BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= ATCG00490.1
Length=1440
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg475563 jgi|Araly1|475563|fgenesh2_kg.2__693__ATCG00490.1 2599 0.0
Ahg475602 jgi|Araly1|475602|fgenesh2_kg.2__732__ATCG00490.1 2582 0.0
Ahg907898 jgi|Araly1|907898|Al_scaffold_0002_979 2571 0.0
> Ahg475563 jgi|Araly1|475563|fgenesh2_kg.2__693__ATCG00490.1
Length=1440
Score = 2599 bits (1407), Expect = 0.0
Identities = 1429/1440 (99%), Gaps = 0/1440 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGGTTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTAT 60
Query 61 AAATTGACTTACTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTC 120
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAATTGACTTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTC 120
Query 121 CGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAA 180
Query 181 TCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTAC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTAC 240
Query 241 AAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTAT 300
Query 301 GTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCGGTTACTAACATGTTTACCTCGATT 360
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCGGTTACTAACATGTTTACCTCGATT 360
Query 361 GTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATC 420
Query 421 CCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGAT 480
Query 481 AAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTA 540
Query 541 TCCGCGAAAAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACC 600
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCCGCGAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACC 600
Query 601 AAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTT 660
Query 661 TGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTG 720
Query 721 AATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTG 780
Query 781 GGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTG 840
Query 841 TCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTT 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTT 900
Query 901 ATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTA 960
Query 961 TCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAG 1020
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCTGGTGGAGATCATGTTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAG 1020
Query 1021 TCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGC 1080
Query 1081 GGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCTGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCAGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGG 1140
Query 1141 GGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTA 1200
Query 1201 CAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCCAAC 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1201 CAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCTAAC 1260
Query 1261 CGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAG 1320
Query 1321 GGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAA 1380
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAGTGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAA 1380
Query 1381 GTATGGAAAGAGATCACATTTAACTTCCCAACCATCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAG 1440
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GTATGGAAAGAGATCAGATTTAACTTCCCAACCGTCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAG 1440
> Ahg475602 jgi|Araly1|475602|fgenesh2_kg.2__732__ATCG00490.1
Length=1440
Score = 2582 bits (1398), Expect = 0.0
Identities = 1426/1440 (99%), Gaps = 0/1440 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGGTTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTAT 60
Query 61 AAATTGACTTACTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTC 120
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAATTGACTTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTC 120
Query 121 CGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAA 180
Query 181 TCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTAC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTAC 240
Query 241 AAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTAT 300
Query 301 GTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCGGTTACTAACATGTTTACCTCGATT 360
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCGGTTACTAACATGTTTACCTCGATT 360
Query 361 GTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATC 420
Query 421 CCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGAT 480
Query 481 AAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTA 540
Query 541 TCCGCGAAAAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACC 600
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCCGCGAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACC 600
Query 601 AAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTT 660
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AAAGATGATGAGAATGTGAAATCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTT 660
Query 661 TGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTG 720
Query 721 AATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTG 780
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AATGCTATTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTG 780
Query 781 GGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTG 840
Query 841 TCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTT 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 841 GCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCATGCAATGCACGCTGTT 900
Query 901 ATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTA 960
Query 961 TCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAG 1020
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCTGGTGGAGATCATGTTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAG 1020
Query 1021 TCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGC 1080
Query 1081 GGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCTGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCAGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGG 1140
Query 1141 GGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTA 1200
Query 1201 CAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCCAAC 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1201 CAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCTAAC 1260
Query 1261 CGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAG 1320
Query 1321 GGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAA 1380
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAGTGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAA 1380
Query 1381 GTATGGAAAGAGATCACATTTAACTTCCCAACCATCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAG 1440
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GTATGGAAAGAGATCAGATTTAACTTCCCAACCGTCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAG 1440
> Ahg907898 jgi|Araly1|907898|Al_scaffold_0002_979
Length=1440
Score = 2571 bits (1392), Expect = 0.0
Identities = 1424/1440 (99%), Gaps = 0/1440 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGGTTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTAT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGAGTAT 60
Query 61 AAATTGACTTACTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTC 120
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAATTGACTTATTATACTCCTGAATATGAAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTC 120
Query 121 CGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAA 180
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CAAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCTGCGGTAGCTGCTGAA 180
Query 181 TCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTAC 240
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTATGGACCGATGGGCTTACCAGCCTTGATCGTTAC 240
Query 241 AAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTAT 300
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAGGACGATGCTACCACTTCGAGCCCGTTCCAGGAGAAGAAACTCAATTTATTGCGTAT 300
Query 301 GTAGCTTATCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCGGTTACTAACATGTTTACCTCGATT 360
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GTAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTTGGTTACTAACATGTTTACCTCGATT 360
Query 361 GTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCCCTGGCTGCTCTACGTCTAGAGGATCTGCGAATC 420
Query 421 CCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGAT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCTCCTGCTTATACTAAAACTTTCCAAGGACCACCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGAT 480
Query 481 AAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AAATTGAACAAGTATGGACGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGGTTA 540
Query 541 TCCGCGAAAAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACC 600
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TCCGCGAAGAACTATGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACC 600
Query 601 AAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AAAGATGATGAGAATGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTT 660
Query 661 TGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGGCATTATTTG 720
Query 721 AATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGAGCTGTATTTGCCAGAGAATTG 780
Query 781 GGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GGAGTTCCTATCGTAATGCATGACTACTTAACAGGGGGATTCACCGCAAATACTAGTTTG 840
Query 841 TCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTT 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCTCATTATTGCCGAGATAATGGCCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCACGCTGTT 900
Query 901 ATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAGCTAAAGCTTTACGTCTA 960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 901 ATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCACTTCCGTGTACTAACTAAAGCTTTACGTCTA 960
Query 961 TCTGGTGGAGATCATATTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAG 1020
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TCTGGTGGAGATCATGTTCACGCGGGTACAGTAGTAGGTAAACTTGAAGGAGACAGGGAG 1020
Query 1021 TCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGC 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TCAACTTTGGGCTTTGTTGATTTACTGCGCGATGATTATGTTGAAAAAGATCGAAGCCGC 1080
Query 1081 GGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCTGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GGTATCTTTTTCACTCAAGATTGGGTCTCACTACCAGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGG 1140
Query 1141 GGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTTTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCTGTACTA 1200
Query 1201 CAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCCAAC 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1201 CAATTCGGTGGAGGAACTTTAGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCTAAC 1260
Query 1261 CGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CGAGTAGCTCTGGAAGCATGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCAGTCGAG 1320
Query 1321 GGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAA 1380
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GGTAATGAAATTATCCGTGAAGCTTGCAAGTGGAGTCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAA 1380
Query 1381 GTATGGAAAGAGATCACATTTAACTTCCCAACCATCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAG 1440
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 GTATGGAAAGAGATCAGATTTAACTTCCCAACCGTCGATAAATTAGATGGCCAAGAGTAG 1440
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 53859606430
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5