BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G58940.1
Length=1617
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg950628 jgi|Araly1|950628|scaffold_802515.1 2392 0.0
Ahg951756 jgi|Araly1|951756|scaffold_13900004.1 2381 0.0
Ahg319178 jgi|Araly1|319178|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002194 2294 0.0
> Ahg950628 jgi|Araly1|950628|scaffold_802515.1
Length=1472
Score = 2392 bits (1295), Expect = 0.0
Identities = 1414/1473 (96%), Gaps = 2/1473 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 78 ATAACCATGTCTATAGACACATGCCAATGAGGAGCAAAACCCCAACGCCTCTCCGCTTCT 137
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATAACCATGTCTATAGACATATGCCAATGAGGAGCAAAACCCCAACGCCTCTCCGCTTCT 60
Query 138 CAAATGGAAAGCATCAGAGAGATGATTCTGAGTATAGTTGGACTGATGTAGGTACTGGGG 197
||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 61 CAAGTGGAAAGCATCAAAAAGCTGATTCTGAGTATAGTTGGAGTGATGTAGGTACTGGGG 120
Query 198 AGAAGGCCAGGAATGTCTCCGTCCTCGGTGCGATCAGAAGGGCAGCTAAGAAAGTCTTTG 257
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGAAGGCGAGGAATGTCTCCGTCCTCGGTGCCATCAGAAGGGCAGCTAAGAAAGTCTTTG 180
Query 258 TTATTATTTTCTTAGGACAACGGAAGTTAAAGCCAACAGAATGTAGATCTGATCCTGGAG 317
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTATTATTTTCTTAGGACAACAAAAGTTCAAGCCCACAGAATGTAGATCTGATCCTGGAG 240
Query 318 AGAGCAGCACGCACGACAGAGAATCTACATTATCAGGCTGGACTGGTTATTCATCACCAA 377
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 241 AGAGCAGCACGCTTGACAGAGAATCTACATTATCAGGCTGGACTGGCTATTCATCACCAA 300
Query 378 GCTCCTTTGGAAGGTCAACAGAAAGAAAGGTTTCAGGTCAATATCGTTTTTCTGGTTCAA 437
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTCTTTTGGAAGGTCAGCAGAAAGAAAGATTTCAGGTCAATATCGTTTTTCTGGTTCAA 360
Query 438 GATTTCAAAGTCCTGGGAAAGATTCTTCTTCTAGCAAAAGTTGGCAT-CAAGGCCCGGTA 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 361 GATTTCAAAGTCCTGGGAAAGATTCTTCTTCTAGCAAAAGTTGGC-TCCAAGGCCCGGTT 419
Query 497 ATATTTTCTTTTGGGGAGCTTCAAAGGGCAACCGCAAATTTTTCTTCGGTTCATCAAATT 556
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 420 ATATTTTCTTTTGGGGAGCTTCAAAGGGCAACTGCAAATTTTTCATCGGTTCATCAAATT 479
Query 557 GGGGAAGGCGGTTTTGGAACTGTTTTTAAGGGAAAACTTGATGATGGAACTATTGTTGCT 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GGGGAAGGCGGTTTTGGAACTGTTTTTAAGGGAAAGCTTGATGATGGAACTATTGTTGCT 539
Query 617 ATCAAGCGTGCGAGAAAGAACAACTATGGCAAAAGCTGGTTGCTAGAGTTCAAGAATGAA 676
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 ATCAAGCGTGCAAGAAAGAACAACTATGGCAAAAGCTGGTTGCTAGAGTTCAAGAATGAA 599
Query 677 ATATACACATTGTCAAAGATTGAGCATATGAATTTGGTAAAGCTGTATGGATTTCTTGAA 736
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ATATACACATTGTCGAAGATTGAGCATATGAATTTGGTAAAGCTGTATGGATTTCTTGAA 659
Query 737 CATGGAGATGAAAAGGTTATTGTTGTTGAATATGTTGCCAATGGAAACCTACGAGAACAT 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CATGGAGATGAAAAGGTTATTGTTGTTGAATATGTTGGCAATGGAAACCTACGAGAACAT 719
Query 797 CTAGATGGTTTAAGGGGTAACCGCCTTGAAATGGCAGAACGTCTTGAGATTGCAATTGAT 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 720 CTAGATGGTTTAAGGGGTAACCGCCTTGAAATGGCAGAACGTCTTGAGATTGCGATTGAT 779
Query 857 GTGGCTCATGCATTGACCTATTTGCACACATATACTGATAGTCCAATAATCCACAGAGAC 916
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 780 GTATCTCATGCATTAACCTATTTGCACACATATACTGATACTCCAATAATACACAGAGAC 839
Query 917 ATTAAAGCATCAAATATCCTCATCACGAATAAGCTTAGAGCCAAAGTGGCGGACTTTGGC 976
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 840 ATTAAAGCATCAAATATTCTCATCACGAATAAGCTTAGAGCCAAAGTGGCAGACTTTGGC 899
Query 977 TTTGCTCGTTTAGTGTCGGAAGATCTTGGGGCTACTCATATATCGACTCAGGTCAAAGGA 1036
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TTTGCTCGTTTAGTTTCGGAAGATCTCGGGGCTACTCATATATCGACTCAGGTCAAAGGA 959
Query 1037 TCTGCAGGCTATGTGGATCCAGATTACCTCAGGACGTTTCAACTAACTGACAAGAGCGAC 1096
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 960 TCTGCAGGCTATGTGGATCCAGATTACCTCAGGACGTTTCAACTAACTGACAAGAGTGAC 1019
Query 1097 GTTTACTCTTTTGGTGTTTTGCTCGTAGAGATTCTCACTGGAAGACGTCCCATTGAGTTA 1156
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GTTTACTCTTTTGGTGTTTTGCTCATAGAGCTTCTCACTGGAAGACGTCCCATTGAGTTA 1079
Query 1157 AAGAGACCACGAAAAGACAGACTCACGGTTAAATGGGCATTGAGGAGACTCAAAGACGAT 1216
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AAGAGACCACGGAAAGACCGACTCACGGTTAAATGGGCATTGAGGAGACTCAAAGACGAT 1139
Query 1217 GAAGCTGTTCTCATAATGGACCCATTTCTCAAGAGAAACCGAGCCGCCATTGAAGTGGCT 1276
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1140 GAAGCTGTTCTCATAATGGACCCGTTTCTCAAGAGAAACCGAGCCGCTATTGAAGTGGCT 1199
Query 1277 GAGAAGATGCTGAGACTTGCGAGCGAATGTGTTACCCCGACGAGAGCTACACGTCCAGCT 1336
||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GAGAAAATGCTGAGACTGGCGAGCGAATGTCTTGCCCCGACGAGAGCTACACGTCCAGCT 1259
Query 1337 ATGAAAGGCATTGCGGAAAAGCTATGGGCTATAAGGAGAGAGATGAAGGAGACGATGATA 1396
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 ATGAAAGACATTGCGGAAAAGCTATGGGCTATAAGGAGAGAGATGAAGGAGACGATGATA 1319
Query 1397 TGTTCATCTGCATCTAATTCTTCTTGTTCTTCAACAACACATAGCTTCATTGGTCGTGAT 1456
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TGTTCCTCTGCCTCTAATTCTTCGTGTTCTTCAACAACACATAGCTTCATTGGTCGTGAT 1379
Query 1457 TCAGACAGATATGCATTGCCGAGGATTGAAGATAACGAGAATAGCATTGAGTAACTCTCT 1516
|||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1380 TCAGACAGATTTGCATTGCCGAGGATCGAAGACAACGAGAATAGCATTGAGTTACTCTCT 1439
Query 1517 CCTTGATGATATCAATCTGTGAAACATGCTGCT 1549
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1440 CCTTGATGATATCAATTTGTGAAACATGTTGCT 1472
> Ahg951756 jgi|Araly1|951756|scaffold_13900004.1
Length=1472
Score = 2381 bits (1289), Expect = 0.0
Identities = 1413/1474 (96%), Gaps = 4/1474 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 78 ATAACCATGTCTATAGACACATGCCAATGAGGAGCAAAACCCCAACGCCTCTCCGCTTCT 137
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATAACCATGTCTATAGACATATGCCAATGAGGAGCAAAACCCCAACGCCTCTCCGCTTCT 60
Query 138 CAAATGGAAAGCATCAGAGAGATGATTCTGAGTATAGTTGGACTGATGTAGGTACTGGGG 197
|||||||||||||||| | || | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 61 CAAATGGAAAGCATCAAAAAGCTCATTCTGACTATAGTTGGAGTGATGTAGGTACTGGGG 120
Query 198 AGAAGGCCAGGAATGTCTCCGTCCTCGGTGCGATCAGAAGGGCAGCTAAGAAAGTCTTTG 257
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGAAGGCGAGGAATGTCTCCGTCCTCGGTGCCATCAGAAGGGCAGCTAAGAAAGTCTTTG 180
Query 258 TTATTATTTTCTTAGGACAACGGAAGTTAAAGCCAACAGAATGTAGATCTGATCCTGGAG 317
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTATTATTTTCTTAGGACAACAAAAGTTCAAGCCCACAGAATGTAGATCTGATCCTGGAG 240
Query 318 AGAGCAGCACGCACGACAGAGAATCTACATTATCAGGCTGGACTGGTTATTCATCACCAA 377
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 241 AGAGCAGCACGCTTGACAGAGAATCTACATTATCAGGCTGGACTGGCTATTCATCACCAA 300
Query 378 GCTCCTTTGGAAGGTCAACAGAAAGAAAGGTTTCAGGTCAATATCGTTTTTCTGGTTCAA 437
|||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GCTCTTTTGGAAGGTCAGCAGAAAGAAAGATTTCAGGTCAATATCGTTTTTCTGGTTCAA 360
Query 438 GATTTCAAAGTCCTGGGAAAGATTCTTCTTCTAGCAAAAGTTGGCAT-CAAGGCCCGGTA 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||
Sbjct 361 GATTTCAAAGTCCTGGGAAAGATTCTTCTTCTAGCAAAAGTTGGC-TCCAAGGCCCAGTT 419
Query 497 ATATTTTCTTTTGGGGAGCTTCAAAGGGCAACCGCAAATTTTTCTTCGGTTCATCAAATT 556
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 420 ATATTTTCTTTTGGGGAGCTTCAAAGGGCAACTGCAAATTTTTCATCGGTTCATCAAATT 479
Query 557 GGGGAAGGCGGTTTTGGAACTGTTTTTAAGGGAAAACTTGATGATGGAACTATTGTTGCT 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GGGGAAGGCGGTTTTGGAACTGTTTTTAAGGGAAAGCTTGATGATGGAACTATTGTTGCT 539
Query 617 ATCAAGCGTGCGAGAAAGAACAACTATGGCAAAAGCTGGTTGCTAGAGTTCAAGAATGAA 676
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 ATCAAGCGTGCAAGAAAGAACAACTATGGCAAAAGCTGGTTGCTAGAGTTCAAGAATGAA 599
Query 677 ATATACACATTGTCAAAGATTGAGCATATGAATTTGGTAAAGCTGTATGGATTTCTTGAA 736
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 ATATACACATTGTCGAAGATTGAGCATATGAATTTGGTAAAGCTGTATGGATTTCTTGAA 659
Query 737 CATGGAGATGAAAAGGTTATTGTTGTTGAATATGTTGCCAATGGAAACCTACGAGAACAT 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CATGGAGATGAAAAGGTTATTGTTGTTGAATATGTTGGCAATGGAAACCTACGAGAACAT 719
Query 797 CTAGATGGTTTAAGGGGTAACCGCCTTGAAATGGCAGAACGTCTTGAGATTGCAATTGAT 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 720 CTAGATGGTTTAAGGGGTAACCGCCTTGAAATGGCAGAACGTCTTGAGATTGCGATTGAT 779
Query 857 GTGGCTCATGCATTGACCTATTTGCACACATATACTGATAGTCCAATAATCCACAGAGAC 916
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 780 GTATCTCATGCATTGACCTATTTGCACACATATACTGATACTCCAATAATTCACAGAGAC 839
Query 917 ATTAAAGCATCAAATATCCTCATCACGAATAAGCTTAGAGCCAAAGTGGCGGACTTTGGC 976
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 840 ATTAAAGCATCAAATATTCTCATCACGAATAAGCTTAGAGCCAAAGTGGCAGACTTTGGC 899
Query 977 TTTGCTCGTTTAGTGTCGGAAGATCTTGGGGCTACTCATATATCGACTCAGGTCAAAGGA 1036
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TTTGCTCGTTTAGTTTCGGAAGATCTCGGGGCTACTCATATATCGACTCAGGTCAAAGGA 959
Query 1037 TCTGCAGGCTATGTGGATCCAGATTACCTCAGGACGTTTCAACTAACTGACAAGAGCGAC 1096
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 960 TCTGCAGGCTATGTGGATCCAGATTACCTCAGGACGTTTCAACTAACTGACAAGAGTGAC 1019
Query 1097 GTTTACTCTTTTGGTGTTTTGCTCGTAGAGATTCTCACTGGAAGACGTCCCATTGAGTTA 1156
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GTTTACTCTTTTGGTGTTTTGCTCATAGAGCTTCTCACTGGAAGACGTCCCATTGAGTTA 1079
Query 1157 AAGAGACCAC-GAAAAGACAGACTCACGGTTAAATGGGCATTGAGGAGACTCAAAGACGA 1215
|||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AAGAGACCACAGAAA-GACCGACTCACGGTTAAATGGGCATTGAGGAGACTCAAAGACGA 1138
Query 1216 TGAAGCTGTTCTCATAATGGACCCATTTCTCAAGAGAAACCGAGCCGCCATTGAAGTGGC 1275
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1139 TGAAGCTGTTCTCATAATGGACCCGTTTCTCAAGAGAAACCGAGCCGCTATTGAAGTGGC 1198
Query 1276 TGAGAAGATGCTGAGACTTGCGAGCGAATGTGTTACCCCGACGAGAGCTACACGTCCAGC 1335
|||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 TGAGAAAATGCTGAGACTGGCGAGCGAATGTCTTGCCCCGACGAGAGCTACACGTCCAGC 1258
Query 1336 TATGAAAGGCATTGCGGAAAAGCTATGGGCTATAAGGAGAGAGATGAAGGAGACGATGAT 1395
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TATGAAAGACATTGCGGAAAAGCTATGGGCTATAAGGAGAGAGATGAAGGAGACGATGAT 1318
Query 1396 ATGTTCATCTGCATCTAATTCTTCTTGTTCTTCAACAACACATAGCTTCATTGGTCGTGA 1455
|||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 ATGTTCCTCTGCCTCTAATTCTTCGTGTTCTTCAACAACACATAGCTTCATTGGTCGTGA 1378
Query 1456 TTCAGACAGATATGCATTGCCGAGGATTGAAGATAACGAGAATAGCATTGAGTAACTCTC 1515
||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1379 TTCAGACAGATTTGCATTGCCGAGGATCGAAGACAACGAGAATAGCATTGAGTTACTCTC 1438
Query 1516 TCCTTGATGATATCAATCTGTGAAACATGCTGCT 1549
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1439 TCCTTGATGATATCAATTTGTGAAACATGTTGCT 1472
> Ahg319178 jgi|Araly1|319178|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002194
Length=1425
Score = 2294 bits (1242), Expect = 0.0
Identities = 1364/1425 (96%), Gaps = 0/1425 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 98 ATGCCAATGAGGAGCAAAACCCCAACGCCTCTCCGCTTCTCAAATGGAAAGCATCAGAGA 157
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1 ATGCCAATGAGGAGCAAAACCCCAACGCCTCTCCGCTTCTCAAATGGAAAGCATCAAAAA 60
Query 158 GATGATTCTGAGTATAGTTGGACTGATGTAGGTACTGGGGAGAAGGCCAGGAATGTCTCC 217
| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 GCTGATTCTGACTATAGTTGGAGTGATGTAGGTACTGGGGAGAAGGCGAGGAATGTCTCC 120
Query 218 GTCCTCGGTGCGATCAGAAGGGCAGCTAAGAAAGTCTTTGTTATTATTTTCTTAGGACAA 277
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTCCTCTGTGCCATCAGAAGGGCAGCTAAGAAAGTCTTTGCTATTATTTTCTTAGGACAA 180
Query 278 CGGAAGTTAAAGCCAACAGAATGTAGATCTGATCCTGGAGAGAGCAGCACGCACGACAGA 337
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 CGAAAGTTCAAGCCAACAGAATGTAGATCTGATCCTGGAGAGAGCAGCACGCTTGACAGA 240
Query 338 GAATCTACATTATCAGGCTGGACTGGTTATTCATCACCAAGCTCCTTTGGAAGGTCAACA 397
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 241 GATTCTACATTATCAGGCTGGACTGGCTATTCATCACCAAGCTCTTTTGGAAGGTCAACA 300
Query 398 GAAAGAAAGGTTTCAGGTCAATATCGTTTTTCTGGTTCAAGATTTCAAAGTCCTGGGAAA 457
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GAAAGAAAGATTTCAGGTCAATATCGTTTTTCTGGTTCAAGATTTCAAAGTCCTGGGAAA 360
Query 458 GATTCTTCTTCTAGCAAAAGTTGGCATCAAGGCCCGGTAATATTTTCTTTTGGGGAGCTT 517
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 361 GATTCTTCTTCTAGCAAAAGTTGGCACCAAGGCCCGGTAATATTTTCTTTTGTGGAGCTT 420
Query 518 CAAAGGGCAACCGCAAATTTTTCTTCGGTTCATCAAATTGGGGAAGGCGGTTTTGGAACT 577
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAAAGGGCAACTGCAAATTTTTCATCGGTTCATCAAATTGGGGAAGGCGGTTTTGGAACT 480
Query 578 GTTTTTAAGGGAAAACTTGATGATGGAACTATTGTTGCTATCAAGCGTGCGAGAAAGAAC 637
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 481 GTTTTTAAGGGAAAGCTTGATGATGGAACTATTGTTGCTATCAAGCGAGCCAGAAAGAAC 540
Query 638 AACTATGGCAAAAGCTGGTTGCTAGAGTTCAAGAATGAAATATACACATTGTCAAAGATT 697
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AACTATGACAAAAGCTGGTTGCTAGAGTTTAAGAATGAAATATACACATTGTCAAAGATT 600
Query 698 GAGCATATGAATTTGGTAAAGCTGTATGGATTTCTTGAACATGGAGATGAAAAGGTTATT 757
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GAGCATATGAATTTGGTAAAGCTATATGGATTTCTTGAACATGGAGATGAAAAGGTTATT 660
Query 758 GTTGTTGAATATGTTGCCAATGGAAACCTACGAGAACATCTAGATGGTTTAAGGGGTAAC 817
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 661 GTTGTTGAATATGTTGGCAATGGAAACCTACGAGAACATCTAGATGGTTTACGGGGTAAC 720
Query 818 CGCCTTGAAATGGCAGAACGTCTTGAGATTGCAATTGATGTGGCTCATGCATTGACCTAT 877
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 721 CGCCTTGAAATGGCAGAACGTCTTGAGATTGCGATTGATGTAGCTCATGCATTGACCTAT 780
Query 878 TTGCACACATATACTGATAGTCCAATAATCCACAGAGACATTAAAGCATCAAATATCCTC 937
|||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 781 TTGCACACATATACGGATACTCCAATAATACACAGAGACATTAAAGCCTCAAATATCCTC 840
Query 938 ATCACGAATAAGCTTAGAGCCAAAGTGGCGGACTTTGGCTTTGCTCGTTTAGTGTCGGAA 997
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 841 ATTACGAATAAGCTTAGAGCCAAAGTGGCAGACTTTGGCTTTGCTCGTTTAGTTTCGGAA 900
Query 998 GATCTTGGGGCTACTCATATATCGACTCAGGTCAAAGGATCTGCAGGCTATGTGGATCCA 1057
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 901 GATCTCGGGGCTACTCATATATCGACTCAGGTCAAAGGATCTGCAGGTTATGTGGATCCA 960
Query 1058 GATTACCTCAGGACGTTTCAACTAACTGACAAGAGCGACGTTTACTCTTTTGGTGTTTTG 1117
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GATTACCTCAGGACGTTTCAACTAACCGACAAGAGTGACGTTTACTCTTTTGGTGTTTTG 1020
Query 1118 CTCGTAGAGATTCTCACTGGAAGACGTCCCATTGAGTTAAAGAGACCACGAAAAGACAGA 1177
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1021 CTCATAGAGCTTCTCACTGGAAGACGTCCCATTGAGTTAAAGAGACCACGAAAAGACCGA 1080
Query 1178 CTCACGGTTAAATGGGCATTGAGGAGACTCAAAGACGATGAAGCTGTTCTCATAATGGAC 1237
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CTTACTGTTAAATGGGCATTGAGGAGACTCAAAGACGATGAAGCTGTTCTCATAATGGAT 1140
Query 1238 CCATTTCTCAAGAGAAACCGAGCCGCCATTGAAGTGGCTGAGAAGATGCTGAGACTTGCG 1297
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1141 CCATTTCTCAAGAGAAACCGAGCCGCCATTGAAGTGGCTGAGAAAATGCTGAGACTGGCG 1200
Query 1298 AGCGAATGTGTTACCCCGACGAGAGCTACACGTCCAGCTATGAAAGGCATTGCGGAAAAG 1357
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1201 AGCGAATGTCTTGCCCCGACGAGAGCTACACGTCCAGCTATGAAAGACATTGCGGAAAAG 1260
Query 1358 CTATGGGCTATAAGGAGAGAGATGAAGGAGACGATGATATGTTCATCTGCATCTAATTCT 1417
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1261 CTATGGGCTATAAGGAGAGAGATGAAGGAGACGATGATATGTTCCTCTGCCTCTAATTCT 1320
Query 1418 TCTTGTTCTTCAACAACACATAGCTTCATTGGTCGTGATTCAGACAGATATGCATTGCCG 1477
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1321 TCCTGTTCTTCAACAACACATAGCTTCATTGGTCGTGATTCAGACAGATTTGCGTTGCCG 1380
Query 1478 AGGATTGAAGATAACGAGAATAGCATTGAGTAACTCTCTCCTTGA 1522
||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1381 AGGATCGAAGACAACGAGAATAGCATTGAGTTACTCTCTCCTTGA 1425
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 60601579795
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5