BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= ATCG00180.1
Length=2043
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg315525 jgi|Araly1|315525|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000558 3646 0.0
Ahg925484 jgi|Araly1|925484|scaffold_201045.1 2940 0.0
> Ahg315525 jgi|Araly1|315525|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000558
Length=2031
Score = 3646 bits (1974), Expect = 0.0
Identities = 2022/2043 (99%), Gaps = 12/2043 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATCGATCGGTATAAACATCAACAACTCCGAATTGGCTTAGTTTCTCCTCAGCAAATA 60
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Sbjct 1 ATGATCGATCGGTATAAACATCAACAACTCCGAATTGGATTAGTTTCTCCTCAGCAAATA 60
Query 61 AGTGCTTGGGCCACTAAAATAATACCTAATGGAGAGATAGTTGGAGAGGTGACAAAACCC 120
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Sbjct 61 AGTGCTTGGGCCACTAAAATAATACCTAATGGAGAGATAGTTGGAGAGGTGACAAAACCC 120
Query 121 TATACTTTTCATTACAAAACCAATAAACCGGAAAAAGATGGATTATTTTGTGAAAGGATT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TATACTTTTCATTACAAAACCAATAAACCGGAAAAAGATGGATTATTTTGTGAAAGGATT 180
Query 181 TTTGGACCTATAAAGAGTGGAATTTGCGCTTGTGGAAATTATCGAGTGATCGGAGATGAA 240
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTTGGGCCTATAAAGAGTGGAATTTGCGCTTGTGGAAATTATCGAGTGATCGGAGATGAA 240
Query 241 AAAGAAGACCCAAAGTTTTGTGAACAATGTGGAGTTGAATTTGTTGATTCTCGGATACGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAGAAGACCCAAAGTTTTGTGAACAATGTGGAGTTGAATTTGTTGATTCTCGGATACGA 300
Query 301 AGATATCAAATGGGATACATAAAACTGACATGTCCTGTAACTCATGTATGGTATTTGAAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGATATCAAATGGGATACATAAAACTGACATGTCCTGTAACTCATGTATGGTATTTGAAA 360
Query 361 CGTCTTCCTAGTTATATTGCGAATCTTTTAGATAAACCTCTTAAAGAATTAGAAGGCCTA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CGTCTTCCTAGTTATATTGCGAATCTTTTAGATAAACCTCTTAAAGAATTAGAAGGCCTA 420
Query 421 GTATACTGCGATTTTTCTTTTGCTAGGCCCATAACTAAAAAACCTACTTTCTTACGATTA 480
||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTATACTGCGA---------TG-T--GCCCATAACTAAAAAACCTACTTTCTTACGATTA 468
Query 481 CGAGGTTCATTTGAATATGAAATTCAATCCTGGAAATACAGCATCCCACttttttttACT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 CGAGGTTCATTTGAATATGAAATTCAATCCTGGAAATACAGCATCCCACTTTTTTTTACT 528
Query 541 ACTCAAGGTTTCGATATATTTCGAAATCGAGAAATTTCTACTGGGGCGGGTGCTATCCGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 529 ACTCAAGGTTTCGATATATTTCGAAATCGAGAAATTTCTACCGGGGCGGGTGCTATCCGA 588
Query 601 GAACAATTAGCCGATTTAGATTTGCGAATTATTATAGAAAATTCGTTGGTAGAATGGAAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 GAACAATTAGCCGATTTAGATTTGCGAATTATTATAGAAAATTCGTTGGTAGAATGGAAA 648
Query 661 CAATTAGGAGAAGAAGGGCCTACGGGGAATGAATGGGAAGATCGAAAAATTGTAAGAAGA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 CAATTAGGAGAAGAAGGGCCTACGGGGAATGAATGGGAAGATCGAAAAATTGTAAGAAGA 708
Query 721 AAAGATTTTTTAGTTAGACGTATGGAATTAGCTAAGCATTTTATTCGAACAAATATAGAA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 AAAGATTTTTTAGTTAGACGTATGGAATTAGCTAAGCATTTTATTCGAACAAATATAGAA 768
Query 781 CCCGAATGGATGGTTTTATGTCTCTTACCGGTTCTTCCTCCCGAGTTGAGACCCATCATT 840
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 CCAGAATGGATGGTTTTATGTCTCTTACCGGTTCTTCCTCCCGAGTTGAGACCCATCATT 828
Query 841 CAGATAGAAGGGGGTAAACTAATGAGTTCAGATATTAATGAACTCTATAGAAGAGTTATC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 CAGATAGAAGGGGGTAAACTAATGAGTTCAGATATTAATGAACTCTATAGAAGAGTTATC 888
Query 901 TATCGGAACAATACTCTTACCGATCTATTAACAACAAGTAGATCTACACCGGGGGAATTA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATCGGAACAATACTCTTACCGATCTATTAACAACAAGTAGATCTACACCGGGGGAATTA 948
Query 961 GTAATGTGTCAGGAAAAATTGGTACAAGAAGCCGTGGATACACTTCTTGATAATGGAATC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 GTAATGTGTCAGGAAAAATTGGTACAAGAAGCCGTGGATACACTTCTTGATAATGGAATC 1008
Query 1021 CGTGGACAACCCATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATTTTCAGATGTAATT 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 CGTGGACAACCCATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATTTTCAGATGTAATT 1068
Query 1081 GAAGGCAAAGAGGGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGGAAACGGGTCGATTATTCGGGG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GAAGGCAAAGAGGGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGGAAACGGGTCGATTATTCGGGG 1128
Query 1141 CGCTCGGTGATTGTCGTTGGACCTTCACTTTCATTACATCGCTGTGGATTGCCTCGCGAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 CGCTCGGTGATTGTCGTTGGACCTTCACTTTCATTACATCGCTGTGGATTGCCTCGCGAA 1188
Query 1201 ATAGCAATAGAGCTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTTTAATTAGACAACACCTGGCT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 ATAGCAATAGAGCTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTTTAATTAGACAACACCTGGCT 1248
Query 1261 TCGAACATAGGAGTTGCTAAGAGTCAAATTCGTGaaaaaaaGCCGATTGTCTGGGAAATC 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 TCGAACATAGGAGTTGCTAAGAGTCAAATTCGTGAAAAAAAGCCGATTGTCTGGGAAATC 1308
Query 1321 CTTCAAGAAGTCATGCAGGGGCATCCCGTATTACTGAATAGAGCACCTACCCTACATAGA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 CTTCAAGAAGTCATGCAGGGGCATCCCGTATTACTGAATAGAGCACCTACCCTACATAGA 1368
Query 1381 TTAGGCATACAGTCATTCCAACCTATTTTAGTGGAAGGACGCACTATTTGTTTACATCCA 1440
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 TTAGGCATACAGTCATTCCAACCAATTTTAGTGGAAGGACGCACTATTTGTTTACATCCA 1428
Query 1441 TTAGTTTGTAAGGGGTTCAATGCAGACTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTGCCT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 TTAGTTTGTAAGGGGTTCAATGCAGACTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTGCCT 1488
Query 1501 TTATCTTTAGAGGCTCAAGCAGAGGCTCGTTTACTTATGTTTTCTCATATGAATCTCTTA 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 TTATCTTTAGAGGCTCAAGCAGAGGCTCGTTTACTTATGTTTTCTCATATGAATCTCTTA 1548
Query 1561 TCTCCAGCTATTGGAGATCCCATTTCGGTACCGACTCAAGATATGCTTATTGGACTCTAT 1620
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 TCTCCAGCTATTGGAGATCCCATTTCTGTACCGACTCAAGATATGCTTATTGGACTCTAT 1608
Query 1621 GTATTAACGAGCGGCACTCGTCGAGGTATTTGTGCAAACAGATATAATCCATGTAATCGA 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 GTATTAACGAGCGGCACTCGTCGAGGTATTTGTGCAAACAGATATAATCCATGTAATCGA 1668
Query 1681 AAAAACTATCAAAATGAAAGAATTTACGAAACAAACTATAAGTATACGAAAGAACCCttt 1740
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 AAAAACTATAAAAATGAAAGAATTTACGAAACAAACTATAAGTATACGAAAGAACCCTTT 1728
Query 1741 ttttGCAATTCCTATGATGCAATTGGAGCTTATCGACAGaaaaaaaTCAATTTAGATAGT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1729 TTTTGCAATTCCTATGATGCAATTGGAGCTTATCGACAGAAAAGAATCAATTTAGATAGT 1788
Query 1801 CCTTTGTGGCTTCGGTGGCAATTAGATCAACGCGTTATTGCTTCAAGAGAAGTTCCTATC 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 CCTTTGTGGCTTCGGTGGCAATTAGATCAACGCGTTATTGCTTCAAGAGAAGTTCCTATC 1848
Query 1861 GAAGTTCACTATGAATCTTTTGGTAACTATCATGAGATTTATGCACACTATCTAATAGTA 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 GAAGTTCACTATGAATCTTTTGGTAACTATCATGAGATTTATGCACACTATCTAATAGTA 1908
Query 1921 AGAAGTGTaaaaaaaGAAAATTTTTGTATATATATTCGAACCACAGTTGGTCATATTTCT 1980
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 AGAAGTGTAAAAAAAGAAACTTTTTGTATATATATTCGAACCACAGTTGGTCATATTTCT 1968
Query 1981 TTTTATCGAGAAATCGAGGAAGCTATACAAGGTTTTTCTCAAGCCTGTTCATATGATACC 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 TTTTATCGAGAAATCGAGGAAGCTATACAAGGTTTTTCTCAAGCCTGTTCATATGATACC 2028
Query 2041 TAA 2043
|||
Sbjct 2029 TAA 2031
> Ahg925484 jgi|Araly1|925484|scaffold_201045.1
Length=5564
Score = 2940 bits (1592), Expect = 0.0
Identities = 1606/1613 (99%), Gaps = 0/1613 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 431 ATTTTTCTTTTGCTAGGCCCATAACTAAAAAACCTACTTTCTTACGATTACGAGGTTCAT 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3834 ATTTTTCTTTTGCTAGGCCCATAACTAAAAAACCTACTTTCTTACGATTACGAGGTTCAT 3893
Query 491 TTGAATATGAAATTCAATCCTGGAAATACAGCATCCCACttttttttACTACTCAAGGTT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3894 TTGAATATGAAATTCAATCCTGGAAATACAGCATCCCACTTTTTTTTACTACTCAAGGTT 3953
Query 551 TCGATATATTTCGAAATCGAGAAATTTCTACTGGGGCGGGTGCTATCCGAGAACAATTAG 610
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3954 TCGATATATTTCGAAATCGAGAAATTTCTACCGGGGCGGGTGCTATCCGAGAACAATTAG 4013
Query 611 CCGATTTAGATTTGCGAATTATTATAGAAAATTCGTTGGTAGAATGGAAACAATTAGGAG 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4014 CCGATTTAGATTTGCGAATTATTATAGAAAATTCGTTGGTAGAATGGAAACAATTAGGAG 4073
Query 671 AAGAAGGGCCTACGGGGAATGAATGGGAAGATCGAAAAATTGTAAGAAGAAAAGATTTTT 730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4074 AAGAAGGGCCTACGGGGAATGAATGGGAAGATCGAAAAATTGTAAGAAGAAAAGATTTTT 4133
Query 731 TAGTTAGACGTATGGAATTAGCTAAGCATTTTATTCGAACAAATATAGAACCCGAATGGA 790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4134 TAGTTAGACGTATGGAATTAGCTAAGCATTTTATTCGAACAAATATAGAACCAGAATGGA 4193
Query 791 TGGTTTTATGTCTCTTACCGGTTCTTCCTCCCGAGTTGAGACCCATCATTCAGATAGAAG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4194 TGGTTTTATGTCTCTTACCGGTTCTTCCTCCCGAGTTGAGACCCATCATTCAGATAGAAG 4253
Query 851 GGGGTAAACTAATGAGTTCAGATATTAATGAACTCTATAGAAGAGTTATCTATCGGAACA 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4254 GGGGTAAACTAATGAGTTCAGATATTAATGAACTCTATAGAAGAGTTATCTATCGGAACA 4313
Query 911 ATACTCTTACCGATCTATTAACAACAAGTAGATCTACACCGGGGGAATTAGTAATGTGTC 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4314 ATACTCTTACCGATCTATTAACAACAAGTAGATCTACACCGGGGGAATTAGTAATGTGTC 4373
Query 971 AGGAAAAATTGGTACAAGAAGCCGTGGATACACTTCTTGATAATGGAATCCGTGGACAAC 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4374 AGGAAAAATTGGTACAAGAAGCCGTGGATACACTTCTTGATAATGGAATCCGTGGACAAC 4433
Query 1031 CCATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATTTTCAGATGTAATTGAAGGCAAAG 1090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4434 CCATGAGGGATGGTCATAATAAGGTTTACAAGTCATTTTCAGATGTAATTGAAGGCAAAG 4493
Query 1091 AGGGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGGAAACGGGTCGATTATTCGGGGCGCTCGGTGA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4494 AGGGAAGATTTCGCGAGACTCTGCTTGGGAAACGGGTCGATTATTCGGGGCGCTCGGTGA 4553
Query 1151 TTGTCGTTGGACCTTCACTTTCATTACATCGCTGTGGATTGCCTCGCGAAATAGCAATAG 1210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4554 TTGTCGTTGGACCTTCACTTTCATTACATCGCTGTGGATTGCCTCGCGAAATAGCAATAG 4613
Query 1211 AGCTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTTTAATTAGACAACACCTGGCTTCGAACATAG 1270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4614 AGCTCTTCCAGACATTTGTAATTCGTGGTTTAATTAGACAACACCTGGCTTCGAACATAG 4673
Query 1271 GAGTTGCTAAGAGTCAAATTCGTGaaaaaaaGCCGATTGTCTGGGAAATCCTTCAAGAAG 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4674 GAGTTGCTAAGAGTCAAATTCGTGAAAAAAAGCCGATTGTCTGGGAAATCCTTCAAGAAG 4733
Query 1331 TCATGCAGGGGCATCCCGTATTACTGAATAGAGCACCTACCCTACATAGATTAGGCATAC 1390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4734 TCATGCAGGGGCATCCCGTATTACTGAATAGAGCACCTACCCTACATAGATTAGGCATAC 4793
Query 1391 AGTCATTCCAACCTATTTTAGTGGAAGGACGCACTATTTGTTTACATCCATTAGTTTGTA 1450
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4794 AGTCATTCCAACCAATTTTAGTGGAAGGACGCACTATTTGTTTACATCCATTAGTTTGTA 4853
Query 1451 AGGGGTTCAATGCAGACTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTGCCTTTATCTTTAG 1510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4854 AGGGGTTCAATGCAGACTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTGCCTTTATCTTTAG 4913
Query 1511 AGGCTCAAGCAGAGGCTCGTTTACTTATGTTTTCTCATATGAATCTCTTATCTCCAGCTA 1570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4914 AGGCTCAAGCAGAGGCTCGTTTACTTATGTTTTCTCATATGAATCTCTTATCTCCAGCTA 4973
Query 1571 TTGGAGATCCCATTTCGGTACCGACTCAAGATATGCTTATTGGACTCTATGTATTAACGA 1630
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4974 TTGGAGATCCCATTTCTGTACCGACTCAAGATATGCTTATTGGACTCTATGTATTAACGA 5033
Query 1631 GCGGCACTCGTCGAGGTATTTGTGCAAACAGATATAATCCATGTAATCGAAAAAACTATC 1690
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5034 GCGGCACTCGTCGAGGTATTTGTGCAAACAGATATAATCCATGTAATCGAAAAAACTATA 5093
Query 1691 AAAATGAAAGAATTTACGAAACAAACTATAAGTATACGAAAGAACCCtttttttGCAATT 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5094 AAAATGAAAGAATTTACGAAACAAACTATAAGTATACGAAAGAACCCTTTTTTTGCAATT 5153
Query 1751 CCTATGATGCAATTGGAGCTTATCGACAGaaaaaaaTCAATTTAGATAGTCCTTTGTGGC 1810
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5154 CCTATGATGCAATTGGAGCTTATCGACAGAAAAGAATCAATTTAGATAGTCCTTTGTGGC 5213
Query 1811 TTCGGTGGCAATTAGATCAACGCGTTATTGCTTCAAGAGAAGTTCCTATCGAAGTTCACT 1870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5214 TTCGGTGGCAATTAGATCAACGCGTTATTGCTTCAAGAGAAGTTCCTATCGAAGTTCACT 5273
Query 1871 ATGAATCTTTTGGTAACTATCATGAGATTTATGCACACTATCTAATAGTAAGAAGTGTaa 1930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5274 ATGAATCTTTTGGTAACTATCATGAGATTTATGCACACTATCTAATAGTAAGAAGTGTAA 5333
Query 1931 aaaaaGAAAATTTTTGTATATATATTCGAACCACAGTTGGTCATATTTCTTTTTATCGAG 1990
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5334 AAAAAGAAACTTTTTGTATATATATTCGAACCACAGTTGGTCATATTTCTTTTTATCGAG 5393
Query 1991 AAATCGAGGAAGCTATACAAGGTTTTTCTCAAGCCTGTTCATATGATACCTAA 2043
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5394 AAATCGAGGAAGCTATACAAGGTTTTTCTCAAGCCTGTTCATATGATACCTAA 5446
Score = 787 bits (426), Expect = 0.0
Identities = 430/432 (99%), Gaps = 0/432 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATCGATCGGTATAAACATCAACAACTCCGAATTGGCTTAGTTTCTCCTCAGCAAATA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3347 ATGATCGATCGGTATAAACATCAACAACTCCGAATTGGATTAGTTTCTCCTCAGCAAATA 3406
Query 61 AGTGCTTGGGCCACTAAAATAATACCTAATGGAGAGATAGTTGGAGAGGTGACAAAACCC 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3407 AGTGCTTGGGCCACTAAAATAATACCTAATGGAGAGATAGTTGGAGAGGTGACAAAACCC 3466
Query 121 TATACTTTTCATTACAAAACCAATAAACCGGAAAAAGATGGATTATTTTGTGAAAGGATT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3467 TATACTTTTCATTACAAAACCAATAAACCGGAAAAAGATGGATTATTTTGTGAAAGGATT 3526
Query 181 TTTGGACCTATAAAGAGTGGAATTTGCGCTTGTGGAAATTATCGAGTGATCGGAGATGAA 240
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3527 TTTGGGCCTATAAAGAGTGGAATTTGCGCTTGTGGAAATTATCGAGTGATCGGAGATGAA 3586
Query 241 AAAGAAGACCCAAAGTTTTGTGAACAATGTGGAGTTGAATTTGTTGATTCTCGGATACGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3587 AAAGAAGACCCAAAGTTTTGTGAACAATGTGGAGTTGAATTTGTTGATTCTCGGATACGA 3646
Query 301 AGATATCAAATGGGATACATAAAACTGACATGTCCTGTAACTCATGTATGGTATTTGAAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 AGATATCAAATGGGATACATAAAACTGACATGTCCTGTAACTCATGTATGGTATTTGAAA 3706
Query 361 CGTCTTCCTAGTTATATTGCGAATCTTTTAGATAAACCTCTTAAAGAATTAGAAGGCCTA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3707 CGTCTTCCTAGTTATATTGCGAATCTTTTAGATAAACCTCTTAAAGAATTAGAAGGCCTA 3766
Query 421 GTATACTGCGAT 432
||||||||||||
Sbjct 3767 GTATACTGCGAT 3778
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 76828024165
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5