BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT5G61140.2
Length=6770
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg950867 jgi|Araly1|950867|scaffold_802754.1 1.053e+04 0.0
> Ahg950867 jgi|Araly1|950867|scaffold_802754.1
Length=6383
Score = 1.053e+04 bits (5702), Expect = 0.0
Identities = 6158/6373 (97%), Gaps = 51/6373 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 196 CGACGCCGTTTTAGAACGCAAGCGATCGCCTTCTTCCTCGGAGAGCCGACCAGAGGTGAA 255
|||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |
Sbjct 44 CGACGCCG-TTT--AACGCCAGCGATCGCCTTCTTCCTCGGAGA---G-CC------G-- 88
Query 256 AACACCACAGAGGAGAAGAATCCTAAACGACACAAGTACAGGGATTTTGTCATGTTAGTT 315
|| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |
Sbjct 89 AA-ACCACAGAGAAGAAGAATCTTAAACGACGCAAGTACAGTGTTTTTGTCATGTTAGCT 147
Query 316 CAGCTTCCTCGCTTGACAAGCTCTCTTAGAGAGCCTTTCGACATCGATCAGGCTTACCTT 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 CAGCTTCCTCGCTTGACAAGCTCTCTTAGAGAGCCTTTCGACATCGATCAGGCTTACCTT 207
Query 376 CGCCGCAAAACTATACTCCAAACTCTTAATAAGCCTCGCAGCTCCGGTAATCGCCTTGAT 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 208 CGCCGCAAAACTATACTCCAAACTCTTAATAAGCCTCGCAGCTCCGGGAATCGCCTTGAT 267
Query 436 GAATCTGACCTTGCTAAGAGGATAGTTCATCAATGGGAAGGAGCTTCTCTC-GAAGTGCG 494
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 268 GAATCCGACCTTGCTAAGAGGATAGTTCATCAATGGGAAGGAGCTTCTC-CAGAAGTGCG 326
Query 495 ACAAGCATACAAGCAGTTTATTGGAGCTGTAGTGGAATTGATTGATCGGGAAGTTCCATC 554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 327 ACAAGCATACAAGCAGTTTATTGGAGCTGTAGTGGAGTTAATTGATCGGGAAGTTCCATC 386
Query 555 AGATGAGTTTCGCGAGGTTGCTTTTTCCGCTTATCGTCTGTTTAACAATCCAGTGGAGGA 614
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 387 AGATGAGTTTCGTGAGGTTGCTTTTTCCACTTATCATCTGTTTGGCAAGCCAGTGGAGG- 445
Query 615 AGATGATAGTGATATCAATGATAATATAAGCATTTCCGGGAAGAAGTTAGAGTTGCAAAA 674
|| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||
Sbjct 446 AG--GACAGTGATATCAATGATAATAAAAGCATTGCCGAAAACAAGTTAGAGTTGCAAAA 503
Query 675 TCTTGTCGGGCATGCTGTCTCAGATGCTAATGTAAAAAACGTGGCCTCCTTTGCTCAGGC 734
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 504 TCTTGTTGGGCATGCTGTCTCAGATGCTAATGTAAAGAACGTGGCCTCCTTAGCTCAGGC 563
Query 735 ACTTTACTCAATACAGCCTACTCATCAGTCTGAGACATATGCTGATGAAGTTAATGGGGG 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 564 ACTTTACTCAATACAGCCTACTCATCAGTCTGAGACATATGTTAATGAAGTTAATGGGGG 623
Query 795 AGCTGAGTTTGGTGCCGACCTTGTTTTCAATCTACCAGCTCGTTTTTTGGTGGAAGCATC 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 624 AGCTGAGTTTGGTGCCGACCTTGTTTTCAATCTACCAGCTCGTTTTTTGGTAGAAGCATC 683
Query 855 TCTTGACGAAACTGGGTTTGTGGATGTAGAAAGCAATGATGCTCATACATCGTTTTCTGA 914
||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 684 TCTTGACGAAAAAGGATTTCTGGATGTGGAAAGCAATGATGCTCATGCATCCTTTTCTGA 743
Query 915 AGGATGGAGTGGTGTTAGCGACACGAAAAATAATCTCAGTGCAGGAAAATTCAATTTAAG 974
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 AGGATGGAGTGATGTTATCGACACGAAAAATAATCACAGTGCAGGAAAATTCAATTTAAG 803
Query 975 TTGGCTAAGAGATGCATGTGGTCGGATGGTTAGAGAAACCAATTCACAACTTTCCCGTGA 1034
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 TTGGCTAAGAGATGCATGTGGTCAGATGGTTAGAGAAACCAATTCACAACTTTCCCGTGA 863
Query 1035 AGAATTGGCTATGGCTATATGCAGATTTCTGGATTCGGATAAACCCGGTGAGGAGATAGC 1094
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 AGAACTGGCTATGGCTATATGCAGATTTTTGGATTCAGATAAACCCGGTGAGGAGATAGC 923
Query 1095 TGGGGATCTGCTGGATCTTGTTGGGGATGGTGCATTTGAGACTGTTCAAGACCTTATTAT 1154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 TGGGGATCTGCTGGATCTTGTTGGGGATGGTGCATTTGAGACTGTTCAAGACCTTATTAT 983
Query 1155 GCATCGGAAAGAAATTGTTGATGCTATCCATCATGGCCAAATGATTCTCAAGTCTGACAA 1214
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 984 GCATCGGAAGGAAATTGTTGATGCTATCCATCATGGTCAAATGATTCTCAAGTCTGACAA 1043
Query 1215 AGCAGCTTCAAACACCCAATCTCGGATGCCTACCTATGGAACACAGGTTACTGTTCAAAC 1274
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1044 AACAGCTTCAAACACCCAATCTCGGATGCCTACCTATGGTACACAGGTTACTGTTCAAAC 1103
Query 1275 AGAGTCTGCAAAGCAAATTGAAAAACTTCGGCGTAAGGAGGAAAAGAAAAATAAACGAAA 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 AGAGTCTGCAAAGCAAATTGAAAAACTTCGGCGCAAGGAGGAAAAGAAAAATAAACGAAA 1163
Query 1335 TGCTGATCTTGGTTTAGAGAGTGAAATATCAGAGGCCAATTTTTCTTCTTTACTTGAGGC 1394
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 TGCCGATCTTGGTTTAGAGAGTGAAATATCAGAGGCCAATTTTTCTTCTTTACTTGAGGC 1223
Query 1395 AAGTGAAAAGAAGACTGCATTTGAGGATCTGATTGGGTCTGGAGAAGCGAATTCTCTTGC 1454
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1224 AAGTGAAAAGAAGACTGCATTTGAGGATCTGATCGGGTCTGGAGAAGCGAATTCTCTGGC 1283
Query 1455 ACTTGCCCTTCCCCAAGGTACTGTAAGGAAGCACTTAAAAGGATATGAGGAAGTGTTTAT 1514
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 ACTGGCCCTTCCCCAAGGTACTGTAAGGAAGCACTTAAAAGGATATGAGGAAGTGTTTAT 1343
Query 1515 CCCGCCAACCCCTACTGCACAAATGAAACCTGGCGAGAAGCTGATTGAGATAAAAGAGTT 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 CCCGCCAACCCCTACTGCACAAATGAAACCTGGCGAGAAGCTGATTGAGATAAAAGAGTT 1403
Query 1575 AGATGACTTTGCTCAAGCTGCTTTTCATGGTTACAAGTCTTTAAACCGTATTCAGAGTCG 1634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 AGATGACTTTGCTCAAGCTGCTTTTCATGGTTACAAGTCTTTAAACCGTATTCAGAGTCG 1463
Query 1635 CATATTTCAGACAGTTTACCACACCAATGAGAATATATTGGTCTGTGCTCCAACAGGAGC 1694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464 CATATTTCAGACAGTTTACCACACCAATGAGAATATATTGGTCTGTGCTCCAACAGGAGC 1523
Query 1695 TGGTAAAACAAATATAGCTATGATTTCTGTTCTACATGAGATCAAACAACACTTCAGGGA 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1524 TGGTAAAACAAATATAGCTATGATTTCTGTTCTACATGAGATCAAACAACATTTCAGGGA 1583
Query 1755 TGGCTACTTGCACAAAAATGAGTTTAAGATTGTTTATGTAGCTCCTATGAAGGCGTTAGC 1814
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 TGGCTACTTGCACAAAAACGAGTTTAAGATTGTTTATGTAGCTCCTATGAAGGCGTTAGC 1643
Query 1815 AGCAGAGGTCACGTCAGCATTTAGCCGTCGTCTAGCTCCATTAAATATGGTTGTGAAGGA 1874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1644 AGCAGAGGTCACGTCAGCATTTAGCCGTCGTCTAGCTCCATTAAATATGGTTGTTAAAGA 1703
Query 1875 GCTTACAGGGGATATGCAACTCACGAAGACTGAACTTGAAGAAACTCAGATGATAGTGAC 1934
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 GCTTACAGGGGATATGCAACTCACGAAGAGTGAACTTGAAGAAACTCAGATGATAGTGAC 1763
Query 1935 AACACCAGAGAAATGGGATGTCATTACTCGCAAAAGCAGTGACATGTCAATGTCAATGCT 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1764 AACACCAGAGAAATGGGATGTCATTACTCGCAAAAGCAGTGACATGTCATTATCAATGCT 1823
Query 1995 AGTAAAACTATTGATCATTGATGAAGTGCATCTTCTGAATGATGATAGAGGTGCAGTGAT 2054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824 AGTAAAACTATTGATCATTGATGAAGTGCATCTTCTGAATGATGATAGAGGTGCAGTGAT 1883
Query 2055 AGAGGCGCTAGTTGCTCGGACCCTCCGTCAGGTGGAGTCAACTCAGACAATGATAAGAAT 2114
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1884 AGAGGCGCTAGTTGCTCGGACCCTCCGTCAGGTGGAGTCAACACAGACAATGATAAGAAT 1943
Query 2115 TGTAGGCCTGTCAGCCACTTTACCTAGCTACCTACAGGTTGCTCAGTTTCTACGAGTGAA 2174
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944 TGTGGGCCTGTCAGCCACTTTACCTAGCTACCTACAGGTTGCTCAGTTTCTACGAGTGAA 2003
Query 2175 TACAGACACTGGCCTATTCTATTTTGATTCAAGTTATCGCCCAGTTCCCTTAGCTCAACA 2234
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004 TCCAGACACTGGCCTCTTCTATTTTGATTCAAGTTATCGCCCAGTTCCCTTAGCTCAACA 2063
Query 2235 ATACATAGGCATCACTGAGCATAACTTTGCTGCTAGAAACGAATTATTAAATGAGATATG 2294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2064 GTACATAGGCATCACTGAGCATAACTTTGCTGCTAGAAACGAATTGTTAAATGAGATATG 2123
Query 2295 CTACAAAAAGGTTGTTGATTCAATTAAACAAGGTCATCAAGCAATGATATTTGTTCATTC 2354
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2124 CTACAAAAAGGTTGTTGATTCAATTAAACAAGGTCATCAAGCAATGATTTTTGTTCATTC 2183
Query 2355 CCGAAAAGACACTTCAAAAACAGCTGAGAAACTGGTTGATCTTGCCCGGCAATATGAAAC 2414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2184 CCGAAAAGACACTTCAAAAACAGCTGAGAAACTGGTTGATCTTGCTCGGCAGTATGAAAC 2243
Query 2415 TCTGGATTTGTTCACGAATGAGACTCATCCTCAATTTCAACTGATGAAGAAAGACGTTAT 2474
||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2244 TCTGGATTTGTTCGCGAATGAGACTCATCCTCAGTGTCAACTGATGAAGAAAGACGTTAT 2303
Query 2475 GAAGTCCAGAAATAAGGATCTTGTCAAATTCTTTGAAGCTGGCTTCGGAATTCATCATGC 2534
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2304 GAAGTCCAGAAATAAGGATCTTGTCAAATTTTTTGAAGCTGGCTTCGGAATTCATCATGC 2363
Query 2535 TGGGATGTTGAGATCTGATAGAACACTTACGGAGAGGCTGTTTTCTGATGGTCTCTTGAA 2594
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2364 TGGGATGTTGCGATCTGATAGAACACTTACGGAGAGGCTGTTTTCTGATGGTCTCTTGAA 2423
Query 2595 GGTGCTTGTTTGCACTGCAACTCTTGCGTGGGGTGTAAATCTGCCTGCACACACAGTCGT 2654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2424 GGTGCTTGTTTGCACTGCAACTCTTGCGTGGGGTGTAAATCTGCCTGCACACACAGTCGT 2483
Query 2655 AATTAAGGGAACACAATTGTATGATGCCAAGGCTGGTGGGTGGAAAGACTTGGGAATGCT 2714
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2484 AATTAAGGGAACTCAATTGTATGATGCCAAGGCTGGTGGGTGGAAAGACTTGGGAATGCT 2543
Query 2715 TGATGTCATGCAGATCTTTGGAAGGGCAGGGAGACCACAATTTGATAAGAGTGGTGAGGG 2774
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2544 TGATGTCATGCAGATCTTTGGAAGGGCTGGGAGACCCCAATTTGATAAGAGTGGTGAGGG 2603
Query 2775 AATTATCATCACATCCCATGACAAGCTGGCATACTATCTCCGGCTGCTGACTAGTCAGCT 2834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2604 AATTATCATCACATCCCATGACAAGCTGGCATACTATCTCCGGCTGCTGACGAGTCAGCT 2663
Query 2835 TCCCATAGAAAGTCAGTTCATAAGCTCCTTGAAAGATAACTTAAACGCAGAAGTGGTTTT 2894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664 TCCCATAGAAAGTCAGTTCATAAGCTCCTTGAAAGATAACTTAAACGCAGAAGTGGTTTT 2723
Query 2895 GGGAACTGTAACTAATGTAAAGGAAGCCTGTGCTTGGCTTGGATATACATATTTGTCAAT 2954
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 GGGAACTGTGACTAATGTAAAGGAAGCCTGTGCTTGGCTTGGATATACATATTTGTCAAT 2783
Query 2955 TCGGATGAAGTTAAATCCTTTGGCTTATGGCATTGGATGGGAAGAGATAATTGCCGATCC 3014
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2784 TCGGATGAAGTTGAATCCTTTGGCTTATGGCATTGGATGGGACGAGATAATTGCCGATCC 2843
Query 3015 TTCTTTATCCTTGAAGCAACGAGCCCTTGTTGCTGATGCTGCCCGTTCACTGGACAAAGC 3074
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2844 TTCTTTATCGTTGAAGCAACGAGCCCTTGTGGCTGATGCTGCACGTTCACTGGACAAAGC 2903
Query 3075 TAAGATGATGAGGTTCGATGAGAAAAGTGGAAACTTTTACTGTACCGAGCTTGGACGGGT 3134
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2904 TAAGATGATGAGGTTCGATGAGAAAAGTGGGAACTTTTACTGTACCGAGCTTGGACGGGT 2963
Query 3135 TGCAAGTCACTTCTATATTCAATATTCTAGTGTTGAAACATACAACGAAATGTTGAAGCG 3194
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2964 TGCAAGTCACTTCTATATTCAATATTCTAGTGTTGAAACATACAACGAGATGTTGAAGCG 3023
Query 3195 GCACATGAATGAAAGCGAGATAATTAATATGGTTGCCCATTCTTCTGAATTTGAAAATAT 3254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3024 GCACATGAATGAAAGCGAGATAATTAATATGGTTGCCCATTCTTCTGAATTTGAAAATAT 3083
Query 3255 TGTGGTAAGAGAGGAAGAGCAGCATGAACTTGAGACTCTTGCACGCTCTTGCTGTCCCTT 3314
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3084 TGTGGTAAGAGAGGAAGAGCAGCATGAACTTGAGTCTCTTGCACGCTCTTGCTGTCCCTT 3143
Query 3315 AGAAGTTAAGGGAGGCCCTTCTAACAAACATGGAAAAATTTCGATTCTTATTCAGTTGTA 3374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3144 AGAAGTTAAGGGAGGCCCTTCTAACAAACATGGAAAAATTTCGATTCTTATTCAGTTGTA 3203
Query 3375 CATATCCCGTGGATCAATTGATGCATTTTCTCTGGTCTCTGATGCTTCATACATTAGTGC 3434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3204 CATATCCCGTGGATCAATTGATGCATTTTCTCTGGTCTCTGATGCTTCATACATTAGTGC 3263
Query 3435 TAGTTTAGCACGTATAATGCGTGCTCTGTTTGAAATATGCTTGCGAAAAGGCTGGTGTGA 3494
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3264 TAGTTTAGCACGTATAATGCGTGCTCTGTTTGAGATATGCTTGCGAAAAGGCTGGTGTGA 3323
Query 3495 GATGACTTTATTTATGTTGGAATACTGCAAGGCAGTTGATCGTCAACTATGGCCTCATCA 3554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3324 GATGACTTTATTTATGTTGGAATACTGCAAGGCAGTTGATCGTCAACTATGGCCTCATCA 3383
Query 3555 GCATCCTCTTCGGCAATTCGAAAGGGATCTGCCTTCTGATATATTAAGAAAACTTGAAGA 3614
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |
Sbjct 3384 GCATCCTCTTCGGCAATTCGATAGGGATCTACCTTCTGAT------------C--GA-G- 3427
Query 3615 GCGAAGGGATGACTTAGACCATTTGTATGAGATGGAGGAAAAGGAAATTGGAGCGCTGAT 3674
| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 3428 G-G--GC--TGACTTAGACCGTTTGTATGAGATGGAGGAAAAAGACATTGGAGCGCTGAT 3482
Query 3675 TCGTTATAATCCTGGGGGAAGGTTGGTCAAGCAGCATCTAGGATATTTTCCTTCAATTCA 3734
|||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3483 TCGTTATAATCCTGGGGGAAGG-----CAA-CA---TCTAGGATATTTTCCTTCAATTCA 3533
Query 3735 GTTGGCAGCTACTGTTAGTCCAATCACCCGCACTGTATTGAAGGTGGATTTGCTTATAAC 3794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3534 GTTGGCAGCTACTGTTAGTCCAATCACCCGCACTGTATTGAAGGTGGATGTGCTTATAAC 3593
Query 3795 TCCAAATTTCATATGGAAGGATCGTTTTCATGGTACTGCTCTTCGTTGGTGGATTCTCAT 3854
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3594 TCCAGATTTCATATGGAAGGATCGTTTTCATGGTGCTGCTCTTCGTTGGTGGATTCTCAT 3653
Query 3855 TGAGGACACAGAGAATGATTATATCTATCACTCAGATCTTTTCACACTAACGAAGCGGAT 3914
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3654 TGAGGACACAGAGAATGATTATATCTACCACTCAGATCTTTTCACACTAACGAAACGGAT 3713
Query 3915 GGCTAGAGGGGAACCACAGAAGCTTTCTTTTACCGTACCGATATTTGAACCACACCCACC 3974
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3714 GGCTAGAGGGGAACCGCAGAAGCTTTCTTTTACCGTACCGATATTTGAACCACACCCACC 3773
Query 3975 ACAATACTATGTTCATGCGGTTTCTGATTCTTGGTTGCATGCAGAGACTTACTTCACAAT 4034
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3774 ACAATACTATGTTCATGCAGTTTCTGATTCTTGGTTGCATGCAGAGTCTTTCTTCACAAT 3833
Query 4035 CTCTTTTCACAATCTTGCACTACCAGAGGCGCGGACGTCTCACACAGAGCTTTTAGACTT 4094
|||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3834 CTCTTTCCACAATCTTGCACTACCAGAGGCACGAACATCTCACACAGAGCTTTTAGACTT 3893
Query 4095 AAAACCTCTTCCTGTGACTTCTCTTGGGAATAAGTTGTATGAATCGCTTTACAAATTTTC 4154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3894 AAAACCTCTTCCTGTGACTTCTCTTGGGAATAAGTTGTATGAATCGCTTTACAAATTTTC 3953
Query 4155 ACATTTCAATCCAATACAGACTCAGATTTTTCATGTGTTATATCACACAGACAACAATGT 4214
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3954 ACATTTCAATCCAATACAGACTCAGATTTTCCATGTGTTATATCACACAGACAACAATGT 4013
Query 4215 TCTTGTAGGAGCTCCAACTGGAAGTGGGAAAACTATATCTGCTGAACTTGCAATGTTGCG 4274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4014 TCTTGTAGGAGCTCCAACTGGAAGTGGGAAAACTATATCTGCTGAACTTGCAATGTTGCG 4073
Query 4275 TCTCTTCAGTACCCAGCCTGATATGAAGGTTGTTTACATAGCACCACTGAAGGCTATTGT 4334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4074 TCTCTTCAGTACCCAGCCTGATATGAAGGTTGTTTACATAGCACCACTGAAGGCTATTGT 4133
Query 4335 TCGAGAAAGGATGAATGATTGGAAAAAGCATCTTGTTGCTCCACTTGGAAAAGAAATGGT 4394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4134 TCGAGAAAGGATGAATGATTGGAAAAAGCATCTTGTTGCTCCACTTGGAAAAGAAATGGT 4193
Query 4395 TGAAATGACTGGAGATTACACTCCAGATTTAGTAGCTCTCTTGTCCGCGGACATCATCAT 4454
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4194 TGAAATGACTGGAGATTACACTCCAGATTTAGTAGCTCTCTTGTCCGCAGACATTATCAT 4253
Query 4455 ATCTACCCCTGAAAAATGGGATGGCATTAGTCGTAATTGGCATACTCGAAGTTATGTCAA 4514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4254 ATCTACCCCTGAAAAATGGGATGGCATTAGTCGTAATTGGCATACTCGAAGTTATGTCAA 4313
Query 4515 AAAGGTCGGCCTTGTTATTTTGGATGAGATTCACTTGCTTGGAGCCGACAGAGGACCGAT 4574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4314 AAAGGTCGGCCTTGTTATTTTGGATGAGATTCACTTGCTTGGAGCCGACAGAGGACCCAT 4373
Query 4575 TCTTGAGGTTATTGTATCTAGGATGAGATATATATCATCACAGACAGAGCGCTCCGTCCG 4634
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4374 ACTTGAGGTTATTGTGTCTAGGATGAGATATATATCATCACAGACAGAGCGCTCGGTCCG 4433
Query 4635 GTTTGTTGGGCTTTCTACAGCTCTGGCAAATGCAGGTGATTTGGCTGACTGGTTGGGTGT 4694
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4434 GTTTGTTGGTCTTTCTACAGCTTTGGCAAATGCAGGTGATTTGGCTGACTGGTTGGGTGT 4493
Query 4695 TGGGGAGATCGGACTTTTCAATTTTAAACCAAGCGTCAGGCCTGTACCAATTGAAGTTCA 4754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4494 TGGGGAGATCGGACTTTTCAATTTTAAACCAAGCGTCAGGCCTGTACCAATTGAAGTTCA 4553
Query 4755 TATTCAGGGTTATCCTGGAAAGTATTACTGCCCAAGGATGAATAGCATGAACAAGCCAGC 4814
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4554 TATTCAGGGTTATCCTGGGAAGTATTACTGCCCACGGATGAATAGCATGAACAAGCCAGC 4613
Query 4815 ATATGCAGCCATATGTACTCATTCACCTACGAAACCTGTTCTTATCTTTGTTTCATCCCG 4874
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4614 ATATGCAGCCATATGTACCCATTCACCTACAAAACCAGTTCTTATCTTTGTTTCATCCCG 4673
Query 4875 TAGGCAGACAAGGCTTACTGCATTGGATCTTATTCAGTTTGCTGCCTCCGACGAACATCC 4934
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4674 TAGGCAGACAAGGCTTACCGCACTGGATCTTATTCAGTTTGCTGCCTCCGACGAACATCC 4733
Query 4935 GCGGCAATTTCTGAGTGTGTCAGAGGAAGACTTGCAGATGGTCCTCTCACAGATAACTGA 4994
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4734 GCGGCAATTTCTAAGTGTGTCAGAGGAAGACTTGCAGATGGTCCTCTCACAGATAACTGA 4793
Query 4995 TCAAAACCTTCGACATACGTTGCAATTCGGCATCGGACTGCATCATGCAGGTTTAAACGA 5054
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4794 CCAGAACCTCCGACATACGTTGCAATTCGGCATCGGACTGCATCATGCAGGTTTAAACGA 4853
Query 5055 CCACGATAGATCTGCAGTCGAAGAGCTTTTCACGAACAACAAGATTCAGGTTTTGGTCTC 5114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4854 CCACGATAGATCTGCAGTCGAAGAGCTTTTCACGAACAACAAGATTCAGGTTTTGGTCTC 4913
Query 5115 AACAAGTACCTTGGCATGGGGAGTGAACCTACCAGCTCACTTAGTTATTATAAAGGGAAC 5174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4914 AACAAGTACCTTGGCATGGGGAGTGAACCTACCAGCTCACTTAGTTATTATAAAGGGAAC 4973
Query 5175 AGAATATTTCGACGGGAAAACCAAAAGATATGTTGACTTCCCTCTTACAGAGATCTTGCA 5234
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4974 TGAATATTTCGACGGGAAAACCAAAAGATATGTTGACTTCCCTCTTACAGAGATCTTGCA 5033
Query 5235 AATGATGGGACGTGCAGGGCGACCACAGTTTGACCAACATGGGAAAGCGGTTATTCTTGT 5294
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5034 AATGATGGGACGTGCAGGGCGTCCACAGTTTGACCAACATGGGAAAGCGGTCATTCTTGT 5093
Query 5295 ACATGAACCTaaaaaaaGCTTTTACAAAAAGTTCTTGTACGAACCATTCCCCGTAGAAAG 5354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5094 ACATGAACCTAAAAAAAGCTTTTACAAAAAGTTCTTGTACGAACCATTCCCCGTAGAAAG 5153
Query 5355 TAGTTTGAAAGAGAAGCTGCACGATCACTTCAATGCGGAAATCGTCTCTGGAACAATAGG 5414
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5154 TAGTTTGAAAGAGAAGCTGCACGATCACTTCAACGCAGAAATAGTCTCTGGAACAATAGG 5213
Query 5415 CAACAAAGAAGATGCAGTGCATTATCTTACATGGACGTATTTGTTTCGTAGACTGATGGC 5474
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5214 CAACAAAGAAGATGCGGTGCATTATCTTACATGGACGTATTTGTTTCGCAGACTGATGGC 5273
Query 5475 TAATCCTGCTTACTATGGGCTAGAAGGTACTCAAGACGAAACAATCTGTTCCTACTTATC 5534
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5274 TAATCCTGCTTACTATGGGCTAGAAGGTACTCAAGACGAAACGATCTGTTCCTACTTATC 5333
Query 5535 AAGATTGGTGCAAACCACATTTGAGGATCTTGAAGACAGTGGTTGCCTCAAAGTAAATGA 5594
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5334 AAGATTGGTGCAAACCACATTTGAGGATCTTGAAGACAGTGGATGCCTCAAAGTAAATGA 5393
Query 5595 AGATAGTGTGGAGCCTACGATGCTGGGTACAATAGCGTCACAGTATTACCTTTGCTACAT 5654
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5394 AGATAGTGTGGAGCCTACGATGCTGGGTACAATAGCGTCACAATATTACCTTTGCTACAT 5453
Query 5655 GACCGTGTCTATGTTTGGCTCTAATATAGGTCCTGACACATCGCTTGAAGCATTTTTGCA 5714
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5454 GACCGTGTCTATGTTTGGCTCTAATATAGGTCCTGACACATCACTTGAAGCATTTTTGCA 5513
Query 5715 TATCTTGGCTGGTGCTTCTGAGTATGATGAACTTCCTGTGCGGCACAATGAGGAAAATTA 5774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5514 TATCTTGGCTGGTGCTTCTGAGTATGATGAACTTCCTGTGCGGCACAATGAGGAAAATTA 5573
Query 5775 CAATAAAACACTGTCAGATAGAGTTCGGTATCCCGTGGATAATAACCATCTAGATGATCC 5834
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5574 CAACAAAACACTGTCAGATAAAGTTCGGTATCCCGTGGATAATAACCATCTAGATGATCC 5633
Query 5835 TCATGTGAAAGCGAATCTGCTCTTCCAGGCACATTTTTCTCAATTGGCACTTCCAATCAG 5894
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 5634 TCATGTCAAAGCAAATCTGCTCTTCCAGGCACATTTTTCTCAGTTGGCACTCCCAATCAG 5693
Query 5895 TGATTATAACACGGATTTAAAGTCAGTACTGGATCAAAGCATTCGGATCCTCCAGGCCAT 5954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5694 TGATTATAACACGGATTTAAAGTCAGTACTGGATCAAAGCATTCGGATCCTCCAGGCCAT 5753
Query 5955 GATTGATATCTGCGCAAACAGTGGATGGCTCTCAAGCTCACTGACGTGTATGCGCCTTTT 6014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5754 GATTGATATCTGCGCAAACAGTGGATGGCTCTCAAGCTCACTGACGTGTATGCGCCTTTT 5813
Query 6015 GCAAATGGTCATGCAGGGCATGTGGTCTGATCAAGATTCGTCATTATGGATGATCCCATG 6074
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5814 GCAAATGGTTATGCAGGGCATGTGGTCCGATCAAGATTCGTCATTATGGATGATCCCATG 5873
Query 6075 CATGAATGACCTTCTTCTAGGATCTCTGACCGCAAGAGGGATTCACACGCTACATCAGCT 6134
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 5874 CATGAATGATGATCTTCTAGGATCTCTGACCGCAAGAGGAATTCACACGCTGCATCAGCT 5933
Query 6135 ATTAAATCTTCCAAGGGAAACTCTACAAAGTGTAACCGAAAACTTCCCTGCATCAAGATT 6194
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5934 ATTAGATCTTCCAAAGGAAACTCTACAAAGTGTAACCGGAAACTTCCCTGCATCAAGATT 5993
Query 6195 ATCTCAGGATCTCCAACGATTCCCACGGATCCAAATGAATGTGAGACTCCAAAAGAAGGA 6254
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5994 ATCTCAGGATCTCCAACGCTTTCCACGGATCCAAATGAATGTGAGACTTCAAAAGAAGGA 6053
Query 6255 TTCCGATGGCAAGAAAAAGCCTTCAACGCTGGAAATCAGATTGGAAAAGACATCAAAGAG 6314
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6054 TTCGGATGGCAAGAAAAAGCCTTCAACGCTGGAAATCAGATTGGAAAAGACATCAAAGAG 6113
Query 6315 GAATAGCTCGAGGGCATTGGCCCCTCGATTCCCAAAGGTGAAAGACGAAGCGTGGTGGTT 6374
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6114 GAATAGCTCGAGGGCGTTGGCCCCTCGATTCCCAAAGGTGAAAGACGAAGCGTGGTGGTT 6173
Query 6375 GGTTCTTGGTGATACTTCAACTTCTGAGCTCTTTGCTGTGAAGAGAGTTTCGTTCACTGG 6434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 6174 GGTTCTTGGTGATACTTCAACTTCTGAGCTCTTTGCTGTGAAGAGGGTTTCGTTCACTGG 6233
Query 6435 TCGTCTGATCACACGCATGGAGTTACCTCCCAATATAACCTCTTTTCAGGATACGAAACT 6494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 6234 TCGTCTGATCACACGCATGGAGTTACCTCCCAATATAACCTCGTTTCAGGATACGAAACT 6293
Query 6495 CATCTTAGTTTCGGATTGTTATTTGGGGTTTGAACAAGAACACTCCATTGAACAACTTGC 6554
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6294 CATCTTAGTTTCGGATTGTTATTTGGGGTTTGAGCAAGAACACTCCATTGAACAACCTGC 6353
Query 6555 ACGACGCGGATGA 6567
||| |||||||||
Sbjct 6354 ACGTCGCGGATGA 6366
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 256622214739
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5