BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G56220.1
Length=3103
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg950279 jgi|Araly1|950279|scaffold_802166.1 4852 0.0
Ahg497314 jgi|Araly1|497314|fgenesh2_kg.191__1__AT5G56220.1 2039 0.0
Ahg948392 jgi|Araly1|948392|scaffold_800279.1 154 4e-36
> Ahg950279 jgi|Araly1|950279|scaffold_802166.1
Length=2960
Score = 4852 bits (2627), Expect = 0.0
Identities = 2860/2971 (96%), Gaps = 22/2971 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 39 GAAGTAAAAGGAGTAATGAAGGGAAT---AGAAG-A--AGAAGCAAGTTTAGTTGGTTTA 92
|||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||
Sbjct 6 GAAGTAAAAGGAGTAATGAAGGGAATAGAAGAAGAAGCAGAAGCAAGTTTAGTTGGATTA 65
Query 93 ACCATAAGAACTTCATCACCAGCAAGCTCTTCAAGTAAGAAAGGTAAAGAAGATCTTCTT 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 66 ACCATAAGAACTTCATCACCAGCAAGCTCTTCAAGTAAGAAAGGT--A-AAGATCTTCTT 122
Query 153 CAAGCAAATAATAATGCTTCAGATTCATCTCCAAGTATCAAAAACTCTCCTTTCTATTCA 212
||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 123 CAAACAAATAACAATGCTTCAGATTCATCTCCAAGTATCAAAAACTCTCCTTTCAATTCA 182
Query 213 CCTTCTCTTGTGTCCCCACCATCTTCTGCTTTTGTTTCCGCTTTGCAATCTCCTTATATA 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 CCTTCTCTTGTGTCCCCACCATCTTCTGCTTTTGTTTCCGCTTTGCAATCTCCTTATATA 242
Query 273 TCCCCAAGAGCTACAACACCCTCCATTACCACTCACAAGCCATCACCGCCTCTTTCTTAC 332
|||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 243 TCCCCAAGAGCTACTACA--C-CCATTACCACTCACAAGCCATCACCGCCTCTCTCTTAC 299
Query 333 AAAGGCTCACAATCTGATGATGTACCAAGCAGCTCCTACACTCCTCCTTCTGACCAGTAC 392
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 300 AAAGGCTCACAATCTGAAGATGTACCTAGCAGCTCCTACACTCCTCCCTCTGACCAGTAC 359
Query 393 GAGTTTTCTGATGAACAACCATCAGATCGGAAGCTCAAGTTATCAGCATCTTGTACTCCA 452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 360 GAGTTTTCTGATGAACAACCATCAGATCGGAAGCTCAAGTTATCAG---CTTGTACTCCA 416
Query 453 GATCCTGCTCCTCCAAGGATCTCTTTCTCTTTCCCTGTTCCTAGGGTTTCTTTGGCTAAA 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 GATCCTGCTCCTCCAAGGATCTCTTTCTCTTTCCCTGTTCCTAGGGTTTCTTTGGCTAAA 476
Query 513 GTCTCTGTTTCTTCACCTGCAACTAACACCAAGCTCAGGAGCTCTGATGTCTTCATAGGG 572
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 477 GTTTCTGTTTCTTCACCTGCAACTAACACCAAGCTCAGGAGCTCTGATGTCTTCATTGGG 536
Query 573 TTTCATGGACAAAACCCAAACTTGGTGAGATTCTGCAAATGGTTAAAGTCAGAGCTTGAG 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 TTTCATGGACAAAACCCAAACTTGGTGAGATTCTGCAAATGGTTAAAGTCAGAGCTTGAG 596
Query 633 CTTCAGGGAATCGCTTGTTTCGTTGCTGACAGAGCTAAGTATTCGGACACACAGAGTCAT 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 CTTCAGGGAATCGCTTGTTTCGTTGCTGACAGAGCTAAGTATTCGGACACACAGAGTCAT 656
Query 693 GAGATCGCCGACAGAGTTATCTGTTCTGTTACTTATGGGATTGTGGTTGTCTCTTGTTCC 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 GAGATCGCCGACAGAGTTATCTGTTCTGTTACTTATGGGATTGTGGTTGTCTCTTGTTCC 716
Query 753 AGCTTGCTCAACTACCTTAGCTTGGAGGAAGTTAGGTTCTTTGCTCAAAAGAAGAACTTG 812
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 AGCTTGCTCAACTACCTTAGCTTGGAGGAGGTTAGGTTCTTTGCTCAAAAGAAGAACTTG 776
Query 813 ATTCCTATTTTCTATGGAACTGGTCCTTCTGAGATTATGGGTCTTCTCAACTGCAATGCC 872
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 ATTCCAATTTTCTATGGAACTGGTCCTTCTGAGATAATGGGTCTTCTCAACTGCAATGCC 836
Query 873 ATAGATAAAGAGTGTAAAGAAGCCATTGATGGGTTGATTAAGTCTCATGAGTTTAAACTA 932
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 837 ATAGATAAAGAGTGTAAAGAAGCCATTGATGGGTTGATTAAGTCACATGAGTTTAAACTT 896
Query 933 GAAGCTAATGAGAGTAACTGGAGAAGCTGTGTGGGAAAGACTGCGACGATTCTCAGGGCA 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 897 GAAGCTAATGAGAGTAACTGGAGAAGCTGTGTGGGAAAGACCGCGACGATTCTCAGGGCA 956
Query 993 AAGCTTGGGAGGAAGAGTGTGGCTGATAAAGAGATTGTGGAAGGGATTGATGAGCTTCCA 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 AAGCTTGGGAGGAAGAGTGTGGCTGATAAAGAGATAGTGGAAGGGATTGATGAGCTTCCA 1016
Query 1053 TTTCCGAGGAACAGATCTTTTCTTGGAAGAGAAAAGGAGATCATTGAAATGGAGATGGCT 1112
||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1017 TTTCCAAGGAACAGATATTTTCTTGGAAGAGAAAAGGAGATAATTGAAATGGAAATGGCT 1076
Query 1113 TTATTTGGTAATGGAGAGTATCTTGAGTCTACAACACCAAGTACCAGAGGAGAAGCAAGT 1172
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1077 TTATTTGGTAATGGAGAGTATCTTGAATCTACAACACCAAGCACCAGAGGAGAAGCAAGT 1136
Query 1173 GGACAATCTGAAGGACTTGCAGATGAGGAATCAGATGTTGTACCAACTCGAAATGGGAAG 1232
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1137 GGACAATCTGAAGGACTTGCAGATGAGGAATCAGATGTTGTATCAACTCGAAATGGGAAA 1196
Query 1233 TTTATTAGCTTGGAGCTTGGAAGATGCTCAGATTCAAGAAGTGAGGCTTGGAGTGATCCA 1292
||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 TTTATCAGCTTGGAGCTTGGAAAATGTTCAGAGCCAAGAAGTGAGGCTTGGAGTGATCCA 1256
Query 1293 AATGGTGGGAAAAACTCTCTTAAAAGATTGTTGAAGACTAAGAAGTGTAGAAACAATAGT 1352
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1257 AATGGTGGGAAAAACTCGCTTAAAAGACTGTTGAAGAGTAAGAAGTATAGAAACAATAGT 1316
Query 1353 AACTGCAAAAGTAGCACAAGTGTTGTTTGTGTAAATGGAGTTCCAGGGATTGGGAAGACA 1412
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1317 AACTGCAAAAGTAGCACAAGTGTTGTTTGCGTGAATGGAGTTCCCGGGATTGGGAAGACA 1376
Query 1413 GAGTTAGCTCTTGAATTCGCTTACAGGTATTCTCAGAGGTATAAGATGGTTTTGTGGGTC 1472
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 GAGTTAGCCCTTGAATTCGCTTACCGGTATTCTCAGAGATATAAGATGGTTTTGTGGGTC 1436
Query 1473 GGAGGGGAAGCTCGATACTTTAGACAGAACCTGTTAAATCTGTCATTCAGCTTGGGGCTT 1532
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 GGAGGGGAAGCTCGATACTTCAGACAGAACCTGTTGAATCTGTCATTCAGCTTGGGGCTT 1496
Query 1533 GATGTTAGTGCAGATGCTGAGAAGGATAGAGGTAGACTAAGGAGCTTTGATGAACAAGAG 1592
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1497 GATGTTAGTGCAGATGCTGAGAAGGATAGAGGTAGGCTAAGGAGCTTTGATGAGCAAGAG 1556
Query 1593 TTTGAAGCTTTCAAGAGAATAAAGCGTGAGTTATTCAGAGACATGCCTTATCTGTTGATC 1652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1557 TTTGAAGCTTTCAAGAGAATAAAGCGTGAGTTATTCAGAGACATGCCCTATCTGTTGATC 1616
Query 1653 ATTGATAATCTTGAGATAGAGAAGGATTGGTGGGAAGGGAAAGATCTAAATGATTTGATT 1712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1617 ATTGATAATCTTGAGATAGAGAAGGATTGGTGGGAAGGGAAAGATCTAAATGATCTGATT 1676
Query 1713 CCGAGGAACACCGGAGGAACACATGTTTTGATCACTACTAGACTTCCTAAAGTCATGACC 1772
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1677 CCGAGGAACACCGGAGGAACACATGTCCTGATCACTACTAGACTTCCTAAAGTAATGACC 1736
Query 1773 TTTGACACTGTGCAGCTTTCTATATTGCCTTCGTCTGATGCAATGGTGTTACTGAGAGGA 1832
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1737 TTTGACACTGTGCAGCTTTCTGTATTGCCTTCGTCTGATGCAATGGTTTTACTGAGAGGA 1796
Query 1833 AGAAGAAAGAAAGATTACCCGGTGGAGGAGGTGGAGGTCCTCAAGCTTTTCGATGAGAAA 1892
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 AGAAGAAAGAAAGATTACCCGGTGGAGGAGGTTGAGGTCCTCAAGCTTTTCGATGAGAAA 1856
Query 1893 TTGGGAAGGTTGAGCTATGGTCTTTGGGTGGTTGGATCATTGCTTTCAGAGCTTGCAATT 1952
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 TTGGGACGGTTGAGCTATGGTCTTTGGGTGGTTGGATCATTGCTTTCAGAGCTTGCAATT 1916
Query 1953 CTGCCTTCTGCTCTCTTTGAAGCTGTAAACAAAGTTCAAATCGAAGAACGTTCGGCCTCG 2012
| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1917 CCGCCTTCTGCACTCTTTGAAGCTGTAAACAAAATTCAAATCGAAGAACGTTCAGCATCG 1976
Query 2013 CCTTTTCTGAACTTAAATGATGAGCAATACTGCAAGTCCAATCCATTTGTTGCAAAGGTT 2072
|||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 CCTTTTCTAAACGTAATTGATGAACAATACTGCAAGTCCAATCCATTTGTTGCAAAGGTC 2036
Query 2073 TTAGCTTTCAGTTTGGCTGTTTTGGAGCAAGCTGAGGGAAACAGAAACCTTCTCTCATTG 2132
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 TTAGCATTCAGTTTGGCTGTTTTGGAGCAAGCTGAGGGAAACAGAAACCTTCTCTCATTA 2096
Query 2133 AAAATGCTACTCGTGGGAGCTTGGTTTGCTCCTGTCCCTATACCGGTTAACTTATTAGCT 2192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2097 AAAATGCTACTCGTGGGAGCTTGGTTTGCTCCTGTCCCTATTCCGGTTAACTTGTTAGCT 2156
Query 2193 GCAGCTGCTAAGAACATGCCCACAGGTGGAAACCGGTTCAGCAAATGGAACAAGTGTCTG 2252
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2157 GCAGCTGCTAAGAACATGCCCACAGGTGGCAACCGGTTCAGCAAATGGAACAAATGTCTG 2216
Query 2253 AGTCACACATTTGCTTGGTGTGGTGGTTGTGGTTTAGGACGCAGAAGCGAAGAGGATGCT 2312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 AGTCACACATTTGCTTGGTGTGGTGGTTGTGGTTTAGGACGCAGAAGCGAAGAGGATGCT 2276
Query 2313 GCTTTTTTACTAGTCAGATTAGGACTAGCGAGGTTAACAAATAGACAACCTGGATGTTGG 2372
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 GCATTTTTACTAGTCAGATTAGGACTAGCGAGGATAACAAATAGACAACCTGGATGTTGG 2336
Query 2373 ATTCAGTTCCATCCGATAACTCAAACTTTCGCGAGGAGACGAGACTACATCCTTGCACCA 2432
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2337 ATTCAGTTCCATCCGATAACTCAAACTTTCGCGAGGAGACGAGACTACATACTTGCACCA 2396
Query 2433 AAGGCAACAGTTCAAGGCGTGAGGAAAATCGATAACCCGTTGTTGAATCTTGATCACCTA 2492
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2397 AAGGCGACGGTTCAAGGCGTGAGGAAAATCGATAACCCGTTGTTGAATCTCGATCACCTA 2456
Query 2493 TGGGCTTCAGCTTTCTTAGTATTCGGATTCAAATCAGAACCTCCTTTGGTTCAACTACAA 2552
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2457 TGGGCTTCAGCTTTCTTAGTATTTGGATTCAAATCAGAACCTCCTTTGGTCCAACTACAA 2516
Query 2553 GCCATGGATATGGTACTTTACATCAAGAGAACAGCTCTTCCTTTAGCAATCACAGCTTTC 2612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCCATGGATATGGTACTTTACATCAAGAGAACAGCTCTTCCTTTAGCAATCACAGCTTTC 2576
Query 2613 ACAACCTTCTCAAGGTGCAACTCCGCGCTGGAGCTCCTAAAAGTATGCACCAACGTGTTA 2672
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 ACAACCTTCTCGAGGTGCAACTCCGCGCTGGAGCTCTTAAAAGTATGCACCAACGTGTTA 2636
Query 2673 GAGGAAGTGGAGAAATCATTTGTGTCTCAGATACAAGATTGGCGCCAAGGCTCGCTCTGT 2732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637 GAGGAAGTGGAGAAATCATTTGTGTCTCAGATACAAGATTGGCGCCAAGGCTCGCTCTGT 2696
Query 2733 TGGAAGAAGAAGACTAACAAGAAAGTCGATGAATACGTGTGGCAGGATGTTACATTGTTG 2792
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2697 TGGAAGAAGAAGACTAACAAGAAGGTCGATGAATACGTGTGGCAAGATGTTACATTGTTA 2756
Query 2793 AAAGCTTTATTGCTGGAGACCAGAGCAAAGCTGCTGCTACGAGGCGGACATTTCGATAGT 2852
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2757 AAAGCTTTATTGCTGGAGACAAGAGCTAAGCTGCTGCTACGAGGCGGGCATTTCGATAGT 2816
Query 2853 GGAGAGGAACTTTGCAGGACTTGTATCAGTATCAGGACAGTGATGCTTGGCCATAACCAT 2912
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 GGAGAGGAACTATGCAGGACTTGTATCAGTATCAGGACAGTGATGCTTGGCCATAACCAT 2876
Query 2913 GATCTCACTTTGGCTGCTCAAGAAACACTAGCAAAGTTAGTCAGAATGAGAAGCAAGATA 2972
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 GATCTCACATTGGCTGCTCAAGAAACACTAGCAAAGTTAGTCAGAATGAGAAGCAAGATA 2936
Query 2973 TGATGAAACCACACACAAAAACATTTCTCCT 3003
||| || | | || |||| ||||||||||
Sbjct 2937 TGA--AA-C-AGAC-CAAA--CATTTCTCCT 2960
> Ahg497314 jgi|Araly1|497314|fgenesh2_kg.191__1__AT5G56220.1
Length=2379
Score = 2039 bits (1104), Expect = 0.0
Identities = 1211/1262 (96%), Gaps = 9/1262 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1823 ACTGAGAGGAAGAAGAAAGAAAGATTACCCGGTGGAGGAGGTGGAGGTCCTCAAGCTTTT 1882
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1126 ACTGAGAGGAAGAAGAAAGAAAGATTACCCGGTGGAGGAGGTTGAGGTCCTCAAGCTTTT 1185
Query 1883 CGATGAGAAATTGGGAAGGTTGAGCTATGGTCTTTGGGTGGTTGGATCATTGCTTTCAGA 1942
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 CGATGAGAAATTGGGACGGTTGAGCTATGGTCTTTGGGTGGTTGGATCATTGCTTTCAGA 1245
Query 1943 GCTTGCAATTCTGCCTTCTGCTCTCTTTGAAGCTGTAAACAAAGTTCAAATCGAAGAACG 2002
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1246 GCTTGCAATTCCGCCTTCTGCACTCTTTGAAGCTGTAAACAAAATTCAAATCGAAGAACG 1305
Query 2003 TTCGGCCTCGCCTTTTCTGAACTTAAATGATGAGCAATACTGCAAGTCCAATCCATTTGT 2062
||| || ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 TTCAGCATCGCCTTTTCTAAACGTAATTGATGAACAATACTGCAAGTCCAATCCATTTGT 1365
Query 2063 TGCAAAGGTTTTAGCTTTCAGTTTGGCTGTTTTGGAGCAAGCTGAGGGAAACAGAAACCT 2122
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 TGCAAAGGTCTTAGCATTCAGTTTGGCTGTTTTGGAGCAAGCTGAGGGAAACAGAAACCT 1425
Query 2123 TCTCTCATTGAAAATGCTACTCGTGGGAGCTTGGTTTGCTCCTGTCCCTATACCGGTTAA 2182
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1426 TCTCTCATTAAAAATGCTACTCGTGGGAGCTTGGTTTGCTCCTGTCCCTATTCCGGTTAA 1485
Query 2183 CTTATTAGCTGCAGCTGCTAAGAACATGCCCACAGGTGGAAACCGGTTCAGCAAATGGAA 2242
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1486 CTTGTTAGCTGCAGCTGCTAAGAACATGCCCACAGGTGGCAACCGGTTCAGCAAATGGAA 1545
Query 2243 CAAGTGTCTGAGTCACACATTTGCTTGGTGTGGTGGTTGTGGTTTAGGACGCAGAAGCGA 2302
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 CAAATGTCTGAGTCACACATTTGCTTGGTGTGGTGGTTGTGGTTTAGGACGCAGAAGCGA 1605
Query 2303 AGAGGATGCTGCTTTTTTACTAGTCAGATTAGGACTAGCGAGGTTAACAAATAGACAACC 2362
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1606 AGAGGATGCTGCATTTTTACTAGTCAGATTAGGACTAGCGAGGATAACAAATAGACAACC 1665
Query 2363 TGGATGTTGGATTCAGTTCCATCCGATAACTCAAACTTTCGCGAGGAGACGAGACTACAT 2422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666 TGGATGTTGGATTCAGTTCCATCCGATAACTCAAACTTTCGCGAGGAGACGAGACTACAT 1725
Query 2423 CCTTGCACCAAAGGCAACAGTTCAAGGCGTGAGGAAAATCGATAACCCGTTGTTGAATCT 2482
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1726 ACTTGCACCAAAGGCGACGGTTCAAGGCGTGAGGAAAATCGATAACCCGTTGTTGAATCT 1785
Query 2483 TGATCACCTATGGGCTTCAGCTTTCTTAGTATTCGGATTCAAATCAGAACCTCCTTTGGT 2542
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1786 CGATCACCTATGGGCTTCAGCTTTCTTAGTATTTGGATTCAAATCAGAACCTCCTTTGGT 1845
Query 2543 TCAACTACAAGCCATGGATATGGTACTTTACATCAAGAGAACAGCTCTTCCTTTAGCAAT 2602
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846 CCAACTACAAGCCATGGATATGGTACTTTACATCAAGAGAACAGCTCTTCCTTTAGCAAT 1905
Query 2603 CACAGCTTTCACAACCTTCTCAAGGTGCAACTCCGCGCTGGAGCTCCTAAAAGTATGCAC 2662
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1906 CACAGCTTTCACAACCTTCTCGAGGTGCAACTCCGCGCTGGAGCTCTTAAAAGTATGCAC 1965
Query 2663 CAACGTGTTAGAGGAAGTGGAGAAATCATTTGTGTCTCAGATACAAGATTGGCGCCAAGG 2722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1966 CAACGTGTTAGAGGAAGTGGAGAAATCATTTGTGTCTCAGATACAAGATTGGCGCCAAGG 2025
Query 2723 CTCGCTCTGTTGGAAGAAGAAGACTAACAAGAAAGTCGATGAATACGTGTGGCAGGATGT 2782
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2026 CTCGCTCTGTTGGAAGAAGAAGACTAACAAGAAGGTCGATGAATACGTGTGGCAAGATGT 2085
Query 2783 TACATTGTTGAAAGCTTTATTGCTGGAGACCAGAGCAAAGCTGCTGCTACGAGGCGGACA 2842
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2086 TACATTGTTAAAAGCTTTATTGCTGGAGACAAGAGCTAAGCTGCTGCTACGAGGCGGGCA 2145
Query 2843 TTTCGATAGTGGAGAGGAACTTTGCAGGACTTGTATCAGTATCAGGACAGTGATGCTTGG 2902
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 TTTCGATAGTGGAGAGGAACTATGCAGGACTTGTATCAGTATCAGGACAGTGATGCTTGG 2205
Query 2903 CCATAACCATGATCTCACTTTGGCTGCTCAAGAAACACTAGCAAAGTTAGTCAGAATGAG 2962
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2206 CCATAACCATGATCTCACATTGGCTGCTCAAGAAACACTAGCAAAGTTGGTCAGAATGAG 2265
Query 2963 AAGCAAGATATGATGAAACCACACACAAAAACATTTCTCCTGGTTATTATTTCCACATTA 3022
||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2266 AAGCAAGATATGA--AA-C-AGACACAAA--CATTTCTCCTGGTTATTATTTCCACATTA 2319
Query 3023 CTACTCTAAGCTCAGTTTTGTTGAAGACATCAAATCATGTAATGGCTATTTTTAACCTTT 3082
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||
Sbjct 2320 CTG-T--AAGCTCAGTTTTGTTGAAGACATCAAATCATGCAATGGCTACTTTAAACCTTT 2376
Query 3083 TT 3084
||
Sbjct 2377 TT 2378
Score = 1842 bits (997), Expect = 0.0
Identities = 1085/1125 (96%), Gaps = 16/1125 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGAGCTTTCATTTGAGTTTAATTTGTGTTTGGTGAAAGAAGTAAAAGGAGTAATGAAGG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGAGCTTTCATTTGAGTTTAATTTGTGTTTGGTG-AGGAAGTAAAAGGAGTAATGAAGG 59
Query 61 GAAT---AGAAG-A--AGAAGCAAGTTTAGTTGGTTTAACCATAAGAACTTCATCACCAG 114
|||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 GAATAGAAGAAGAAGCAGAAGCAAGTTTAGTTGGATTAACCATAAGAACTTCATCACCAG 119
Query 115 CAAGCTCTTCAAGTAAGAAAGGTAAAGAAGATCTTCTTCAAGCAAATAATAATGCTTCAG 174
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||||||
Sbjct 120 CAAGCTCTTCAAGTAAGAAAGGT--A-AAGATCTTCTTCAAACACATAACAATGCTTCAG 176
Query 175 ATTCATCTCCAAGTATCAAAAACTCTCCTTTCTATTCACCTTCTCTTGTGTCCCCACCAT 234
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 ATTCATCTCCAAGTATCAAAAACTCTCCTTTCAATTCACCTTCTCTTGTGTCCCCACCAT 236
Query 235 CTTCTGCTTTTGTTTCCGCTTTGCAATCTCCTTATATATCCCCAAGAGCTACAACACCCT 294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 237 CTTCTGCTTTTGTTTCCGCTTTGCAATCTCCTTATATATCCCCAAGAGCTACTACA--C- 293
Query 295 CCATTACCACTCACAAGCCATCACCGCCTCTTTCTTACAAAGGCTCACAATCTGATGATG 354
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 294 CCATTACCACTCACAAGCCATCACCGCCTCTCTCTTACAAAGGCTCACAATCTGAAGATG 353
Query 355 TACCAAGCAGCTCCTACACTCCTCCTTCTGACCAGTACGAGTTTTCTGATGAACAACCAT 414
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 TACCTAGCAGCTCCTACACTCCTCCCTCTGACCAGTACGAGTTTTCTGATGAACAACCAT 413
Query 415 CAGATCGGAAGCTCAAGTTATCAGCATCTTGTACTCCAGATCCTGCTCCTCCAAGGATCT 474
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 CAGATCGGAAGCTCAAGTTATCAG---CTTGTACTCCAGATCCTGCTCCTCCAAGGATCT 470
Query 475 CTTTCTCTTTCCCTGTTCCTAGGGTTTCTTTGGCTAAAGTCTCTGTTTCTTCACCTGCAA 534
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 471 CTTTCTCTTTCCCTGTTCCTAGGGTTTCTTTGGCTAAAGTTTCTGTTTCTTCACCTGCAA 530
Query 535 CTAACACCAAGCTCAGGAGCTCTGATGTCTTCATAGGGTTTCATGGACAAAACCCAAACT 594
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 531 CTAACACCAAGCTCAGGAGCTCTGATGTCTTCATTGGGTTTCATGGACAAAACCCAAACT 590
Query 595 TGGTGAGATTCTGCAAATGGTTAAAGTCAGAGCTTGAGCTTCAGGGAATCGCTTGTTTCG 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 TGGTGAGATTCTGCAAATGGTTAAAGTCAGAGCTTGAGCTTCAGGGAATCGCTTGTTTCG 650
Query 655 TTGCTGACAGAGCTAAGTATTCGGACACACAGAGTCATGAGATCGCCGACAGAGTTATCT 714
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 TTGCTGACAGAGCTAATTATTCGGACACACAGAGTCATGAGATCGCCGACAGAGTTATCT 710
Query 715 GTTCTGTTACTTATGGGATTGTGGTTGTCTCTTGTTCCAGCTTGCTCAACTACCTTAGCT 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 GTTCTGTTACTTATGGGATTGTGGTTGTCTCTTGTTCCAGCTTGCTCAACTACCTTAGCT 770
Query 775 TGGAGGAAGTTAGGTTCTTTGCTCAAAAGAAGAACTTGATTCCTATTTTCTATGGAACTG 834
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 771 TGGAGGAGGTTAGGTTCTTTGCTCAAAAGAAGAACTTGATTCCAATTTTCTATGGAACTG 830
Query 835 GTCCTTCTGAGATTATGGGTCTTCTCAACTGCAATGCCATAGATAAAGAGTGTAAAGAAG 894
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 GTCCTTCTGAGATAATGGGTCTTCTCAACTGCAATGCCATAGATAAAGAGTGTAAAGAAG 890
Query 895 CCATTGATGGGTTGATTAAGTCTCATGAGTTTAAACTAGAAGCTAATGAGAGTAACTGGA 954
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 CCATTGATGGGTTGATTAAGTCACATGAGTTTAAACTTGAAGCTAATGAGAGTAACTGGA 950
Query 955 GAAGCTGTGTGGGAAAGACTGCGACGATTCTCAGGGCAAAGCTTGGGAGGAAGAGTGTGG 1014
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 GAAGCTGTGTGGGAAAGACCGCGACGATTCTCAGGGCAAAGCTTGGGAGGAAGAGTGTGG 1010
Query 1015 CTGATAAAGAGATTGTGGAAGGGATTGATGAGCTTCCATTTCCGAGGAACAGATCTTTTC 1074
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1011 CTGATAAAGAGATAGTGGAAGGGATTGATGAGCTTCCATTTCCGAGGAACAGATCTTTCC 1070
Query 1075 TTGGAAGAGAAAAGGAGATCATTGAAATGGAGATGGCTTTATTTG 1119
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1071 TTGGAAGAGAAAAGGAGATAATTGAAATGGAAATGGCTTTATTTG 1115
> Ahg948392 jgi|Araly1|948392|scaffold_800279.1
Length=191
Score = 154 bits (83), Expect = 4e-36
Identities = 108/119 (91%), Gaps = 5/119 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 2882 TATCAGGACAGTGATGCTTGGCCATAACCATGATCTCACTTTGGCTGCTCAAGAAACACT 2941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 78 TATCAGGACAGTGATGCTTGGCCATAACCATGATCTCACATTGGCTGCTCAAGAAACACT 137
Query 2942 AGCAAAGTTAGTCAGAATGAGAAGCAAGATATGATGAAACCACACACAAAAACATTTCT 3000
||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||
Sbjct 138 AGCAAAGTTGGTTAGAGTGAGAAGCAAGATATGA--AA-CTACACTCAAA--CATTTCT 191
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 117203683865
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5