BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT5G60040.2 Length=4428 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg496142 jgi|Araly1|496142|fgenesh2_kg.8__1958__AT5G60040.1 6083 0.0 > Ahg496142 jgi|Araly1|496142|fgenesh2_kg.8__1958__AT5G60040.1 Length=4569 Score = 6083 bits (3294), Expect = 0.0 Identities = 3668/3843 (95%), Gaps = 47/3843 (1%) Strand=Plus/Plus Query 602 CGCTGTTCCAACATGCTTTTAGATGAGAAATTGTATGAAGATCACTTGAGGAAGATGCGG 661 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 427 CGCTGTTCCAACATGCTTTTAGATGAGAAATTGTATGAAGATCACTTAAGGAAGATGCGG 486 Query 662 AATCCCAGAATGGAGCCATTGAAGAAGACAGAATTGGCAAAAGCCGTTGTCAAGAAGTGC 721 ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 487 AATCCCAAAATGGAGCCATTGAAGAAGACTGAATTGGCGAAAGCGGTTGTCAAGAAGTGC 546 Query 722 AGTACGATGGCGAGCCAGAGAATTATAACGTGCAAAAAATGTGGCTACCTGAATGGGATG 781 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 547 AGTACGATGGCAAGCCAGAGAATTATAACGTGCAAAAAATGTGGCTACCTGAATGGCATG 606 Query 782 GTAAAAAAGATTGCAGCGCAGTTTGGTATAGGCATCAGTCATGACCGATCTAAAATCCAT 841 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 607 GTAAAAAAGATTGCAGCGCAGATGGGTATAGGCATCAGTCATGACCGATCTAAAATCCAT 666 Query 842 GGTGGAGAGATTGATGAATGTAAATCTGCAATATCCCACACAAAGCAGTCTACT-GCAGC 900 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| Sbjct 667 GGTGGAGAGGTTGATGAATGTAAATCTGCAATATCCCACACAAAGGAGTCTACTAG-AGC 725 Query 901 AATAAATCCTCTTACCTATGTTCTTGATCCTAACTTGGTGCTCGGGCTTTTTAAAAGAAT 960 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 726 AATAAATCCTCTTACGTATGTTCTTGATCCTAACTTGGTGCTCGGGCTTTTTAAAGGAAT 785 Query 961 GAGTGACAAGGACTGCGAACTTCTTTATATTGCCTATAGACCTGAGAATCTTATCATAAC 1020 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 786 GAGTGACAAGGACTGTGAACTTCTTTATATTGCCCATAGACCTGAGAATCTTATCACAAT 845 Query 1021 GTGCATGCTTGTGCCACCTTTATCCATCCGACCGTCTGTTATGATTGGTGGTATTCAAAG 1080 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 846 GTGCATGCTTGTGCCACCTTTATCCATCCGACCGTCTGTTATGATTGGTGGTACTCGAAG 905 Query 1081 CAATGAAAACGACTTAACAGCGCGATTAAAGCAAATCATTCTAGGCAATGCTTCTCTTCA 1140 ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| Sbjct 906 CAATGAAAACGACATAACAGAGCGATTAAAGCTAATCATTCAAAACAATGCTTGTCTTCA 965 Query 1141 TAAAATTTTAAGTCAACCTACCTCATCCCCCAAAAACATGCAAGTATGGGATACAGTTCA 1200 || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 966 TAGAATTTTAAGTCAACCTACCACATCGCCCAAAAACATGCAAGTATGGGATACAGTTCA 1025 Query 1201 AATCGAGGTTGCAAGATACATTAACAGTGAAGTCCGTGGTTGT-CAAAACCAGCCAGA-A 1258 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | Sbjct 1026 AAGCGAGGTTGCAAAATACATTAACAGTGAAGTCCGTGG-TGTACAAAACCAGCCAGAGA 1084 Query 1259 GAGCATCCACTGTCTGGAATTCTTCAGCGTCTCAAAGGAAAAGGGGGACGTTTCCGTGCA 1318 | || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1085 AAACA-CCACTGAGTGGACTTCTTCAGCGTCTTAAAGGAAAACAGGGACGTTTCCGTGCA 1143 Query 1319 AACTTGTCGGGGAAGCGTGTCGAGTTCACTGGTAGAACTGTAATTTCACCTGATCCCAAT 1378 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1144 AACTTGTCGGGGAAGCGTGTCGAGTACACTGGTAGAACTGTTATTTCACCTGATCCCAAT 1203 Query 1379 CTGAAAATTACAGAGGTAGGAATTCCAATCCTTATGGCTCAGATCCTAACTTTTCCTGAA 1438 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct 1204 CTGAAAATTACAGAGGTAGGAATTCCCATCCTTATGGCTCGGATCTTAACTTTTCCTGAA 1263 Query 1439 TGTGTTTCTCGTCATAATATTGAGAAGTTGAGGCAATGTGTCCGTAATGGCCCTAATAAA 1498 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1264 TGTGTTTCCCGTCATAATATTGAGAAGTTGAGGCAATGTGTCCGTAATGGCCCTAATAAA 1323 Query 1499 TACCCTGGTGCCAGAAATGTCAGATATCCAGATGGTTCTTCAAGGACTTTGGTTGGTGAT 1558 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1324 TACCCTGGTGCCAGAAATGTCAGATATCCAGATGGTTCTTCAAGGACTTTGGTTGGTGAT 1383 Query 1559 TATCGCAAGCGTATTGCTGATGAACTGGCCATTGGCTGCATAGTTGACCGCCATTT-GCA 1617 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 1384 TATCGTAAGCGTATTGCTGATGAACTGACCATTGGCTGCATAGTTGACCGCCATTTAG-A 1442 Query 1618 AGAAGGAGATGTTGTTCTTTTTAACAGGCAACCGAGTCTGCATCGGATGTCTATCATGTG 1677 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1443 AGAAGGGGATGCTGTTCTTTTTAACAGGCAACCGAGTCTGCATCGGATGTCTATCATGTG 1502 Query 1678 TCACAGGGCAAGAATAATGCCTTGGAGAACGTTGAGGTTCAACGAATCGGTTTGTAACCC 1737 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1503 TCACAGGGCAAGAATAATGCCTTGGAGAACATTGAGGTTCAACGAATCGGTTTGTAACCC 1562 Query 1738 ATATAATGCTGATTTTGATGGTGATGAGATGAACATGCACGTACCACAAACAGAGGAGGC 1797 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1563 ATATAATGCTGATTTTGATGGTGATGAGATGAACATGCACGTACCACAAACAGAGGAGGC 1622 Query 1798 TCGGACAGAGGCTATTACATTGATGGGGGTACAAAACAATTTATGCACCCCAAAAAATGG 1857 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1623 TCGGACAGAGGCTATTACATTGATGGGGGTACAAAACAATTTGTGCACCCCAAAAAATGG 1682 Query 1858 AGAAATTTTAGTAGCATCAACGCAGGACTTTTTGACATCTTCTTTTTTGATAACGAGAAA 1917 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || Sbjct 1683 AGAAATTTTAGTAGCATCAACGCAGGACTTTTTGACAACTTCCTTTTTGATAACGAGGAA 1742 Query 1918 GGACACATTTTATGACCGTGCAGCCTTTTCACTTATATGTTCTTACATGGGAGATGGGAT 1977 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1743 GGACACATTTTATGACCGTGCAGCCTTTTCACTTATATGTTCTTACATGGGAGATGGCAT 1802 Query 1978 GGATTCCATAGATTTGCCAACACCCACAATCCTTAAGCCAATAGAGCTTTGGACTGGTAA 2037 |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1803 GGATGCCATAGATTTGCCCACACCCACAATCATTAAGCCAATAGAGCTTTGGACTGGTAA 1862 Query 2038 ACAGATCTTTAGTGTTTTGCTGCGTCCAAATGCAAGTATTAGAGTCTACGTAACTCTTAA 2097 |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1863 ACAGCTTTTTAGTGTTTTGCTGCGTCCAAATGCAAGTGTTAGAGTCTACGTAACTCTTAA 1922 Query 2098 TGTGAAAGAGAAGAACTTCAAGAAGGGAGAGCATGGTTTCGATGAAACAATGTGCATAAA 2157 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1923 TGTGAAAGAGAAGAACTTCAAGAAGGGAGAGCATGGTTTCGATGAAACAATGTGCGTAAA 1982 Query 2158 TGATGGATGGGTTTATTTTCGAAACAGTGAGCTAATATCAGGACAGTTGGGGAAGGCTAC 2217 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 1983 TGATGGATGGGTTTATTTTCGAAACAGTGAGCTAATATCAGGACAATTGGGGAAGG---C 2039 Query 2218 GTTAGCACTCGATATTTTTCCTCTAGGAAATGGAAACAAGGATGGATTATATTCTATTCT 2277 | | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2040 --T---A--CG----------T-TAGGAAATGGAAACAAGGATGGATTATATTCTATTCT 2081 Query 2278 TCTAAGAGATTACAACTCCCATGCTGCTGCAGTCTGCATGAATCGGCTAGCAAAATTGAG 2337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2082 TCTAAGAGATTACAACTCCCATGCTGCTGCAGTCTGCATGAATCGGCTAGCAAAATTGAG 2141 Query 2338 TGCTCGGTGGATTGGTATCCATGGCTTCTCTATTGGAATTGATGACGTTCAACCTGGTGA 2397 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2142 TGCTCGGTGGATTGGAATCCATGGCTTCTCCATTGGAATTGATGACGTTCAACCTGGTGA 2201 Query 2398 AGAGTTGAGTAAGGAAAGAAAAGACAGCATCCAGTTTGGATATGACCAGTGCCATCGCAA 2457 |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2202 AGAGTTGAATAAGGAAAGAAAAGATAGCATCCAGTTCGGATATGACCAGTGCCATCGCAA 2261 Query 2458 AATTGAGGAATTTAATAGAGGAAATTTGCAACTTAAAGCTGGTCTAGATGGTGCAAAATC 2517 |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2262 AATTGAAGAATTTAATCGAGGAAATTTGCAACTTAAAGCTGGTCTAGATGGTGCAAAATC 2321 Query 2518 CTTAGAAGCTGAAATAACAGGGATTCTCAATACAATTCGAGAAGCCACTGGGAAGGCCTG 2577 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2322 ATTAGAAGCTGAAATAACAGGGATTCTCAATACAATTCGAGAAGCCACTGGGAAGGCATG 2381 Query 2578 TATGAGCGGATTACATTGGAGAAATAGTCCCTTGATCATGTCACAATGTGGTTCCAAAGG 2637 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2382 TATGAGCGGATTACATTGGAGAAATAGTCCCTTGATCATGTCACAATGTGGTTCCAAAGG 2441 Query 2638 ATCTCCTATCAATATCAGTCAGATGGTCGCATGTGTTGGTCAGCAGACAGTTAATGGTCA 2697 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2442 ATCTCCTATCAATATCAGTCAGATGGTCGCATGTGTTGGTCAGCAGACAGTTAATGGTCA 2501 Query 2698 CCGTGCTCCTGATGGATTTATAGATCGAAGTCTTCCTCATTTCCCTAGGATGTCCAAATC 2757 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2502 CCGTGCTCCTGATGGATTTATAGATCGAAGTCTTCCTCATTTCCCTAGGATGTCCAAATC 2561 Query 2758 ACCTGCAGCGAAAGGTTTTGTTGCTAATTCGTTCTACAGTGGTCTTACTGCCACAGAATT 2817 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2562 ACCTGCAGCTAAAGGTTTTGTTGCTAATTCGTTCTACAGTGGTCTTACTGCCACAGAATT 2621 Query 2818 TTTCTTTCACACTATGGGTGGACGAGAAGGTCTAGTTGATACAGCGGTGAAAACTGCAAG 2877 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2622 TTTCTTTCACACTATGGGTGGACGAGAAGGTCTAGTTGATACAGCGGTGAAAACTGCAAG 2681 Query 2878 TACAGGTTACATGTCTCGTAGACTGATGAAAGCCTTGGAGGATCTATTAGTCCATTATGA 2937 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2682 TACAGGTTACATGTCTCGTAGACTGATGAAAGCTTTGGAGGATCTATTAGTCCATTATGA 2741 Query 2938 TAACACAGTGAGAAATGCCAGCGGATGTATACTTCAATTTACTTATGGGGATGATGGAAT 2997 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2742 TAACACAGTGCGAAATGCCAGCGGATGTATACTTCAATTTACTTATGGGGATGATGGAAT 2801 Query 2998 GGACCCAGCACTAATGGAAGGAAAGGATGGAGCTCCTTTAAATTTTAATAGATTATTTCT 3057 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2802 GGACCCAGCACTAATGGAAGGAAAGGATGGAGCTCCTTTAAATTTTGATAGATTATTTCT 2861 Query 3058 GAAAGTTCAGGCCACATGTCCTCCTCGATCTCACCACACAT-ATCTTTCTTCAGAAGAAT 3116 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | Sbjct 2862 GAAAATTCAGGCCACATGTCCTCCTCGATCTCACCACA-ATTATCTTTCCTCAGAAGAGT 2920 Query 3117 TGTCGCAAAAGTTTGAAGAGGAATTAGTCAGACATGATAAAAGTCGGGTTTGCACTGATG 3176 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2921 TGTCGCAAAAGTTTGAAGAGGAATTAGTCAGACATGATAAAAGTCGGGTTTGCACTGACG 2980 Query 3177 CCTTTGTGAAATCTCTTCGAGAATTTGTTTCCTTGCTCGGAGTGAAGTCTGCAAGCCCGC 3236 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 2981 CCTTTGTGAAATCTCTTCGAGAATTTGTTTCCTTGCTCGGAGTAAAGTCTGCAAGCACGC 3040 Query 3237 CCCAGGTTTTATATAAAGCATCTGGTGTGACTGATAAGCAACTCGAGGTATTTGTAAAAA 3296 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3041 CTCAGGTTTTATATAAAGCATCTGGTGTGACTGATAAGCAACTCGAGGTATTTGTAAAAA 3100 Query 3297 TTTGTGTATTTCGCTACCGGGaaaaaaaaaTTGAGGCTGGGACTGCAATTGGGACAATAG 3356 ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3101 TTTGTGTATCTCGCTATCGGGAAAAAAAAATTGAGGCTGGGACTGCAATTGGAACAATAG 3160 Query 3357 GAGCTCAGAGTATTGGAGAACCTGGGACACAAATGACTTTGAAAACTTTTCACTTTGCTG 3416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3161 GAGCTCAGAGTATTGGAGAACCTGGGACACAAATGACTCTGAAAACTTTTCACTTTGCTG 3220 Query 3417 GAGTTGCGAGCATGAATATCACACAAGGAGTCCCCCGAATCAATGAAATCATCAATGCTT 3476 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3221 GAGTGGCGAGCATGAATATCACACAAGGAGTCCCCCGAATCAATGAAATCATCAATGCTT 3280 Query 3477 CCAAAAATATAAGCACGCCTGTCATCTCTGCAGAACTTGAGAACCCCCTGGAATTGACTA 3536 | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3281 CTAAAAATATAAGCACACCTGTCATCTCTGCAGAACTTGAGAACCCCCTGGAATTGACTA 3340 Query 3537 GTGCACGATGGGTGAAAGGACGCATTGAGAAAACTACTTTAGGACAGGTTGCTGAGAGTA 3596 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3341 GTGCGCGATGGGTGAAAGGACGCATTGAAAAAACTACTTTAGGACAGGTTGCTGAGAGTA 3400 Query 3597 TCGAGGTGCTAATGACTTCAACATCAGCGTCAGTGAGGATAATTCTTGACAATAAAATAA 3656 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 3401 TCGAGGTGCTAATGACTTCAACATCAGCGTCAGTGAGAATAATTCTTGACAAAAAAATAA 3460 Query 3657 TCGAGGAGGCATGTTTATCTATAACCCCCTGGTCGGTAAAAAATTCCATCCTAAAGACCC 3716 |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3461 TCGAGGAGGCATGTTTGTCTATAAGCCCCTGGTCGGTAAAAAATTCCATCCTAAAGACCC 3520 Query 3717 CCAGAATCAAACTCAACGATAATGATATTAGGGTTTTAGATACGGGTTTGGATATTACTC 3776 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3521 CCAGAATCAAACTGAACGATAATGATATTAGGGTTTTAGATACGGGATTGGATATTACTC 3580 Query 3777 CCGTGGTGGATAAAAGTAGGGCTCATTTCAATCTCCACAATCTGAAGAATGTGCTGCCAA 3836 | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3581 CTGTGGTGGATAAAAGTAGGACTCATTTCAATCTCCACAATCTGAAGAATGTGCTGCCAA 3640 Query 3837 ATATTATAGTGAATGGGATCAAAACAGTTGAGCGAGTTGTTGTCGCAGAGGATATGGATA 3896 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3641 ATATCATAGTGAATGGGATCAAAACAGTTGAGCGAGTTGTTGTCGCAGAGGATATGGATA 3700 Query 3897 AAA-TG--CTAGCTAAGCTGATAATTCCATGTC----CTCGTT-G-GGCATG-CACAAAC 3946 ||| | | || || | || || | | || || ||| | || | | ||||||| Sbjct 3701 AAAATAAAC-AGATA-GATGGGAAGACAAGGTGGAAACT-GTTTGTGG-AGGGCACAAAC 3756 Query 3947 CTCCTGGCAGTTATGGGGACACCGGGAATCAATGGGAGAACTACTACAAGTAACAATGTT 4006 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3757 CTCCTGGCTGTTATGGGGACACCGGGAATCAATGGGAGAACTACTACAAGTAACAATGTT 3816 Query 4007 GTCGAAGTAAGCAAAACACTTGGAATCGAGGCTGCAAGGACAACGATTATTGATGAAATA 4066 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3817 GTCGAAGTGAGCAAAACACTTGGAATCGAGGCTGCAAGGACAACAATTATTGATGAAATA 3876 Query 4067 GGGACAGTTATGGGAAACCATGGTATGAGTATAGACATCCGTCACATGATGCTTTTGGCT 4126 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3877 GGGACAGTTATGGGAAACCATGGTATGAGTATAGACATCCGTCACATGATGCTTTTGGCT 3936 Query 4127 GATGTCATGACTTACAGGGGGGAGGTTCTCGGAATACAAAGAACCGGGATTCAGAAGATG 4186 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3937 GATGTCATGACTTACAGGGGGGAGGTTCTCGGGATACAAAGAACTGGGATTCAGAAGATG 3996 Query 4187 GATAAAAGTGTTCTGATGCAGGCATCTTTTGAGAGGACTGGAGATCATTTATTTAGTGCA 4246 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3997 GACAAAAGTGTGCTGATGCAGGCATCTTTTGAGAGGACTGGAGATCATTTATTTAGTGCA 4056 Query 4247 GC-AGCTAGCGGAAAAGTTGATAACATAGAGGGAGTTACAGAATGTGTGATTATGGGCAT 4305 || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4057 GCTAT-TAGCGGAAAGGTTGATAACATAGAGGGAGTTACAGAATGTGTGATTATGGGCAT 4115 Query 4306 ACCAATGAAGCTCGGAACCGGGATACTCAAAGTCCTTCAAAGGACCGATGATTTGCCCAA 4365 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4116 ACCAATGAAGCTCGGAACCGGAATACTCAAAGTTCTCCAAAGGACCGATGATCTGCCCAA 4175 Query 4366 GTTGAAATATGGACCTGATCCAATCATCTCTTGAAAAGACAGAAACAAAGGTTCACATGC 4425 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 4176 GTTGAAATATGGAGCTGATCCAATCATCTCTTGAAAAGACAGAAACAAAGTTTCACGTGC 4235 Query 4426 CGA 4428 ||| Sbjct 4236 CGA 4238 Score = 582 bits (315), Expect = 6e-165 Identities = 398/435 (91%), Gaps = 17/435 (4%) Strand=Plus/Plus Query 145 ACTTAGCTCTGCTGCTTCTTCTTAAACCCTAAACCCACCTTCCTTCACCGTCGTC-TTTT 203 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || |||| Sbjct 1 ACTTAGCTCTGCTGCTTCTTCTTAAA-CCTAAACCCACCTT-TTTCACCCTCTTCTTTTT 58 Query 204 T-CACCCTTTTGTTTGTA-GAGATGGAGACGAAGATGGAAATTGAATTCACT-AAGAAGC 260 | || | |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | Sbjct 59 TGCA-GC-TTTGATTGGAGGAGATGGAGACGAAGATGGAAATCGAATTCACTAAACAA-C 115 Query 261 CCTACATCGAAGATGTTGGTCCTCTTAAAATAAAAAGCATAAACTTCTCTGTGCTTTCTG 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 116 CCTACATCGAAGATGTTGGTCCTCTTAAAATAAAAAGCATAAACTTCTCTGTGCTTTCTG 175 Query 321 ATCTTGAGGTCATGAAAGCCGCTGAAGTTCAAGTCTGGAA-CATCGGTTTA-TAC--GAC 376 | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| Sbjct 176 ACCTTGAGATCATGAAAGCTGCTGAAGTTCAAGTCTGGAAGAAT--AATTACTACGAGAC 233 Query 377 CACAGTTTTAAACCCTATGAAAACGGCTTGTTGGATCCTCGAATGGGTCCTCCAAACAAA 436 || | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 234 CA-A-TCTTAAACCCTATGAAAACGGCTTGTTGGATGCTCGAATGGGTCCTCCAAACAAA 291 Query 437 AAGTCTATATGCACAACCTGTGAAGGAAACTTCCAAAATTGTCCGGGACACTATGGATAT 496 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 292 AAGTCTATATGCACAACCTGTGACGGAAACTTCCAAAATTGTCCGGGACACTATGGATAT 351 Query 497 CTGAAGCTTGACCTCCCAGTTTACAACGTTGGATACTTTAATTTTATCCTTGATATTTTG 556 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 352 CTGAAGCTTGACCTCCCAGTTTACAACGTTGGATTCTTCAATTTTATCCTTGACATTTTG 411 Query 557 AAGTGCATTTGTAAG 571 ||||||||||||||| Sbjct 412 AAGTGCATTTGTAAG 426 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 167491378773 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5