
Query 721 GAACCGATTATTGCGCAAGTTTTCCTTACTCCTACAACTAAATCTAAAGCTGACTTTGAG 780
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 GAACCGATAATTGCGCAAGTTTTCCTTACTCCTACAACTAAATCTAAAGCTGACTTTGAG 801
Query 781 CAACAGATGTATATCCTTAGAAGGGTTTCTATGGTTGCTATTCGAGCTGCGTTGAACCTT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 CAACAGATGTATATCCTTAGAAGGGTTTCTATGGTTGCTATTCGAGCTGCGTTGAACCTT 861
Query 841 CAACATGGTGCGATGAAGGACTTCTACATCTGTTCGTTGTCTTCTAGGACTATCGTCTAC 900
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 862 CAACATGGTGCGATGAAGGACTTCTATATCTGTTCTTTGTCTTCTAGGACTATTGTCTAC 921
Query 901 AAAGGACAATTGAAGCCTGATCAACTAAAGGACTATTACTATGCGGATCTTGGGAGTGAA 960
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct 922 AAAGGACAATTGAAGCCGGATCAACTGAAGGACTATTATTACGCAGATCTTGGGAGTGAA 981
Query 961 AGGTTTACGAGCTACATGGCCCTGGTTCATTCTCGGTTCTCTACCAATACATTTCCCAGC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 982 AGGTTTACGAGCTACATGGCCCTGGTTCATTCTCGGTTCTCTACCAATACATTTCCCAGC 1041
Query 1021 TGGGATCGTGCTCAGCCGATGCGTGTTTTGGGCCACAATGGGGAGATCAATACACTCAGG 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 TGGGATCGTGCTCAGCCGATGCGTGTTTTGGGCCACAATGGGGAGATCAATACACTCAGG 1101
Query 1081 GGAAACGTGAACTGGATGAGGGCACGTGAGGGTCTGCTCAAGTGCAATGAACTTGGATTA 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 GGAAACGTGAACTGGATGAGGGCACGTGAGGGTCTGCTCAAGTGCAATGAACTTGGATTA 1161
Query 1141 TCAAAGAAAGAGTTGAAGAAGCTTCTACCTATTGTGGACGTTAGCTCTTCTGACTCAGGT 1200
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 TCAAAGAAGGAATTGAAGAAGCTTCTACCTATTGTGGACGTTAGCTCTTCTGACTCAGGT 1221
Query 1201 GCTTTTGATGGTGTTCTTGAGCTTCTTGTCCGAGCTGGTAGAAGTCTTCCTGAAGCTGTT 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1222 GCTTTTGATGGTGTTCTTGAGCTTCTTGTCCGAGCTGGCAGAAGTCTTCCTGAAGCTGTT 1281
Query 1261 ATGATGATGATCCCTGAAGCATGGCAAAATGACAAAAACATTGATCCAAGCAGGAAAGAG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1282 ATGATGATGATCCCTGAAGCATGGCAAAATGACAAAAACATAGATCCAAGCAGGAAAGAG 1341
Query 1321 TTTTATGAATACTTATCTGCTCTAATGGAGCCATGGGATGGACCTGCCCTCATATCATTC 1380
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1342 TTTTATGAATACTTATCTGCTCTGATGGAGCCATGGGATGGACCTGCCCTCATTTCATTC 1401
Query 1381 ACTGATGGTCGCTACTTGGGTGCCACATTGGACCGTAATGGACTTCGTCCTGGTAGGTTC 1440
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1402 ACTGATGGTCGATACTTGGGTGCCACATTGGACCGTAATGGGCTTCGTCCTGGTAGGTTT 1461
Query 1441 TACATAACCCACAGTGGAAGGGTTATCATGGCTAGTGAAGTTGGGGTAGTGGATGTACCA 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1462 TACATAACCCACAGTGGAAGGGTTATCATGGCTAGTGAAGTTGGGGTAGTTGATGTACCA 1521
Query 1501 CCTGAAGATGTGATGAGGAAAGGAAGACTTAACCCGGGTATGATGCTTCTTGTCGATTTT 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522 CCTGAAGATGTGATGAGGAAAGGAAGACTTAACCCGGGTATGATGCTTCTTGTCGATTTT 1581
Query 1561 GAGAAGCATATTGTTGTTGATGACGATGCCTTGAAGCAGCAGTATTCACTGGCAAGGCCT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||
Sbjct 1582 GAGAAGCATATTGTTGTTGATGACGATGCCTTGAAACAACAATATTCACTGGCAAGGCCT 1641
Query 1621 TATGGTGAGTGGCTTAAAAGGCAAAAGATTGAACTTAAAGACATCATTGAGTCAGTTCCG 1680
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1642 TATGGCGAGTGGCTTAAAAGGCAAAAGATTGAACTTAAAGACATCATCGAGTCAGTTCCG 1701
Query 1681 GAGGCTGAACGGATTGCTCCTTCAATTTCTGGGGTTGTACCGGCCTCTAATGATGATGAC 1740
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 GCGGCTGAACGGATTGCTCCTTCAATTTCTGGGGTTGTACCGGCCTCTAATGATGATGAC 1761
Query 1741 TCAATGGAGAGCATGGGCATTCATGGTTTATTGTCTCCACTAAAAGCCTTTGGCTACACA 1800
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1762 TCGATGGAGAGCATGGGCATTCATGGTTTATTGTCTCCACTAAAAGCCTTTGGTTACACA 1821
Query 1801 GTTGAGGCCTTGGAGATGTTGCTGCTTCCGATGGCTAAAGATGGCTCTGAAGCACTTGGT 1860
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822 GTTGAGGCCTTGGAGATGCTGCTGCTTCCGATGGCTAAAGATGGCTCTGAAGCACTTGGT 1881
Query 1861 TCTATGGGAAATGATACCCCTCTAGCTGTAATGTCAAACAGAGAAAAATTATGCTTTGAG 1920
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1882 TCTATGGGAAATGATACCCCTCTAGCTGTAATGTCAAACAGAGAGAAATTATGCTTTGAG 1941
Query 1921 TACTTCAAGCAAATGTTTGCTCAAGTAACAAATCCTCCAATTGATCCTATTCGTGAGAAA 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1942 TACTTCAAGCAAATGTTTGCTCAAGTAACAAATCCTCCAATTGATCCAATTCGTGAGAAA 2001
Query 1981 ATTGTTACATCAATGGAGTGCATGATCGGTCCAGAAGGCGATCTAACCGAAACAACTGAA 2040
|||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2002 ATTGTTACTTCGATGGAGTGCATGATAGGTCCAGAAGGTGATCTAACCGAAACAACTGAA 2061
Query 2041 GAGCAATGTCACCGTCTCTCCCTAAAAGGTCCTCTTTTGAAAATCGAAGAGATGGAAGCC 2100
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062 GAGCAATGTCACCGTCTTTCCCTTAAAGGTCCTCTTTTGAAAATCGAAGAGATGGAAGCT 2121
Query 2101 ATCAAGAAAATGAACTACAGAGGCTGGCGGACTAAAGTTCTGGATATAACTTATGCAAAA 2160
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2122 ATCAAGAAAATGAATTACAGAGGCTGGCGGACTAAAGTTCTTGATATAACTTATGCAAAA 2181
Query 2161 GAAAGAGGTACAAAAGGGTTAGAGGAGACTTTGGACCGAATTTGTGATGAAGCAAATGAA 2220
||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182 GAACGAGGTACAAAAGGGTTAGAGGAGACCTTGGACCGAATTTGTGATGAAGCAAATGAA 2241
Query 2221 GCAATAAAGGAGGGCTACACATTACTGGTTTTGTCTGATCGAGCTTTCTCTGCAACACGT 2280
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2242 GCGATAAAGGAGGGCTACACATTACTGGTTTTGTCTGATCGAGCTTTCTCTGCAACCCGT 2301
Query 2281 GTTGCTGTGAGCTCCCTCATGGCTGTTGGTGCCGTTCATCACCACCTGGTTAAGACACTT 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2302 GTTGCTGTGAGCTCCCTCATGGCTGTTGGTGCCGTTCATCACCACCTGGTTAAGACACTT 2361
Query 2341 GCGCGCACCCAAGTTGGTTTGGTAGTGGAATCTGCTGAACCACGTGAAGTGCATCATTTC 2400
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2362 GCGCGCACCCAGGTTGGGTTGGTAGTGGAATCTGCTGAACCACGTGAAGTGCATCATTTC 2421
Query 2401 TGCACACTTGTCGGATTTGGAGCAGATGCTATCTGCCCATATTTGGCTGTAGAGGCCGTT 2460
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2422 TGCACACTTGTCGGATTCGGAGCAGATGCTATCTGCCCATATTTGGCTGTGGAGGCCGTT 2481
Query 2461 TATAGATTACAGGTTGATGGCAAAATACCACCCAAATCTAATGGGGAATTCCATTCCAAA 2520
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2482 TATAGATTACAGGTTGATGGCAAGATACCACCCAAATCCAACGGGGAATTCCATTCCAAA 2541
Query 2521 GAAGAGTTGGTCAAGAAGTATTACAAGGCAAGTAACTATGGAATGATGAAGGTTCTTGCC 2580
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2542 GAAGAGCTGGTGAAGAAGTATTACAAGGCAAGTAACTACGGAATGATGAAGGTTCTTGCC 2601
Query 2581 AAAATGGGAATTTCTACTCTAGCCTCATACAAAGGTGCTCAGATATTTGAAGCTCTTGGG 2640
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2602 AAAATGGGAATTTCTACTCTGGCCTCATACAAGGGTGCTCAGATATTTGAAGCTCTTGGA 2661
Query 2641 CTTTCATCTGAAGTAATTCAGAAATGTTTTGCCGGTACCCCAAGCCGAGTGGAAGGAGCA 2700
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 2662 CTTTCATCTGAAGTAATTCAGAAATGTTTTGCGGGCACCCCAAGCAGGGTGGAAGGAGCA 2721
Query 2701 ACATTTGAGATGCTTGCACGAGATGGACTTCAATTGCATGAGTTGGCCTTTCCAACCCGT 2760
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2722 ACATTTGAGATGCTTGCTCGAGATGGACTTCAATTGCATGAGTTGGCCTTTCCAACCCGT 2781
Query 2761 GGCTATGCCCCAGGAAGTGCAGAAGCTTCAGCACTTACCAACCCTGGAAACTATCACTGG 2820
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2782 GGCTATGCCCCTGGAAGTGCAGAAGCCTCAGCACTTACCAACCCTGGGAACTATCACTGG 2841
Query 2821 AGGAAAAATGGAGAGATTCATCTCAACGATCCTCTTGCAATAGCCAAA-TTACAAGAGGC 2879
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||
Sbjct 2842 AGGAAAAATGGAGAGATTCATCTCAACGATCCCCTTGCTATTG-CAAAGTTACAAGAGGC 2900
Query 2880 AGCACGGACCAACAGTGTGGCCGCCTACAAGGAATACTCAAAGCGTATCAATGAATTGAA 2939
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2901 TGCACGGACTAACAGTGTGGCCGCCTACAAGGAATACTCAAAGCGTATCAATGAACTGAA 2960
Query 2940 CAAGCAAAGTAATTTGCGTGGGCTCATGAAGTTTAAAGACGCAGATGTGAAAATTCCACT 2999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CAAGCAAAGTAATTTGCGTGGGCTCATGAAGTTTAAAGACGCAGATGTGAAAATTCCACT 3020
Query 3000 AGATGAAGTCGAGCCTGCCAGTGAAATTGTTAAGCGGTTCTGCACTGGTGCCATGAGTTA 3059
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3021 TGATGAAGTAGAGCCTGCCAGTGAAATTGTTAAGCGATTCTGCACTGGTGCCATGAGTTA 3080
Query 3060 TGGATCAATTTCTCTGGAGGCGCATACAACCCTTGCAATGGCCATGAACAAGCTTGGAGG 3119
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3081 TGGATCAATATCTCTGGAGGCGCATACAACCCTTGCAATGGCCATGAACAAGCTTGGAGG 3140
Query 3120 AAAGTCGAATACAGGTGAGGGAGGGGAACTGCCATCCCGTATGGAGCCTCTTGCGGATGG 3179
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3141 AAAATCGAATACAGGTGAGGGAGGGGAACTGCCATCCCGTATGGAGCCTCTTGCGGATGG 3200
Query 3180 TTCAAGGAACCCCAAAAGAAGTTCGATCAAACAAATTGCTAGTGGAAGATTTGGAGTTTC 3239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3201 TTCAAGGAACCCCAAAAGAAGTTCGATCAAACAAATTGCTAGTGGAAGATTTGGAGTTTC 3260
Query 3240 TAGCTACTATCTTACAAATGCTGATGAGCTGCAGATAAAGATGGCTCAGGGTGCCAAACC 3299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3261 GAGCTACTATCTTACAAATGCTGATGAGCTGCAGATAAAGATGGCTCAGGGTGCCAAACC 3320
Query 3300 TGGGGAAGGTGGGGAGCTACCAGGCCACAAGGTCATAGGAGACATTGCTATAACCAGAAA 3359
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3321 TGGGGAAGGCGGGGAGCTACCAGGCCACAAGGTCATAGGAGACATTGCTATAACCAGAAA 3380
Query 3360 TTCCACTGCTGGTGTAGGACTTATCAGTCCACCTCCTCATCATGATATCTACTCTATCGA 3419
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3381 TTCCACTGCTGGTGTAGGGCTTATCAGTCCACCTCCTCATCATGACATCTACTCTATCGA 3440
Query 3420 GGATCTTGCCCAGCTAATTCACGATCTTAAGAATGCCAATCCTGGCGCACGTATTAGTGT 3479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3441 GGATCTTGCCCAGCTAATTCACGATCTTAAGAATGCCAATCCTGGGGCACGTATTAGTGT 3500
Query 3480 TAAGCTTGTATCTGAAGCTGGTGTTGGAGTTATTGCTAGCGGTGTGGTGAAGGGGCATGC 3539
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3501 TAAGCTTGTATCTGAAGCTGGTGTTGGAGTTATTGCTAGCGGCGTGGTGAAGGGGCATGC 3560
Query 3540 TGACCATGTTCTGATAGCAGGTCATGATGGAGGTACTGGTGCATCTCGCTGGACCGGTAT 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3561 TGACCATGTTCTGATAGCAGGTCATGATGGAGGTACTGGTGCATCTCGCTGGACCGGTAT 3620
Query 3600 TAAAAATGCTGGTCTTCCATGGGAACTGGGTCTAGCTGAGACACACCAAACTCTTGTTGC 3659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3621 TAAAAATGCTGGTCTTCCATGGGAACTGGGTCTAGCTGAGACACACCAAACTCTTGTTGC 3680
Query 3660 CAATGACCTTCGTGGCCGTACTGTTCTTCAGACAGATGGCCAGCTAAAAACTGGCAGAGA 3719
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3681 CAATGACCTTCGTGGCCGCACTGTTCTTCAGACAGATGGCCAGCTAAAAACTGGCAGAGA 3740
Query 3720 CGTTGCAGTTGCTGCACTTCTTGGTGCAGAAGAATTTGGTTTTAGTACTGCACCCCTTAT 3779
||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3741 TGTTGCAGTTGCAGCGCTTCTTGGTGCAGAAGAGTTTGGTTTTAGTACTGCACCCCTTAT 3800
Query 3780 CACACTAGGGTGTATCATGATGAGAAAGTGCCACAAGAACACCTGCCCTGTGGGAATTGC 3839
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3801 CACACTAGGGTGTATCATGATGAGAAAATGCCACAAGAACACCTGCCCTGTGGGAATTGC 3860
Query 3840 TACCCAAGATCCAGTTCTCCGTGAAAAATTTGCTGGGGAGCCTGAACATGTTATTAACTT 3899
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3861 TACTCAAGATCCAGTTCTCCGTGAAAAATTTGCTGGGGAACCTGAACATGTTATTAACTT 3920
Query 3900 CTTCTTTATGCTTGCTGAGGAAGTTAGGGAGATCATGTCTGGACTTGGTTTTAGAACTGT 3959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3921 CTTCTTTATGCTTGCTGAGGAAGTTAGGGAGATCATGTCTGGACTTGGTTTTAGAACTAT 3980
Query 3960 AACTGAGATGATTGGTCGTGCGGATATGCTTGAACTTGATAGGGAAGTTGTCAAGAACAA 4019
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3981 AACTGAGATGATTGGTCGTGCAGATATGCTTGAACTTGACAGGGAAGTTGTCAAGAACAA 4040
Query 4020 CGATAAGCTGGAGAACATTGACCTATCTCTTTTGCTCAGACCTGCTGCTGAGATTCGTCC 4079
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4041 CGATAAGCTGGAGAACATTGACCTCTCTCTTTTGCTCAGACCTGCTGCTGAGATTCGTCC 4100
Query 4080 TGGGGCTGCTCAGTACTGTGTTCAGAAACAAGATCATGGTTTAGACATGGCTTTGGATCA 4139
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4101 TGGGGCAGCTCAGTACTGTGTCCAGAAACAAGATCACGGTTTAGACATGGCTTTGGATCA 4160
Query 4140 AGAGCTGATTGCATTGTCTAAATCTGCTCTGGAGAAATCTCTTCCGGTGTACATTGAAAC 4199
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4161 AGAGCTGATTGCATTGTCTAAATCTGCTCTAGAGAAATCTCTTCCAGTGTACATTGAAAC 4220
Query 4200 TCCTATCTGCAACGTTAACCGTGCTGTTGGGACAATGCTGAGCCATGAGGTAACCAAACG 4259
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4221 TCCTATCTGCAACGTTAACCGTGCTGTTGGGACGATGCTGAGCCATGAGGTAACTAAACG 4280
Query 4260 TTACCACTTGACTGGGCTTCCAAAGGACACAATTCATATCAAGTTCACAGGAAGTGCTGG 4319
|||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4281 TTACCACTTGGCTGGGCTTCCGAAGGATACAATTCATATCAAGTTCACAGGAAGTGCTGG 4340
Query 4320 GCAGAGTCTTGGAGCTTTCTTGTGTCCTGGAATTATGCTAGAACTTGAAGGAGATAGCAA 4379
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 4341 GCAGAGTCTTGGAGCTTTCCTGTGTCCAGGAATTATGCTAGAACTTGAGGGCGATAGCAA 4400
Query 4380 TGACTATGTTGGAAAAGGGCTCTCTGGAGGTAAAGTTGTTGTTTACCCTCCAAAAGGAAG 4439
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4401 TGACTATGTTGGAAAAGGGCTCTCAGGAGGTAAAGTTGTTGTCTACCCTCCAAAAGGAAG 4460
Query 4440 CAGCTTTGATCCAAAAGAAAATATCGTTATTGGTAATGTAGCACTTTACGGTGCCACTAG 4499
| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4461 CGGCTTTGATCCAAAGGAAAATATCGTTATCGGTAATGTAGCACTTTATGGTGCCACTAG 4520
Query 4500 TGGTGAAGCATACTTCAATGGGATGGCTGCTGAAAGGTTCTCTGTTCGTAATTCTGGTGC 4559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4521 TGGTGAAGCATACTTCAATGGGATGGCTGCTGAAAGGTTCTCTGTTCGTAATTCTGGTGC 4580
Query 4560 TAAAGCTGTTGTGGAAGGTCTTGGTGATCATGGTTGTGAGTACATGACTGGTGGTACTGT 4619
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4581 TAAAGCCGTTGTGGAAGGTGTTGGTGATCATGGTTGTGAGTACATGACTGGTGGTACTGT 4640
Query 4620 TGTGGTGCTTGGAAAGACTGGTAGAAACTTTGCTGCTGGTATGAGTGGTGGTATTGCTTA 4679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4641 AGTGGTGCTTGGAAAGACTGGTAGAAACTTTGCTGCTGGTATGAGTGGGGGTATTGCTTA 4700
Query 4680 TGTCCTTGATGTGGACGGAAAGTTTAACACCAGATGCAACCTTGAACTGGTTGATTTGGA 4739
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4701 TGTCCTTGATGTGGACGGAAAGTTCCACACGAGATGCAACCTTGAACTGGTTGATTTGGA 4760
Query 4740 TAAAGTTGAAGATGAGGAGGACAAAATGACGCTCAAAATGATGATCCAGCAACATCAAAG 4799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 4761 TAAAGTTGAAGATGAGGAGGACAAAATGACGCTCAAAATGATGATTCAGCAACATCAACG 4820
Query 4800 ACACACCAACAGCCAACTTGCTCAAGAAGTTCTTGCAGACTTTGAGAATTTGCTGCCCAA 4859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4821 ACACACCAACAGCCAACTTGCTCAAGAAGTTCTTGCAGACTTTGAGAATTTGCTGCCTAA 4880
Query 4860 GTTTATCAAGGTTTTCCCAAGAGATTACAAACGTGTTTTATCAGCCATGAAACACGAAGA 4919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 4881 GTTTATCAAGGTTTTCCCAAGAGATTACAAACGTGTTTTGTCAGCCATGAAACATGAAGA 4940
Query 4920 GGTCTCCAAGCAAGCAATCGAGCGGGCTTCTGAGGAAGCTGACGAGACT-GAAGAGAAAG 4978
||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||
Sbjct 4941 GGTCTCCAAGCAAGCCATAGAGCATGCTTCTGAGGAAGCTGACGA-AATGGAAGAAAAAG 4999
Query 4979 AACTCGAGGAGAAAGATGCATTTGCAGAACTGAAGAACATGGCAGCTGCTTCGTCAAAAG 5038
|||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5000 AACTTGAGGAGAAAGACGCCTTTGCAGAGCTGAAGAACATGGCAGCTGCTTCCTCAAAAG 5059
Query 5039 AGGAGATGTCAGGAAACGGAGTGGCAGCTGAAGCTAGACCTTCTAAGGTAGATAATGCTG 5098
| | | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5060 A-G-G-TGTCCGGAAACGGAGTGGCAGCTGAAGCTAAACCTTCTCAGGTAGATAATGCTG 5116
Query 5099 TTAAAAACGGTGGTTTCATTGCTTATGAGCGTGAGGGAGTTAAGTACAGGGATCCCAATG 5158
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5117 TTAAACACGGTGGTTTCATTGCTTATGAGCGTGAGGGAGTTAAGTACAGGGATCCCAATG 5176
Query 5159 TTCGTCTTAATGACTGGAACGAAGTCATGGAGGAATCAAAACCTGGACCACTCCTTACAA 5218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5177 TTCGTCTTAATGACTGGAACGAAGTCATGGAGGAATCAAAACCTGGACCACTCCTTACAA 5236
Query 5219 CTCAGTCAGCTCGTTGCATGGATTGTGGAACTCCATTCTGCCACCAGGAGAACTCTGGGT 5278
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5237 CTCAGTCAGCTCGTTGCATGGATTGTGGAACTCCATTCTGCCACCAGGAGAATTCTGGGT 5296
Query 5279 GTCCTCTCGGTAATAAGATCCCTGAATTCAATGAACTTGTCTACCAGAACAGATGGCAAG 5338
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5297 GTCCTCTCGGTAACAAGATCCCTGAATTCAACGAACTTGTCTACCAGAACAGATGGCAAG 5356
Query 5339 AAGCCTTGAATCGTCTACTTGAGACAAACAACTTTCCAGAATTTACTGGGCGAGTATGCC 5398
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5357 AAGCCTTGAATCGTCTACTTGAGACGAACAACTTTCCAGAATTTACTGGGCGAGTATGCC 5416
Query 5399 CTGCACCATGTGAAGGTTCTTGTGTTCTTGGAATAATTGAGAACCCTGTTTCTATCAAAA 5458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5417 CTGCACCATGTGAAGGTTCTTGTGTTCTTGGAATAATTGAGAACCCTGTTTCTATCAAAA 5476
Query 5459 GCATTGAATGTGCTATTATCGATAAAGCCTTTGAGGAAGGGTGGATGGTACCAAGGCCTC 5518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5477 GCATTGAATGTGCTATTATCGATAAAGCCTTTGAGGAAGGGTGGATGGTACCAAGGCCTC 5536
Query 5519 CTCTCAAGAGAACAGGGAAAAAGGTTGCTATTATCGGAAGTGGACCGGCTGGGTTAGCTG 5578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5537 CTCTCAAGAGAACAGGGAAAAAGGTTGCTATTATCGGAAGTGGACCGGCTGGACTAGCTG 5596
Query 5579 CGGCTGACCAGCTGAACAAAATGGGCCATTTAGTAACCGTGTATGAGCGCTCGGACAGAA 5638
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5597 CGGCTGACCAGCTGAACAAAATGGGCCACTTAGTAACCGTGTATGAGCGCTCTGACAGAA 5656
Query 5639 TTGGTGGGCTGATGATGTATGGAGTACCAAACATGAAGACTGACAAAATTGACGTCGTTC 5698
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 5657 TTGGTGGGCTTATGATGTATGGAGTACCAAACATGAAGACTGACAAAATTGATGTAGTTC 5716
Query 5699 AACGGCGGGTTGATCTTATGACCAAAGAAGGTATCAACTTTGTGGTCAATGCCAATATTG 5758
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5717 AACGGCGGGTTGATCTTATGACCAAAGAAGGTATCAACTTTGTGGTTAATGCCAATATTG 5776
Query 5759 GAAAGGACCCATCTTACTCCCTTGATGGACTTAAGGAAGAGAATGATGCAATCGTTCTTG 5818
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||
Sbjct 5777 GAAAGGACCCGTCTTACTCCCTTGATGGACTTAAGGAAGAGAGTGATGCACTCATTCTTG 5836
Query 5819 CTGTTGGTTCCACAAAACCAAGAGATCTTCCAGTGCCTGGTCGTGATCTATCTGGTGTTC 5878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5837 CTGTTGGTTCCACAAAACCAAGAGATCTTCCAGTGCCTGGTCGTGATCTATCTGGTGTTC 5896
Query 5879 ACTTTGCCATGGAGTTTCTTCATGCAAACACCAAAAGTTTACTTGACAGCAATCATGAGG 5938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||
Sbjct 5897 ACTTTGCCATGGAGTTTCTTCATGCAAACACCAAAAGCTTGCTTGATAGCAATCTTGAGG 5956
Query 5939 ATGGCAATTACATTTCTGCAAAAGGGAAAAAGGTTGTTGTTATTGGTGGAGGTGATACCG 5998
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5957 ATGGCAATTACATTTCTGCAAAGGGGAAAAAGGTTGTCGTTATTGGTGGAGGTGATACCG 6016
Query 5999 GCACAGATTGCATCGGAACATCTATCCGCCATGGATGTACCAACATTGTAAACCTAGAAC 6058
| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 6017 GTACAGATTGCATTGGAACATCTATCCGTCATGGATGCACCAACATTGTAAACCTAGAGC 6076
Query 6059 TTCTTCCTCAGCCACCCTCAACAAGAGCTCCTGGAAACCCTTGGCCACAGTGGCCTCGTG 6118
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6077 TTCTTCCTCAGCCACCTTCAACAAGAGCTCCTGGAAACCCTTGGCCACAGTGGCCCCGTG 6136
Query 6119 TATTCCGTATTGACTACGGACATCAAGAAGCTACCACCAAATTCGGAAAAGACCCTAGGA 6178
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 6137 TGTTCCGTATTGACTACGGACATCAAGAAGCTACCACCAAATTCGGAAAAGACCCAAGAA 6196
Query 6179 CCTATGAGGTCTTAACGAAGAGGTTCATAGGAGATGACAATGGAAACGTGAAGGGGCTTG 6238
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6197 CCTATGAGGTCTTAACCAAGAGGTTCATAGGAGATGACAATGGAAACGTGAAAGGGCTTG 6256
Query 6239 AACTTGTGCGTGTGAGTTGGGAGAAGGATGAAACCGGGAGGTTCCAGTTCAAGGAGATCG 6298
|| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6257 AAATTGTGCGAGTGAGTTGGGAGAAGGATGATACCGGGAGGTTCCAGTTCAAGGAAATCG 6316
Query 6299 AAGGCTCTGAGGAAATCATTGAAGCAGACCTCGTTTTCTTGGCCATGGGTTTCCTTGGAC 6358
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6317 AAGGCTCTGAGGAAATAATTGAAGCAGACCTCGTTTTCTTGGCCATGGGTTTCCTTGGAC 6376
Query 6359 CTGAGCCAACACTTGCTGAGAAGCTAGGTCTCGAATGTGACAACAGGTCAAACTTTAAGG 6418
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 6377 CTGAGCCAACACTTGCGGAGAAGCTAGGACTCGAATGTGACAACAGGTCGAACTTTAAGG 6436
Query 6419 CCGAGTATGGCCGGTTTTCCACAACCGTGGAAGGTGTTTTCGCAGCAGGTGATTGTCGGA 6478
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6437 CAGAGTATGGCCGGTTTTCCACAACTGTGGAAGGTGTTTTCGCAGCAGGTGATTGTCGGA 6496
Query 6479 GAGGCCAGTCTTTGGTTGTCTGGGCTATCTCAGAAGGACGTCAAGCTGCAGATCAGGTAG 6538
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 6497 GAGGCCAGTCTTTGGTTGTCTGGGCCATCTCAGAAGGACGTCAAGCTGCAGCTCAGGTCG 6556
Query 6539 ACAAATTCCTCACCAAAACGGATGATGACGAAGACGCCAAGCTACAACAAGACCTTAACC 6598
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6557 ACAAATTCCTCACCAAAACCGATGATGACGAAGACGCCAAGCTACAACAAGACCTTAACC 6616
Query 6599 AGATGAAACACAACACTATCACAAACTGAGGTAAAAGAAAGCCTTACTCATC 6650
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6617 AGATGAAACACAACACTATCACAAACTGAGGTAAA-GAAAGCCTTACTCATC 6667
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 267811141201
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5