BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G58040.1
Length=3708
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg495910 jgi|Araly1|495910|fgenesh2_kg.8__1726__AT5G58040.1 5594 0.0
> Ahg495910 jgi|Araly1|495910|fgenesh2_kg.8__1726__AT5G58040.1
Length=3725
Score = 5594 bits (3029), Expect = 0.0
Identities = 3527/3756 (94%), Gaps = 79/3756 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GCCGAGACTTGTTGAG-AAGAAGCCCTTAAAGCTTCACCGtctctctctctctctttctc 59
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1 GCCGAGACTTGTTGAGAAAGAAGCCCTT--AGCTTCACCG------TCTCTCTCTTTCTC 52
Query 60 gtgagcttcaattcgaatcggccgttcttcttcttcttcctccaatctct-TTACTCCAA 118
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||
Sbjct 53 GTGAGCTTC-TTTCGAATCGGCCGTTCTTCTTCTTC-T--TCCAATATCTCTTACTCCAA 108
Query 119 TGGAAGAGGACGATGAGTTCGGAGATCTATATTCCGACGTTCTCCAGCCGTTTCAACCTC 178
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 TGGAAGAAGACGATGAGTTCGGAGATCTGTATTCCGACGTTCTCCAGCCGTTTCAACCTC 168
Query 179 CCGTTGTTCTCCCTCCTCCGCCTCCTCTTCCTCACCGTTCAATCGACCTCAACCTCCGAT 238
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 169 CCGTTGTTCTCCCACCTCCGCCTCCTCTTCCTCATCGTTCTATCGACCTCAACCTCCGAT 228
Query 239 CCCAAGATCAAGATGTCTCAGAACCTAATTCAGCTCCAATCTCTAGGGTTTCGGACAACG 298
||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 229 CCCAAGATCAAGACGTGGCAGAACCTAATTCAGCTTCAATCTCTAGGGTTTCAGACAACG 288
Query 299 ATGCCGTAAAATTAT--------CT-ACTCAGGACGCGACTCGTCAAGCAATTGTCGATG 349
|||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 ATGCTTTAAAATTATCCACCACGCTCTCTCAGGACGCGACTCGTCAAGCAATTGTCGATG 348
Query 350 GTGGCGGCGACGATAAGGATATGAGCTTTGATATCGAAGAACCCGATGCCGATTCTACAC 409
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 GTGGCGGCGACGATAAGGACATGAGCTTTGATATCGAAGAACCCGATGCCGATTCTACAC 408
Query 410 CTACGATTCCTGGTC-TTT--T---CG--T-T--A-CTGGAGCGTTACCTGGTTTGGCTA 457
||||||||||||||| ||| | || | | | ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 409 CTACGATTCCTGGTCTTTTCGTCACCGCTTCTGAAGCTGGAGCGTTACCTGGTTTGGTTA 468
Query 458 CAGATCGAGGCGTTTCGCAAGTTACGACAAGAATTGAGCAGCAGGTTGGTGGTGGTGGCG 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 469 CAGATCGAGGCGTTTCGCAAGTTACGACAAGAATTGAGCAGCAGG-T--TGGTGGTGGC- 524
Query 518 ATGGAGGCTATGGAGGACAAGGAGAAGGAGATGATTGGGATAGCGACAGTGAAGATGATT 577
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 -----GGCGAT---GGACAAGGAGAAGGAGATGATTGGGATAGCGACAGTGAAGATGATT 576
Query 578 TGCAGATAGTGTTGAATGATAGTAGCCGTAACGTCATGATCGGAGGAGCtgatagaagat 637
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 577 TGCAGATAGTGTTGAATGATAGTAGCCGCAACGTCATGATTGGAGGAGCTGATAGAAGAT 636
Query 638 caaggatgggagataatgaagatgacgatgatgaagatgatgaagaCCCACTTGTTATAG 697
|||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 CAAGAATGGGAGACAACGAAGATGACGATGACGAAGATGATGAAGACCCACTTGTTATAG 696
Query 698 TGGCCGACACGGATCCAAATCAACCTATGGAGGAGCAGATGTGGGGAGAAGATGGTCTTC 757
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 697 TGGCTGACACGGATCCAAATCAACCGATGGAGGAGCAGCTGTGGGGAGAAGATGGTCTGC 756
Query 758 AAGGGATTGAAGGAGATGGCAAAGACGGAGGAGAAGCTGGCAAGGGAAGTGGACCAGGAG 817
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 757 AAGGAATTGAAGGAGATGGCAAAGATGGAGGAGAAGCTGGGAAGGGAAGTGGACCAGGAG 816
Query 818 GTGCTACTGGACCGCCCAAAGCAGGGTATAGCAGTCATGGGTATCATCCGTTTCATTCTC 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 GTGCTACTGGACCGCCCAAAGCAGGGTATAGCAGTCATGGGTATCATCCGTTTCATTCTC 876
Query 878 AGTTTAAGTATGTAAGACCGGGGGCAGCTCCCATTCCTGGAGGTGCTGCATCTGTTGGT- 936
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 AGTTTAAGTATGTAAGACCGGGGGCAGCTCCCATTCCTGGAGGTGCTGCATCTGTTGGTG 936
Query 937 GGACCCTCCTCAGGTCAAGTTCGTCCACCCGCCAACCTTGGTCCTATGGCTGGTCGTGGC 996
||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 937 GGA-CCTCCTCAGGTCAAGTTCGTCCACCTGCCAACCTTGGTCCTTTGGCTGGTCGTGGC 995
Query 997 AGAGGAGATTGGCGTCCACTGGGAATGAGGAATGCTTCTGCTGCACAGAAAGGGTTCCAC 1056
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 996 AGAGGAGATTGGCGTCCACTGGGAATGAGAAATGCTTCTGCTGCACAGAAAGGCTTCCAT 1055
Query 1057 CAGCCTTGGGGTAGTAATACAGCAGGGCGTGGACTGGACTTCACTCTTCCCTCTCACAAG 1116
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1056 CAGCCTTGGGGTAGTAACACAGCAGGGCGGGGACTGGACTTTACTCTTCCCTCTCACAAG 1115
Query 1117 ACTATATTTGAGGTCGACATAGATAGTTTTGAAGAAAAGCCCTGGAGATATCCAGGAGTT 1176
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 ACTATATTTGAGGTTGACATAGAGAGTTTTGAAGAGAAGCCCTGGAGATATCCAGGAGTT 1175
Query 1177 GAGATGACAGACTACTTCAACTTTGGACTAAATGAGGAGAGCTGGAAAGACTATTGCAAA 1236
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 GATATGACAGACTACTTCAACTTTGGACTAAATGAAGAGAGCTGGAAAGACTATTGCAAA 1235
Query 1237 CAGCTGGACCAACACCGTATAC-AGACTACGATGCAAAGCAGAATACGTGTTTATGAAAG 1295
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1236 CAGCTGGACCAACACCGTAT-CGAGACTACGATGCAAAGCAGAATACGCGTTTATGAAAG 1294
Query 1296 CGGTAGAACGGATCAGGGTTATGATCCAGATCTACCCCCAGAGTTAGCTGCAGCAACAGG 1355
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295 TGGTAGAACAGATCAGGGTTATGATCCAGATCTACCACCAGAGTTAGCTGCAGCAACAGG 1354
Query 1356 GGCACAGGGTGTTCCCGTTGATTCTTCAAATTTAGTGAAGCCAGACTCTGTTCAAGGTGA 1415
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355 CGCGCAGGGTGTTCCAGTTGATTCTTCAAATTTAGTGAAGCCAGACTCTGTTCAAGGTGA 1414
Query 1416 TTCAGCGAAAGTGCCAGCCAATGTTAGACCGACACTACCCCCTGGAAGACCAATACCTGT 1475
|||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1415 TTCAGCTAAAGTACCAGCCAATGTTCGACCTTCACTACCCCCTGGAAGACCCATACCTGT 1474
Query 1476 GGAGACTGGTTCTGGTGAACGTCTTCCGTCCATTGATACACGTGCTCCTCGGATGCGTGA 1535
|||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1475 GGAGGCTGGTTCTGGTGAACGTCTACCATCCATTGATACACGTGCTCCTCGAATGCGTGA 1534
Query 1536 TCTAGATGCTATCATTGAGATTGTATGTCAGGATTCACATGAGGATGAACCCTCGGGTGA 1595
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 TCTAGATGCTATCATTGAGATTGTGTGTCAGGATTCACATGAGGATGAACCCTCGGGTGA 1594
Query 1596 AAATGGCACAGATCAAGCTGATAGTAGCCTTCCTGGAGAAAATGTACCAGTTGAGACTAG 1655
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1595 AAATGGCACAGATCAAGCTGATAGTAGCCTTCCTGAAGAAAATGTCCCAGTTGAGACTAG 1654
Query 1656 TTATGTTAACAACAAAAGACCTGACACGGAATCTGCTGAACATAGTCCTGCACAGGATGA 1715
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1655 TTATGTTAACAGCAGGAGACCTGACACGGAATCTGCTGAACATAGTCCTGCGCAGGATGA 1714
Query 1716 GCCACAT-AAAAATCTTCTCAAAAAGCAAGACGATGAGATCTCTAGAAGCACAGATAGTG 1774
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1715 GCCAC-TGAAAAATCTTCTCAAAAAGCAAGACGATGAGATCTCTAGAAGCACGGATAGTG 1773
Query 1775 GCCAGAGTTTTCGTTCATCGTCTCCTGTTGGAGACAGAGGCACAAGGTCATCAAGTGTTG 1834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GCCAGAGTTTTCGTTCATCGTCTCCTGTTGGAGACAGAGGCACAAGGTCATCAAGTGTTG 1833
Query 1835 ACCGCGAAGATGTGGGAGGTGAAGCTGGCAAAGATGCTGAGATGGGGGAGGAGCTTAAAA 1894
| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1834 ATCGCGAAAATGTGGGAGGTGAAGCTGGCAAAGATGCTGAGATGGGGGAGGATCATAAAA 1893
Query 1895 TGAGTTTTACATCCCCTCAGTCAGCAGTGCAAGAAGATGATGGAGGGGAGTCAAAGACGG 1954
| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1894 TTAGTTCTAAATTCCCTCAGTCAGCAGTTCAAGAAGATGATGGAGGGGAATCAAAGACGG 1953
Query 1955 AGAGGAGTAGTGAAAGCAGCAAAGCAAGATCTGGAAGTCACAGAGATTTTCAGC------ 2008
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1954 AGAGGAGTAGTGAAAGCAGCAAAGCAAGATCTGGAAGTCACAAAGATTATCAGCAATTGA 2013
Query 2009 ---A------AGAAGAGGACGTTATTCAAGATAAGCATTCTTCTCGACCAGCTAACAATA 2059
| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||
Sbjct 2014 AGGATGGTGCAGAAGAGGAAGTTATTCAAGATAAGCATTATACTCGACCAGCTAGCAATA 2073
Query 2060 GGAAACAGTACGATAACAATGCACCTCATCAGAGCAGAAAGAATCAGGACAGAGGGAAGG 2119
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2074 GGAAACAGCACGATAACAATGCACCGCATCAGAGCAGAAAGAATCAGGACAGAGGGAAGG 2133
Query 2120 AAATGGAAAGAACACGAGCGGCGAGCAAAGGTGGTAGAGAGAACTCTAATCCACATATGG 2179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2134 AAATGGAAAGAACACGAGCGGCGAGCAAAGGTGGTAGAGAGAACTCTAATCCCCATATGG 2193
Query 2180 AGCTTGATTCTACTTATATCTACTCAATTGCAAGTCGCGAGGATTTTGATAAAAGAAAAG 2239
|||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2194 AGCTTGATTCTAGTTATATCTACTCAATTGCAAACCGCGAGGATTTTGATAAAAGAAAAG 2253
Query 2240 AGCGAGATGTTGATGGCGCAGTCTGGCGCAGGAAAGAAGATGACCCATACAGTAGAAGAG 2299
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2254 AGCGAGATGTTGACGGCGGGGTCTGGCGCAGGAAAGAAGATGACCCATACAGTAGAAGAG 2313
Query 2300 GTGGGGATGAAGGGTCTAGAAAAAGGGATCGTGAAGATGATCCAGGCTTTAGGCAGAGGG 2359
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2314 GTGGGGATGACGGGTCTAGAAAAAGGGATCGTGAAGATGATCCTGGCTTTAGGCAGAGGG 2373
Query 2360 GTAAAATGCGCGAGAATGAAATACGCAGCAAAGATGATCAGGTTCCTTCCAGAAAACATA 2419
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 2374 GTAAAATGCGAGAGAATGAAATACGCAGCAAAGATGACCATGTTCCTTCCAGAAAGCATA 2433
Query 2420 TGGATGATGCTGGTATGAGAAATATTTATGAACCGGATGATCACATTAACAAGAGGAGGA 2479
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2434 TGGATGATGCTGGTATGAGAAATAATTATGAAGCGGATGATCACATTAGCAAGAGGAGGA 2493
Query 2480 AGGATGAAGAATACTTGAGAAGAAGCCGGCCTGaaaaaaaTGAAATCTCATATGGTCAAA 2539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2494 AGGATGAAGAATACTTGAGAAGAAGCCGGCCTGAAAAAAATGAAATCTCATATGGTCAAA 2553
Query 2540 GGGAATCAATGAGCCGCGTGAAACGAGAACGTGATGATAGGTTGGAGCATCAAAAGAGAG 2599
| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2554 GAGAATCAATCAGCCGCCTGAAACGAGAACGTGATGATAGGTTGGAGCATCAAAAGAGAG 2613
Query 2600 ATGTCCAACATAAGATCAGAGATGATTTTGACGACCACGGTTCTCTCAGGCAGAGAGATG 2659
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 2614 ATGTCCAACATAAAATCAGAGATGATTTTGACGACCACAGTTCTCTCAGGCACAGAGATG 2673
Query 2660 ATATCTATATGCAGAGGGATGGAAACGAGAGGTTGAGGGAGCGTGATGTTTTGGATAAAT 2719
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2674 ATATCTATATGCAGAGAGATGGAAACGAGAGGTTGAGGGAGCGTGATGATTTGGATAAAT 2733
Query 2720 TGAAGCTGCCTCACGAGGATGGTATATCAGCACGAGGAAGAGAGAGGCAGGTGGCAGTAA 2779
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2734 TGAAGCTAACTCACGAGGATGGTATATCAGCACGAGGAAGAGAGAGGCAGGTGGCTGTAA 2793
Query 2780 GGGGC-CACAGAGGTTCCGAAGATCGATC-ATCAAGGATGAAGGATGAGTATAAAGCTTC 2837
|||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2794 -GGGCTCACAGAGGTTCAGAAGACCGA-CTATCAAGGATGAAGGATGAGTATAAAGCTTC 2851
Query 2838 TGACAAAGAGCATGTCACGAAAGATACATTAAGGCATGCTAAACAGACAAAGAGAAGGGA 2897
||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2852 TGACAAAGATCATCTCACCAAAGATACATTAAGGCATACTAAACAGACAAAGAGAAGGGA 2911
Query 2898 CTACCCTGGTGAAGAAAGTTCTTCCCATCATAGAGGACATGAAGACTTCTCTGCACGGAC 2957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2912 CTACCCTGGTGAAGAAAGTTCTTCCCATCATAGAGGACATGAAGACTTCTCTGCACGGAC 2971
Query 2958 AGACAACATAGTTAACAATGAGAAAAAACCAAGGCAGGAGAGGACAGGTGCTAAAATTGA 3017
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2972 AGACGACATTGTTAACAATGAGAAAAAACCAAGGCAGGAGAGGACAGGTGCTAAAATTGA 3031
Query 3018 TAAGTTTATTGATACTTTGGATGGCCAGCGATTGCAAGACAGAAAACATAAAGATTCTAG 3077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3032 TAAGTTTATTGATACTTTGGATGGCCAGCGATTGCAAGACAGAAAACATAAAGATTCTAG 3091
Query 3078 ACGAAAGATTAAAGAACAGCGAGAGGGCACAGAATCACTT-AG---CAAGCAAGGGGAGC 3133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 3092 ACGAAAGATTAAAGAACAGCGAGAGGGCACAGAATCA-TTGAGGAGCAAGCAAGGGGAGC 3150
Query 3134 AAAATGGCAGTTCCGTAGTGACAGGATCAAAAGGAACCAACGACGCAAGGAATTGCAGGA 3193
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3151 AAAATGGCAGTTCCGTAGTGACAGGCTCAAAAGGAACAAACGAAGCAAGGAATTGCAGGA 3210
Query 3194 GTGAGATCCCACATCAGCCTAACACCGCCAAAAGACACAAGGAAAATGCATCCTCTGGTG 3253
|||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3211 GTGAGAACCCACAGCAGCCTAACCCCGCCAAAAGACACAAGGAAAATGCATCCTCTGGTG 3270
Query 3254 ATGAGATACACGATTCAAAGAGAGGACGTACAAAACTGGAGCGTTGGGCAAGCCACAAAG 3313
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3271 ATGAGCTACACGATTCAAAGAGAGGACGTACAAAACTGGAGCGTTGGGCAAGCCACAAAG 3330
Query 3314 AGAGAGAAGATGCTGTCTCTGCCAAGTCATCATCCATTTCCTCAAAACTAGAAGAAAAGG 3373
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
Sbjct 3331 AGAGAGATGATACTGTCTCTGCCAAGTCATCATCCATTTCCTCAAAGCTTGAAGAAAATG 3390
Query 3374 A-AAACAACACTAATGGCCGTCTTAGTGAACCTGTTCATGGTTCTATTGGAAAGAGCCGG 3432
| ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 3391 ACAAA-AACACTAACGGCAGGCTTAGTGAACCTGTTCATGGTTCTATTAGCAAGAGCCGG 3449
Query 3433 GATGTAACTGAAGAGAAAATTGGCCATGATCTTGCAGACACAAAAGATGGAAGCGAGAAG 3492
||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 3450 GATGTAACTGAAGAGAAAAGTGGCCATAACCTTGCAGAGACCAAAGATGGAAGCGAGAAG 3509
Query 3493 GGACCAGGAGACCGGCACTTGGATACGGTTGAGAAACTCAAGAAACGCAGTGAAAGGTTC 3552
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3510 GGACCAGGAGACTGGCACTTGGACACGGTTGAGAAACTCAAGAAACGCAGTGAAAGGTTC 3569
Query 3553 AAGCTTCCAATGCCCACGGAGAAAGACACCACGGGAGTAAAGAAAATGGAGTCTGAGACA 3612
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3570 AAGCTTCCAATGCCCACGGAGAAAGACACCACGGGAGTTAAGAAAATGGAGTCTGAGACA 3629
Query 3613 CTGCCCTCCGCAAAAATTGAAGGCCCTGTGGATTCAGAGGGAGAGTATGTGTGGGATGAG 3672
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3630 CTGCCCTCTGCAAAAATTGAAGGCCCTGTGGATTCAGAGGGAGAGTATGTGTGGGATGAG 3689
Query 3673 CGAAGTTGTGTAAGAATAGGGAGGGAATACGCATAA 3708
| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3690 CTAAGTTGTGTAAGAATAGGGAGGGAATACGCTTAA 3725
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 140089926213
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5