BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G56010.1
Length=2423
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg495683 jgi|Araly1|495683|fgenesh2_kg.8__1499__AT5G56010.1 3360 0.0
Ahg495688 jgi|Araly1|495688|fgenesh2_kg.8__1504__AT5G56030.1 2634 0.0
Ahg945414 jgi|Araly1|945414|scaffold_701643.1 2579 0.0
Ahg952322 jgi|Araly1|952322|scaffold_59400001.1 326 6e-88
Ahg950188 jgi|Araly1|950188|scaffold_802075.1 202 1e-50
Ahg947333 jgi|Araly1|947333|scaffold_703562.1 202 1e-50
Ahg351538 jgi|Araly1|351538|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002131 195 2e-48
Ahg343166 jgi|Araly1|343166|fgenesh1_pg.C_scaffold_3002929 187 3e-46
> Ahg495683 jgi|Araly1|495683|fgenesh2_kg.8__1499__AT5G56010.1
Length=2204
Score = 3360 bits (1819), Expect = 0.0
Identities = 2065/2186 (94%), Gaps = 8/2186 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 86 tttttttCCGATCAACGAGAATGGCGGACGCAGAAACCTTTGCTTTCCAAGCTGAGATCA 145
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTTTTTCCGATCAGCGATAATGGCGGACGCAGAGACTTTTGCTTTCCAAGCTGAGATCA 60
Query 146 ACCAGTTGCTCTCCCTCATCATCAATACCTTTTACTCTAACAAGGAGATCTTCCTTCGTG 205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACCAGTTGCTCTCCCTCATCATCAATACCTTTTACTCCAACAAGGAGATCTTCCTTCGTG 120
Query 206 AACTCATCAGTAACTCTTCTGATGCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCCTTGACAGACA 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 121 AACTCATCAGTAACTCTTCTGATGCTTTGGACAAGATTAGGTTCGAGTCTTTGACCGACA 180
Query 266 AGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCAGAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACA 325
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 181 AGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCTGAGCTCTTCATTCATATCATTCCTGACAAGACTAACA 240
Query 326 ACACCTTGACGATTATCGATAGTGGTATTGGGATGACCAAGGCTGATCTGGTGAACAACC 385
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||
Sbjct 241 ACACCTTGACCATTATTGATAGTGGTATTGGGATGACTAAAGCTGATTTGGTAAACAACC 300
Query 386 TTGGAACAATTGCAAGATCTGGAACCAAAGAATTCATGGAGGCGTTGGCTGCTGGAGCTG 445
||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTGGAACTATTGCAAGATCTGGTACCAAGGAATTCATGGAGGCGTTGGCTGCTGGAGCTG 360
Query 446 ATGTTAGCATGATTGGACAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACA 505
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATGTCAGCATGATTGGACAGTTCGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACA 420
Query 506 AGGTTGTTGTTACTACCAAGCACAATGACGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCCG 565
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AGGTTGTTGTTACTACCAAGCACAACGATGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCCG 480
Query 566 GTGGATCTTTCACCGTCACCAGAGACACCTCTGGTGAGGCTCTTGGTAGAGGAACTAAGA 625
||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 481 GTGGATCTTTCACTGTGACCAGAGACACCTCTGGGGAGGCTCTTGGTAGAGGAACCAAGA 540
Query 626 TGGTCCTTTACCTCAAGGAAGACCAGATGGAGTACATTGAGGAGCGAAGGCTTAAGGATT 685
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TGGTTCTTTACCTCAAGGAAGACCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGCGAAGGCTTAAGGATT 600
Query 686 TGGTGAAGAAGCACTCTGAGTTCATCAGCTACCCAATCTCTCTCTGGATtgagaagacca 745
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGGTTAAGAAGCACTCTGAGTTCATCAGCTACCCAATTTCTCTCTGGATTGAGAAGACCA 660
Query 746 ttgagaaggagatctctgatgatgaagaggaggaagagaagaaggatgaggaaggcaagg 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TTGAGAAGGAGATCTCTGATGATGAAGAGGAGGAAGAAAAGAAGGATGAGGAAGGCAAGG 720
Query 806 ttgaggaagttgatgaggagaaagaaaaggaggagaagaaaaagaagaagattaaggagg 865
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTGAGGAAGTAGATGAGGAGAAAGAAAAGGAGGAGAAGAAAAAGAAGAAGATTAAGGAGG 780
Query 866 TTTCTCATGAGTGGGATTTGGTGAACAAGCAGAAACCGATTTGGATGAGGAAGCCAGAGG 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TTTCTCATGAGTGGGATTTGGTGAACAAGCAGAAACCGATTTGGATGAGGAAGCCAGAGG 840
Query 926 AGATCAACAAGGAGGAGTACGCTGCTTTCTACAAGAGTTTGAGCAATGACTGGGAAGAGC 985
| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||
Sbjct 841 AAATCAACAAAGAAGAGTACGCTGCTTTCTACAAGAGTCTCAGCAATGATTGGGAGGAGC 900
Query 986 ATTTGGCTGTGAAGCATTTCTCAGTTGAAGGACAGCTTGAGTTCAAAGCTATCCTCTTTG 1045
|||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATTTGGCTGTGAAGCATTTCTCTGTTGAGGGGCAGCTTGAATTCAAAGCTATCCTCTTTG 960
Query 1046 TTCCCAAGAGAGCTCCTTTTGATCTCTTTGACACTAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGC 1105
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TTCCCAAGAGAGCTCCTTTCGATCTCTTTGACACTAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGC 1020
Query 1106 TCTATGTCCGTCGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAAGACATCATTCCTGAGTACCTTG 1165
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1021 TCTATGTCCGTCGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAAGACATCATCCCTGATTACCTTG 1080
Query 1166 GGTTTGTCAAGGGTATTGTTGACTCTGAAGATCTTCCTCTCAACATCTCAAGAGAAACAT 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GGTTTGTCAAGGGTATTGTTGACTCTGAAGATCTTCCTCTCAACATCTCAAGAGAAACAT 1140
Query 1226 TGCAGCAGAACAAGATCCTCAAGGTCATCCGCAAGAACCTTGTGAAGAAGTGTCTTGAGC 1285
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1141 TGCAGCAAAACAAGATCCTCAAGGTCATCCGCAAGAACCTTGTAAAGAAGTGCCTTGAGC 1200
Query 1286 TCTTCTTTGAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAGTTCTATGAGGCTTTCTCTA 1345
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1201 TCTTCTTTGAGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAGTTCTACGAGGCTTTCTCTA 1260
Query 1346 AGAACCTGAAGCTCGGTATCCATGAGGACTCCCAAAACAGAACCAAGATTGCTGAGTTGC 1405
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||
Sbjct 1261 AGAACCTGAAGCTCGGTATCCACGAGGACTCCCAAAACCGAACAAAAATCGCTGAGTTGC 1320
Query 1406 TCCGTTACCACTCAACCAAGAGCGGTGATGAATTGACCAGTCTCAAGGACTACGTGACAA 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TCCGTTACCACTCAACCAAGAGCGGTGATGAATTGACTAGTCTCAAGGACTACGTGACAA 1380
Query 1466 GGATGAAGGAAGGTCAGAACGATATCTTCTATATCACTGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTTG 1525
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1381 GGATGAAGGAAGGTCAGAACGATATCTTCTACATCACTGGTGAGAGCAAAAAGGCTGTGG 1440
Query 1526 AGAACTCTCCATTCCTTGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGT-ATTGAAGTTCTCTACATGGTT 1584
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||
Sbjct 1441 AGAACTCTCCCTTCCTAGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGTTAC-GAAGTCCTCTACATGGTT 1499
Query 1585 GACGCTATCGATGAGTATGCTATTGGTCAGCTCAAGGAATTCGAAGGAAAGAAGCTTGTC 1644
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1500 GACGCTATTGATGAGTATGCTATTGGTCAGCTCAAGGAATTCGAGGGAAAGAAGCTTGTC 1559
Query 1645 TCTGCAACCAAGGAAGGTCTGAAACTGGATGAGACTgaagacgagaagaagaagaaagaa 1704
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1560 TCTGCAACCAAGGAAGGTCTTAAACTGGAAGAGACTGAAGATGAGAAGAAGAAGAAAGAA 1619
Query 1705 gagctcaaggagaagTTTGAGGGACTCTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGAGACAAG 1764
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1620 GAGCTCAAGGAGAAGTTTGAGGGACTCTGCAAAGTGATCAAGGACGTTCTGGGAGACAAG 1679
Query 1765 GTTGAGAAGGTTATCGTCTCTGACCGTGTTGTGGACTCACCCTGCTGTCTTGTAACAGGC 1824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 1680 GTTGAGAAGGTTATCGTCTCTGACCGTGTTGTGGACTCACCATGCTGTCTTGTTACGGGC 1739
Query 1825 GAGTATGGCTGGACTGCAAACATGGAGAGGATCATGAAAGCTCAAGCCTTGAGAGACAGC 1884
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 1740 GAATATGGCTGGACCGCAAACATGGAGAGGATCATGAAAGCTCAAGCTTTGAGGGATAGC 1799
Query 1885 AGCATGGGTGGCTACATGTCGAGCAAGAAGACAATGGAGATTAACCCAGAGAACTCCATC 1944
| || |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 AACACGGGTAGTTACATGTCAAGCAAGAAGACTATGGAGATTAACCCAGAGAACTCCATC 1859
Query 1945 ATGGATGAGCTGAGAAAGAGAGCTGATGCAGACAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGACCTT 2004
||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1860 ATGGACGAGCTGAGAAAGAGAGCCGACGCGGACAAGAACGATAAGTCTGTGAAGGATCTT 1919
Query 2005 GTACTTCTTCTCTTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAAC 2064
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GTGCTTCTTCTCTTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAAC 1979
Query 2065 ACTTTCGGGAGCAGGATTCACAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGATGACGATGAT 2124
||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1980 ACTTTTGGAAGCAGAATCCATAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGACGATGATGAT 2039
Query 2125 GTTGTTGAAGCCGATGCTGACATGCCTCCACTTGAAGATGATGCCGATGCTGAAGGTAGC 2184
| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2040 GCCGTTGAAGCCGATGCGGAGATGCCTCCACTTGAAGATGATGCTGATGCTGAAGGTAGC 2099
Query 2185 AAGATGGAGGAAGTTGACTAAATTATCACACACAGTCGACTTAA-TCATTAGGGGTGTTG 2243
|||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| || | ||||| ||||||
Sbjct 2100 AAGATGGAGGAAGTCGACTAAAT-ATTGCACAAAGTCGACTAAAAT-ATTAGCGGTGTTA 2157
Query 2244 AGACATT-G-GTTATCTTTTTATCtt 2267
|||| || | ||| ||||||||||||
Sbjct 2158 AGACTTTTGTGTT-TCTTTTTATCTT 2182
> Ahg495688 jgi|Araly1|495688|fgenesh2_kg.8__1504__AT5G56030.1
Length=2278
Score = 2634 bits (1426), Expect = 0.0
Identities = 1598/1683 (95%), Gaps = 3/1683 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 588 AGACACCTCTGGTGAGGCTCTTGGTAGAGGAACTAAGATGGTCCTTTACCTCAAGGAAGA 647
|||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 501 AGACACCTCTGGGGAGGCTCTTGGTAGAGGAACCAAAATGGTCCTTTACCTCAAGGAAGA 560
Query 648 CCAGATGGAGTACATTGAGGAGCGAAGGCTTAAGGATTTGGTGAAGAAGCACTCTGAGTT 707
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 561 CCAGTTGGAGTACCTTGAGGAGCGAAGGCTTAAGGATTTGGTTAAGAAGCACTCTGAGTT 620
Query 708 CATCAGCTACCCAATCTCTCTCTGGATtgagaagaccattgagaaggagatctctgatga 767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 CATCAGCTACCCAATCTCTCTCTGGATTGAGAAGACCATTGAGAAGGAGATCTCTGATGA 680
Query 768 tgaagaggaggaagagaagaaggatgaggaaggcaaggttgaggaagttgatgaggagaa 827
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 681 TGAAGAGGAGGAAGAAAAGAAGGATGAGGAAGGCAAGGTTGAGGAAGTAGATGAGGAGAA 740
Query 828 agaaaaggaggagaagaaaaagaagaagattaaggaggTTTCTCATGAGTGGGATTTGGT 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAAAAGGAGGAGAAGAAAAAGAAGAAGATTAAGGAGGTTTCTCATGAGTGGGATTTGGT 800
Query 888 GAACAAGCAGAAACCGATTTGGATGAGGAAGCCAGAGGAGATCAACAAGGAGGAGTACGC 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 801 GAACAAGCAGAAACCGATTTGGATGAGGAAGCCAGAGGAAATCAACAAAGAAGAGTACGC 860
Query 948 TGCTTTCTACAAGAGTTTGAGCAATGACTGGGAAGAGCATTTGGCTGTGAAGCATTTCTC 1007
|||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 TGCTTTCTACAAGAGTCTCAGCAATGATTGGGAGGAGCATTTGGCTGTGAAGCATTTCTC 920
Query 1008 AGTTGAAGGACAGCTTGAGTTCAAAGCTATCCTCTTTGTTCCCAAGAGAGCTCCTTTTGA 1067
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 TGTTGAGGGGCAGCTTGAATTCAAAGCTATCCTCTTTGTTCCCAAGAGAGCTCCTTTTGA 980
Query 1068 TCTCTTTGACACTAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGCTCTATGTCCGTCGTGTCTTCAT 1127
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 981 TCTCTTTGATACTAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGCTATATGTCCGTCGTGTCTTCAT 1040
Query 1128 CATGGACAACTGTGAAGACATCATTCCTGAGTACCTTGGGTTTGTCAAGGGTATTGTTGA 1187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 CATGGACAACTGTGAAGACATCATTCCTGAGTACCTTGGATTTGTCAAGGGTATTGTTGA 1100
Query 1188 CTCTGAAGATCTTCCTCTCAACATCTCAAGAGAAACATTGCAGCAGAACAAGATCCTCAA 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 CTCTGAAGATCTTCCTCTCAACATCTCAAGAGAAACATTGCAGCAGAACAAGATCCTCAA 1160
Query 1248 GGTCATCCGCAAGAACCTTGTGAAGAAGTGTCTTGAGCTCTTCTTTGAGATTGCTGAGAA 1307
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1161 GGTCATCCGCAAGAACCTTGTGAAGAAGTGCCTTGAGCTCTTCTTTGAGATTGCCGAGAA 1220
Query 1308 CAAGGAGGACTACAACAAGTTCTATGAGGCTTTCTCTAAGAACCTGAAGCTCGGTATCCA 1367
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1221 CAAGGAGGACTACAACAAGTTCTACGAGGCTTTCTCGAAGAATCTGAAGCTCGGTATCCA 1280
Query 1368 TGAGGACTCCCAAAACAGAACCAAGATTGCTGAGTTGCTCCGTTACCACTCAACCAAGAG 1427
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1281 TGAGGACTCTCAAAACAGAACCAAGATCGCTGAGTTGCTCCGATACCACTCAACCAAGAG 1340
Query 1428 CGGTGATGAATTGACCAGTCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGAACGA 1487
||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 CGGTGATGAGTTGACTAGTCTCAAGGATTACGTGACAAGGATGAAGGAAGGTCAGAACGA 1400
Query 1488 TATCTTCTATATCACTGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTTGAGAACTCTCCATTCCTTGAGAA 1547
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 TATCTTCTACATCACTGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTGGAGAACTCTCCATTCCTTGAGAG 1460
Query 1548 GCTCAAGAAGAAGGGTATTGAAGTTCTCTACATGGTTGACGCTATCGATGAGTATGCTAT 1607
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1461 GCTCAAGAAGAAGGGGATTGAAGTCCTCTACATGGTTGACGCTATTGATGAGTATGCTAT 1520
Query 1608 TGGTCAGCTCAAGGAATTCGAAGGAAAGAAGCTTGTCTCTGCAACCAAGGAAGGTCTGAA 1667
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521 CGGTCAGCTGAAGGAATTTGAGGGAAAGAAGCTTGTCTCTGCAACCAAGGAAGGTCTGAA 1580
Query 1668 ACTGGATGAGACTgaagacgagaagaagaagaaagaagagctcaaggagaagTTTGAGGG 1727
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 ACTGGAAGAGACTGAAGATGAGAAGAAGAAGAAAGAAGAGCTCAAGGAGAAGTTTGAGGG 1640
Query 1728 ACTCTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGAGACAAGGTTGAGAAGGTTATCGTCTCTGA 1787
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1641 ACTCTGCAAAGTGATCAAGGATGTTTTGGGAGACAAGGTTGAGAAGGTTATCGTTTCTGA 1700
Query 1788 CCGTGTTGTGGACTCACCCTGCTGTCTTGTAACAGGCGAGTATGGCTGGACTGCAAACAT 1847
|||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 CCGTGTGGTGGACTCACCTTGTTGTCTTGTAACAGGCGAGTATGGCTGGACTGCAAACAT 1760
Query 1848 GGAGAGGATCATGAAAGCTCAAGCCTTGAGAGACAGCAGCATGGGTGGCTACATGTCGAG 1907
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1761 GGAGAGGATCATGAAAGCTCAAGCCCTGAGAGACAGCAGCATGGGTGGTTACATGTCGAG 1820
Query 1908 CAAGAAGACAATGGAGATTAACCCAGAGAACTCCATCATGGATGAGCTGAGAAAGAGAGC 1967
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821 CAAGAAGACAATGGAGATTAACCCTGAGAACTCGATCATGGATGAGCTGAGAAAGAGAGC 1880
Query 1968 TGATGCAGACAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGACCTTGTACTTCTTCTCTTTGAGACCGC 2027
|| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1881 CGAAGCAGACAAGAATGACAAGTCTGTTAAGGACCTTGTGCTTCTCCTCTTTGAGACCGC 1940
Query 2028 TCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTCGGGAGCAGGATTCACAG 2087
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1941 TCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTTGGAAGCAGGATTCACAG 2000
Query 2088 GATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGATGACGATGATGTTGTTGAAGCCGATGCTGACAT 2147
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2001 GATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTGACGACGATGATGCAGTTGAAGCCGATGCTGAGAT 2060
Query 2148 GCCTCCACTTGAAGATGATGCCGATGCTGAAGGTAGCAAGATGGAGGAAGTTGACTAAAT 2207
|||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
Sbjct 2061 GCCTCCCCTTGAAGACGATGCTGATGCTGAAGGTAGCAAGATGGAGGAAGTCGATTAACT 2120
Query 2208 TATCACACACAGTCGACTTA-ATCATTAGGGGTGTTGAGACATTGGTTATCTTTTTATCt 2266
||||||||| |||||||| | || ||||| ||||| |||| || || || |||| |||
Sbjct 2121 TATCACACAAAGTCGACT-ACATTATTAGCGGTGTCAAGACTTTTTTT-TCATTTTCTCT 2178
Query 2267 ttt 2269
|||
Sbjct 2179 TTT 2181
Score = 787 bits (426), Expect = 0.0
Identities = 476/500 (95%), Gaps = 3/500 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 46 TTTATCTCTCGATTTGATTCATAAACCCTAGCTCTTAGAttttttttCCGATCAACGAGA 105
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct 3 TTTTTCTCTTGATTTGATTCATAAACCCTAGCTCTTAGA--TTTTTTCCGATCACCGATA 60
Query 106 ATGGCGGACGCAGAAACCTTTGCTTTCCAAGCTGAGATCAACCAGTTGCTCTCCCTCATC 165
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ATGGCGGACGCAGAGACCTTTGCTTTCCAAGCTGAGATCAACCAGTTGCTCTCCCTCATC 120
Query 166 ATCAATACCTTTTACTCTAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGAACTCATCAGTAACTCTTCT 225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATCAATACCTTTTACTCTAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGAACTCATCAGTAACTCTTCT 180
Query 226 GATGCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCCTTGACAGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAG 285
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 181 GATGCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCCTTAACAGACAAGAGCAAGCTTGATGGTCAG 240
Query 286 CCAGAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGACGATTATCGAT 345
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 241 CCTGAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGACCATTATTGAT 300
Query 346 AGTGGTATTGGGATGACCAAGGCTGATCTGGTGAACAACCTTGGAACAATTGCAAGATCT 405
||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 301 AGTGGGATTGGGATGACTAAAGCTGATTTGGTCAACAACCTTGGAACGATTGCGAGATCT 360
Query 406 GGAACCAAAGAATTCATGGAGGCGTTGGCTGCTGGAGCTGATGTTAGCATGATTGGACAG 465
|| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 361 GGTACCAAGGAATTCATGGAGGCATTGGCTGCTGGAGCTGATGTTAGCATGATTGGTCAG 420
Query 466 TTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTGTTGTTACTACCAAG 525
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTTGGTGTTGGTT-CTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTGTTGTTACTACCAAG 479
Query 526 CACAATGACGATGAGCAGTA 545
||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CACAATGACGATGAGCAGTA 499
> Ahg945414 jgi|Araly1|945414|scaffold_701643.1
Length=2149
Score = 2579 bits (1396), Expect = 0.0
Identities = 1881/2116 (89%), Gaps = 29/2116 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 106 ATGGCGGACGCAGAAACCTTTG-CTTTCCAAGCTGAGATCAACCAG-TTGCTCTCCCTCA 163
||| |||||| ||| || |||| |||| || ||||||||||| ||| || |||||||| |
Sbjct 24 ATGTCGGACGTAGAGACGTTTGCCTTT-CAGGCTGAGATCAATCAGCTT-CTCTCCCTTA 81
Query 164 TCATCAATACCTTT-TAC-TCTAACAAGGAGATCTTCCTTCGTGAACTCATCAGTAACTC 221
||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 82 TCATCAATA-CTTTCTACAGC-AACAAGGAGATCTTCCTTCGTGAGCTCATCAGTAACTC 139
Query 222 TTCTGATGCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCCTTGACAGACAAGAGCAAGCTCGATGG 281
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 140 TTCCGATGCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCTTTGACTGACAAGAGCAAGCTCGATGG 199
Query 282 TCAGCCAGAGCTCTTCATTCACATCATTCCC-GACAAGACTAACAACACCTTGACGATTA 340
|||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 200 TCAGCCTGAACTCTTCATTCACATCA-TCCCGGACAAGACCAACAACACCTTGACCATTA 258
Query 341 TCGATAGTGGTATTGGGATGACCAAGGCTGATCTGGTGAACAACCTTGGAACAATTGCAA 400
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |
Sbjct 259 TCGACAGTGGTATTGGGATGACCAAGGCTGATTTGGTCAACAACCTGGGTACAATTGCCA 318
Query 401 GATCTGGAACCAAAGAATTCATGGAGGCGTTGGCTGCTGGAGCTGATGTTAGCATGATTG 460
| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||
Sbjct 319 GGTCTGGCACCAAGGAGTTCATGGAGGCCTTGGCTGCTGGTGCCGATGTCAGTATGATTG 378
Query 461 GACAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGACAAGGTTGTTGT--TAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
Sbjct 379 GACAGTTTGGTGTTGGTTTCTACTCTGCTTACTTGGTTGCTGAGAAGGTTGTTGTCGT-C 437
Query 519 TACCAAGCACAATGACGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCCGGTGGATCTTTCAC 578
|| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 438 -ACAAAGCACAATGATGATGAGCAGTATGTGTGGGAGTCCCAGGCCGGAGGATCTTTCAC 496
Query 579 CGTCACCAGAGACACCTCTGGTGAGGCTC-TTGGTAGAGGAACTAAGATGGTCCTTTACC 637
|| ||||| || |||||||| |||| || ||||||| || || |||||| ||||||||
Sbjct 497 TGTGACCAGGGATACCTCTGGCGAGG-TCCTTGGTAGGGGTACCAAGATGACCCTTTACC 555
Query 638 TCAAGGAAGACCAGATGGAGTACATTGAGGAGCGAAGGCTTAAGGATTTGGTGAAGAAGC 697
|||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||
Sbjct 556 TCAAGGAAGACCAGTTGGAATACCTTGAAGAGCGACGTCTTAAGGATTTGGTCAAGAAGC 615
Query 698 ACTCTGAGTTCATCAGCTACCCAATCTCTCTCTGGATtgagaagaccattgagaaggaga 757
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616 ACTCTGAGTTCATCAGCTACCCGATCTCTCTTTGGGTTGAGAAGACCATTGAGAAGGAGA 675
Query 758 tctctgatgatgaagaggaggaagagaagaaggatgaggaaggcaaggttgaggaagttg 817
|||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 676 TCTCAGATGACGAAGAAGAGGAAGAGAAGAAAGACGAGGAAGGAAAGGTTGAGGAAGTAG 735
Query 818 atgaggagaaagaaaaggaggagaagaaaaagaagaagattaaggaggTTTCTCATGAGT 877
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 736 ATGAGGAGAAAGAAAAGGAGGAGAAGAAAAAGAAGAAGATCAAGGAGGTGTCTCATGAGT 795
Query 878 GGGAT-TTGGTGAACAAGCAGAAACCGATTTGGATGAGGAAGCCAGAGGAGATCAACAAG 936
||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 796 TTGATCTTA-TGAACAAGCAGAAGCCTATTTGGATGAGGAAGCCCGAGGAGATCAACAAG 854
Query 937 GAGGAGTACGCTGCTTTCTACAAGAGTTTGAGCAATGACTGGGAAGAGCATTTGGCTGTG 996
||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 855 GAGGAATACGCTGCCTTCTACAAGAGTCTCAGCAATGACTGGGAGGAGCATTTGGCTGTC 914
Query 997 AAGCATTTCTCAGTTGAAGGACAGCTTGAGTTCAAAGCTATCCTCTTTGTTCCCAAGAGA 1056
||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||
Sbjct 915 AAGCACTTCTCTGTTGAGGGACAGCTTGAGTTCAAGGCTGTTCTGTTTGTTCCCAAGAGG 974
Query 1057 GCTCCTTTTGATCTCTTTGACACTAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGCTCTATGTCCGT 1116
|| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 975 GCCCCATTCGACCTTTTTGACACCAAGAAGAAGCCCAACAACATCAAGCTCTATGTCCGT 1034
Query 1117 CGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAAGACATCATTCCTGAGTACCTTGGGTTTGTCAAG 1176
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 1035 CGTGTCTTCATCATGGACAACTGTGAAGAGATCATTCCTGAATACCTTGGATTTGTGAAA 1094
Query 1177 GGTATTGTTGACTCTGAAGATCTTCCTCTCAACATCTCAAGAGAAACA-TTGCAGCAGAA 1235
|||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 1095 GGTATTGTTGACTCAGAGGACCTTCCCCTCAACATCTCCAGAGAAACTCTT-CAGCAGAA 1153
Query 1236 CAAGATCCTCAAGGTCATCCGCAAGAACCTTGTGAAGAAGTGTCTT-GAGCTCTTCTTTG 1294
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| |
Sbjct 1154 CAAGATCCTCAAGGTTATCCGCAAGAACCTTGTCAAGAAGTG-CATCGAGCTCTTCTTCG 1212
Query 1295 AGATTGCTGAGAACAAGGAGGACTACAACAAGTTCTATGAGGCTTTCTCTAAGAACCTGA 1354
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1213 AGATTGCTGAGAACAAAGAGGACTACAACAAGTTTTACGAGGCTTTCTCCAAGAACTTGA 1272
Query 1355 AGCTCGGTATCCATGAGGACTCCCAAAACAGAACCAAGATTGCTGAGTTGCTCCGTTACC 1414
|| | |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1273 AGTTGGGTATCCACGAGGACTCTCAGAACAGGACCAAGATTGCTGAGTTGCTCCGATACC 1332
Query 1415 ACTCAACCAAGAGCGGTGATGAATTGACCAGTCTCAAGGACTACGTGACAAGGATGAAGG 1474
|||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTCCACCAAGAGTGGAGATGAGTTGACCAGTCTTAAGGACTATGTGACAAGGATGAAGG 1392
Query 1475 AAGGTCAGAACGATATCTTCTATATCACTGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTTGAGAACTCTC 1534
|||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1393 AAGGACAGAATGACATCTACTACATCACTGGTGAGAGCAAGAAGGCTGTTGAGAACTCAC 1452
Query 1535 CATTCCTTGAGAAGCTCAAGAAGAAGGG-TATTGAAGTTCTCTACATGGTTGACGCTATC 1593
| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| || ||
Sbjct 1453 CCTTCCTTGAGAAGCTCAAGAAGAAGGGATAT-GAAGTCCTTTACATGGTTGATGCCATT 1511
Query 1594 GATGAGTATGCTATTGGTCAGCTCAAGGAATTCGAAGGAAAGAAGCTTGTCTCTGCAACC 1653
|||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1512 GATGAGTACGCCATTGGTCAGCTCAAGGAGTTTGAGGGAAAGAAACTTGTCTCTGCCACC 1571
Query 1654 AAGGAAGGTCTGAAACTGGATGAGACTgaagacgagaagaagaagaaagaagagctcaag 1713
||||||||| ||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 1572 AAGGAAGGTTTGAAACTCGAGGAAACAGAGGACGAGAAGAAAAAGAAGGAAGAACTCAAG 1631
Query 1714 gagaagTTTGAGGGACTCTGCAAAGTGATCAAGGACGTTTTGGGAGACAAGGTTGAGAAG 1773
|||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1632 GAGAAGTTTGAGGGTCTGTGCAAGGTGATCAAGGATGTCTTGGGAGACAAGGTTGAGAAG 1691
Query 1774 GTTATCGTCTCTGACCGTGTTGTGGACTCACCCTGCTGTCTTGTAACAGGCGAGTATGGC 1833
|| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||
Sbjct 1692 GTCATTGTCTCTGACCGTGTTGTTGACTCACCCTGCTGTCTTGTCACTGGCGAGTACGGC 1751
Query 1834 TGGACTGCAAACATGGAGAGGATCATGAAAGCTCAAGCCTTGAGAGACAGCAGCATGGGT 1893
|||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1752 TGGACTGCCAACATGGAGAGAATCATGAAGGCTCAGGCCTTGAGAGACAGCAGCATGGCT 1811
Query 1894 GGCTACATGTCGAGCAAGAAGACAATGGAGATTAACCCAGAGAACTCCATCATGGATGAG 1953
|| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1812 GGGTACATGTCTAGCAAGAAGACAATGGAAATCAACCCAGAGAACTCGATCATGGATGAG 1871
Query 1954 CTGAGAAAGAGAGCTGATGCAGACAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGACCTTGTACTTCTT 2013
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||
Sbjct 1872 TTGAGGAAGAGAGCTGATGCAGACAAGAACGACAAGTCAGTGAAGGATCTTGTCCTCCTC 1931
Query 2014 CTCTTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTCGGG 2073
||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1932 CTCTTCGAGACTGCTCTTCTCACCTCTGGTTTCAGCCTTGATGAGCCCAACACCTTCGGA 1991
Query 2074 AGCAGGATTCACAGGATG-TTGAAGCTTGGATTGAGCATTGATGACGATGATGTTG-T-- 2129
||||| || ||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || |||| | || |
Sbjct 1992 AGCAGAATCCACAGGATGCTT-AAGCTCGGACTCAGCATTGACGATGATGCGGGTGATAC 2050
Query 2130 TGAAGCCGATGCTGACATGCCTCCACTTGAAGATGATGCCGATGCTGAAGGTAGCAAGAT 2189
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||
Sbjct 2051 TGAAGCTGATGCTGACATGCCACCACTTGAAGATGACGCAGAGGCTGAAGGAAGCAAGAT 2110
Query 2190 GGAGGAAGTTGACTAA 2205
||| || || ||||||
Sbjct 2111 GGAAGAGGTCGACTAA 2126
> Ahg952322 jgi|Araly1|952322|scaffold_59400001.1
Length=242
Score = 326 bits (176), Expect = 6e-88
Identities = 219/240 (91%), Gaps = 1/240 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1897 TACATGTCGAGCAAGAAGACAATGGAGATTAACCCAGAGAACTCCATCATGGATGAGCTG 1956
|||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3 TACAGGTCAAGCAAGAAGACTATGGAGATAAACCCAGAGAACTCCATCATGGACGAGCTG 62
Query 1957 AGAAAGAGAGCTGATGCAGACAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGACCTTGTACTTCTTCTC 2016
||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 63 AGAAAGAGAGCCGACGCGGACAAGAACGATAAGTCTGTGAAGGATCTTGTGCTTCTTCTC 122
Query 2017 TTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTCGGGAGC 2076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 123 TTTGAGACCGCTCTTCTCACTTCTGGTTTCAGCCTCGATGAGCCCAACACTTTTGGAAGC 182
Query 2077 AGGATTCACAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATT-GATGACGATGATGTTGTTGAAGC 2135
|| || || ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||
Sbjct 183 AGAATCCATAGGATGTTGAAGCTTGGATTGAGCATTTGACGATGATGATGCCGTTGAAGC 242
> Ahg950188 jgi|Araly1|950188|scaffold_802075.1
Length=523
Score = 202 bits (109), Expect = 1e-50
Identities = 133/144 (92%), Gaps = 4/144 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 229 GCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCCTTGACAGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCA 288
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 GCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCGTTGACGGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCT 83
Query 289 GAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGA-CGATTATCGATAG 347
||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 84 GAGCTATTCCTTCATATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGAAC-ATTATCGATAG 142
Query 348 TG-GTATTGGGATGACCAAGGCTG 370
|| | ||||||||||| |||||||
Sbjct 143 TGTG-ATTGGGATGACTAAGGCTG 165
> Ahg947333 jgi|Araly1|947333|scaffold_703562.1
Length=383
Score = 202 bits (109), Expect = 1e-50
Identities = 132/143 (92%), Gaps = 2/143 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 229 GCTTTGGACAAGATTAGGTTTGAGTCCTTGACAGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCA 288
||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 24 GCTTTGGACAAGATTAGATTTGAGTCGTTGACGGACAAGAGCAAGCTTGATGGTCAGCCT 83
Query 289 GAGCTCTTCATTCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGA-CGATTATCGATAG 347
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 84 GAGCTATTCATTCATATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGAAC-ATTATCGATAG 142
Query 348 TGGTATTGGGATGACCAAGGCTG 370
||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 143 TGGGATTGGGATGACTAAGGCTG 165
> Ahg351538 jgi|Araly1|351538|fgenesh1_pg.C_scaffold_6002131
Length=552
Score = 195 bits (105), Expect = 2e-48
Identities = 133/146 (91%), Gaps = 3/146 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 524 AGCACAATGACGATGAGCAGTACGTGTGGGAGTCTCAGGCCGGTGGATCTTTCACCGTCA 583
||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |
Sbjct 270 AGCAC-ATGACGATGAGCAGTATGTGTGGGAGTCCCAGGCCGGTGGGTCTTTCACTGTGA 328
Query 584 CCAGAGACACCTCTGGTGAGGCTCTTGGTAGAGGAACTAAGATGGTCCTTTACCTCAAGG 643
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 CCAGAGACACCTCTGGGGAGGCTCTTGGTAGAGGAACAAAGATGGTCCTTTACCTCAAGG 388
Query 644 AAGACCAGATGGAGTACAT-TGAGGA 668
|||||||| ||| | ||| ||||||
Sbjct 389 AAGACCAGTTGGTG-ACAGGTGAGGA 413
> Ahg343166 jgi|Araly1|343166|fgenesh1_pg.C_scaffold_3002929
Length=477
Score = 187 bits (101), Expect = 3e-46
Identities = 122/132 (92%), Gaps = 2/132 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 240 GATTAGGTTTGAGTCCTTGACAGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCAGAGCTCTTCAT 299
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
Sbjct 3 GATTAGGTTTGAGTCGTTGACGGACAAGAGCAAGCTCGATGGTCAGCCTGAGCTATTCCT 62
Query 300 TCACATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGA-CGATTATCGATAGTGGTATTGGGA 358
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||
Sbjct 63 TCATATCATTCCCGACAAGACTAACAACACCTTGAAC-ATTATCGATAGTGGGATTGGGA 121
Query 359 TGACCAAGGCTG 370
|||| |||||||
Sbjct 122 TGACTAAGGCTG 133
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 91302317265
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5