BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G56090.1
Length=1720
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg475757 jgi|Araly1|475757|fgenesh2_kg.2__887__AT5G56090.1 2399 0.0
Ahg475683 jgi|Araly1|475683|fgenesh2_kg.2__813__AT5G56090.1 2392 0.0
Ahg950263 jgi|Araly1|950263|scaffold_802150.1 2346 0.0
Ahg917298 jgi|Araly1|917298|Al_scaffold_0008_2049 1424 0.0
> Ahg475757 jgi|Araly1|475757|fgenesh2_kg.2__887__AT5G56090.1
Length=1600
Score = 2399 bits (1299), Expect = 0.0
Identities = 1497/1591 (94%), Gaps = 19/1591 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 83 GCAAAAACCTTGCTTAAACCCTAGAGAGATAGAGATGTTTCGGGCGGTTGGATCGGCTCT 142
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| |
Sbjct 13 GCAGAAACCTTGCTTAAACCCTAGAGAGATAGACATGTTTCGAGCAGTGGGATCGGCTTT 72
Query 143 GAAGAGGAACAAAGAAGCGTTTAATGGAATTGCTCGAGGATTCACCACTTCGTCTCATCG 202
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 GAAGAGGAACAAAGAAGCGTTTAATGGAATCGCTCGAGGATTCACCACTTCGTCTCATCA 132
Query 203 AGTTTTCACTTCTAACATTACAGCTGCTTCTGTAACCTCTGCTTCGTCTTCTCCTTTAGC 262
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 133 AGCTTTCACTTCTAACATTACAGCTGCTACTGTAACCTCTGCTTCGTCTTCTTCTCTAGC 192
Query 263 TGGAAACTCCTTCTATGGCTTGCGATCTCTGCTCAAGGGTCAAAATGCTTCAATGTTTAG 322
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193 TGGAAACTCCTTCTATGGCTTGCCATCTCTTCTCAAGGGTCAAAATGCTTCAATGTTTAG 252
Query 323 GAGGATGTCAACTGTAGCGTCGATAAGCTCAGAGAGTAAAGAGGGTTTGAAGCTTCTTGT 382
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 253 AAAGATGTCAACTGTAGCGTCGATTAGCTCAGAGAGTAAAGAGGGTTTGAAGCATCTTGT 312
Query 383 CACTGGAGGACCTCAAGCTCAG-AAATGGGTTGGAATTTGGCTTTTTGGTTCGGCTGCTT 441
|||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||
Sbjct 313 CACTGGAGGACCTCAAGCTC-GTAAATGGGTTGGCATATGGCTTTTTGGTTCTGCTACTT 371
Query 442 GGGTTTTCAGCATGGTTGTACTTGGCGGTGTAACCCGATTAACTCGATCTGGTTTATCGA 501
||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 372 GGGTTTTCAGCATGGTTGTTCTAGGCGGAGTTACTCGATTAACTCGATCTGGTTTATCCA 431
Query 502 TGACTGATTGGAAATTTACTGGTGAATTCCCTCCTCTGTCAGATGAAGCTTGGGCTAAG- 560
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |
Sbjct 432 TGACTGATTGGAAATTTACTGGTGAATTCCCTCCGCTGTCAGATGAAGCATGGG-TTTGC 490
Query 561 GAGTTTGAGAAATATAAGCAGTCACCTGAATATAAGCGTGTGAACAAAGGGATGAACCTT 620
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 491 GAGTTTGAGAAATATATGCAGTCTCCTGAATATAAGCGTGTGAACAAAGGGATGAATCTT 550
Query 621 GAAGATTTTAAGTTCATATATTGGATGGAGTATGCTCATCGAATGTGGGGAAGAGGATTG 680
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 GAAGATTTTAAGTTTATATATTGGATGGAGTATGCTCATCGAATGTGGGGAAGAGGATTG 610
Query 681 GGAATCATGTTTGCTTTGCCGTTTTCTTATTTTCTGCGTAAAGGGTATATTACTCTACGT 740
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 611 GGAATCATGTTTGCTTTGCCGTTTTCCTATTTTCTGCGGAAAGGGTATATTACTCTACGT 670
Query 741 CTTGGAGTTCAGCTCTCTGGTTTATTTGCGCTTGGTGCTGGACAAGGTTTCATTGGTTGG 800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 671 CTTGGAGTTCAGCTCTCTGGTTTATTTGCGCTTGGTGCTGGACAAGGTCTCATTGGTTGG 730
Query 801 TGGATGGTTAAAAGTGGTTTAGAGGAGCCACCGTCTGAGTATTCTCAACCGAGGGTAAGC 860
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 731 TGGATGGTTAAAAGTGGTTTAGAGGAGCCGCCATCTGAATATTCTCAACCGAGGGTAAGC 790
Query 861 CCATACCGTCTTGCAGCTCACCTGACCTCAGCTTTTGCCATTTATTGTGGACTTTTCTGG 920
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 CCGTACCGTCTTGCAGCTCATCTGACCTCAGCTTTTGCCATTTATTGTGGACTTTTCTGG 850
Query 921 ACCGCTCTCTCTGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCACTGGCTTGGGTTCGCGGA 980
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||
Sbjct 851 ACCGCTCTCTCTGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCATTGGCTTGGGTTAGGGGA 910
Query 981 GCAGCTAAAGTGAAGAAGCTTGCATTACCAGTAAGCTTGATTGTTGGTATCACTGCAATT 1040
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 GCCGCTAAAGTGAAGAAGCTTGCATTACCAGTAAGCTTGATTGTTGGTATCACTGCAATT 970
Query 1041 TCAGGAGCATTTGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACATTTCCC-AAAAT 1099
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 971 TCAGGAGCCTTTGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACATT-CCCGAAAAT 1029
Query 1100 GGGTGACACATGGATCCCAGATAATATATTTGAGATGAAACCACTTTTACGCAACTTTTT 1159
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1030 GGGCGATACATGGATCCCAGATAATATATTTGAGATGAAACCACTTTTACGCAACTTGTT 1089
Query 1160 CGAGAACACAGCAACTGTTCAGCTTGATCATCGCCTTCTGGCAACCACAACATTAATCGC 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1090 CGAGAACACAGCAACTGTTCAGCTTGATCATCGCCTTCTTGCAACCACAACCCTAATCGC 1149
Query 1220 AATCGGAACAATGTGGTGGTTCACAAGGAAGCTAGACATACATCCAGCTGTTAAAGCTTT 1279
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1150 AATTGGAACAATGTGGTGGTTCACAAGGAAGCTAGACATACATCCAGCCGTTAAAGCTTT 1209
Query 1280 GATCGGAAGTACTGTTGGAATGACTGCTGTTCAGGTGACATTAGGTGTATCAACGCTTCT 1339
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 GATCGGAAGTACCGTCGGAATGACTGCTGTTCAGGTGACATTAGGTGTATCAACGCTTCT 1269
Query 1340 GAGTTATGTTCCGGTTTCACTAGGAAGTGCACACCAAGCAGGAGCTTTAACACTTCTCAC 1399
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 GAGTTATGTTCCGGTCTCACTAGGAAGCGCACACCAAGCAGGAGCTTTAACACTTCTCAA 1329
Query 1400 TTTGATGCTACTTCTCAATCACACTCTTCGGAGGCCATCACCTTCTCTTCTCAAATCTCT 1459
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1330 TTTGATGCTACTTCTCAATCACACTCTTCGGAGGCCATCACCTTCTCTTCTCAAGTCTCT 1389
Query 1460 TCCACAAGTTGCTAAATCAAATTTCAGCTAA-GCCCTCTTCACCAAAATCTTTCC-TTTT 1517
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 1390 TCCACAAGTTGCTAAATCAAATTTTAGCTAAAGCCCTCTTCACTAAAATCTT-CCGTTTT 1448
Query 1518 TCATTATTTACTaaaaaaaCAATTCTTTGGCTCACTATGCTACTAGCAAGCTTTCATCGA 1577
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 TCATTATTTACTAAAGAAACTATTCTTTGGCTCACTATTATACTAGCAAGCTTTCATCGA 1508
Query 1578 ATCTTGTGTCAATGATGTTGTATG----GT--T--C--GAAAAATAAAGTACAAAAACAA 1627
|| || |||||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1509 GTCCTGCGTCAATGATGTTGTATTATCAGTCATGACTCGAAAAATAAAGTACGAAAACAA 1568
Query 1628 TTAACAAAAGTTTCATATGAATCCCAGAACT 1658
|||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1569 TTAACAAAAGTTTCATATGAATCCTAGAACT 1599
> Ahg475683 jgi|Araly1|475683|fgenesh2_kg.2__813__AT5G56090.1
Length=1597
Score = 2392 bits (1295), Expect = 0.0
Identities = 1494/1589 (94%), Gaps = 18/1589 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 83 GCAAAAACCTTGCTTAAACCCTAGAGAGATAGAGATGTTTCGGGCGGTTGGATCGGCTCT 142
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| |
Sbjct 13 GCAGAAACCTTGCTTAAACCCTAGAGAGATAGACATGTTTCGAGCAGTGGGATCGGCTTT 72
Query 143 GAAGAGGAACAAAGAAGCGTTTAATGGAATTGCTCGAGGATTCACCACTTCGTCTCATCG 202
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 GAAGAGGAACAAAGAAGCGTTTAATGGAATCGCTCGAGGATTCACCACTTCGTCTCATCA 132
Query 203 AGTTTTCACTTCTAACATTACAGCTGCTTCTGTAACCTCTGCTTCGTCTTCTCCTTTAGC 262
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 133 AGCTTTCACTTCTAACATTACAGCTGCTACTGTAACCTCTGCTTCGTCTTCTTCTCTAGC 192
Query 263 TGGAAACTCCTTCTATGGCTTGCGATCTCTGCTCAAGGGTCAAAATGCTTCAATGTTTAG 322
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193 TGGAAACTCCTTCTATGGCTTGCCATCTCTTCTCAAGGGTCAAAATGCTTCAATGTTTAG 252
Query 323 GAGGATGTCAACTGTAGCGTCGATAAGCTCAGAGAGTAAAGAGGGTTTGAAGCTTCTTGT 382
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 253 AAAGATGTCAACTGTAGCGTCGATTAGCTCAGAGAGTAAAGAGGGTTTGAAGCATCTTGT 312
Query 383 CACTGGAGGACCTCAAGCTCAG-AAATGGGTTGGAATTTGGCTTTTTGGTTCGGCTGCTT 441
|||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||
Sbjct 313 CACTGGAGGACCTCAAGCTC-GTAAATGGGTTGGCATATGGCTTTTTGGTTCTGCTACTT 371
Query 442 GGGTTTTCAGCATGGTTGTACTTGGCGGTGTAACCCGATTAACTCGATCTGGTTTATCGA 501
||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 372 GGGTTTTCAGCATGGTTGTTCTAGGCGGAGTTACTCGATTAACTCGATCTGGTTTATCCA 431
Query 502 TGACTGATTGGAAATTTACTGGTGAATTCCCTCCTCTGTCAGATGAAGCTTGGGCTAAG- 560
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |
Sbjct 432 TGACTGATTGGAAATTTACTGGTGAATTCCCTCCGCTGTCAGATGAAGCATGGG-TTTGC 490
Query 561 GAGTTTGAGAAATATAAGCAGTCACCTGAATATAAGCGTGTGAACAAAGGGATGAACCTT 620
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 491 GAGTTTGAGAAATATATGCAGTCTCCTGAATATAAGCGTGTGAACAAAGGGATGAATCTT 550
Query 621 GAAGATTTTAAGTTCATATATTGGATGGAGTATGCTCATCGAATGTGGGGAAGAGGATTG 680
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 GAAGATTTTAAGTTTATATATTGGATGGAGTATGCTCATCGAATGTGGGGAAGAGGATTG 610
Query 681 GGAATCATGTTTGCTTTGCCGTTTTCTTATTTTCTGCGTAAAGGGTATATTACTCTACGT 740
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 611 GGAATCATGTTTGCTTTGCCGTTTTCCTATTTTCTGCGGAAAGGGTATATTACTCTACGT 670
Query 741 CTTGGAGTTCAGCTCTCTGGTTTATTTGCGCTTGGTGCTGGACAAGGTTTCATTGGTTGG 800
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 671 CTTGGAGTTCAGCTCTCTGGTTTATTTGCACTTGGTGCTGGACAAGGTCTCATTGGTTGG 730
Query 801 TGGATGGTTAAAAGTGGTTTAGAGGAGCCACCGTCTGAGTATTCTCAACCGAGGGTAAGC 860
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 731 TGGATGGTTAAAAGTGGTTTAGAGGAGCCGCCATCTGAATATTCTCAACCGAGGGTAAGC 790
Query 861 CCATACCGTCTTGCAGCTCACCTGACCTCAGCTTTTGCCATTTATTGTGGACTTTTCTGG 920
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 CCGTACCGTCTTGCAGCTCATCTGACCTCAGCTTTTGCCATTTATTGTGGACTTTTCTGG 850
Query 921 ACCGCTCTCTCTGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCACTGGCTTGGGTTCGCGGA 980
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||
Sbjct 851 ACCGCTCTCTCTGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCATTGGCTTGGGTTAGGGGA 910
Query 981 GCAGCTAAAGTGAAGAAGCTTGCATTACCAGTAAGCTTGATTGTTGGTATCACTGCAATT 1040
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 911 GCCGCTAAAGTGAAGAAGCTTGCATTACCAGTAAGCTTGATTGTTGGTATCACTGCAATT 970
Query 1041 TCAGGAGCATTTGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACATTTCCC-AAAAT 1099
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 971 TCAGGAGCCTTTGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACA-TTCCCGAAAAT 1029
Query 1100 GGGTGACACATGGATCCCAGATAATATATTTGAGATGAAACCACTTTTACGCAACTTTTT 1159
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 GGGCGATACATGGATCCCAGATAATATATTTGAGATGAAACCACTTTTACGCAACTTTTT 1089
Query 1160 CGAGAACACAGCAACTGTTCAGCTTGATCATCGCCTTCTGGCAACCACAACATTAATCGC 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||
Sbjct 1090 CGAGAACACAGCAACTGTTCAGCTTGATCATCGCCTTCTTGCAACCACAACCCTAATTGC 1149
Query 1220 AATCGGAACAATGTGGTGGTTCACAAGGAAGCTAGACATACATCCAGCTGTTAAAGCTTT 1279
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1150 AATTGGAACAATGTGGTGGTTCACAAGGAAGCTAGACATACATCCAGCCGTTAAAGCTTT 1209
Query 1280 GATCGGAAGTACTGTTGGAATGACTGCTGTTCAGGTGACATTAGGTGTATCAACGCTTCT 1339
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 GATCGGAAGTACCGTCGGAATGACTGCTGTTCAGGTGACATTAGGTGTATCAACGCTTCT 1269
Query 1340 GAGTTATGTTCCGGTTTCACTAGGAAGTGCACACCAAGCAGGAGCTTTAACACTTCTCAC 1399
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 GAGTTATGTTCCGGTCTCACTAGGAAGCGCACACCAAGCAGGAGCTTTAACACTTCTCAC 1329
Query 1400 TTTGATGCTACTTCTCAATCACACTCTTCGGAGGCCATCACCTTCTCTTCTCAAATCTCT 1459
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1330 TTTGATGCTACTTCTCAATCACACTCTTCGGAGGCCATCACCTTCTCTTCTCAAGTCTCT 1389
Query 1460 TCCACAAGTTGCTAAATCAAATTTCAGCTAAGCCCTCTTCACCAAAATCTTTCC-TTTTT 1518
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||
Sbjct 1390 TCCACAAGTTGCTAAATCAAATTTTAGCTAAGCCCTCTTTACTAAAATCTT-CCGTTTTT 1448
Query 1519 CATTATTTACTaaaaaaaCAATTCTTTGGCTCACTATGCTACTAGCAAGCTTTCATCGAA 1578
|||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 CATTATTTACTAAAGAAACTATTCTTTGGCTCGCTATTATACTAGCAAGCTTTCATCGAG 1508
Query 1579 TCTTGTGTCAATGATGTTGTATG----GT--T--C--GAAAAATAAAGTACAAAAACAAT 1628
|| || |||||||||||||||| || | | |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1509 TCCTGCGTCAATGATGTTGTATTATCAGTCATGACTCGAAAAATAAAGTACGAAAACAAT 1568
Query 1629 TAACAAAAGTTTCATATGAATCCCAGAAC 1657
||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1569 TAACAAAAGTTTCATATGAATCCTAGAAC 1597
> Ahg950263 jgi|Araly1|950263|scaffold_802150.1
Length=1420
Score = 2346 bits (1270), Expect = 0.0
Identities = 1372/1421 (97%), Gaps = 7/1421 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 98 AAACCCTAGAGAGATAGAGATGTTTCGGGCGGTTGGATCGGCTCTGAAGAGGAACAAAGA 157
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2 AAACCCTAGAGAGATAGAGATGTTTCGAGCGGTGGGATCGGCTCTCAAGAGGAACAAAGA 61
Query 158 AGCGTTTAATGGAATTGCTCGAGGATTCACCACTTCGTCTCATCGAGTTTTCACTTCTAA 217
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 62 AGCGTTTAATGGAATCGCTCGAGGATTCACCACTTCGTCTCATCGAGTTTTCACTTCTAA 121
Query 218 CATTACAGCTGCTTCTGTAACCTCTGCTTCGTCTTCTCCTTTAGCTGGAAACTCCTTCTA 277
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 122 CATTACAGCTGCTACTGTAACCTCTGCTTCGTCTTCTTCTCTAGCTGGAAACTCCTTCTA 181
Query 278 TGGCTTGCGATCTCTGCTCAAGGGTCAAAATGCTTCAATGTTTAGGAGGATGTCAACTGT 337
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 182 TGGCTTGCGATCTCTTCTCAAGGGTCAAAATGCTTCAATGTTTAGGAAGATGTCAACTGT 241
Query 338 AGCGTCGATAAGCTCAGAGAGTAAAGAGGGTTTGAAGCTTCTTGTCACTGGAGGACCTCA 397
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 242 AGCCTCGATTAGCTCAGAGAGTAAAGAGGGTTTGAAGCATCTTGTCACTGGAGGACCTCA 301
Query 398 AGCTCA-GAAATGGGTTGGAATTTGGCTTTTTGGTTCGGCTGCTTGGGTTTTCAGCATGG 456
|||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 302 AGCT-AGGAAATGGGTTGGGATATGGCTTTTTGGTTCTGCTACTTGGGTTTTCAGCATGG 360
Query 457 TTGTACTTGGCGGTGTAACCCGATTAACTCGATCTGGTTTATCGATGACTGATTGGAAAT 516
||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTGTACTAGGCGGAGTAACCCGATTTACTCGATCTGGTTTATCGATGACTGATTGGAAAT 420
Query 517 TTACTGGTGAATTCCCTCCTCTGTCAGATGAAGCTTGGGCTAAGGAGTTTGAGAAATATA 576
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCACTGGTGAATTCCCTCCTCTGTCAGATGAAGCTTGGGTTAAGGAGTTTGAGAAATATA 480
Query 577 AGCAGTCACCTGAATATAAGCGTGTGAACAAAGGGATGAACCTTGAAGATTTTAAGTTCA 636
||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGCAGTCGCCTGCATACAAGCGTGTGAACAAAGGGATGAATCTTGAAGATTTTAAGTTCA 540
Query 637 TATATTGGATGGAGTATGCTCATCGAATGTGGGGAAGAGGATTGGGAATCATGTTTGCTT 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TATATTGGATGGAGTATGCTCATCGAATGTGGGGAAGAGGATTGGGAATCATGTTTGCTT 600
Query 697 TGCCGTTTTCTTATTTTCTGCGTAAAGGGTATATTACTCTACGTCTTGGAGTTCAGCTCT 756
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGCCGTTTTCTTATTTTCTGCGGAAAGGGTATATTACTCTACGTCTTGGAGTTCAGCTCT 660
Query 757 CTGGTTTATTTGCGCTTGGTGCTGGACAAGGTTTCATTGGTTGGTGGATGGTTAAAAGTG 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CTGGTTTATTTGCGCTTGGTGCTGGACAAGGTTTCATTGGTTGGTGGATGGTTAAAAGTG 720
Query 817 GTTTAGAGGAGCCACCGTCTGAGTATTCTCAACCGAGGGTAAGCCCATACCGTCTTGCAG 876
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTTTAGAGGAGCCGCCGTCTGAATATTCTCAACCGAGGGTAAGCCCATACCGTCTTGCAG 780
Query 877 CTCACCTGACCTCAGCTTTTGCCATTTATTGTGGACTTTTCTGGACCGCTCTCTCTGTTG 936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTCACCTGACCTCAGCTTTTGCCATTTATTGTGGACTTTTCTGGACCGCTCTCTCTGTTG 840
Query 937 TTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCACTGGCTTGGGTTCGCGGAGCAGCTAAAGTGAAGA 996
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 841 TTATGCCTGAACCACCAGCTGAGTCACTGGCTTGGGTTCGGGGAGCAGCTAAAGTGAAGA 900
Query 997 AGCTTGCATTACCAGTAAGCTTGATTGTTGGTATCACTGCAATTTCAGGAGCATTTGTTG 1056
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AGCTTGCATTACCAGTAAGCTTAATTGTTGGTATCACTGCAATTTCAGGAGCATTTGTTG 960
Query 1057 CTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACATTTCCCAAAA-TGGGTGACACATGGATC 1115
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 961 CTGGAAATGATGCTGGTCGTGCATTCAACACATT-CCCAAAAATGGGTGACACATGGATC 1019
Query 1116 CCAGATAATATATTTGAGATGAAACCACTTTTACGCAACTTTTTCGAGAACACAGCAACT 1175
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 CCTGATAATATATTTGAGATGAAACCACTTTTACGCAATTTTTTCGAGAACACAGCAACT 1079
Query 1176 GTTCAGCTTGATCATCGCCTTCTGGCAACCACAACATTAATCGCAATCGGAACAATGTGG 1235
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1080 GTTCAGCTTGATCATCGCCTTCTTGCAACCACAACGCTAATAGCAATTGGAACAATGTGG 1139
Query 1236 TGGTTCACAAGGAAGCTAGACATACATCCAGCTGTTAAAGCTTTGATCGGAAGTACTGTT 1295
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 TGGTTCACTAGGAAGCTAGACATACATCCAGCCGTTAAAGCTTTGATCGGAAGTACTGTT 1199
Query 1296 GGAATGACTGCTGTTCAGGTGACATTAGGTGTATCAACGCTTCTGAGTTATGTTCCGGTT 1355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1200 GGAATGACTGCTGTTCAGGTGACATTAGGTGTATCAACGCTTCTGAGCTATGTTCCGGTT 1259
Query 1356 TCACTAGGAAGTGCACACCAAGCAGGAGCTTTAACACTTCTCACTTTGATGCTACTTCTC 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TCACTAGGAAGTGCACACCAAGCAGGAGCTTTAACACTTCTCACTTTGATGCTACTTCTC 1319
Query 1416 AATCACACTCTTCGGAGGCCATCACCTTCTCTTCTCAAATCTCTTCCACAAGTTGCTAAA 1475
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1320 AATCACACTCTTCGGAGGCCATCGCCTTCTCTTCTCAAATCCCTTCCACAAGTTGCTAAA 1379
Query 1476 TCAAATTTCAGCTAAGC--CC-TCTTCACCAAAATCTTTCC 1513
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TCAAATTTCAGCTAAGCAGCCCTCTTCACCAAAATCTTTCC 1420
> Ahg917298 jgi|Araly1|917298|Al_scaffold_0008_2049
Length=1224
Score = 1424 bits (771), Expect = 0.0
Identities = 814/835 (97%), Gaps = 2/835 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 657 CATCGAATGTGGGGAAGAGGATTGGGAATCATGTTTGCTTTGCCGTTTTCTTATTTTCTG 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 CATCGAATGTGGGGAAGAGGATTGGGAATCATGTTTGCTTTGCCGTTTTCTTATTTTCTG 450
Query 717 CGTAAAGGGTATATTACTCTACGTCTTGGAGTTCAGCTCTCTGGTTTATTTGCGCTTGGT 776
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 CGGAAAGGGTATATTACTCTACGTCTTGGAGTTCAGCTCTCTGGTTTATTTGCGCTTGGT 510
Query 777 GCTGGACAAGGTTTCATTGGTTGGTGGATGGTTAAAAGTGGTTTAGAGGAGCCACCGTCT 836
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 511 GCTGGACAAGGTCTCATTGGTTGGTGGATGGTTAAAAGTGGTTTAGAGGAGCCGCCGTCT 570
Query 837 GAGTATTCTCAACCGAGGGTAAGCCCATACCGTCTTGCAGCTCACCTGACCTCAGCTTTT 896
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 GAATATTCTCAACCGAGGGTAAGCCCATACCGTCTTGCAGCTCACCTGACCTCAGCTTTT 630
Query 897 GCCATTTATTGTGGACTTTTCTGGACCGCTCTCTCTGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCT 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 GCCATTTATTGTGGACTTTTCTGGACCGCTCTCTCTGTTGTTATGCCTGAACCACCAGCT 690
Query 957 GAGTCACTGGCTTGGGTTCGCGGAGCAGCTAAAGTGAAGAAGCTTGCATTACCAGTAAGC 1016
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 GAGTCACTGGCTTGGGTTCGGGGAGCAGCTAAAGTGAAGAAGCTTGCATTACCAGTAAGC 750
Query 1017 TTGATTGTTGGTATCACTGCAATTTCAGGAGCATTTGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGT 1076
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 751 TTGATTGTTGGTATCACTACGATTTCAGGAGCATTTGTTGCTGGAAATGATGCTGGTCGT 810
Query 1077 GCATTCAACACATTTCCCAAAA-TGGGTGACACATGGATCCCAGATAATATATTTGAGAT 1135
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 GCATTCAACACATT-CCCAAAAATGGGTGACACATGGATCCCAGATAATATATTTGAGAT 869
Query 1136 GAAACCACTTTTACGCAACTTTTTCGAGAACACAGCAACTGTTCAGCTTGATCATCGCCT 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 GAAACCACTTTTACGCAACTTTTTCGAGAACACAGCAACTGTTCAGCTTGATCATCGCCT 929
Query 1196 TCTGGCAACCACAACATTAATCGCAATCGGAACAATGTGGTGGTTCACAAGGAAGCTAGA 1255
||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 TCTTGCAACCACAACGCTAATAGCAATTGGAACAATGTGGTGGTTCACAAGGAAGCTAGA 989
Query 1256 CATACATCCAGCTGTTAAAGCTTTGATCGGAAGTACTGTTGGAATGACTGCTGTTCAGGT 1315
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 990 CATACATCCAGCCGTTAAAGCTTTGATCGGAAGTACTGTGGGAATGACTGCTGTTCAGGT 1049
Query 1316 GACATTAGGTGTATCAACGCTTCTGAGTTATGTTCCGGTTTCACTAGGAAGTGCACACCA 1375
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1050 GACATTAGGTGTATTAACGCTTCTGAGTTATGTTCCGGTCTCACTAGGAAGTGCACATCA 1109
Query 1376 AGCAGGAGCTTTAACACTTCTCACTTTGATGCTACTTCTCAATCACACTCTTCGGAGGCC 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 AGCAGGAGCTTTAACACTTCTCACTTTGATGCTACTTCTCAATCACACTCTTCGGAGGCC 1169
Query 1436 ATCACCTTCTCTTCTCAAATCTCTTCCACAAGTTGCTAAATCAAATTTCAGCTAA 1490
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 ATCGCCTTCTCTTCTCAAATCCCTTCCACAAGTTGCTAAATCAAATTTCAGCTAA 1224
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 64524875030
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5