BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT5G58410.1

Length=5665
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg495958 jgi|Araly1|495958|fgenesh2_kg.8__1774__AT5G58410.1        9027    0.0  


> Ahg495958 jgi|Araly1|495958|fgenesh2_kg.8__1774__AT5G58410.1
Length=5625

 Score = 9027 bits (4888),  Expect = 0.0
 Identities = 5394/5640 (96%), Gaps = 28/5640 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGGCAAACCCAAAGGAGATGCTGCAAGAAGCAAAGCACGTCCATCTAGCAGCAGCTTG  60
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct  1     ATGGGCAAACCCAAAGGAGATGCTGCAAGAAGCAAAGCTCGTCCATCCAGCAGCAGCTTG  60

Query  61    GCAGCTTCTCTGTTGCCGTCTGGCTCTGCAGCCGCCGTAGGTTTTGG-GGGCTATGTCGG  119
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct  61    GCAGCTTCTTTGTTGCCGTCTGGCTCTGCAGCCGCCGTAGGTTTTGGCGGG-TATGTCGG  119

Query  120   TAGCTCTAGATTCCAAACTTCTCTGTCAAACGAAGACTCTGCTT-CCTTCTTGGATTTGG  178
             ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct  120   TAGCTCTAGATTCGAAACGTCTCTGTCAAACGAAGACTCTGCTTCCCTT-TTGGATTTGG  178

Query  179   ATAGTGAGGTTGCCCAACACTTGCAAAGGCTTTCAAGGAAGGATCCTACAACAAAGATTA  238
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179   ATAGTGAGGTTGCCCAGCACTTGCAAAGGCTTTCAAGGAAGGATCCTACAACAAAGATTA  238

Query  239   AAGCTCTTGCTTCCCTATCAGAACTGGTTAAGCAGAAGCAAGGGAAGGAACTTTTGCCAA  298
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||
Sbjct  239   AAGCTCTTGCTTCCCTGTCAGAACTGGTTAAGCAGAAGAAAGGAAAGGAACTTTTCCCAA  298

Query  299   TAATCCCACAATGGACATTTGAGTACAAGAAGCTGATACTGGACTACAGTCGAGATGTTC  358
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct  299   TAATCCCACAATGGACATTTGAGTACAAGAAGCTGATACTGGACTACAATAGAGATGTTC  358

Query  359   GGCGAGCTACTCATGACGTCATGACTAATGTTGTCACTGGTGCCGGGAGAGATATAGCTC  418
             |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  359   GGCGAGCTACGCATGATGTCATGACTAATGTTGTCACTGGTGCCGGGAGAGATTTAGCTC  418

Query  419   CTCATCTAAAGTCTATAATGGGGCCCTGGTGGTTTTCGCAATTTGATTTGGCATCTGAAG  478
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  419   CTCATCTAAAGTCTATAATGGGGCCCTGGTGGTTTTCACAATTTGATTTGGCATCTGAAG  478

Query  479   TTTCTCAAGCAGCAAAGTCGTCTTTCCAGGTTGGCTCCTCGTTTGGTAATTCAGTTTTCT  538
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  479   TTTCTCAAGCAGCAAAGTCGTCTTTCCAGGTTGGCTCCTCGTTTCGTAATTCAGTTTTCT  538

Query  539   TGGTGGAGGCAGCATTCCCTGCCCAGGAAAAGAGATTGCACGCCTTGAATT-TATGTTCA  597
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct  539   TGGTGGAGGCAGCATTCCCTACCCAGGAAAAGAGATTGCACGCCTTG-ATTCTATGTTCA  597

Query  598   GCTGAGATTTTTGCTTATCTGGAGGAAAATCTCAAACTTACACCTCAAAATTTATCTGAT  657
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598   GCTGAGATTTTTGCTTATCTGGAGGAAAATCTCAAACTTACACCTCAAAATTTATCTGAT  657

Query  658   AAATCACTTGCTTCAGATGAATTAGAAGAAATGTACCAGCAGATGATATCGTCATCTCTG  717
             ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658   AAAGCACTTGCATCAGATGAACTAGAAGAAATGTACCAGCAGATGATATCGTCATCTCTG  717

Query  718   GTGGGGTTGGCTACACTTCTAGATATTTTGCTCCGCGAACCCGATAATA-CTGGCTCTGC  776
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||
Sbjct  718   GTGGGGTTGGCTACACTTCTAGATATTTTGCTCCGCAAACCTGATAA-AGTTGGCTCTGC  776

Query  777   AAACATTAATTCTGAATCAAAACTTGCCTCAAAGGCTAGGGCAGTAGCAACCTCCTCAGC  836
             ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777   AAACATTAATTCTGAATCAAAACTTGCATCGAAGGCTAGGGCAGTAGCAACCTCCTCAGC  836

Query  837   TGAGAAGATGTTCTCTTCCCATAAATGCTTTCTGAACTTTCTAAAATCTGAAAGCCCTAG  896
             ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837   TGAGAAGTTGTTCTCTTTCCATAAATGCTTTCTGAACTTTCTAAAATCTGAAAGCCCTAG  896

Query  897   TATTCGGTCAGCGACTTATTCTTTGTTAAGCAGCTTCATTAAAAATGTTCCTGAAGTCTT  956
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897   TATTCGGTCAGCGACTTATTCTTTGTTAAGCAGCTTCATTAAAAATGTTCCTGAAGTCTT  956

Query  957   TGGCGAAGGCGACGTCCGAAGTCTTGCACCAGCTCTGCTTGGTGTTTTTCGAGAAAATAA  1016
             ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  957   TGGCGAAGGAGACGTCCGATGTCTTGCACCAGCTCTGCTTGGCGTTTTTCGAGAAAATAA  1016

Query  1017  TCCAACCTGCCACTCATCAATGTGGGAGGCTGTCTTGCTGTTCTCTAAAAAATTTCCTCA  1076
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1017  TCCAACCTGCCACTCATCAATGTGGGAGGCTGTCTTGCTGTTCTCTAGAAAATTTCCTCA  1076

Query  1077  GAGTTGGGTCTACTTAAATGTTCATAAATCTGTTCTAAATCATTTATGGCAGTTTCTGAG  1136
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct  1077  GAGTTGGGTCTACTTAAATGTTCATAAATCTGTTCTAAGTCATTTATGGCAGTTTCTTAG  1136

Query  1137  GAACGGGTGCTATGGATCCCCACAGGTTTCTTATCCTGCACTGATATTGTTCCTCGAAGT  1196
             ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1137  GAACGGGTGCTATGGATCCTCACGGGTTTCTTATCCTGCACTGATATTGTTCCTGGAAGT  1196

Query  1197  TATGCCAGCACAATCTGTAGAAAG-TGATAAGTTCTTTGTGAATTTTTTCAAAAACTTAT  1255
             ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1197  TATGCCAACACAATCTGTAG-AAGCTGATAAGTTCTTTGTGAATTTTTTCAAAAACTTAT  1255

Query  1256  TGGCTGGAAGGAGTATGTGTGAATCATCAAGTACGGATCAGTTATCACTTCTTCGGGCAA  1315
             ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1256  TGGCTGGGAGGAGTATGTGTGAATCTTCAAGTACAGATCAATTATCACTTCTTCGGGCAA  1315

Query  1316  CCACTGAATGTTTCCTCTGGGGATTACGTAATGCTTCAAGGTATTGCGATGTTCCCAATT  1375
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1316  CCACTGAATGTTTCCTCTGGGGATTACATAATGCTTCAAGGTATTGCGATGATCCCAATT  1375

Query  1376  CTATTCATGATCTCCAGGTTGATCTAATTGATAAAGTCCTAGTGAAGATTCTATGGGCGG  1435
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1376  CTATTCATGATCTCCAGGTTGATCTAATTGATAAAGTCCTCGTGAAGATTCTATGGGCGG  1435

Query  1436  ACTTCACTGAACTATCTAAGGGCAGCATTCCACCTAATCAGAGGAAGTCAGCTGAAAATC  1495
             |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1436  ACTTCTTTGAACTATCTAAGGGCAGCATTCCACCTATTCAGAGGAAGTCAACTGAAAATC  1495

Query  1496  TTGGCATGGGTAATTCAGTTAGTTATCTGCAAGAGCTAGGAAGATGCATCTTAGAAATTC  1555
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1496  TTGGCATGGGTAATTCAGCTAGTTATCTGCAAGAGCTAGGAAGATGCATCTTAGAAATTC  1555

Query  1556  TATCAGGGATTAATTTACTTGAACAGAACCTGCTGTCTTTTTTCTGTAAAGCTGTTCAAG  1615
             | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1556  TTTCAGGGATTAATTTGCTCGAACAGAACCTGCTGTCTTTTTTCTGTAAATCTGTTCAAG  1615

Query  1616  AGAGCTTCTTGAATATGCTTCAGCAGGGAGATTTAGAGATAGTTGCGGGAAGCATGAGAA  1675
             ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1616  AGAGCTTCTTGAACATGCTTCAGCAGGGAAATTTAGAGATAGTTACGGGAAGCATGAGAA  1675

Query  1676  AAATGATTGATTTTCTCTTGTTATTGGAGAGATATTCAGTTTTGGAAGGTGAGAGCTGGC  1735
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1676  AAATGATTGATTTTCTCTTATTATTGGAGAGATGTTCAGTTTTGGAAGGTGAGAGTTGGC  1735

Query  1736  CCTTGCATCAATTTATGGGGCCACTGCTGTCCAAGGCTTTCCCGTGGATAAGATCATCTG  1795
             ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1736  CCTTGGATCAATTTATGGGGCCACTTTTGTCCAAGGCTTTCCCGTGGATAAGATCATCTG  1795

Query  1796  AATTGTTAGATGGTGTGAAGCTTTTGTCAGTTTCAGTATCGGTGTTTGGACCAAGAAAGG  1855
             ||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| 
Sbjct  1796  AATTGATCGAAGGTGTGAAACTTTTGTCAGTTTCAGTATCAGTGTTTGGACCAAGAAAGA  1855

Query  1856  TAGTTCCAGTGCTAATTGATGATATAGAGACTTCTACCCTTCTCTCTGTTGAAAAAGAGA  1915
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1856  TAGTTCCAGTACTAATTGATGATATAGAGACTTCTACCCTTCTCTCTGTTGAAAAAGGGA  1915

Query  1916  AGAATATGAGCCCGGAGAAGCTTATTAAAGTTTTTCAAGAAATTTTTATTCCTTGGTGTA  1975
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1916  AGAATATGAGCCCAGAGAAGCTTATTAAAGTTTTTCAAGAAATTTTTATTCCTTGGTGTA  1975

Query  1976  TGGATGGATATGACTCTTCGACTGCAGCTAGACAAGATCTCCTATTTTCATTGCTTGATG  2035
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1976  TGGATGGATATGACTCTTCGACTGCAGCTAGACAAGATCTCCTATTTTCATTGCTCGATG  2035

Query  2036  ATGAATGTTTCACTCAGCAGTGGAGTGATGTCATTTCTTATGTATTTAATCAACAACATC  2095
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2036  ATGAATGTTTCACTCAGCAGTGGAGTGATGTCATTTCTTATGTATTTAATCAACAACATC  2095

Query  2096  AGGGCTTCAATAACCTGGCTGCTATGAAAATGCTTTTAGAGAAGGCAAGGGATGAAATTA  2155
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2096  AGGGCTTCAATAACCTGGCTGCTATGAAAATGCTTTTAGAGAAGGCAAGGGATGAAATTA  2155

Query  2156  CAAAAAGAAGTTCTGGACAGGAGTTGAATCAAAGAATAGGTTCTCGGCCAGAACATTGGC  2215
             |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2156  CAAAAAGAAGTTCTGGGCAGGAGTTGCATCAAAGAATAGGTTCTCGGCCAGACCATTGGC  2215

Query  2216  ACCATACACTCATAGAATCAACTGCTATAAGTCTTGTCCATTCCTCCTCAGCGACTACAA  2275
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2216  ACCATACACTCATAGAATCAACTGCTATAAGTCTGGTCCATTCCTCCTCAGCGACTACAA  2275

Query  2276  CTTCTGCTGTTCAGTTCCTGTGTTCAGTTCTGGGTGGTTCAACCCAAGACAGCAGTATTT  2335
             | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2276  CCTCTGCTGCTCAGTTCTTGTGTTCAGTTCTGGGTGGTTCAACCCAAGACAGCAGTATTT  2335

Query  2336  CTTTTGTGTCAAGAAGCTCGTTGGTCTTGATATATAGAGGGATCCTCGAAAAACTGCTAT  2395
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2336  CTTTTGTGTCAAGAAGCTCGTTGGTCTTGATATATAGGGGGATCCTCGAAAAACTGCTAT  2395

Query  2396  CTTTTATCAAACAGTCACCATTATGTTCAGTCAATGATACATGTTCGTCTCTTATTGTCG  2455
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2396  CTTTTATCAAACAGTCACCATTATGTTCAGTCAATGATACATGTTCGTCTCTTATTGTCG  2455

Query  2456  AGGCTATAGCGTTTGATTCGAGCAGTTCTGTAGATGTGATCGTGGTTGCTAAGTTTGCAG  2515
             ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2456  AGGCTATAGAGTTTGATTTGAGCAGTTCTGTAGATGTGATCGTGGTTGCTAAGTTTGCAG  2515

Query  2516  CTGAAGTTATTGATGGTAGTTTCTTCAGTTTGAAGTCTCTGAGTCAGGACGCAACCCTAC  2575
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||
Sbjct  2516  CTGAAGTTATTGATGGTAGTTTCTTCAGTTTGAAGTCTCTGAATCAGGACGCCACTCTAC  2575

Query  2576  TTACAACTGTATTGTCTTCTATTTTTATCATTGACTTAGAGAATAGAATGACATCACTAG  2635
             || ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct  2576  TTTCAACTATTTTGTCTTCTATTTTTATCATTGACTTGGAGAGTAGAATGACATCACTAG  2635

Query  2636  TGGACAATACGCTATCTGAGTCCAAAGAGAAGAGAAAGGATCGGAATTTTGTGTGTGATT  2695
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2636  TGGACAGTACGCTATCTGAGTCCAAAGAGAAGAGAAAGGATCGGAATCTTGTGTGTGATT  2695

Query  2696  ATGTTCATGCCGTTTGCTCTAAGATGGATAATCAATTCTGGAAATCTATAAACTATGATG  2755
             || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2696  ATATTCATGCTGTTTGCTCTAAGATGGATAATCAGTTCTGGAAATCTATAAACTATGATG  2755

Query  2756  TCCGGAAGAGTTCAGCAAGCACTTTGGCTCAGTTCCTGAGGTCAGTTGTCCTACTTGAGG  2815
             ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2756  TCCGGAAGAGTTCAGCAAGCATTTTGGTTCAGTTCCTTAGGTCAGTTGTCCTACTTGAGG  2815

Query  2816  ATGATCTGCAACCTTTTGAACTTACATTATTGTGTGCTTCAAGGATGACCGAAGTGTTAG  2875
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
Sbjct  2816  ATGATCTGCAACCTTTTGAACTTACATTATTGTGTGCTTCAAGGATGACCGAGGTATTGG  2875

Query  2876  AATATCTCTCATTGGATCAAAGCGATGAAGAGAATATCTGTGGCCTGCTCCTGCTTGAGA  2935
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||
Sbjct  2876  AATATCTCTCATTGGATCAAAGCGATGAAGAAAATATCCATGGCCTGCTCCTGCTTGAGA  2935

Query  2936  GTGATGCGTGGCCTATTTGGGTCAGCCCCAGCTCGTCAGCTAGCATAGATACCCATGGTA  2995
             | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2936  GAGATGTATGGCCTATTTGGGTCAGCCCCAGCTCGTCAGCTAGCATAAATACCCATGGTA  2995

Query  2996  TGCCTGTTCAGTTGTGCGAATTGAGGAAATCGAAAAGTCAAAGATATGTTTCTTTCATTG  3055
             |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2996  TGCCTGTTCATTTGTGCGAATTGAGGAAATCCAAGAGTCAAAGATATGTTTCTTTCATTA  3055

Query  3056  ACAGCCTGATCATGAAATTGGGAATTCACCGATTTATTGTTGGCCACAAAGATCATGGGT  3115
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  3056  ACAGCCTGATCATGAAATTGGGAATTCACCGATTTCTTGTTGGCCACAAAGATAATGGGT  3115

Query  3116  TTGCCTCTCAAGCTTGGCTTTCCGTAGAAATACTCTGCACGTGGGAGTGGCCAGGGGGTA  3175
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3116  TTGCCTCTCAAGCTTGGCTTTCCGTAGAAATACTCTGCACGTGGGAGTGGCCAGGGGGTA  3175

Query  3176  AAGTTCAGACTTCTTTCCTGCCAAATCTTGTATCATTTTGTAAGGATGAACCATCGAGTG  3235
             | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3176  ATGTTCACACTTCTTTCCTGCCAACTCTTGTATCATTTTGTAAGGGTGAACCATCGAGTG  3235

Query  3236  GAGGTTTACTAAATTCCATTTTTGACATTCTACTCAACGGTGCTCTTGTGCATGTAAAGG  3295
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3236  GAGGTTTACTAAATTCCATTTTTGACATTCTACTCAACGGTGCTCTTGTGCATGTAAAGG  3295

Query  3296  ATGAGGAAGAGGGCTTAGGGAACATGTGGGTTGACTTTAATAATAACATAGTGGACGTCG  3355
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3296  ATGAGGAAGAGGGCTTAGGGAACATGTGGGTTGACTTTAATAATAACATAGTGGACGTCG  3355

Query  3356  TTGAACCATTTTTGAGGGCTCTAGTGTCATTCCTTCACATTTTGTTCAAGGAGGACCTTT  3415
             | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  3356  TAGAACCATTTTTGAGGGCTCTTTTGTCATTCCTTCACATTTTGTTCAAGGAAGACCTTT  3415

Query  3416  GGGGAGAAGAAGAAGCCATGGCTGCTTTCAAAATGATCACAGATAAACTCTTCATAGGGG  3475
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  3416  GGGGAGAAGAAGAAGCCATGTCTGCTTTCAAAATGATCACAGATAAACTCTTCATAGGAG  3475

Query  3476  AAGAGACAAGCAAAAACTGTTTGAGAATTATTCCTTACATTATGAGCATAATAATCTCAC  3535
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3476  AAGAGACAAGCAAAAACTGTTTGAGAATTATTCCTTGCATTATGAGCATAATAATTTCAC  3535

Query  3536  CATTACGTACAAAAGTAAAATCTGGTGGTTCTGGTAAAGATACTCTGCTACCACTGGAAG  3595
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3536  CATTACGTACAAAAATAAAATCTGGTGGTTCTGGTAAAGATACTCTGCTGCCACTGGAAG  3595

Query  3596  TTTTGCTTAGAAATTGGCTGGAGAGGTCTTTGTCGTTTCCTCCTCTGGTGCTCTGGCAAA  3655
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3596  TTTTGCTTAGAAGTTGGCTGGAGAGGTCTTTGTCGTTTCCTCCTCTGGTGCTCTGGCAAA  3655

Query  3656  GTGGGGAAGATATACAGGATTGGTTTCAGCTTGTTATCTCTTGTTATCCCGTAAGTGATA  3715
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct  3656  GTGGGGAAGATATACAGGATTGGTTTCAGCTTGTTATCTCTTGTTATCCCTTAAGTGA-A  3714

Query  3716  AAG-CTGAAGAAGCAAAGGAACTACAGAGGCATCTGAGCACTGAAGAGAGAACGCTCCTG  3774
             ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||
Sbjct  3715  AAGGCTGAAGAAGCAAAGGAAATACAGAGGCATGTGAGTAATGAAGAGAAAACACTCCTG  3774

Query  3775  CTTGACTTGTTCCGCAAACAAAAGCAAGATCCTGGTGCATCAACTGTAGTTACCCAACTT  3834
             ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  3775  CTTGACTTGTTCCGCAAGCAAAATCAAGATCCTGGTGCATCAAGTGTAGTTACCCAACTT  3834

Query  3835  CCAGCTGTGCAAATTCTGCTCGCAAGACTAATTATGATTGCAGTTAGTTACTGTGGAAAC  3894
             |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3835  CCAGCTGTCCAAATTCTGCTCGCAAGACTAATTGTGATTGCAGTTAGTTACTGTGGAAAC  3894

Query  3895  GATTTTAACGAGGATGATTGGGATTTTGTCTTTTCTAATCTGAAGCGTCTGATTCAATCT  3954
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||
Sbjct  3895  AATTTTAACGAGGATGATTGGGATTTTGTCTTTTCTAATTTGAAGCGACAGATTCAGTCT  3954

Query  3955  GCAGTAGTTGTGATGGAGGAAACTTCCGAGAACGTCAACGACTTCATTAGTGGTGTTTCT  4014
             |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||
Sbjct  3955  GCAGTAGTTGTGATGGAGGAAACTGCTGAGAACGTCAATGATTTCATTAGTGGCGTTTCT  4014

Query  4015  TCCATGGAGAAGGAGAAGGAGAATGATACCCTTGAAGGACTTGGGCATATAGTTTTTATC  4074
             |||||||||||||| ||  |   |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| 
Sbjct  4015  TCCATGGAGAAGGA-AA--A---TGATACTCTTGAGGGACTTGGGCATATTGTTTTTATT  4068

Query  4075  TCTGATCCTTCTATAAACAGTGCTCAGAATGCTCTCT-CAGCATTTTCGTTGCTTAATGC  4133
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct  4069  TCTGATCCTTCTATAAACAATGCTCAGAATGCTCTCTAC-GCATTTTCGTTGCTTAATGC  4127

Query  4134  GTTAGTAAACCATAAATCTGTTGAAGGTGAAGACAATCTGAAATCCTTGGCAGATGAAAC  4193
             ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  4128  GTTAGTAAAGCATAAATCGGTTGAATATGAAGACAATCTGAAATCCTTGGCAGATGAAAT  4187

Query  4194  ATGGGATCCTGTTAAAGATCGAATACTTGAAGGTGTTCTGCGTCTTTTCTTCTGCACGGG  4253
             ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  4188  ATGGGATCCGGTTAAGGATCGGATACTTGAAGGTGTTCTGCGTCTTTTCTTCTGCACTGG  4247

Query  4254  TCTTACTGAGGCTATTGCTGCTTCATATTCCCCAGAGGCAGCATCTATTGTTGCTTCATT  4313
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4248  TCTTGCTGAGGCTATTGCTGCTTCATATTCCCCAGAGGCAGCATCTATTGTTGCTTCATT  4307

Query  4314  TCGAGTTGATCATCTGCAGTTCTGGGAGCTGGTAGCTCACCTTGTAGTAGACTCTTCTCC  4373
             ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct  4308  TCGAGTTGATCATTTGCAGTTCTGGGAGTTGGTGGCTCAACTTGTGGTTGACTCTTCTCC  4367

Query  4374  ACGCGCAAGAGATAGAGCTGTCAGAGCAGTGGAATTCTGGGGACTAAGCAGAGG-ATCTA  4432
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | |
Sbjct  4368  ACGTGCAAGAGATAGAGCTGTCAGAGCAGTGGAATTTTGGGGTCTAAGCA-AGGGAGCCA  4426

Query  4433  TAAGCTCTTTGTATGCAATAATGTTCTCTTCCAATCCAATCCCGTCATTGCAACTTGCTG  4492
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4427  TAAGCTCTTTGTATGCAATAATGTACTCTTCCAATCCAATCCCGTCATTGCAACTTGCTG  4486

Query  4493  CATACACTGTTTTGTCTACCGAACCTATTTCCAGGCTGGCCATAGTTGCTGATTTGAATG  4552
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
Sbjct  4487  CATACACTGTTTTGTCTACCGAACCTATTTCCAGGCTGGCCATAGTTGCTGATGGGAATG  4546

Query  4553  CACCACTGAATGATGAGTCTCTCAATGATCAGGACTCAAGCAATGCTGGTTTACCATCTG  4612
             | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  4547  CCCCACTGAATGATGAGTTTCTCAATGATCAGGACTCAAGCAATGCTGGTTTGCCATCTG  4606

Query  4613  AAGACAAGCTACTGCTAAGAGATGAAGTATCTTGTATGGTTGAGAAGTTAGATCATGAAC  4672
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct  4607  AAGAGAAGCTACTGCTAAGAGATGAAGTATCTTGTATGGTTGAGAAGTTAAATCATGATC  4666

Query  4673  TTCTTGATACGGACTTGACTGCGCCAGAAAGGGTGCAAACGTTCCTGGCGTGGTCTTTGT  4732
             |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  4667  TTCTTGATACAGACTTAACTGCGCCAGAAAGGGTGCAAACGTTCCTGGCATGGTCTTTGT  4726

Query  4733  TACTCTC-CAATGTTAACTCTTTACCTTCACTAACCCAAGGACGAGAGAGACTGGTGCAA  4791
             | ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4727  TGCTCTCGCA-TGTTAATTCTTTACCTTCACTAACACAAGGACGAGAGAGACTGGTGCAA  4785

Query  4792  TATATAGAAAAAACTGCAAATCCGTTGATATTAGATAGTCTTTTTCAGCACATTCCTCTA  4851
             |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4786  TATATAGAGAAAACTGCAAATCGGTTGATATTAGATAGTCTTTTTCAGCACATTCCTCTA  4845

Query  4852  GAATTATACATGGGACAGAGCTTGAAGAAAAAAGATGGGGATATTCCGTCTGAGTTATCT  4911
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4846  GAATTATACATGGGACAGAGCTTGAAGAAAAAAGATGGGGATATTCCGTCTGAGTTATCT  4905

Query  4912  GTGGTAGCTTCAGCAGCCACTCGTGCGATTATTACGGGTTCGTCCCTGTCAACGGTTGAA  4971
             ||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  4906  GTGGTAGCTTCTGCAGCCACTCGTGCGATTGTGATGGGTTCGTCCCTGTCAACAGTTGAA  4965

Query  4972  TCACTTTGGCCTATTGAAACTGGAAAGATGGCTTCGCTTGCTGGGGCGATATATGGTCTG  5031
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4966  TCACTTTGGCCTATTGAAACTGGAAAGATGGCTTCGCTTGCTGGGGCGATATATGGTCTG  5025

Query  5032  ATGTTACGTGTCCTTCCAGCTTATGTTAGAGAATGGTTTAGCGAAATGCGTGACCGTTCT  5091
             ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5026  ATGCTACGTGTACTTCCAGCTTATGTTAGAGAATGGTTTAGCGAAATGCGTGACCGTTCT  5085

Query  5092  GCATCATCTCTT-ATTGAAGCATTTACAAGAACGTGGTGCAGCCCATCTCTAATC-AAGA  5149
             ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |
Sbjct  5086  GCATCATCT-TTGATTGAAGCATTTACAAGATCGTGGTGCAGCCCTTCTTTAATCGAA-A  5143

Query  5150  ACGAACTGTCTCAGATAAAGAAGGCAGACTTTAATGATGAGAGCTTTTCAGTCAGCATAA  5209
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5144  ACGAACTGTCTCAGATAAAGAAGGCAGACTTTAATGATGAGAGCTTTTCAGTCAGCATAA  5203

Query  5210  GTAAAGCGGCAAATGAGGTAGTTGCTACATATACGAAGGATGAAACGGGGATGGATCTCG  5269
             |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5204  GTAAAGCGGCGAATGAAGTAGTTGCTACATATACGAAGGATGAAACGGGGATGGATCTCG  5263

Query  5270  TGATCCGGCTTCCAGTTTCTTACCCACTCAAGCCTGTTGACGTTAATTGCGCAAAAAGTA  5329
             |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  5264  TGATCCGGCTTCCAGTTTCTTACCCACTCAGGCCTGTTGACGTTAATTGCACAAAAAGTA  5323

Query  5330  TTGGAATAAGCGAAGCGAAGCAGAGGAAGTGGTTGATGTCTATGCAAATGTTTGTTCGTC  5389
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  5324  TTGGAATAAGCGATGCGAAGCAGAGGAAGTGGTTGATGTCTATGCAAATGTTTGTTCGTA  5383

Query  5390  ATCAGAATGGGGCTCTGGCGGAGGCGATAAGGATATGGAAGCGAAATTCGGACAAGGAAT  5449
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  5384  ATCAGAACGGGGCTCTGGCGGAGGCGATAAGGATATGGAAGCGAAACTCGGACAAGGAAT  5443

Query  5450  TTGAAGGAGTAGAAGACTGCCCGATATGTTACAGTGTGATACACATAGGGAATCACAGCC  5509
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  5444  TTGAAGGAGTAGAAGACTGCCCGATATGTTACAGTGTGATACACACAGGGAATCACAGCC  5503

Query  5510  TTCCAAGGCGAGCTTGCGTGACTTGCAAGTACAAGTTTCACAAAGCATGTTTAGACAAGT  5569
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5504  TTCCAAGGCGAGCTTGCGTGACGTGCAAGTACAAGTTTCACAAAGCATGTTTAGACAAGT  5563

Query  5570  GGTTCTACACGTCTAATAAGAAACTCTGCCCCTTGTGCCAATCTCCTTGCTAATACAATA  5629
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct  5564  GGTTCTACACGTCTCATAAGAAACTCTGCCCCTTGTGCCAATCTCCTTGCTGATTCAATA  5623



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 214568596574


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5