Detail



ID : Ahg903624

Blast(Query) A.halleri   /   A.thaliana (RECIPROCAL DATA)     Link: ATTEDⅡ / TAIR        MR: MR LIST


Annotation
Descriptionjgi|Araly1|903624|Al_scaffold_0003_752
Sequence
ATGCTGATAC ATATCAGAAT TCCTCGAAAG ATCTTAGCTT TGAGGCGTCA TGTTTTTCCG CCTTATAATG CGTTCTTCTC CGTCTCTTCT CGACCTTCTC AGTTTTCCTC GGACCAAGTG GCGGCTCACA ATGTTGCATC TTTACTAAAA AGCCCCAATT GGGAGAAGAA CAGTTCTCTT AAATCTCTAG TCTCTCACAT GAGCCCAAAT GTCGCTTCAC AGGTCATTTC GCTTCAACGC AGTGACAATG ACATTTGCGT TCGCTTTTTC ATGTGGGTCT GCAAGCATTC GTCGTACTGT TTTGACCCAG CTCAGAAAAA TCAGCTTTTG AAACTGACTG TTTCTTCCGG ATTGTTTCGA GTTGCGCATG ATGTTATTGT TGCGTTGATC AGGGAATGTA GTAGATGCGA GAAAGAGATG TTGAAACTAA TAAGTTGTTT TGATGAGCTG AGAGAGGTTT CTGGGTTCCG GTTAAATTAC CCTTGTTACA GCTCTCTTTT GATGTCCTTG GCTAAACTTG ATTTAGGATT TTTAGCTTAC GTGACTTACA GAAGAATGGA AGCTGACGGA TTTGTTGTTG GTATGATTGA TTATAGAACC ATTGTCAATG CTCTGTGTAA GAATGGATAC ACGGAAGCCG CTGAGATGTT CATGTGTAAG ATTCTTAAAG TTGGGTTTCT GTTAGATTCC CATATAGTCA CTTCTCTGTT GCTGGGTTTC TGCCGTGGAT TGAATCTTAG AGATGCACTC AAGGTGTTTG ATGTAATGTC TAGGGAGGGA ACTTGTGCAC CAAACTCTGT TAGTTACTCC ATTTTGATTC ACGGGTTGTG TGAAGTAGGG AGACTTGAAG AAGCCTTTGG CTTAAAAGAT CAAATGGGTG AGAAAGGTTG CCAACCAAGC ACACGTACAT ATACTGTGCT TATTAAAGCC TTGTGCGATA GAGGTTTGAT TGATAAAGCT TTTAACTTGT TTGATGAGAT GATTGCTAGA GGGTGCAAAC CAAACGTTCA CACTTACACC GTTTTGATTG ATGGGTTATG TAGAGACGGA AAGATTGAAG AGGCTAATGG GGTTTGTCGA AAGATGGTTA AAGACGGGAT ATTTCCCAGT GTAATAACTT ACAATGCGTT GATAAATGGC TACTGCAAAG ATGGACGGGT TGTTCCCGCT TTTGAGCTTC TTACTGTAAT GGGGAAGAGG GCTTGCAAAC CAAATGTAAG AACTTTTAAC GAGCTTATGG AAGGGTTGTG TAGAGTTGGG AAACCGTACA AGGCCGTGCA CCTTTTGAAG AGAATGCTGG ACAATGGCCT GTCACCTGAC ATTGTGAGCT ATAATGTTTT GATCGATGGG CTTTGTAGAG AAGGCCATAT GAATGTGGCG TACAAGCTAC TTACCTCGAT GAACTCCTTT GACCTTGAGC CTGATTGTCT TACATTCACC GCTATAATAA ATGCTTTCTG CAAACAAGGG AAGGCTGACG TTGCTAGCGC GTTCTTAGGT TTGATGCTTA GAAAAGGAAT AAGCCTAGAT GAAGTAACAG GTACAACTCT TATTGATGGT GTCTGCAATG TCGGTAAAAC CCGTGACGCA TTGTTTATCC TGGAGACGTT GGTTAAAATG AGAATGTTGA CAACTCCTCA CTCCCTGAAC GTGATTCTTG ATATGCTCAG TAAAGGTTGT AAACTGAAGG AGGAATTAGC AATGCTTGGG AAAATCAATA AGCTTGGTTT AGTTCCTTCT GTAGTGACTT ACACAACATT GGTTGATGGG TTGATTCGAT CAGGTGATAT TAGCGGTTCC TTCAGGATGC TAGAACTGAT GAAGTTAAGT GGTTGTTTGC CGAATGTCTA TCCATACACA ATCATCATCA ATGGTCTTTG TCAATTTGGG AGAGTCGAGG AAGCAGAGAA GCTTCTTTCT GCTATGCAAG ATTCAGGAGT TTCACCAAAC CATGTTACTT ATACCGTTAT GGTGAAAGGA TATGTCAATA ATGGAAAACT AGACCGTGCT CTTGAAACAG TAAGAGCAAT GGTTGAAAGA GGATATGAAC TAAATGACCG TATCTATTCT TCTTTGTTAC GGGGATTTGT CTTATCTCAA AAAGGTATTA GAGAAACCGA TCCTGAATGT ATCAAAGAAC TCATATCTGT GGTAGAACAA CTTGGTGGGT CTACCAGCGG GTTATGTATT TTCTTGGTCA CACGGTTATG CAAAGAGGGA AGAACGGATG AGTCCAACGG TCTAGTCCAA ACTATACTCA AGAGCGGTGT TTTTCTCGAG AAGGCCATCG ACATCATCAT GGAATCTTAT TGCAGCAAGA AGAAACACAC CAAGTGTGTG GAGCTGATAA CACTTGTTCT CAAATCCGGG TTTGTCCCGA GTTTCAAATC TTTCTGCCTA GTGATTCAAG GTTTGAAGAA GGAAGGAGAT ACAGAGCGGG CGCGTGAGCT CGTAATGGAG CTTCTTACCT CGAATGGAGT TGTAGAGAAA AGTGGAGTGT TGCCTTATGT TGAGTGTCTC ATGGAAACTG GTGATTGCAG TGAAGTCATA GATTTGGTGG ATCAATTGCA CAGCAGAGAA AGACCCACCT TCTAA 
Length2595
Protein Sequence
Protein Residue
Map Locationscaffold_3: 2883918.. 2886560
Download Sequence
A.thaliana
AGI-codeAT3G07290.1
DescriptionPentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
TAIR curator summary
Alias
Gene coexpression
MR
MR Locus Description
56.8419 Ahg921475
RNA-seq
Seasonal expression (July 2011 to June 2013)
The four seasons
Growth Chamber expression