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ID : Virus3286

     Link: ATTEDⅡ / TAIR        MR: MR LIST


Annotation
DescriptionHeliconius_erato_iflavirus|invertebrates|ssRNA
Sequence
CGCGGGTTTA TCCCGCGCAG CGTTGTAGAG CATAATTTCA CTAATATTTC AAAGTGCATG TCTATTGTAA ATTATTTGTG TTAGTTCAGT TTGTATGTTC CTAAAGGTTC GATACTTGTT CGTAATACAG AGATGTTTCC TTTGATGGCA TGTATTTGAA TATTAGCTTT GTATGTTTAC GTCATAGTTT TAAAATAAAT TATTTTGTTA GTTATTGTAT ATATTATATC ATTGTATAGT ATTAATAAAA TATAATACTC GGTACTGACC GGGGCTATAT CTAACGACTT ATTATTTTCA CATCATGTGT TTTCGTAGTC GGCCTCTATA TAATTCCTTT CAGTGGGTAT TAGTAACTAC GACACCGGCA TAATCACCCC CGGTGGCAAC AAGCACCTCT CATGTGTTTA TAATAAGAAC GATTTATAGT GTAAAAATAA TAATTTTAAG GCAAGACTAA TTTCTATTGC AAATGTCTAT GAGTAGATGA AACATAGTGA AGAAGTAAGT GTGTTAAAAT AGGGACCCCT CTAAGTGGCT AAAACCACCG CCTACTACTT TTTCACGTAT TATGACATAA TCGAAAATGA CCGCTTTGTG TAGAAAGTTG GTGACCCTCA TTCTGTCATG GAGGTGAGGT TAATCCGGCT GAGTTTATCT CAAAACCTCG ATGACATGTG TATCCATGGA TTTCGGGAAC ATATCTCTAA GATATGGTCG GACTTCTGAA CCCTAAATTT ACGGACGTTT TAGTAGGAAG AATAAAACGT GTCCATTTCT TATTCATTTT CTTTTATGGT GACAATTTAT TGAGTATTAA CATTATTTTG TTTGTTTGAT TCTATCACTT TTACAGTCTT GTGTATTCTT TCCACTTTAT TTTGAATTTA TTAAATCTTT AAAAAATGGC 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GCATTAGCGG ATGATTGTCG TTTTACAACT TATCAGGGAG TTCCCCCTAT GGTTATCATA GACGACTTGC CTGAATATAA GTCTTCTTTA GAATATCAAG GTATCACTGA TTTCTTTAGG AAAGATCCTA GGAAAATCGG AGAAGAAATT GCAGAAGGCG CTACAGAGAC ATTATCTGCT AATGTTCAGC CCATGTTAAA TGAATTTTTA TCTACATTCC AAAGTAAACT TTCTGATACA TATAGCAGTG TTAAGGAGGA TTTAAAAGGG ACAAATTTTT ATACTAAATT AAGTAGTATA GCTTCTCAAA TTATTCATGC TGTTAATAAT CCTACGCCAT CTACAATAGC TATATCCGTA TTTAGTATTT TAGTTGTTTT AGGTATTATT ACATATTCTG TTTACCACGT AGTTGTTAAA TATGTTTCGG CTATATGGAA TTGGATATCA AACAAAGTTG TTTCGAATAA AGTGCAAGAA GAAGTAGAAA CCGCAGAAGA AGCATTAGAG TTTCAAGATG GAACTAAAGA CAATGCAGTT GTAGGGTTTC TATCACTAAT CTGTGGAGGA TTGTGCACTT TGTTTGGTAT GAAAAATTCC ATAAAGTATA AGCCTGTGTC CGAGAGTTTA TTTCAAAATA TAAGCTCAGG AATGAAAGTA AGTAATGTGT GCTTCGTATT TTTTAAGAAT CTACTGTCAT GTATCACTGA TATGAAGTCC TTAATAGTAG CATATTTATA TCCGGGTTTT AACGCAGCCG AAAGTTTAAT GCAAGGTCGT GATATAATAG AAAAATGGGT TATGTATGCA CAAGATATAT TAGATCCTTT AGTCAGTAAG AATTTGTTGT ATGATAGAGA AGCTCAAATT AAATTATTGG ATTGTTATGC ATTCGGAAAA ATTCTTAAAG TTAAGGCTTT AGAAACTCAG TATCCCGCTA TTATTCAATT AGTTAATACC ACGTTTGATA AATTACATAA GAAACATACT GAACTTGTTG CTCAAGGTTT GGATCCTCAT ATTCGTAAAA TGCCATTTGT TATTTATAAT TATGGAGCAC CTGAAATAGG GAAGAGCCAT CTCACAACAG ATTTATGTGC TGAATTATGC AAGAGTCAGG ACATTAAAAC TGAAACAGAT TTAATGTGTG TTCTCAATGC TACGTCAAAG TTTTGGGATA ACTGTGACAG ACAACCGTGT TTAGTTATGG ATGATGCTTT TAATATTCGT AAAGGAACTA TGCTGGAAGA TCAAATAGCA GCTATATTTA ATGTAGTGTC TCCTGTTGTT CTTGTTCCTC CTAAAGCTGC CGTTGAAGAT AAAGGTAAAT TATATAATCC TGAAATTTTT ATATTAAATA GTAATTGTGA TTTCTTTAAA ACAGAAGTTT GCATTGAGGA AGCGTTATGG CGTAGACGTG ATATTCTTAT ACATACTGAA TTAGATTTAG AATTTGTTAA ACCTGGATGT GTTCACTGTG AAAAGAAGCT ACCCGTCAAT GCGCTTTTAC CACCTGAAGC AATCTCATCT TTAAAAGATT TCCATCATCT GAAATTTAAA TATACTTTCG ATGTTAAAAA TCCGTCGTGC GCTTATCTAC CGGAAGGTAG ATATTTGAAG TATGATGAAC TTCTCATTCT TCTTAAAGAT TTATTTAAGA AAAATAGAGA GGCTGAAAAT ATTAAGTTTG CGCGTCGTGT AGAACAATGC AATGAAGTTG TAGGAGATCG CCATTCTATT GTAGGGAATG TGGAGAATTT GGAACAATTA TGGAATGATG CTATAATGAA AAGAAAAGCA GCAGCTGATC TCGTTAAAAA TTCTACGTTC GCCACAATAT GTAAGAGTTT TGCTTCGAAT GCGTTGGAGA GATGGGAGCA AGGGAAACAC TATGTTCTTA AAACTATTGC TGGGATTGTT AAGCCTAATA ATAATAAATA TTTGTTAAAA AATGATCTAT GTGAAGAATG TAATAGAATT AAGTATCAAT GTATTTCGTG TAGAATTAAT ATGGAAAACG CAATGTTAGA TAATCCTACA CCATCAACGT CTCAGGGTTC TACGTCTATA GAGGTTTTGC TCGAAGACGA TGATAAGATG GGTTATCAAG CAGATAATGA TGGCGAAGTT GTAGTGCCTG AATTTCACCA TGATATCATT TATCATCTTA GTGACAGTGG TCAGAAAGAT TTTAAACGAT TGAGTAAAGA TTATGATGCG TATGTATTAG ATCATTTTAA AAAATTCCTA GATATATGTA GTCCCACTAT AATAATTGAT CTGCGCAGAT ATCCCCGATA TGCACGTAGT TTTAATATCT TTAGGTCATT ATGTGAGAAA TATTGTAAAT GCCTTCACAA CTATACAGTT AATCGTCCAA TTGTGTATCA AAATAAATTT GCTTTTATTA ATCCAAGCAG ACCATCAGAT CCAGATATTA TAGACGATAT ATCATGTGAT CAAGGTTGCT GGTTATCGCT GCCTTGGTTT TACTATAACA CTATTACTGT CTGTAAAAGA ATTAATAGTG CTATTGTTGA GCCATGGATG TTAGATATAG GAAGTGCTAA GTTAATTCAT TCTAAAATTA CTTTAGATTC TATATTTTCT AGAATGCTTA AATTTGTATG GGACTTTTAT TATGATCATA TGAAACCTGC TATCAAAACT ATATTTAGTA TGTTTACTTC ATTTGGTGGG TGGGTTATGG GTTTGACTTT CCTATCATTA TTGTTTAGTA CAACTATTAT GGGTATAGGG GTATATGAAG CATACAATAT GCCTTCTGTA AGTAGTGGAG TACAGCAAGC ATTACGTGAT CCGGATTGTT TATCTCATAG AACATCTCCA AAAGGAAACT GCCTTTTTTT TGAAAGTAAT TCGTATGAAG CGGGGAAACC TAAAGTATCT CGAGCAGTAA AACCTAAAGT TAAAACCCCT ACTCGTGCAT CGAAAACATT AGATTATCAG AGTTCTCAAC AATTTTCAGT AGTTGAAAAT AGATTGCGCA ATAATATGTC TACTATCGTA TGCGTTTTTA CAGACGTTGA AGGAAAACTG AAAAGGGTTG AAAATTCTGG TATTATGTTG AAAGATCAAC AAATGTTAAT TCAAAAACAT TATTACGATT ATTGGAAGCG ATTAGATATA TCCACAAAGT TTTATTTTTA TAATAGTAAT ATTAAAAACA TATCGGAGTG TGGACTTTTA TTAAATAATT TCTTTGATTT AGAAATAGAT TGGTTCTATT CTGATAATAG TGAATTTTGT GATAGTAATT TTGGCATATT ACATCTGCCA AAGTATGTGC CTGCATTCAA AGATCTTACA AAATTTATAG CTAAACAATC CGATCATGAG TATATAAAAG CTGATGAATG TTATCTGTTT TCTAGTTTAG AATTACGTAG TAAGCATTGT GTTATGAATC TAGAATTTAA TAAGTCAGTA ACCGATCAAC ATGGTTGGTT GCGTTTGGAT CAATGCTATT CGTATCGATA TACGTGTAAA GGTTTGTGTG GTAGTGTATT ATTGAGTAGT ACTTTAGAAC GTCCAATCAT CGGCATACAT TTTGCAGGTA CTAATGTGTT AGGCTATGCT GAACCTTTAT GCGCTGAGAG TTTTACCGGA ATTGAAGTTA AGCATTATGA TTATGAGCTG CATGAACTAA GACTTGATGG GGATGATCCG AAGATTGATT TTGACACGTT ATTATATCCT CAAGGTACTG TTCATGCAGC TTATAGTCAT CATCAAGGAA GCGTTAGCCA GTATATACCG AGTTTGGTGC AAGGAGTGTA TGAAGTGGAC ACCGAACCAA ATCCTTTGAG TCCACGTGAT CCGCGCTTAC CTGAAGGTAA CCCGCCATTA AAACGTGGTG TTGAACATAT GGGTAAACCT CCTCTAGATT TCCCTAAGAA ACATTTAGAT TTGGCATCTG ATGATCTTCA AAGTATATTG TTACAAGCAG TCAAACCTGT TCGTATTAAC GTAGGTTTAG TATCTCTTCA AGATGCGATA TGTGGGAATG TTAGTGTTAA AGGTTTCGAA CCGTTAGAAT GGTCTTCAAG TGAAGGATTT CCTTTAAAAT CGATTAGGCC AAAAGGTGTG AGAGGGAAGC GCTGGCTATT TGACTTAGAG GAAACCCCTG AAGGATTTCA GTTAAAGGGT ATGCATGGCG AGTTGCAGCG ACAATTGAGC GTGTGTCATG CGTTGCGTAA GAAAGGAATT CGATGCCCTA CGATATTTAC TGATTGTTTG AAAGATACAT GTATAGACGT TAATAAGTGT AAAATACCAG GAAAGACGCG TGTGTTTTCC ATATCACCAG TACAATTTAC TATAGCTTTT AAACAATATT TCAATGATTT TCTTGCGTCA TACCAAAATG CTAGAATAAG TGCTGAGCAT GGAATTGGAA TTAATGTGGA TTCATTAGAG TGGACAGAAG TTGCGAATTA TATTACGCGA TATGGTTCGG CAATTGTAGC AGGTGATTAT AAGAATTATG GGCCTAGCTT AATGCTAAGC TGCGTTGAAA AAGCCTTCGA TATTATAATG GCCTGGTACG AGAGATATGA TCCCGATGAA GAGCGTCAAT TGGTTCGCCG TGTCTTATTG TCCGAAATTC TTCATGCTAA GCATTTATGC TTAAATGTAG TATATGGTGT ACCTTGTGGT ATACCGTCTG GTAGTCCTAT TACAACTCCA TTAAATAGTA TAGTTAACTC GTTATATCTT CGATGCGCGT GGAAAGATAT AGTAAATGAG AGTTTTGAAG TTATGCATAA TAATGTTAAG TTTCTTACAT ATGGTGATGA CGTATGTATT AATGTTAGCG ATAATTATAA GGATATATAT AATACTGAAA CATTAAATGC ATTTTTTAAG AAATATAATA TTATTTTTAC AGATATAGAT AAGAGTGATA ATATTATAAA ATATCGTACT TTAGACAACG TTACATTTTT AAAACGTGGT TTCAAGTTAC ATCCAAGTAG TAAAGCTGTG TTTCTCGCAC CAATCGAAGA GCAGAGTATT AGAAAATGTG TTAGTTGGAT TACACGAAAG GGTGATCCTT TACAAAATAC ATTAGAAAAT TGCAAACAAG CGTGCGAGCT TGCCTTTGGA TGGGGACCAG AATATTATAA TGCTGTACGA GAGCGTCTGT CACGAGAGTG TCTGACGCGC TGTGGTCAGT CGTTTTCAGC GCCTTCGTGG TATGAAAAGT CTGAAATGTG TTATAATATT TAGAGTCTTT TCTTTTAAAT TTATATTAAT TTTGTGTATA TTTTATTAGT ATAAGCCTTT CCCGATGTGG AACGCCCGTG TGAGCGAGGC CCGGGGAAAA TTGGTAAGAG 
Length9910
Protein Sequence
Protein Residue
A.thaliana
AGI-code
Description
TAIR curator summary
Alias
Gene coexpression
MR
MR Locus Description
1 Virus3899
1.41421 Virus2873
1.73205 Ahg907360 SCR-like 5
2.82843 Ahg952550
3.4641 Ahg932264 N-acetyl-l-glutamate synthase 1
4.24264 Ahg934403
4.47214 Ahg334007
4.58258 Ahg494339 MADS-box family protein
6 Ahg918286 elicitor peptide 2 precursor
6.245 Ahg496065 actin 4
RNA-seq
Seasonal expression (July 2011 to June 2013)
The four seasons
Growth Chamber expression