BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G58160.1
Length=3998
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg495923 jgi|Araly1|495923|fgenesh2_kg.8__1739__AT5G58160.1 3509 0.0
> Ahg495923 jgi|Araly1|495923|fgenesh2_kg.8__1739__AT5G58160.1
Length=3667
Score = 3509 bits (1900), Expect = 0.0
Identities = 2143/2258 (95%), Gaps = 25/2258 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 96 GTGTTCGATTGCTGCTTCTCTACCGATTCATGGGAAGAAGAAAACTACAAAGTTTATATG 155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 GTGTTCGATTGCTGCTTCTCTACCGATTCATGGGAAGAAGAAAACTACAAAGTTTATATG 112
Query 156 GCAGGAGTAGTCAATCAACTACAAGAGCATTTCCCTGAAGCATCTTCTCTTGTGTTTAAT 215
|| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 GCGGGAGTAGTCAATCAACTACAGGAGCACTTCCCTGAAGCATCTTCTCTTGTGTTTAAT 172
Query 216 TTCCGTGAAGTGGGTACTCGAAGTGTGATGGCTGATGTCTTATCTGAACATGGCTTGACT 275
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 173 TTCCGTGAAGTGGGTACTCGGAGTGTGATGGCTGATGTCTTGTCAGAACATGGTTTGACC 232
Query 276 ATAATGGATTATCCTCGGCACTACGAAGGCTGCTCATTGTTACCTGTGGAAGTGATGCAT 335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 233 ATAATGGATTATCCTCGGCACTACGAAGGCTGCTCATTGTTACCTGTGGAAGTTATGCAC 292
Query 336 CATTTTCTCCGGTCAAGTGAAAGTTGGCTCTCGCTTGGGCCAAATAACTTGTTACTAATG 395
||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 293 CATTTTCTCCGGTCAAGTGAAAGCTGGCTCTCACTCGGCCCAAATAACTTGTTACTAATG 352
Query 396 CATTGTGAAAGTGGGGCTTGGCCTGTTTTAGCTTTTATGCTAGCTGCCCTCCTTATATAC 455
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 353 CATTGTGAAAGCGGGGCTTGGCCAGTTTTAGCTTTTATGCTAGCTGCCCTCCTTATATAC 412
Query 456 AGGAAGCAGTATAGTGGTGAGT-CTAAGACTTTGGACATGATCTACAAGCAGGCTCCGCG 514
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 413 CGGAAGCAGTATAGTGGTGAGTAC-AAGACTTTGGACATGATCTACAAGCAGGCTCCGCG 471
Query 515 TGAGCTTCTGCGTTTGTTCTCGCCCTTGAACCCAATTCCTTCTCAGCTTCGTTATCTACA 574
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 472 TGAGCTTCTGCGTTTGTTCTCACCGTTGAACCCAATTCCCTCTCAGCTTCGCTATCTACA 531
Query 575 GTACGTGTCAAGAAGGAATTTGGTCTCTGAATGGCCTCCATTGGATAGGGCTCTCACCAT 634
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 532 GTACGTTTCGAGAAGGAATTTGGTCTCTGAATGGCCTCCACTGGATAGGGCTCTCACCAT 591
Query 635 GGATTGTGTTATTTTGAGATTTATTCCTGATGTTAGTGGACAAGGAGGCTTTCGCCCTAT 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 592 GGATTGTGTTATTTTGAGATTTATTCCTGATGTTAGTGGACAAGGAGGCTTTCGCCCAAT 651
Query 695 GTTTCGAATATATGGTCAGGATCCCTTTTTTGTTGATGATAAAAAGCCTAAGCTTTTGTA 754
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 652 GTTCCGAATATATGGTCAGGATCCCTTTTTTGTAGATGATAAAAAGCCCAAGCTTTTGTA 711
Query 755 CACTACTCCCAAGAAAGGGAAACACCTGAGGGTCTACAAGCAGGCAGAATGTGAACTAGT 814
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 CTCTACTCCCAAGAAAGGGAAACACCTGAGGCTCTACAAGCAGGCAGAATGTGAACTAGT 771
Query 815 CAAGATTGACATTAATTGTCATGTGCAAGGTGATATCGTGATCGAGTGCCTTAGTTTGAA 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 772 CAAGATTGACATTAATTGTCATGTGCAAGGTGATATCGTGATCGAGTGCCTCAGTTTGAA 831
Query 875 CGATGACATGGAAAGAGAGGTCATGATGTTTCGAGTGGTTTTTAACACTGCTTTTATTAG 934
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 832 CGATGACATGGAAAGAGAGGTCATGATGTTTCGAGTGGTTTTCAATACTGCTTTTATTAG 891
Query 935 ATCAAACATTTTGATGCTTAACCGTGATGAAGTCGACACATTATGGCATATAAAAGAATT 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 ATCAAACATTTTGATGCTTAACCGTGATGAAGTCGACACATTATGGCATATAAAAGAATT 951
Query 995 CCCAAAGGGGTTCAGAGTTGAGCTTCTCTTCTCAGATATGGATGCTGCCTCTTCTGTTGA 1054
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 952 CCCAAAGGGATTCAGAGTTGAGCTTCTCTTCTCAGATATGGATGCTGCATCTTCTGTTGA 1011
Query 1055 CTTGATGAATTTTTC-TTCCTTGGAAGAGAAAGATGGTCTTCCAATAGAAGTTTTTTCCA 1113
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1012 CTTGATGAATTTTTCGTTC-TTGGAAGAGAAAGATGGTCTTCCCATAGAAGTTTTTTCCA 1070
Query 1114 AAGTTCATGAGTTCTTCAATCAAGTTGATTGGGTTGATCAGACAGATGCCACACGCAATA 1173
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1071 AAGTTCATGAGTTCTTCAATCAAGTTGACTGGGTTGATCAGACGGATGCCACACGCAATA 1130
Query 1174 TGTTTCAGCAGTTAGCCATTGCAAATGCTGTCCAAGAAGGACTAGATGGTAATTCAAGCC 1233
|| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 1131 TGCTTCAGCAGTTAGCCATTGCAAATGCTGTTCAGGAAGGACCAGATGGGAATTCAAGCC 1190
Query 1234 CAAGACTACAAGGGTTAAGCCCTAAAAGTATCCATGATATTATGAAGCATGCAGCAATTG 1293
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1191 CAAGACTACAAGGGTTAAGCCCTAGAAGTATCCATGATATTATGAAACATGCAGCAATTG 1250
Query 1294 AAAATAGTGCAAAGTTCAAATTGTCTTCAATGTCCGAGGTTGAAACAATCGACACACCAG 1353
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1251 AAAATAGTGCAAAGTTCAAATTGTCTTCAATGTCCGAGGTTGAAACAATCAACACACCAG 1310
Query 1354 AAAAGCCTCCTACTGATTCAGTCAAGAAGTTTATAGCAGAAGATGTACATTCTGTCCTTC 1413
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1311 AAAAGCCTCCTACTGATTCAGTCAAGACGTTTATAGCAGAAGATTTACATTCTGTCCTTC 1370
Query 1414 AGATAAATAATCAGGAACAAAAC-GCCAGCGAGGATGCAACAAAGTTGTTACATCAAGAG 1472
|||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 1371 AGATAAGTAATCAGGAA-AAAACCGCCAGCCAGGAGGCAACCAAGTTGTTACATGAAGAG 1429
Query 1473 TCCCCTTCTCTCAAGCTTGTGCATCATTCTGCAACAGTTAAACCTCTTGTGGACGATTCT 1532
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1430 TCCCCTTCTCTCAAGCTTGTGCATCATTCTGCTACAGTTAAACCTCTTGTGGACGGTTCT 1489
Query 1533 AAATCTCCAGAAAATGCCGAGGAGAATTTTCCGAAGAGTCCTTCAGCA--CATGATGGGA 1590
|||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||
Sbjct 1490 AAATCTTCAGAATATGTTGAGGAGAATTTTCTGAAAAGTCCTTCAGCAAACA-G-TGGGA 1547
Query 1591 AAGCAATCTCGTTTTCGCCACCCACACCGTCACCACCTCATCCTGTAAGACCGCAGTTGG 1650
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1548 AAGCAATTTCGTTTTCGCCACCCACACCGTCACCACCTCATCCTGCAAGACCGCAGTTGG 1607
Query 1651 CTCAAGCGGGAGCACCTCCCCCACCTCCTCCACTTCCAGCTGCTGCTTCTAAACCTTCAG 1710
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1608 CTCTAGCGGGAGCACCTCCCCCACCTCCTCCACTTCCAGCTGCTGCTTCTAAGCCTTCAG 1667
Query 1711 AGCAATTGCAGCATTCTGTTGTTCAAGCAACAGAGCCTCTGTCACAAGGAAATTCCTGGA 1770
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 AGCAATTGCAGCATTCTGTTGTTCAACCAACAGAGCCTCTGTCACAAGGAAATTCCTGGA 1727
Query 1771 TGTCATTAGCAGGCTCTACGTTT---CAAACAGTTCCAAACGaaaaaaaTCTCATTACAC 1827
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1728 TGTCATTAGCAGGCTCTACGTTTTATCAAACAGTTCCAAACGAAAAAAATCCCATTACAC 1787
Query 1828 TGCCTCCAACACCTCCCCTTGCTTCTACATCCCATGCCTCTCCTGAGCCATCTTCTAAAA 1887
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 1788 TGCCTCCAACACCTCCCCTTACTTCTACATCACATTCCTGTCCTGAGCCATCATCTAAAA 1847
Query 1888 CAACAAATTCATTGTTACTGTCACCTCAAGCATCACCAGCTACTCCCACCAACCCATCAA 1947
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1848 CAACAACTTCATTGTTACAGTCACCTCAAGCATCATCAGCTACTCCCGCCAACCCATTAA 1907
Query 1948 AAACTGTTTCAGTAGAtttttttGGTGCTGCTACTTCACCTCATTTAGGAGCTTCCGATA 2007
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1908 AAACTGTTTCAGTAGATTCTTTTGGTCCTGCTACTTCACCTCATTTAGGAGCGTCCGATA 1967
Query 2008 ATGTGGCTTCAAATCTTGGACAACCGGCGAGGTCACCTCCTCCAATATCTAATTCAGACA 2067
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1968 ATGTGGCTTCAAATCTTGGACAACCGGCGAGGTCACCTCCTCCAGTATCTAATTCAGACA 2027
Query 2068 AAAAGCCTGCTTTGCCTCGACCGcctcctccccctcctccccctccAATGCAGCATTCCA 2127
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 AAAAGCCTGCTTTGCCTCGACCGCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCCAATGCAGCATTCCA 2087
Query 2128 CAGTAACTAAAGTcccccctccaccaccaccagcaccaccagcacccccaacaccaATTG 2187
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2088 CAGTCACTAAAGTCCCCCCTCCACCACCACCACCACCACCAGCACCCCCAGCACCATTTG 2147
Query 2188 TTCATACCTCTTctccccctcctcctcctcctcctcctcctccgcccgctcctccAACAC 2247
||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2148 TTCATGCCTCTTCTCCCCCTCC-CC-C-TCCTCC---------GCCCGCTCCTCCTACAC 2195
Query 2248 CACAATCTAATGGAATCTCTGCTATGAAAAGTTCACCTCCTGCACCACCTGCACCTCCCC 2307
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2196 CACATTCTAATGGAATCTCTGCTATGAAAAGTTCACCTCCTGCACCCCCTGCACCTCCCC 2255
Query 2308 GGCTTCCCACCCATTCTGCCTCTCCTCCCCCTCCAACC 2345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2256 GGCTTCCCACCCATTCTGCCTCTCCTCCCCCTCCAACC 2293
Score = 1958 bits (1060), Expect = 0.0
Identities = 1196/1258 (95%), Gaps = 23/1258 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2742 CTTGAAAGTCTTTTCTCCGCATCAGCTCCAGAACAAGCAGGAAAATCGAGACTAGATAGC 2801
||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2432 CTTGAAAGTCTGTTCTCCGCATCTGCTCCAGAGCAGGCAGGAAAATCGAGACTAGATAGC 2491
Query 2802 TCTCGTGGACCTAAACCCGAGAAAGTCCAACTGATTGAACACCGGCGAGCCTACAATTGT 2861
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2492 TCTCGTGGACCTAAACCCGAGAAAGTCCAACTGATTGAACACCGGCGAGCGTACAATTGT 2551
Query 2862 GAAATCATGCTTTCAAAAGTGAAAGTACCTTTACAGGATTTGACGAACTCAGTGCTTAAC 2921
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2552 GAAATTATGCTTTCAAAAGTGAAAGTACCTTTGCAGGATTTGACGAACTCAGTGCTTAAC 2611
Query 2922 CTGGAGGAGTCGGCTCTTGATGCTGATCAGGTTGAGAACCTAATTAAGTTTTGCCCAACA 2981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2612 CTGGAGGAGTCGGCTCTTGATGCTGATCAGGTTGAGAACCTAATTAAATTTTGCCCAACA 2671
Query 2982 AGAGAAGAGATGGAGTTACTAAAGGGTTATACTGGTGACAAGGACAAGCTTGGAAAATGC 3041
|||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2672 AGAGAAGAAATGGAATTACTAAAGGGTTACACTGGTGACAAGGACAAGCTTGGAAAATGC 2731
Query 3042 GAACTGTTCTTCTTAGAGATGATGAAAGTCCCACGAGTAGAAACAAAGCTCAGGGTATTC 3101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2732 GAACTGTTCTTCTTAGAGATGATGAAAGTCCCACGAGTAGAAACAAAGCTCAGGGTATTC 2791
Query 3102 TCATTCAAAATGCAGTTTACCTCTCAGATTTCTGAACTCAGGAATAGTCTAGGTGTTGTG 3161
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2792 TCATTCAAAATGCAGTTTACCTCTCAGATTTCTGAACTAAGGAATAGTCTAGGTGTTGTG 2851
Query 3162 AACTCCGCAGCAGAACAGGTAAAAAATTCTGAAAAATTCAAAAGAAT-AATGCAGACGAT 3220
||||||||| ||||||||| | ||| || ||| | | || ||| ||
Sbjct 2852 AACTCCGCATCAGAACAGG---------C----AAA-TC---AGACTCACTG--GACAAT 2892
Query 3221 TTTGTCACTTGGGAACGCCCTAAACCAAGGGACTGCTAGGGGTGCTGCGGTTGGGTTTAA 3280
||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2893 TTTATCCCTTGGGAACGCCCTAAACCAAGGGACGGCTAGGGGTGCTGCGGTTGGGTTTAA 2952
Query 3281 ATTGGACAGTTTGCCGAAACTCAGTGAAACACGGGCACGTAATAACCGAATGACTCTGAT 3340
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2953 ATTGGACAGTTTGCCGAAACTCAGTGAAACACGGGCGCGTAATAACCGAATGACTCTGAT 3012
Query 3341 GCATTATCTATGCAAGGTAAGCTTTTATAGTCTGCGCTTCTGTAGCTTTGTGGATGTACT 3400
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3013 GCATTATCTATGCAAGGTAAGCTATTATAGTCTGCTCTTCTGTAGCTTTATGGATGTACT 3072
Query 3401 AGAGGAAGAAAGATATAGTCTGATGGATTCTTTACAGATTCTTGCTGAAAAAATCCCAGA 3460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3073 AGAGGAAGAAAGATATAGTCTGATGGATTCTTTACAGATTCTTGCTGAAAAAATCCCAGA 3132
Query 3461 AGTTTTGGATTTTACAAAAGAATTATCCTCGTTGGAGCCGGCAACAAAGATTCAACTGAA 3520
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3133 AGTTTTAGATTTTACAAAAGAATTATCCTCGTTGGAGCCGGCAACAAAGATTCAACTGAA 3192
Query 3521 GTTTCTGGCCGAGGAGATGCAAGCTATAAACAAGGGACTTGAGAAAGTCGTACAGGAACT 3580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3193 GTTTCTGGCCGAGGAGATGCAAGCTATAAACAAGGGACTGGAGAAAGTCGTACAGGAACT 3252
Query 3581 TTCCTTGTCCGAAAATGATGGCCCGATTTCCCATAACTTTAACAAGATATTGAAGGAGTT 3640
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3253 TTCCTTGTCCGAAAATGATGGCCCGATTTCACATAACTTTAACAAGATATTGAAGGAGTT 3312
Query 3641 CCTTCATTATGCGGAAGCAGAAGTAAGGTCATTGGCTTCACTTTATTCGGGAGTGGGAAG 3700
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3313 CCTTCATTATGCGGAAGCAGAAGTAAGGTCGTTGGCTTCACTCTATTCAGGAGTGGGAAG 3372
Query 3701 AAACGTGGATGGTTTAATTCTCTATTTTGGTGAAGACCCTGCCAAGTGCCCTTTTGAACA 3760
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3373 AAACGTGGATGGCTTAATTCTCTACTTTGGTGAAGACCCTGCCAAGTGCCCTTTTGAACA 3432
Query 3761 AGTAGTGTCGACTCTTCTAAACTTTGTAAGACTGTTCAATCGTGCACATGAAGAAAACGG 3820
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 3433 AGTGGTGTCGACTCTTCTAAACTTTGTAAGACTGTTCAATCGTGCGCTTGAAGAAAACGG 3492
Query 3821 AAAACAACTCGAGGCAGAAGCTAAGAAGAATGCTGCTGAAAAGGAGAAACCAAAAACAGG 3880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3493 AAAACAACTCGAGGCAGAAGCTAAGAAGAATGCTGCTGAAAAGGAGAAACCAAAAACAGG 3552
Query 3881 TGGATTAGATACAGAAATCAAGAAGCCCTTAAATGAAGAAGTTAAGGAGGAGAAAACAAA 3940
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||
Sbjct 3553 TGGATTAGATAAAGAAATCAAGAAGCCCTTGGATGAAGAAGTTAAGGAG-A-AAA-CAAA 3609
Query 3941 AACAAGTGGATTAGGTAAAGAAATGAGTGACCGACTAAAGGAAAGAACCGCTCCTTGA 3998
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3610 AACAAGTGGATTAGGTAAAGAAATGAGTGAGCGAATAAAGGAAAGAACCGCTCCTTGA 3667
Score = 167 bits (90), Expect = 6e-40
Identities = 94/96 (98%), Gaps = 0/96 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2541 AAGCCATACCACTGGTTGAAACTGACAAGAGCTGTCAATGGGAGCTTATGGGCTGAAACA 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2297 AAGCCATACCACTGGTTGAAACTGACAAGAGCTGTCAATGGGAGCTTATGGGCTGAAACA 2356
Query 2601 CAAATGTCTAGTGAAGCTTCTAAGTATGCATTGTTC 2636
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2357 CAAATGTCTAGGGAAGCTTCTAAGTATGCATTATTC 2392
Score = 75.0 bits (40), Expect = 4e-12
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2671 ATTCTTGCATGATTTCCAATTCATTGATACTTTACCTCCTTGT 2713
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2389 ATTCTTGCATGATTTCCAATTCATTGATACTTTACCTCTTTGT 2431
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 151126622383
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5