BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G57160.1
Length=3903
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg495812 jgi|Araly1|495812|fgenesh2_kg.8__1628__AT5G57160.1 5956 0.0
> Ahg495812 jgi|Araly1|495812|fgenesh2_kg.8__1628__AT5G57160.1
Length=3818
Score = 5956 bits (3225), Expect = 0.0
Identities = 3523/3670 (96%), Gaps = 8/3670 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 59 ATGACGGAGGAGATCAAATTCAGCGTACTGGTATCTCTCTTTAACTGGATTCAAAAAAGC 118
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACGGAAGAGATCAAATTCAGCGTTCTGGTATCTCTCTTCAACTGGATTCAAAAAAGC 60
Query 119 AAAACCTCATCTCAGAAACGATCCAAATTCCGCAAGTTTCTCGACACTTACTGCAAACCC 178
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAAACCTCATCTCAAAAACGCTCCAAATTCCGCAAGTTTCTCGACACTTACTGCAAACCC 120
Query 179 TCCGACTACTTCGTCGCCGTCCGTTTAATCATTCCGTCGCTTGATCGAGAACGAGGTAGC 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCGACTACTTCGTCGCCGTCCGTTTAATCATTCCGTCGCTTGATCGAGAACGAGGTAGC 180
Query 239 TACGGCCTTAAAGAGTCAGTGCTCGCCACGTGTCTGATCGACGCACTTGGTATCTCGCGT 298
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 181 TACGGCCTCAAAGAGTCAGTGCTCGCCACGTGTCTGATCGACGCACTTGGCATCTCTCGT 240
Query 299 GATGCTCCTGATGCTGTTCGTCTTCTCAATTGGCGTAAAGGAGGAACTGCTAAAGCTGGA 358
|| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 241 GACGCTCCTGACGCTGTACGTCTTCTCAATTGGCGTAAAGGAGGAACCGCTAAAGCTGGA 300
Query 359 GCCAATGCTGGAAACTTCTCCTTAATTGCTGCTGAGGTATTGCAACGTAGACAAGGAATG 418
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCCAATGCTGGAAACTTTTCCTTGATTGCTGCTGAGGTATTGCAACGTAGACAAGGAATG 360
Query 419 GCTTCTGGCGGTTTGACTATTAAGGAATTGAATGATTTGCTTGATCGTTTGGCTTCAAGT 478
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCTTCTGGTGGTTTGACTGTTAAGGAATTGAATGATTTGCTTGATCGTTTGGCTTCAAGT 420
Query 479 GAG-A-A----CAGAGCGGAGAAAACTTTGGTTCTTTCTACATTGATTCAGAAGACAAAT 532
||| | | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAGAACAGGTGCAGAGCCGAAAAAACTTTGGTTCTTTCTACTTTGATTCAGAAGACAAAT 480
Query 533 GCTCAGGAGATGAAGTGGGTCATTAGGATTATTCTAAAAGATTTGAAACTGGGAATGAGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GCTCAGGAGATGAAGTGGGTCATTAGGATTATTCTTAAAGATTTGAAACTGGGAATGAGT 540
Query 593 GAGAAGAGCATTTTTCAGGAGTTCCATCCAGATGCTGAGGACTTGTTTAATGTCACATGT 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 541 GAGAAGAGCATTTTTCAGGAGTTCCATCCAGATGCTGAGGACTTGTTTAATGTTACCTGT 600
Query 653 GATTTGAAACTAGTCTGTGAAAAGTTGAGGGATCGACACCAACGGCACAAGCGCCAGGAT 712
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GACTTGAAACTAGTCTGTGAAAAGTTGAGGGATCGACACCAACGGCACAAGCGCCAGGAT 660
Query 713 ATAGAGGTTGGAAAAGCCGTACGACCCCAGTTAGCTATGCGTATTGGTGACGTAAATGCT 772
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 661 ATAGAGGTTGGGAAAGCCGTACGACCCCAATTAGCTATGCGTATCAGTGATGTAAATGCT 720
Query 773 GCTTGGAAGAAGCTGCATGGGAAAGATGTAGTTGCTGAATGCAAATTTGATGGGGATCGC 832
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TCTTGGAAGAAACTGCATGGGAAAGATGTAGTTGCTGAATGCAAATTTGATGGGGATCGC 780
Query 833 ATACAAATACACAAAAATGGGACTGACATACATTACTTCTCTAGGAACTTCCTTGACCAT 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ATACAAATACACAAAAATGGGACTGACATACATTACTTCTCTAGGAACTTCCTTGACCAT 840
Query 893 TCTGAATACGCACATGCCATGTCGGATCTTATTGTACAAAATATATTGGTGGACAAGTGT 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 841 TCTGAATACGCACATGCCATGTCGGATCTTATTGTACAAAATATATTAGTGGACAAGTGT 900
Query 953 ATCCTTGATGGTGAAATGTTGGTCTGGGATACATCTCTGAATCGGTTTGCTGAGTTTGGT 1012
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATCCTCGATGGTGAAATGTTGGTCTGGGATACATCCCTGAATCGGTTTGCTGAGTTTGGT 960
Query 1013 TCGAATCAGGAAATAGCCAAGGCAGCAAGGGAGGGTCTTGACAGCCATAAACAGTTGTGT 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCGAATCAGGAAATAGCCAAGGCAGCAAGGGAGGGTCTTGACAGCCATAAACAGTTGTGT 1020
Query 1073 TATGTTGCCTTTGATGTTCTTTATGTTGGCGATACTAGCGTCATCCACCAGAGTTTGAAG 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TATGTTGCCTTTGATGTTCTTTATGTTGGCGATACTAGCGTCATCCACCAGAGTTTGAAG 1080
Query 1133 GAACGGCATGAACTGCTGAAGAAAGTGGTCAAACCTTTAAAAGGTCGGCTCGAAGTTTTA 1192
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1081 GAACGGCATGAACTGCTGAGGAAAGTGGTCAAACCTTTAAAAGGTCGGCTCGAAGCTTTA 1140
Query 1193 GTACCTGAAGGTGGTCTCAATGTTCACCGCCCTTCAGGGGAACCTAGTTGGTCTATTGTT 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GTACCTGAAGGTGGTCTCAATGTTCACCGCCCTTCAGGGGAACCTAGTTGGTCTATTGTT 1200
Query 1253 GTTCATGCTGCTGCTGATGTTGAGCGATTTTTCAAAGAAACAGTTGAAAACAGAGATGAA 1312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GTTCATGCTGCTGCTGATGTTGAGCGATTTTTCAAAGAAACAGTTGAAAACAGAGATGAA 1260
Query 1313 GGAATTGTGCTTAAAGACCTGGAATCAAAATGGGAACCTGGAGATCGTAGTGGCAAGTGG 1372
||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 GGAGTTGTGCTTAAAGACCTGGGATCGAAATGGGAACCTGGAGATCGTAGTGGCAAGTGG 1320
Query 1373 ATGAAATTGAAGCCTGAATATATCCGGGCTGGTGCTGACCTGGATGTTCTTATAATAGGA 1432
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TTGAAATTGAAGCCTGAATATATCCGGGCTGGTGCTGACCTGGATGTTCTTATAATAGGA 1380
Query 1433 GGATACTATGGCTCCGGACGTCGTGGAGGAGAGGTAGCACAGTTTCTTGTAGCCTTGGCT 1492
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1381 GGATACTATGGCTCCGGACGTCGTGGAGGAGAGGTAGCACAGTTTCTTGTCGCCTTGGCT 1440
Query 1493 GACCGGGCAGAGGCAAATGTATATCCCAGGCGATTTATGTCCTTTTGTAGAGTTGGCACT 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GACCGGGCAGAGGCAAATGTATATCCCAGGCGATTTATGTCCTTTTGTAGAGTTGGCACT 1500
Query 1553 GGGCTTTCTGATGATGAGCTTAACACTGTTGTAAGCAAACTGAAGCCTTATTTCAGAAAA 1612
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GGACTTTCTGATGATGAGCTCAACACTGTTGTAAGCAAACTGAAGCCTTATTTCAGAAAA 1560
Query 1613 AATGAGCACCCAAAGAAGGCTCCACCAAGCTTCTATCAGGTCACTAATCACTCCAAAGAG 1672
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1561 AATGAACACCCAAAGAAGGCTCCACCAAGCTTCTATCAGGTCACTAATCACTCAAAAGAG 1620
Query 1673 AGACCGGATGTTTGGATTGACAGCCCGGAAAAATCAATAATACTTTCAATCACTAGTGAT 1732
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 AGACCGGATGTTTGGATTGAAAGCCCGGAAAAATCAATAATACTTTCAATCACTAGTGAT 1680
Query 1733 ATCAGGACGATAAGGTCTGAGGTGTTTGTTGCACCTTACAGTCTGAGGTTTCCTCGTATT 1792
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1681 ATCAGGACAATAAGGTCTGAGGTGTTTGTTGCACCTTACAGCCTGAGGTTTCCTCGTATT 1740
Query 1793 GATAAAGTAAGATATGACAAGCCTTGGCATGAATGTCTTGATGTGCAGGCTTTTGTGGAA 1852
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GATAAAGTAAGATATGACAAGTCTTGGCATGAATGTCTCGATGTGCAGGCTTTTGTGGAA 1800
Query 1853 TTGGTGAATTCGAGTAACGGCACCACACAGAAACAGAAGGAGTCTGAAAGCACACAGGAC 1912
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1801 TTGGTAAATTCGAGTAACGGCACCACACAGAAACAGAAGGAATCTGAAAGCACACAGGAC 1860
Query 1913 AATCCGAAAGTCAATAAATCCTCCAAGAGAGGAGAGAAAAAGAATGTCTCTCTTGTTCCC 1972
||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1861 AATCCAAAAGTCAATAAATCTTCCAAGAAAGGAGAGAAAAAGAATGTCTCTCTTGTCCCC 1920
Query 1973 TCTCAGTTTATTCAAACTGATGTATCGGATATCAAGGGCAAGACCTCAATCTTCTCAAAT 2032
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1921 TCTCAGTTTATTCAAACTGATGTATCGGATATCAAGGGCAAGACCTCAGTCTTCTCAAAT 1980
Query 2033 ATGATATTTTATTTTGTTAACGTGCCTCGGTCCCATTCTCTTGAGACATTCCACAAAATG 2092
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1981 ATGATATTTTATTTTGTTAACGTGCCTCTGTCCCATTCTCTTGAGACTTTCCACAAAATG 2040
Query 2093 GTGGTTGAAAACGGAGGGAAGTTTTCAATGAACTTAAACAACTCAGTGACTCATTGCATT 2152
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GTGGTTGAGAATGGAGGGAAGTTTTCAATGAACTTAAACAACTCAGTGACTCATTGCATT 2100
Query 2153 GCAGCAGAAAGCAGTGGAATAAAGTATCAGGCAGCAAAGCGTCAGCGAGATGTCATCCAC 2212
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2101 GCAGCAGAAAGCAGTGGAATAAAATATCAGGCAGCAAAGCGTCAGAGAGATGTCATCCAC 2160
Query 2213 TTTTCATGGGTCTTAGATTGTTGTTCACGAAATAAGATGCTTCCTTTGCTGCCAAAGTAC 2272
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2161 TTTTCATGGGTCTTAGATTGCTGTTCGCGAAATAAGATGCTTCCTTTGCAGCCAAAGTAT 2220
Query 2273 TTCCTCCACCTCACTGATGCTTCAAGGACAAAATTACAGGATGATATTGATGAATTTTCT 2332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2221 TTCCTCCACCTCACTGATGCTTCAAGGACAAAATTACAGGATGACATTGATGAATTTTCT 2280
Query 2333 GATTCTTATTACTGGGATTTAGACCTTGAAGGTCTCAAACAGGTCTTAAGCAATGCCAAG 2392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2281 GATTCTTATTACTGGGATTTAGACCTTGAAGGTCTCAAACAGGTCTTAAGCAATGCCAAG 2340
Query 2393 CAATCTGAAGATTCAAAATCTATTGACTACTACAAGAAAAAGTTATGTCCTGAAAAAAGA 2452
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2341 CAATCTGAAGATTCAAAATCCATTGACTACTACAAGAAAAAGTTATGTCCAGAGAAAAGA 2400
Query 2453 TGGTCCTGCCTCTTAAGCTGCTGTGTTTACTTTTACCCGTATAGTCAAACATTGAGCACT 2512
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2401 TGGTCCTGCCTCTTTAGCTGCTGTGTTTACTTCTACCCGTATAGTCAAACATTGAGCACT 2460
Query 2513 GAAGAGGAAGCCCTATTGGGAATTATGGCTAAGAGATTAATGCTTGAAGTCTTAATGGCT 2572
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
Sbjct 2461 GAAGAGGAAGCCCTGTTGGGAATTATGGCTAAGAGATTAGCGCTTGAAGTGTTAATGGGT 2520
Query 2573 GGTGGTAAAGTTAGCAATAATCTTGCTCATGCGTCGCACCTTGTAGTTCTTGCTATGGCA 2632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2521 GGTGGTAAAGTTAGCAATAATCTTGCTCATGCGTCGCACCTTGTAGTCCTTGCTGTGGCA 2580
Query 2633 GAAGAACCTTTGGATTTTACTTTAGTTTCGAAAAGTTTCAGCGAAATGGAGAAACGTCTT 2692
||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2581 GAAAAATCTTTGGATTTTGCTTCAGTTTCGAAAAGTTTCAGTGAGATGGAGAAACGTCTT 2640
Query 2693 TTGCTGAAGAAAAGGCTTCATGTTGTTAGCTCGCACTGGTTAGAGGAAAGCTTGCAAAGA 2752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2641 TTGCTGAAGAAAAGGCTTCATGTTGTTAGCTCGCACTGGTTAGAGGACAGCTTGCGAAGA 2700
Query 2753 GAGGAAAAACTGTGCGAGGATGTCTACACTCTGAGGCCTAAGTATATGGAAGAGTCTGAT 2812
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 GAGGAAAAACTGTGCGAGGATGTCTACAATCTGAGGCCTAAGTATATGGAAGAGTCTGAT 2760
Query 2813 ACTGAAGAATCAGATAAATCCGAACATGATACAACGGAAGTAGCTTCCCAAGGTAGTGCT 2872
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2761 ACTGAAGAATCAGATAAATCCGAACATGATACAACGGAAGTAGCTTCCGAAGGTAGTGCT 2820
Query 2873 CAAACCAAAGAGCCAGCTTCCTCTAAAATTGCAATTACGAGTTCAAGAGGACGGTCAAAT 2932
|||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2821 CAAACCGAAGAGCCAGCTTCCTCAAAAATGGCAATTACGAGTTCAAGAGGACGGTCAAAT 2880
Query 2933 ACTCGAGCTGTTAAAAGGGGAAGGTCTTCTACAAACTCACTGCAACGAGTACAGAGACGC 2992
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2881 ACTAGAGCTGTTAAAAGGGGAAGGTCTTCTACAAACTCACTGCGACGAGTACAGAGACGG 2940
Query 2993 AGAGGCAAGCAGCCGTCTAAGATAAGCGGAGATGAAACAGAGGAAAGTGATGCTTCTGAA 3052
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2941 AGAGGCAAGCAGCCTTCTAAGATAACCGGAGATGAAACAGAGGAGAGTGATGCTTCTGAA 3000
Query 3053 GAAAAGGTTTCAACAAGACTCAGTGATATAGCAGAAGAGACGGATTCGTTTGGTGAGGCT 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3001 GAAAAGGTTTCAACAAGACTCAGTGATATAGCAGAAGAGACTGATTCGTTTGGTGAGGCT 3060
Query 3113 CAAAGAAACTCTAGCAGAGGAAAATGTGCGAAGAGAGGAAAGTCTCGTGTGGGACAAACC 3172
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 CAAAGAAACTCTAGCAGAGGAAGATCTGCGAAGAGAGGAAAGTCTCGTGTGGGACAAACC 3120
Query 3173 CAAAGAGTACAGAGATCACGCAGAGGCAAGAAAGC-TGCGAAGATAGGAGGAGATGAGTC 3231
|||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3121 CAAAGAGTACAGAGATCACGAAGAGGCAAGAA-GCCTTCAAAGATAGGAGGAGATGAGTC 3179
Query 3232 TGATGAAAATGATGAATTAGATGGCAATAACAATGTGTCAGCAGATGCGGAAGAGGGTAA 3291
||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3180 TGAGGAAAATGATGAATTTGGTGACAAAAACAATGTGTCATCAGATGCGGAAGAGAGTAA 3239
Query 3292 TGCAGCTGGTAGATCTGTGGAAAACGAAGAAACCCGAGAGCCTGACATAGCGAAGTACAC 3351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 TGCAGCTGGTAGATCTGTGGAAAACGAAGAAACCCGAGAACCTGACATAGCGAAGTACAC 3299
Query 3352 AGAATCACAGCAAAGAGACAACACAGTAGCAGTTGAAGAGGCCTTACAAGATTCTAGAAA 3411
|||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 3300 AGAATCACTGCAAAGAGACACCACAGCAGCAGTTGAAGACGCCTCACAAGATTCTAGAAA 3359
Query 3412 TGCAAAGACGGAGATGGATATGAAAGAGAAGTTACAAATCCATGAGGATCCACTACAAGC 3471
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 TGCAAAGACCGAGATGGATATGAAAGAGAAGTTACAAATCCATGAGGATCCACTACAAGC 3419
Query 3472 TATGTTAATGAAAATGTTCCCTATTCCCAGTCAAAAAACCACAGAGACATCAAACCGAAC 3531
|||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 TATGCTAATGAACATGTTCCCGAGTCTCAGTCAAAAAAACACAGAGACATCAAACCGAAT 3479
Query 3532 CACTGGGGAATATAGAAAGGCTAATGTTTCTGGTGAATGTGAGTCTTCAGAGAAAAGAAA 3591
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 CACCGGGGAAAATAGAAAGGCTAATGTTTCTGGTGAATGCGAGTCTTCAGAGAAAAGAAA 3539
Query 3592 ACTCGACGCTGAGACTGATAATACATCTGTGAACGCAGGCGCAGAATCAGACGTAGTTCC 3651
||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||
Sbjct 3540 ACTCGACACCGAGACTGATAATACTTGTGTGAACACAGGCACAGACTCAGAAGCAGTTCC 3599
Query 3652 TCCTCTAGTGAAGAAAAAGAAAGTCAGCTACCGGGATGTTGCCGGAGAACTGCTCAAAGA 3711
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 TCCTCTTGCGAAGAAAAAGAAAGTCAGCTACCGGGATGTTGCCGGAGAACTGCTCAAAGA 3659
Query 3712 CTGGTGATAC 3721
||||||||||
Sbjct 3660 CTGGTGATAC 3669
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 147511152948
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5