BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= ATCG00680.1
Length=1527
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg907865 jgi|Araly1|907865|Al_scaffold_0002_946 2726 0.0
Ahg338690 jgi|Araly1|338690|fgenesh1_pg.C_scaffold_2000789 2687 0.0
Ahg930932 jgi|Araly1|930932|scaffold_303389.1 1155 0.0
> Ahg907865 jgi|Araly1|907865|Al_scaffold_0002_946
Length=1527
Score = 2726 bits (1476), Expect = 0.0
Identities = 1510/1527 (99%), Gaps = 0/1527 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTTGCCTTGGTATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTTTGCCTTGGTATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTT 60
Query 61 GCTGTTCATATAATGCATACTGCTCTAGTTGCTGGTTGGGCTGGTTCGATGGCTCTATAT 120
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTGTTCATATAATGCATACTGCTCTGGTTGCTGGTTGGGCTGGTTCGATGGCTCTATAT 120
Query 121 GAATTAGCAGTTTTTGATCCCTCCGACCCCGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAGGTATG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAATTAGCAGTTTTTGATCCCTCCGACCCCGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAGGTATG 180
Query 181 TTCGTTATACCTTTCATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCTTGGGGCGGTTGGAATATT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTCGTTATACCTTTCATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCGTGGGGCGGTTGGAATATT 240
Query 241 ACAGGGGGGACTATAACGAATCCGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACAT 300
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ACAGGAGGGACTATAACGAATCCGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACAT 300
Query 301 ATAGTGTTTTCTGGTTTGTGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTA 360
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCGTGTTTTCTGGTTTGTGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTA 360
Query 361 GAAATTTTTTGTGATGAACGTACAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAAATTTTTTGTGATGAACGTACAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGA 420
Query 421 ATTCATTTATTTCTTTCAGGAGTGGCTTGCTTCGGTTTTGGCGCATTTCATGTAACAGGA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 ATTCATTTATTTCTTTCAGGAGTGGCTTGCTTCGGTTTTGGCGCATTTCATGTAACAGGA 480
Query 481 TTATATGGTCCTGGAATATGGGTATCCGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTACAACCC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 481 TTATATGGTCCTGGAATATGGGTATCCGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTCCAACCC 540
Query 541 GTAAACCCGGCGTGGGGCGTGGAGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GTAAACCCGGCGTGGGGCGTGGAGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCT 600
Query 601 CATCATATTGCAGCAGGGACGTTGGGTATATTAGCGGGCCTATTCCATCTTAGTGTTCGT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CATCATATTGCAGCAGGGACGTTGGGTATATTAGCGGGCCTATTCCATCTTAGTGTTCGT 660
Query 661 CCGCCTCAACGTCTATACAAAGGATTACGTATGGGCAATATTGAAACCGTCCTTTCCAGT 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 661 CCGCCTCAACGTCTATACAAAGGATTACGTATGGGCAATATTGAAACCGTTCTTTCCAGT 720
Query 721 AGTATTGCTGCTGTCTTTTTTGCAGCTTTTGTTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AGTATTGCTGCTGTCTTTTTTGCAGCTTTTGTTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCT 780
Query 781 GCAACTACTCCCATCGAATTATTTGGTCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTT 840
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GCAACTACTCCTATCGAATTATTTGGTCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTT 840
Query 841 CAACAAGAAATATATCGAAGAGTTAGTGCTGGACTGGCTGAAAATCAAAGTTTATCAGAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CAACAAGAAATATATCGAAGAGTTAGTGCTGGACTGGCTGAAAATCAAAGTTTATCAGAA 900
Query 901 GCTTGGGCGAAAATTCCTGAAAAATTAGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCA 960
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GCTTGGGCTAAAATTCCTGAAAAATTAGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCA 960
Query 961 AAAGGGGGGTTATTCCGAGCGGGTTCAATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGG 1020
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AAAGGGGGGTTATTCCGAGCAGGTTCAATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGG 1020
Query 1021 TTAGGCCACCCCGTCTTTAGAAATAAAGAAGGGCGTGAACTTTTTGTACGCCGCATGCCT 1080
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1021 TTGGGCCACCCCGTCTTTAGGAATAAAGAAGGGCGTGAACTTTTTGTACGCCGTATGCCT 1080
Query 1081 ACtttttttGAAACTTTTCCGGTAGTTTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCTGAC 1140
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1081 ACTTTTTTTGAAACTTTTCCGGTTGTTTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCCGAC 1140
Query 1141 GTCCCGTTTAGAAGGGCAGAATCAAAATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GTCCCGTTTAGAAGGGCAGAATCAAAATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAG 1200
Query 1201 TTTTATGGTGGTGAACTCAATGGAGTGAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATAT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TTTTATGGTGGTGAACTCAATGGAGTGAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATAT 1260
Query 1261 GCTAGACGGGCTCAATTGGGTGAGATTTTTGAATTAGATCGTGCGACTTTGAAATCTGAT 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1261 GCTAGACGGGCTCAATTGGGTGAGATTTTTGAATTAGATCGTGCGACTTTGAAATCCGAT 1320
Query 1321 GGTGTTTTTCGTAGCAGCCCAAGAGGTTGGTTTACGTTTGGACATGCTTCGTTTGCTCTA 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GGTGTTTTTCGTAGCAGCCCAAGAGGTTGGTTTACGTTTGGACATGCTTCGTTTGCTCTA 1380
Query 1381 CTTTTCTTCTTTGGACACATTTGGCATGGTGCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCT 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 CTTTTCTTCTTTGGACACATTTGGCATGGTGCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCT 1440
Query 1441 GGTATTGATCCAGATTTGGATGCTCAAGTGGAATTCGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGAT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GGTATTGATCCAGATTTGGATGCTCAAGTGGAATTTGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGAT 1500
Query 1501 CCAACTACAAAACGACAAGCAGTCTGA 1527
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CCAACTACAAAACGACAAGCAGTCTGA 1527
> Ahg338690 jgi|Araly1|338690|fgenesh1_pg.C_scaffold_2000789
Length=1527
Score = 2687 bits (1455), Expect = 0.0
Identities = 1503/1527 (98%), Gaps = 0/1527 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTTGCCTTGGTATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTT 60
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTTTGTCTTGGTATCGTGTTCATACTGTTGTATTGAATGATCCCGGTCGTTTACTT 60
Query 61 GCTGTTCATATAATGCATACTGCTCTAGTTGCTGGTTGGGCTGGTTCGATGGCTCTATAT 120
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTGTTCATATAATGCATACTGCTCTGGTTGCTGGTTGGGCTGGTTCGATGGCTCTATAT 120
Query 121 GAATTAGCAGTTTTTGATCCCTCCGACCCCGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAGGTATG 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAATTAGCAGTTTTTGATCCCTCCGACCCCGTTCTTGATCCAATGTGGAGACAAGGTATG 180
Query 181 TTCGTTATACCTTTCATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCTTGGGGCGGTTGGAATATT 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTCGTTATACCTTTCATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCGTGGGGCGGTTGGAATATT 240
Query 241 ACAGGGGGGACTATAACGAATCCGGGTCTTTGGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACAT 300
||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ACAGGAGGGACTATAACGAATCCGGGTCTTTCGAGTTACGAAGGGGTAGCCGGAGCACAT 300
Query 301 ATAGTGTTTTCTGGTTTGTGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTA 360
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATCGTGTTTTCTGGTTTGTGCTTCTTGGCAGCTATTTGGCATTGGGTATATTGGGATCTA 360
Query 361 GAAATTTTTTGTGATGAACGTACAGGAAAACCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGA 420
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GAAATTTTTTGTGATGAACGTACAGGAAAATCTTCTTTGGATTTGCCCAAGATTTTTGGA 420
Query 421 ATTCATTTATTTCTTTCAGGAGTGGCTTGCTTCGGTTTTGGCGCATTTCATGTAACAGGA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 421 ATTCATTTATTTCTTTCAGGAGTGGCTTGCTTCGGTTTTGGCGCATTTCATGTAATAGGA 480
Query 481 TTATATGGTCCTGGAATATGGGTATCCGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTACAACCC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 481 TTATATGGTCCTGGAATATGGGTATCCGACCCTTATGGACTAACCGGAAAGGTCCAACCC 540
Query 541 GTAAACCCGGCGTGGGGCGTGGAGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GTAAACCCGGCGTGGGGCGTGGAGGGTTTTGACCCTTTTGTTCCGGGAGGAATAGCCTCT 600
Query 601 CATCATATTGCAGCAGGGACGTTGGGTATATTAGCGGGCCTATTCCATCTTAGTGTTCGT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CATCATATTGCAGCAGGGACGTTGGGTATATTAGCGGGCCTATTCCATCTTAGTGTTCGT 660
Query 661 CCGCCTCAACGTCTATACAAAGGATTACGTATGGGCAATATTGAAACCGTCCTTTCCAGT 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 661 CCGCCTCAACGTCTATACAAAGGATTACGTATGGGCAATATTGAAACCGTTCTTTCCAGT 720
Query 721 AGTATTGCTGCTGTCTTTTTTGCAGCTTTTGTTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AGTATTGCTGCTGTCTTTTTTGCAGCTTTTGTTGTTGCTGGAACTATGTGGTATGGTTCT 780
Query 781 GCAACTACTCCCATCGAATTATTTGGTCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTT 840
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GCAACTACTCCTATCGAATTATTTGGTCCTACTCGTTATCAATGGGATCAGGGATACTTT 840
Query 841 CAACAAGAAATATATCGAAGAGTTAGTGCTGGACTGGCTGAAAATCAAAGTTTATCAGAA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CAACAAGAAATATATCGAAGAGTTAGTGCTGGACTGGCTGAAAATCAAAGTTTATCAGAA 900
Query 901 GCTTGGGCGAAAATTCCTGAAAAATTAGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCA 960
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GCTTGGGCTAAAATTCCTGAAAAATTAGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCA 960
Query 961 AAAGGGGGGTTATTCCGAGCGGGTTCAATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGG 1020
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AAAGGGGGGTTATTCCGAGCAGGTTCAATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGG 1020
Query 1021 TTAGGCCACCCCGTCTTTAGAAATAAAGAAGGGCGTGAACTTTTTGTACGCCGCATGCCT 1080
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1021 TTGGGCCACCCCGTCTTTAGGAATAAAGAAGGGCGTGAACTTTTTGTACGCCGTATGCCT 1080
Query 1081 ACtttttttGAAACTTTTCCGGTAGTTTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCTGAC 1140
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1081 ACTCTTTTTGAAACTTTTCCGGTTGTTTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCCGAC 1140
Query 1141 GTCCCGTTTAGAAGGGCAGAATCAAAATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAG 1200
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GTCCCATTTAGAAGGGCAGAATCAAAATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAG 1200
Query 1201 TTTTATGGTGGTGAACTCAATGGAGTGAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATAT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TTTTATGGTGGTGAACTCAATGGAGTGAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATAT 1260
Query 1261 GCTAGACGGGCTCAATTGGGTGAGATTTTTGAATTAGATCGTGCGACTTTGAAATCTGAT 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1261 GCTAGACGGGCTCAATTGGGTGAGATTTTTGAATTAGATCGTGCGACTTTGAAATCCGAT 1320
Query 1321 GGTGTTTTTCGTAGCAGCCCAAGAGGTTGGTTTACGTTTGGACATGCTTCGTTTGCTCTA 1380
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GGTGTTTTTCATAGCAGCCCAAGAGGTTGGTTTACGTTTGGACATGCTTCGTTTGCTCTA 1380
Query 1381 CTTTTCTTCTTTGGACACATTTGGCATGGTGCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCT 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 CTTTTCTTCTTTGGACACATTTGGCATGGTGCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCT 1440
Query 1441 GGTATTGATCCAGATTTGGATGCTCAAGTGGAATTCGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGAT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 GGTATTGATCCAGATTTGGATGCTCAAGTGGAATTTGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGAT 1500
Query 1501 CCAACTACAAAACGACAAGCAGTCTGA 1527
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CCAACTACAAAACGACAAGCAGTCTGA 1527
> Ahg930932 jgi|Araly1|930932|scaffold_303389.1
Length=808
Score = 1155 bits (625), Expect = 0.0
Identities = 653/667 (98%), Gaps = 0/667 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 861 AGTTAGTGCTGGACTGGCTGAAAATCAAAGTTTATCAGAAGCTTGGGCGAAAATTCCTGA 920
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 122 AGTTAGTACTGGACTGGCTGAAAATCAAAGTTTATCAGAAGCTTGGGCTAAAATTCCTGA 181
Query 921 AAAATTAGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCAAAAGGGGGGTTATTCCGAGC 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 AAAATTAGCTTTTTATGATTATATTGGTAATAATCCAGCAAAAGGGGGGTTATTCCGAGC 241
Query 981 GGGTTCAATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGGTTAGGCCACCCCGTCTTTAG 1040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 242 AGGTTCAATGGACAATGGGGATGGAATAGCTGTTGGATGGTTGGGCCACCCTGTCTTTAG 301
Query 1041 AAATAAAGAAGGGCGTGAACTTTTTGTACGCCGCATGCCTACtttttttGAAACTTTTCC 1100
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302 GAATAAAGAAGGGCGTGAACTTTTTGTACGCCGTATGCCTACTTTTTTTGAAACTTTTCC 361
Query 1101 GGTAGTTTTGGTAGACGGAGACGGAATTGTTAGAGCTGACGTCCCGTTTAGAAGGGCAGA 1160
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 GGTTGTTTTGGTAGACGGAGATGGAATTGTTAGAGCCGACGTCCCGTTTAGAAGGGCAGA 421
Query 1161 ATCAAAATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAGTTTTATGGTGGTGAACTCAA 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 ATCAAAATATAGTGTCGAACAAGTAGGTGTAACTGTTGAGTTTTATGGTGGTGAACTCAA 481
Query 1221 TGGAGTGAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATATGCTAGACGGGCTCAATTGGG 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 TGGAGTGAGTTATAGTGATCCCGCAACTGTGAAAAAATATGCTAGACGGGCTCAATTGGG 541
Query 1281 TGAGATTTTTGAATTAGATCGTGCGACTTTGAAATCTGATGGTGTTTTTCGTAGCAGCCC 1340
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 TGAGATTTTTGAATTAGATCGTGCGACTTTGAAATCCGATGGTGTTTTTCGTAGCAGCCC 601
Query 1341 AAGAGGTTGGTTTACGTTTGGACATGCTTCGTTTGCTCTACTTTTCTTCTTTGGACACAT 1400
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 AAGAGGTTGGTTTACGTTTGGACATGCTTTGTTTGCTCTACTTTTCTTCTTTGGACACAT 661
Query 1401 TTGGCATGGTGCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCTGGTATTGATCCAGATTTGGA 1460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 TTGGCATGGTGCTAGAACCCTCTTCAGAGATGTTTTTGCTGGTATTGATCCAGATTTGGA 721
Query 1461 TGCTCAAGTGGAATTCGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGATCCAACTACAAAACGACAAGC 1520
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 TGCTCAAGTGAAATTTGGGGCATTCCAAAAACTTGGAGATCCAACTACAAAACGACAAGC 781
Query 1521 AGTCTGA 1527
|||||||
Sbjct 782 AGTCTGA 788
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 57173457745
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5