BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G60390.1
Length=1764
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg496177 jgi|Araly1|496177|fgenesh2_kg.8__1993__AT5G60390.1 2682 0.0
Ahg311847 jgi|Araly1|311847|fgenesh1_pm.C_scaffold_1000627 2012 0.0
Ahg470837 jgi|Araly1|470837|fgenesh2_kg.1__791__AT1G07930.1 1984 0.0
> Ahg496177 jgi|Araly1|496177|fgenesh2_kg.8__1993__AT5G60390.1
Length=1599
Score = 2682 bits (1452), Expect = 0.0
Identities = 1553/1602 (97%), Gaps = 6/1602 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAGGGTGCGCTCTCATATTTCTCACATTTTCGTAGCCGCAAGACTCCTTTCAGATTCTTA 60
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1 TAGGGTGCGCTCTCATATTTCTCACACTTTCGTAGCCGCAAGCCTCCTCTCAGATTCTTA 60
Query 61 CTTGCAGCTATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGAT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 61 CTTGCAGCTATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGAC 120
Query 121 TCTGGAAAATCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCTGGAAAATCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGT 180
Query 181 GTCATCGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCA 240
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 GTCATCGAGAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCA 240
Query 241 TGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 241 TGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTC 300
Query 301 TGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 TGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGAT 360
Query 361 TTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGAC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGAC 420
Query 421 TCCACCACTGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCT 480
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCCACCACTGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCT 480
Query 481 CTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCC 540
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 481 CTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCC 540
Query 541 ACCACCCCCAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATAC 600
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ACTACCCCCAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATAC 600
Query 601 CTGAAGAAGGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAG 660
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 601 CTGAAGAAGGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAG 660
Query 661 GGAGACAACATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTT 720
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 661 GGAGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTT 720
Query 721 GAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCA 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 721 GAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCA 780
Query 781 CTTCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACT 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTTCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACC 840
Query 841 GGTATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGTATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTT 900
Query 901 AAGTCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AAGTCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGA 960
Query 961 TTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 961 TTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCC 1020
Query 1021 AAGGATGATCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCAC 1080
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1021 AAGGATGACCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCAC 1080
Query 1081 CCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCA 1140
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CCTGGTCAGATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCA 1140
Query 1141 GTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAG 1200
Query 1201 GAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1201 GAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCC 1260
Query 1261 ATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCTTTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATG 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1261 ATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCATTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATG 1320
Query 1321 AGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCC 1380
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 AGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCC 1380
Query 1381 AAGGTCACCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGATGAGACTTTCGTTATGATCGA 1440
|||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1381 AAGGTCACCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGATGAGACTTTCGTTATGATGGA 1440
Query 1441 CTCTCTTATGGttttctttggttcttaaaactttgatggcgtttgagcctttttcttttt 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1441 CTCTCTTATGGTTTTCTTTGGTTCTTAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCTTTTT-TTTT- 1498
Query 1501 tctctttatttctgtgactttct-ctctc--cctcctttttggatatctctgagactttt 1557
|||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 -CTCTTTATTTCTATGACTTTCTTCTCTCTTCCTCCTTTTTGGATATCTCTGAGACTTTT 1557
Query 1558 tATTATGGTTTTCAATTATGCAGTTTCCGGATAATTTTGCTT 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 TATTATGGTTTTCAATTATGCAGTTTCCGGATAATTTTGCTT 1599
> Ahg311847 jgi|Araly1|311847|fgenesh1_pm.C_scaffold_1000627
Length=2856
Score = 2012 bits (1089), Expect = 0.0
Identities = 1264/1351 (94%), Gaps = 2/1351 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||
Sbjct 1507 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 1566
Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
|||||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1567 TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 1625
Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1626 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 1685
Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308
||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 1686 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 1745
Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 1746 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 1805
Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1806 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 1865
Query 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1866 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 1925
Query 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 1985
Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 1986 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 2045
Query 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668
||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 2105
Query 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2106 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 2165
Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2166 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 2225
Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2226 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 2285
Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2286 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 2345
Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2346 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 2405
Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2406 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 2465
Query 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
|| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 2525
Query 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2526 GATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 2585
Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2586 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 2645
Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2646 GTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 2705
Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCTTTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGAC 1328
||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 2706 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTAGGACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGAC 2765
Query 1329 CGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCAC 1388
||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2766 TGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTTAC 2825
Query 1389 CAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGA 1419
||||||||| || ||||||||||| || |||
Sbjct 2826 CAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 2856
Score = 1986 bits (1075), Expect = 0.0
Identities = 1255/1344 (93%), Gaps = 4/1344 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||
Sbjct 1 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 60
Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
|||||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 61 TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 119
Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 120 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCTTTCAAGTACGCATGGGTTTT 179
Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308
||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 180 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 239
Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 240 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 299
Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GAACATGATCACTGGTACCTCTCAGGCCGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 359
Query 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 360 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 419
Query 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 479
Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 480 CAGGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 539
Query 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668
||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 599
Query 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 600 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 659
Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 660 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 719
Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 779
Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 780 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 839
Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 840 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 899
Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 900 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 959
Query 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
|| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1019
Query 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1020 GATCGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCACACATTGCAGTCAAGTT 1079
Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1139
Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
|| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1199
Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCT-TTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327
||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 1200 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGG-ACGTTTTGCCGTGAGGGACATGAGGCAGA 1258
Query 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387
| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1259 CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1318
Query 1388 CCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTG 1411
|||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1319 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTG 1342
> Ahg470837 jgi|Araly1|470837|fgenesh2_kg.1__791__AT1G07930.1
Length=1522
Score = 1984 bits (1074), Expect = 0.0
Identities = 1260/1352 (93%), Gaps = 4/1352 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGATTCTGGAAAA 129
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||
Sbjct 6 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATCGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGTAAA 65
Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
|| ||||| ||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 66 TCAACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGAGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 124
Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 125 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 184
Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTATGGAAGTT 308
||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 185 GGACAAACTTAAGGCTGAGAGAGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 244
Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAA 368
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 245 TGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTCATCAA 304
Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 305 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCCGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 364
Query 429 TGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 365 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCATGCTCTCCTTGC 424
Query 489 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 548
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAAATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACCACCCC 484
Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 485 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 544
Query 609 GGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 668
||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCGTTTGTGCCCATCTCTGGATTCGAGGGAGACAA 604
Query 669 CATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 728
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 605 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTTGAGGCTCT 664
Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCACTTCAGGA 788
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 665 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 724
Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 784
Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 785 CAAGCCTGGTATGGTCGTGACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 844
Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 845 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGGTTCAATGT 904
Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 905 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCAAAGGATGA 964
Query 1029 TCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
|| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 CCCTGCCAAGGGAGCAGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1024
Query 1089 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 GATTGGTAACGGTTACGCCCCTGTCCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1084
Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1144
Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1145 GTTTTTGAAGAATGGGGATGCCGGTATGGTTAAGATGACTCCGACCAAGCCCATGGTTGT 1204
Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCT-TTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327
||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||
Sbjct 1205 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCCCTTGG-ACGTTTTGCGGTGAGGGACATGAGGCAGA 1263
Query 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387
| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1264 CTGTTGCAGTCGGTGTCATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1323
Query 1388 CCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGA 1419
|||||||||| || ||||||||||| || |||
Sbjct 1324 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 1355
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 66200845810
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5